Pagsusuri ng mutation ng BRCA1/BRCA2 genes sa breast cancer

Kasalukuyang hindi pinagana ang Javascript sa iyong browser. Hindi gagana ang ilang feature ng website na ito kapag hindi pinagana ang javascript.
Magrehistro gamit ang iyong mga partikular na detalye at partikular na gamot ng interes at tutugmain namin ang impormasyong ibibigay mo sa mga artikulo sa aming malawak na database at agad kaming mag-email sa iyo ng isang PDF na kopya.
作者 Stella S, Vitale SR, Martorana F, Massimino M, Pavone G, Lanzafame K, Bianca S, Barone C, Gorgone C, Fichera M, Manzella L
Stefania Stella, 1,2 Silvia Rita Vitale, 1,2 Federica Martorana, 1,2 Michele Massimino, 1,2 Giuliana Pavone, 3 Katia Lanzafame, 3 Sebastiano Bianca, 4 Chiara Barone, 5 Cristina Gorgone, 6 Marco Fichera, 6, 7 Livia ng Unibersidad ng Manzella, 7 Livia Catania, Catania, 95123, Italy;2 Center for Experimental Oncology and Hematology, AOU Policlinico “G.Rodolico – San Marco”, Catania , 95123, Italy; 3 Medical Oncology, AOU Policlinico “G. Rodolico – San Marco”, Catania, 95123, Italy; 4 Medical Genetics, ARNAS Garibaldi, Catania, 95123, Italy; 5 Medicine Genetics, ASP, Syracuse, 96100, Italy; 6 Department of Biomedical and Biotechnology Sciences, Unibersidad ng Catania, Medical Genetics, Catania, Italy, 95123; 7Oasi Research Institute-IRCCS, Troina, 94018, Italy Mga Komunikasyon: Stefania Stella, tel +39 095 378 1946, email [email protected]; [email protected] Layunin: Ang mga mutasyon ng germline sa BRCA1 at BRCA2 at naitatag na breast cancer (BC), ovary (OC) at iba pang nauugnay sa panghabambuhay na panganib ng cancer. Ang pagsubok para sa BRCA gene ay susi sa pagtatasa ng indibidwal na panganib, gayundin para sa paghahanap ng mga paraan ng pag-iwas sa malusog na carrier at pag-angkop ng mga paggamot sa mga pasyente ng cancer. Ang prevalence ng BRCA1 at BRCA2 ay nag-iiba-iba sa mga pathogen ng data, at malawak ang pagkakaiba-iba ng mga pathogen ng BRCA1 at BRCA2 sa rehiyon, at malawak na umiiral ang mga pathogen ng BRCA1 at BRCA2. Sa mga variant sa mga pamilyang Sicilian, kulang ang mga pag-aaral na partikular na nagta-target ng mga populasyon sa silangang Sicily. Ang layunin ng aming pag-aaral ay imbestigahan ang saklaw at pamamahagi ng mga pagbabago sa BRCA pathogenic germline sa isang pangkat ng mga pasyente ng BC mula sa silangang Sicily at upang masuri ang kanilang kaugnayan sa mga partikular na katangian ng BC gamit ang susunod na henerasyong pagkakasunud-sunod. Ang pagkakaroon ng mga pagbabago sa grade ng ULTS, at proliferation na nauugnay sa tumor. 35 na pasyente (9%) ay may BRCA pathogenic na variant, 17 (49%) sa BRCA1 at 18 (51%) sa BRCA2. Ang mga pagbabago sa BRCA1 ay laganap sa triple-negative na mga pasyente ng BC, samantalang ang BRCA2 mutations ay mas karaniwan sa luminal na mga pasyente ng BC. Kung ikukumpara sa mga non-carrier, ang mga subject na may mas mataas na mga variant ng index ng BRCA1. pangkalahatang-ideya ng BRCA mutational status sa mga pasyente ng BC mula sa silangang Sicily at kumpirmahin ang papel ng pagsusuri ng NGS sa pagtukoy sa mga pasyente na may namamana na BC. Sa pangkalahatan, ang mga data na ito ay pare-pareho sa nakaraang ebidensya na sumusuporta sa BRCA screening para sa wastong pag-iwas at paggamot ng cancer sa mga mutation carrier.
Ang kanser sa suso (BC) ay ang pinakakaraniwang malignancy sa buong mundo at ang pinakanakamamatay na kanser sa mga kababaihan.1 Ang mga biological na tampok na tumutukoy sa prognosis ng BC at klinikal na pag-uugali ay malawakang pinag-aralan at bahagyang napaliwanagan sa paglipas ng panahon. Sa katunayan, ilang mga surrogate marker ang kasalukuyang ginagamit upang i-classify ang BC sa iba't ibang molecular subtypes. Ang mga ito ay estrogen (ER) at/o progesterone receptor factor (PgR2), human growth factor (PgR) receptor2. amplification, proliferation index na Ki-67 at tumor grade (G).2 Tinukoy ng kumbinasyon ng mga variable na ito ang mga sumusunod na kategorya ng BC: 1) Ang mga luminal na tumor, na nagpapakita ng ER at/o PgR expression, ay umabot sa 75% ng mga BC. Ang mga tumor na ito ay nahahati pa sa Luminal A, kapag ang Ki-67 ay mas mababa sa 20% at ang Luminal B2, at ang Luminal B2, at ang Luminal B2, ay negatibo, at ang Luminal B2 ay negatibo. sa pagkakaroon ng HER2 amplification, anuman ang index ng paglaganap; 2) HER2+ tumor na ER at PgR negatibo ngunit nagpapakita ng HER2 amplification. Ang pangkat na ito ay bumubuo ng 10% ng lahat ng mga tumor sa suso; 3) Ang triple-negative na breast cancer (TNBC), na hindi nagpapakita ng ER at PgR expression at HER2 amplification, ay bumubuo ng humigit-kumulang 15% ng mga kanser sa suso.2-4
Sa mga subtype na ito ng BC, ang grade ng tumor at proliferation index ay kumakatawan sa mga cross-sectional biomarker na direkta at independiyenteng nauugnay sa pagiging agresibo at pagbabala ng tumor.5,6
Bilang karagdagan sa mga nabanggit na biological features, ang papel na ginagampanan ng minanang genetic alterations na humahantong sa pag-unlad ng BC ay naging lalong mahalaga sa nakalipas na ilang taon.7 Humigit-kumulang 1 sa 10 na tumor sa suso ang minana dahil sa mga pagbabago sa germline sa mga partikular na gene.8 Dalawang malalaking epidemiological na pag-aaral na kinasasangkutan ng higit sa 180,000 kababaihan, BRARD na gene, kamakailan ay natukoy ang isang pangkat ng, e1 ATM, BRARD genes, BRARD, e Ang CHK2, PALB2, RAD51C, at RAD51D) ay pangunahing responsable para sa namamana na BC. Sa mga gene na ito, ang BRCA1 at BRCA2 (mula dito ay tinutukoy bilang BRCA1/2) ay nagpakita ng pinakamatibay na ugnayan sa pag-unlad ng mga bukol sa suso.9-12 Sa katunayan, ang germline BRCA1/2 mutations ay makabuluhang nagpapataas ng panghabambuhay na panganib ng BC, pati na rin ang mga kanser sa prostate, pati na rin ang iba pang panganib ng BC. pancreatic, colorectal, at melanoma.Mula sa edad na 13 hanggang 80 taon, ang pinagsama-samang insidente ng BC ay 72% sa mga babaeng may BRCA1 pathogenic variant (PV) at 69% sa mga babaeng may BRCA2 PV.14
Kapansin-pansin, ang isang kamakailang publikasyon ay nagmumungkahi na ang panganib ng BC ay nakasalalay sa uri ng PV. Sa katunayan, kumpara sa mga variant ng pathogenic truncating, ang maliwanag na mga variant ng missense, lalo na sa gene ng BRCA1, ay nauugnay sa isang pinababang panganib ng BC, lalo na sa mga matatandang babae.15
Ang pagkakaroon ng BRCA1 o BRCA2 PV ay nauugnay sa iba't ibang biological at clinicopathological features.16,17 BRCA1-associated BCs ay may posibilidad na maging clinically aggressive, poorly differentiated, at mataas na proliferative. Ang mga tumor na ito ay kadalasang triple negative at may maagang edad ng onset. Ang mga tumor na nangyayari sa mga pasyenteng may mahusay na pagkakaiba-iba at may pagkakaiba-iba ng grade na ipinakita ng BRCA2. proliferative index. Ang mga tumor na ito ay mas karaniwan sa lumen B at kadalasang nangyayari sa mga matatanda.16-18 Kapansin-pansin, ang mga mutasyon sa BRCA1 at BRCA2 ay nagpapataas ng sensitivity sa mga partikular na paggamot, kabilang ang mga platinum salt at mga naka-target na gamot tulad ng poly(ADP-ribose) polymerase inhibitors (PARPi).19,20
Sa nakalipas na ilang taon, ang pagpapatupad ng next-generation sequencing (NGS) sa klinikal na kasanayan ay nagbigay-daan sa dumaraming bilang ng mga pasyente ng BC na sumailalim sa molecular testing para sa cancer susceptibility syndromes, kabilang ang BRCA1/2.21 Kasabay nito, ang mga kahulugang batay sa tumpak na pamantayan patungkol sa family history , demograpiko, at clinicopathological na mga katangian upang mas makilala ang mga indibidwal na karapat-dapat sa BRCA1/2 na pagsubok na ito. BRCA1/2 screening sa mga partikular na populasyon, na nagha-highlight ng mga pagkakaiba sa mga heyograpikong rehiyon.24–27 Bagama't may mga ulat sa BC cohort sa western Sicily, mas kaunting data ang available sa BRCA1/2 screening sa silangang populasyon ng Sicily.28,29
Inilalarawan namin dito ang mga resulta ng screening ng germline BRCA1/2 sa mga pasyente ng BC mula sa silangang Sicily, na higit pang nakakaugnay sa pagkakaroon ng BRCA1 o BRCA2 mutations na may pangunahing mga tampok na clinicopathological ng mga tumor na ito.
Isang retrospective na pag-aaral ang isinagawa sa "Center for Experimental Oncology and Hematology" sa Policlinico Hospital.Rodolico – San Marco sa Catania.Mula Enero 2017 hanggang Marso 2021, kabuuang 455 na pasyente na may suso at ovarian, melanoma, pancreatic o prostate cancer ay isinagawa para sa diagnostic na laboratoryo ng BRCA/2 na ito ay isinagawa para sa diagnostic na pag-aaral ng BRCA/2 na ito. ng Helsinki, at lahat ng kalahok ay nagbigay ng nakasulat na pahintulot na may kaalaman bago ang pagsusuri sa molekular.
Ang mga histological at biological na katangian (ER, PgR, HER2 status, Ki-67, at grade) ng BC ay nasuri sa core biopsy o surgical sample, na isinasaalang-alang lamang ang mga agresibong bahagi ng tumor. Ki-67≥20%), luminal B-HER2+ (ER at/o PgR+, HER2+), HER2+ (ER at PgR-, HER2+) o triple negatibo (ER at PgR-, HER2-).
Bago tasahin ang status ng mutation ng BRCA1 at BRCA2, isang multidisciplinary team kabilang ang isang oncologist, isang geneticist, at isang psychologist ay nagsagawa ng isang tumor genetics consultation para sa bawat pasyente upang matukoy ang pagkakaroon ng BRCA1 at/o BRCA1. o mga indibidwal na may mataas na panganib ng PV sa BRCA2 gene. Ang pagpili ng pasyente ay isinagawa ayon sa mga alituntunin ng Italian Society of Medical Oncology (AIOM) at mga lokal na rekomendasyong Sicilian.30,31 Kabilang sa mga pamantayang ito ang: (i) family history ng mga kilalang pathogenic variant sa susceptibility genes (hal, BRCA1, BRCA2, TP53, PTEN); (ii) mga lalaking may BC; (iii) ang mga may BC at OC; (iv) mga babaeng may BC <36 taon, TNBC <60 taon, o bilateral BC <50 taon; (v) personal na medikal na kasaysayan ng BC <50 taon at hindi bababa sa isang first-degree na kamag-anak: (a) BC < 50 taon; (b) non-mucinous at non-borderline OC ng anumang edad; (c) bilateral BC; (d) lalaki BC; (e) pancreatic cancer; (f) kanser sa prostate; (vi) dalawa o higit pang Personal na kasaysayan ng BC > 50 taon at family history ng BC, OC, o pancreatic cancer para sa mga kamag-anak na first-degree na kamag-anak sa isa't isa (kabilang ang mga kamag-anak kung saan siya ay first-degree na kamag-anak); (vii) Personal na kasaysayan ng OC at hindi bababa sa isang first-degree na kamag-anak: (a) BC <50 taon; (b) NOC; (c) bilateral BC; (d) lalaki BC; (vii) babaeng may mataas na antas ng serous OC.
Ang isang 20 mL peripheral blood sample ay nakuha mula sa bawat pasyente at nakolekta sa EDTA tubes (BD Biosciences). Ang genomic DNA ay nahiwalay sa 0.7 mL na buong sample ng dugo gamit ang QIAsymphony DSP DNA Midi kit Isolation Kit (QIAGEN, Hilden, Italy) ayon sa mga tagubilin ng tagagawa at ipinasa sa isang Qubitor® 3.0. MA, USA) Magsagawa ng quantification. Ang target na pagpapayaman at paghahanda sa library ay ginagawa ng Oncomine™ BRCA Research Assay Chef, na handang i-load sa Ion AmpliSeq™ Chef Reagents DL8 Kit para sa automated na paghahanda sa library ayon sa mga tagubilin ng manufacturer. Ang kit ay binubuo ng dalawang multiplex PCR primer pool na magagamit para pag-aralan ang lahat ng BRCA1 (NM_0073000 (0N)) at BRCA1 (NM_00730020) genes. Sa madaling sabi, 15 µL ng bawat diluted sample DNA (10 ng) ay idinagdag sa barcoded plates para sa paghahanda ng library at lahat ng reagents at consumable ay na-load sa Ion Chef™ instrument. Ang awtomatikong paghahanda ng library at barcoded sample library pooling ay isinagawa sa instrumento ng Ion Chef™. Ang bilang ng mga inihandang aklatan ay tinasa ng Qubitor® 3 (Ang bilang ng mga inihandang aklatan ay tinasa ng isang Qubitor® . Scientific, Waltham, MA, USA) ayon sa mga tagubilin ng tagagawa. Sa wakas, pinagsama-sama ang mga aklatan sa mga equimolar ratio sa mga sample tube ng library ng Ion Chef™ (mga barcoded na tubo) at ni-load sa instrumento ng Ion Chef™. Isinagawa ang pagkakasunud-sunod gamit ang Ion Torrent S5 (Thermo Fisher Scientific) na instrumento ng Scientific Fisher (Thermo Fisher Scientific). (Thermo Fisher Scientific).Ang pagsusuri ng data ay isinagawa ng Amplicon Suite (SmartSeq srl) at Ion Reporter Software.
Sinundan ng lahat ng variant nomenclature ang kasalukuyang mga alituntunin ng Human Genome Variation Consortium, na available online (HGVS, http://www.hgvs.org/mutnomen). Ang klinikal na kahalagahan ng mga variant ng BRCA1/2 ay tinukoy gamit ang pag-uuri ng International Consortium ENIGMA (Evidence-Based Network para sa Interpreting Germline Mutant Alleles) tulad ng iba't ibang database ng pagkonsulta sa Germline Mutant Alleles, https://orgenii/consult. ARUP, BRCAEXCHANGE , ClinVar, IARC_LOVD, at UMD. Kasama sa klasipikasyon ang limang natatanging kategorya ng panganib: benign (kategorya I), malamang na benign (kategorya II), variant ng hindi tiyak na kahalagahan (VUS, kategorya III), malamang na pathogenic (kategorya IV), at pathogenic (kategorya V). 30 database.32
Upang magtalaga ng potensyal na klinikal na kahalagahan sa bawat VUS, ginamit ang mga sumusunod na computational protein prediction algorithm: MUTATION TASTER, 33 PROVEAN-SIFT (//provean.jcvi.org/index.php), POLYPHEN-2 (http:// /genetics.bwh.harvard.edu/pph2/) at Align-GVGD (http://agvgd.hci.utah.edu/agvgd_input.php).Itinuring na wild type ang mga variant na inuri bilang class 1 at 2.
Kinumpirma ng Sanger sequencing ang pagkakaroon ng bawat pathogenic na variant. Sa madaling sabi, ang isang pares ng mga partikular na primer ay idinisenyo para sa bawat nakitang variant sa pamamagitan ng paggamit ng BRCA1 at BRCA2 gene reference sequence (NG_005905.2, NM_007294.3 at NG_012772.3, NM_000059.3, ayon sa pagkakabanggit). pagkakasunud-sunod.
Ang mga pasyenteng nag-negatibo para sa BRCA1/2 gene ay sinuri ng multiplex ligation-dependent probe amplification (MLPA) ayon sa mga tagubilin ng manufacturer para masuri ang pagkakaroon ng malalaking genomic rearrangements (LGR). haba.Ang mga produkto ng probe amplification, na binubuo ng isang natatanging hanay ng mga PCR amplicon, ay sinuri ng capillary electrophoresis at ng Cofalyser.Net software kasabay ng naaangkop na mga talahanayan ng Cofalyser na partikular sa batch (www.mrcholland.com).
Ang mga napiling clinicopathological variable (histological grade at Ki-67% proliferation index) ay nauugnay sa pagkakaroon ng BRCA1/2 PV, na kinakalkula gamit ang Prism software v. 8.4 gamit ang eksaktong pagsubok ni Fisher na ipinapalagay na ang p-value <0.05 ay makabuluhan.
Sa pagitan ng Enero 2017 at Marso 2021, 455 na mga pasyente ang na-screen para sa germline BRCA1/2 mutations. Ang pagsusuri sa mutation ay isinagawa sa Policlinico Hospital's Center for Experimental Oncology and Hematology. 2020), ang Rodolico ng Catania – San Marco” sa kabuuan, 389 na mga pasyente Nagkaroon ng breast cancer, 37 ovarian cancer, 16 pancreatic cancer, 8 prostate cancer at 5 melanoma. Ang distribusyon ng mga pasyente ayon sa uri ng cancer at mga resulta ng pagsusuri ay ipinapakita sa Figure 1.
Ang Figure 1 ay nagpapakita ng flow chart na nagpapakita ng pangkalahatang-ideya ng pag-aaral. Ang mga pasyenteng may mga tumor sa suso, melanoma, pancreatic, prostate, o ovarian ay sinubukan para sa mga mutasyon sa BRCA1 at BRCA2 genes.
Mga pagdadaglat: PV, pathogenic na variant; VUS, variant ng hindi tiyak na kahalagahan; WT, wild-type na BRCA1/2 sequence.
Pinili naming itinuon ang aming mga pag-aaral sa mga pangkat ng kanser sa suso. Ang mga pasyente ay may median na edad na 49 taon (saklaw ng 23-89) at higit sa lahat ay babae (n=376, o 97%).
Sa mga paksang ito, 64 (17%) ang may mutasyon ng BRCA1/2 at lahat ay babae. Tatlumpu't limang (9%) ang may PV at 29 (7.5%) ang may VUS. Labimpito (48.6%) ng 35 pathogenic na variant ang naganap sa BRCA1 at 18 (51.4%) sa BRCA2, habang 8.8%) ang naganap sa BRCA2 (2.8%) (2.8%) sa BRCA17. BRCA2 (Mga Larawan 1 at 2). Wala ang LGR sa pagsusuri ng MLPA.
Figure 2. Pagsusuri ng BRCA1 at BRCA2 mutations sa 389 na mga pasyente ng kanser sa suso.(A) Distribusyon ng mga pathogenic na variant (PV) (pula), mga variant ng hindi tiyak na kahalagahan (VUS) (orange), at WT (asul) sa 389 na mga pasyente ng kanser sa suso; (B) 389 na mga pasyente ng kanser sa suso Tatlumpu't limang (9%) ang may BRCA1/2 pathogenic variants (PVs). Kabilang sa mga ito, 17 (48.6%) ang BRCA1 PV carriers (dark red) at 18 (51.4%) ang BRCA2 carriers (light red); (C) 29 (7.5%) ng 389 na paksa ang nagdala ng VUS, 5 (17.2%) BRCA1 genes (dark orange) at 24 (82.8%) BRCA2 genes (light orange).
Mga pagdadaglat: PV, pathogenic na variant; VUS, variant ng hindi tiyak na kahalagahan; WT, wild-type na BRCA1/2 sequence.
Susunod naming inimbestigahan ang paglaganap ng BC molecular subtypes sa mga pasyenteng may BRCA1/2 PV. Kasama sa distribusyon ang 2 (5.7%) luminal A, 15 (42.9%) luminal B, 3 (8.6%) luminal B-HER2+, 2 (5.7%) HER2+ at 13 (37.1%) na pasyenteng BRTNBC 1.2. luminal B BC, 2 (11.8%) ang may sakit na HER2+, at 10 (58.8%) ang may TNBC. Ang mga tumor na walang mutasyon ng BRCA1 ay alinman sa luminal A o luminal B-HER2+ (Larawan 3). Sa BRCA2-positibong subgroup, 10 (55.6%) ang mga tumor ay luminal B, HER2% (16.7%) ay luminal B, HER2 (16.7%) (16.7%). Ang TNBC at 2 (11.1%) ay luminal A (Larawan 3). Walang mga tumor ng HER2+ na naroroon sa pangkat na ito. Kaya, ang mga mutasyon ng BRCA1 ay laganap sa mga pasyente ng TNBC, samantalang ang mga pagbabago sa BRCA2 ay nangingibabaw sa mga indibidwal na lumen B.
Figure 3 Prevalence ng mga subtype ng breast cancer sa mga pasyenteng may mga pathogenic na variant sa BRCA1 at BRCA2. Ang mga histogram na nagpapakita ng distribusyon ng BRCA1- (dark red) at BRCA2- (light red) na mga PV sa mga molecular subtype ng mga pasyente ng breast cancer. Ang mga numerong iniulat sa loob ng bawat kahon ay kumakatawan sa porsyento ng mga pasyenteng may BRCA1 at BRCA2 subtype ng breast cancer para sa bawat breast cancer subtype.
Mga pagdadaglat: PV, pathogenic na variant; HER2+, human epidermal growth factor receptor 2 positibo; TNBC, triple-negative na kanser sa suso.
Kasunod nito, sinuri namin ang uri at gene localization ng BRCA1 at BRCA2 PVs. Sa BRCA1 PV, naobserbahan namin ang 7 solong nucleotide variants (SNVs), 6 na pagtanggal, 3 duplication at 1 insertion. Isang mutation lang (c.5522delG) ang kumakatawan sa isang bagong pagtuklas. Ang pinakakaraniwang BRCA na PV ay natukoy sa parehong paksa. c.5035_5039delCTAAT. Ang pagbabagong ito ay nagsasangkot ng pagtanggal ng limang nucleotides (CTAAT) sa BRCA1 exon 15, na nagreresulta sa pagpapalit ng amino acid na leucine ng tyrosine sa codon 1679, at dahil sa isang translation frameshift na may hinulaang alternatibong stop codon, ang isa pang nahuhulaang pagbabago sa codon ay hindi nade-detect sa napaaga na protina. ng mga naiulat na PV ay matatagpuan sa splice site consensus region (c.4357+1G>T) (Talahanayan 1).
Tungkol sa BRCA2 PV, napansin namin ang 6 na pagtanggal, 6 na SNV at 2 pagdoble. Wala sa mga nakitang pagbabago ay nobela. Tatlong mutasyon ang naulit sa aming populasyon, c.428dup at c.8487+1G>A na naobserbahan sa 3 paksa, na sinusundan ng c.5851_5854delAGIT na kaso ng dalawang kaso ret. pag-uulit ng C sa exon 5 ng BRCA2, na hinulaang mag-encode ng pinutol, hindi gumaganang protina. Ang c.8487+1G>A mutation ay nangyayari sa intronic na rehiyon ng BRCA2 intron 19 (± 1,2) at naaapektuhan ang splicing consensus sequence, na nagreresulta sa binagong splicing na nagreresulta sa abnormal na_5.58 na variant ng pathogen4 o absent na pathogen4.58 na pathogen4. ay dahil sa isang 4-nucleotide na pagtanggal mula sa mga posisyon ng nucleotide 5851 hanggang 5854 sa coding exon 10 ng BRCA2 gene at nagreresulta sa isang translational frameshift na may hinulaang alternatibong stop codon (p.S1951WfsTer). pasyente.34 Ang unang mutation ay kinasasangkutan ng pagpapalit ng adenosine (A) sa BRCA2 exon 7 na may guanine (G) na naglalaman ng nucleotide na nagreresulta sa pagbabago ng valine sa isoleucine sa codon 211, isoleucine Ang Amino acid ay isang amino acid na may lubos na katulad na mga katangian. Ang pagbabagong ito ay nakakaapekto sa normal na mRNA splicing at ang pangalawang variant ng AT ay matatagpuan sa isang intronic na rehiyon. pagpapalit bago ang exon 13 ng gene na naka-encode ng BRCA2. Ang pagbabago ng c.7008-2A>T ay maaaring makabuo ng maraming transcript na may iba't ibang haba. Higit pa rito, sa pangkat ng mga BRCA2 PV, 4 sa 18 na pagbabago (22.2%) ay intronic.
Pagkatapos ay na-map namin ang BRCA1/2 deleterious mutations sa functional domains at protein-binding regions (Fig. 4). Sa BRCA1 gene, 50% ng mga PV ay matatagpuan sa breast cancer cluster region (BCCR), habang ang 22% ng mutations ay matatagpuan sa ovarian cancer cluster region (OCCR) (Fig. 4A). Ang 42.8% ng mga mutasyon ay matatagpuan sa OCCR (Larawan 4B). Susunod, sinuri namin ang lokasyon ng PV sa loob ng mga domain ng protina ng BRCA1 at BRCA2. Para sa protina ng BRCA1, nakakita kami ng tatlong PV sa loop at naka-coiled na mga domain ng coil, at dalawang mutasyon sa domain ng BRCT (Fig. 4A, sa 4 na domain ng BRCA2, naka-mapa sa 4 PVRC na protina). Ang intronic at 3 exonic na pagbabago ay nakita sa oligo/oligosaccharide-binding (OB) at tower (T) na mga domain (Larawan 4B).
Figure 4 Schematic representation ng BRCA1 at BRCA2 proteins at localization ng pathogenic variant. Ipinapakita ng figure na ito ang distribusyon ng BRCA1 (A) at BRCA2 (B) pathogenic variant sa mga pasyente ng breast cancer. Ang mga exonic mutation ay ipinapakita sa kulay asul, habang ang intronic na variant ay ipinapakita sa orange. Ang taas ng bar ay kumakatawan sa bilang ng mga kaso. Ang BRCA1 at BRCA2 na mga ito ay naglalaman ng protina na domain. domain (RING) at isang nuclear localization sequence (NLS), isang coiled-coil domain, isang SQ/TQ cluster domain (SCD), at isang BRCA1 C-terminal domain (BRCT).(B) Naglalaman ang BRCA2 protein ng walong BRC repeats, isang DNA-binding domain na may helical domain (Helical), tatlong oligonucleotide/oligosaccharide (aB) domain. NLS sa C side. Ang mga lugar na tinatawag na Breast Cancer Cluster Region (BCCR) at Ovarian Cancer Cluster Region (OCCR) ay ipinapakita sa ibaba.*Kumakatawan sa mga mutasyon na tumutukoy sa mga stop codon.
Pagkatapos ay inimbestigahan namin ang mga tampok na clinicopathological ng BC na maaaring nauugnay sa pagkakaroon ng BRCA1/2 PV. Ang mga kumpletong klinikal na tala ay magagamit para sa 181 BRCA1/2-negatibong mga pasyente (hindi carrier) at lahat ng mga carrier (n = 35). Nagkaroon ng ugnayan sa pagitan ng rate ng paglaganap at grado ng tumor.
Kinakalkula namin ang distribusyon ng Ki-67 batay sa median ng aming cohort (25%, range <10-90%). Ang mga subject na may Ki-67 < 25% ay tinukoy bilang "mababang Ki-67", habang ang mga indibidwal na may value na ≥ 25% ay itinuring na "high Ki-67" Mga carrier ng PV (Larawan 5A).
Figure 5 Correlation ng Ki-67 na may grade distribution sa breast cancer women na may at walang BRCA1 at BRCA2 PVs.(A) Boxplot na nagpapakita ng median na Ki-67 values ​​​​sa 181 non-carrier BC na pasyente kumpara sa BRCA1 (18) o BRCA2 (17) PV na pasyente.P values ​​​​sa ibaba ng 0.5 B ay itinuturing na istatistikal na pagtatalaga ng kanyang mga pasyenteng may cancer(BC) histological grade group (G2 at G3) ayon sa BRCA1 at BRCA2 mutation status (WT subjects, BRCA1 at BRCA2 PVs carriers).
Gayundin, sinuri namin kung may kaugnayan ang grade ng tumor sa pagkakaroon ng BRCA1/2 PV. Dahil wala ang G1 BC sa aming populasyon, hinati namin ang mga pasyente sa dalawang grupo (G2 o G3). Alinsunod sa mga resulta ng Ki-67, ang pagsusuri ay nagsiwalat ng makabuluhang ugnayan sa istatistika sa pagitan ng grade ng tumor at mutation ng BRCA1, na may mas mataas na proporsyon ng mga tumor na hindi G3 Ang mga pag-unlad sa teknolohiya ng pagkakasunud-sunod ng DNA ay nagbigay-daan sa mga hindi pa naganap na pag-unlad sa BRCA1/2 genetic testing, na may mahahalagang implikasyon para sa mga pasyenteng may family history ng cancer. Sa ngayon, humigit-kumulang 20.000 BRCA1/2 na variant ang natukoy at inuri ayon sa American Society of Medical Genetics 35 at ang ENIGMA system.35,36 BRCA1/vational spectrum na malawak na kilala sa buong geographic spectrum. rehiyon.37 Sa loob ng Italya, ang rate ng BRCA1/2 PVs ay mula 8% hanggang 37%, na nagpapakita ng malawak na pagkakaiba-iba sa loob ng bansa.38,39 Sa populasyon na halos 5 milyon, ang Sicily ang ikalimang pinakamalaking rehiyon sa Italya sa mga tuntunin ng bilang ng mga naninirahan.
Ang aming pag-aaral ay isa sa mga unang ulat sa insidente ng BRCA1/2 PV sa mga pasyente ng BC sa silangang Sicily.28 Itinuon namin ang aming pagsusuri sa BC, dahil ito ang pinakakaraniwang sakit sa aming pangkat.
Kapag sinusuri ang 389 BC na mga pasyente, 9% ang may dalang BRCA1/2 PVs, pantay na ipinamahagi sa pagitan ng BRCA1 at BRCA2. Ang mga resultang ito ay pare-pareho sa mga naunang naiulat sa populasyon ng Italy.28 Kapansin-pansin, 3% (13/389) ng aming pangkat ay lalaki. Ang rate na ito ay mas mataas kaysa sa inaasahan para sa mga lalaki na kanser sa suso (1% ng lahat ng BC na nakabatay sa BC sa amin), panganib.Gayunpaman, wala sa mga lalaking ito ang nakabuo ng BRCA1/2 PV, kaya sila ay mga kandidato para sa karagdagang molecular analysis upang ibukod ang pagkakaroon ng hindi gaanong karaniwang mga mutasyon gaya ng PALB2, RAD51C at D, bukod sa iba pa. Ang mga variant ng hindi tiyak na kabuluhan ay nakuha sa 7% ng mga paksa kung saan ang BRCA2 VUS ay nakikita.24 na may nauna nang katibayan.
Noong sinuri namin ang distribusyon ng mga BC molecular subtypes sa BRCA1/2 mutant women, kinumpirma namin ang mga kilalang asosasyon sa pagitan ng TNBC at BRCA1 PV (58.8%) at sa pagitan ng luminal B BC at BRCA2 PV (55.6%).16,43 Ang luminal A at HER2+ na mga tumor sa BRCA1 at BRCA2 PV3 na mga carrier ay pare-pareho sa mga kasalukuyang carrier ng data ng literatura ng BRCA1 at BRCA2.
Pagkatapos ay tumutok kami sa uri at lokasyon ng BRCA1/2 PV. Sa aming cohort, ang pinakakaraniwang BRCA1 PV ay c.5035_5039delCTAAT. Bagama't ang Incorvaia et al. Hindi inilarawan ang variant na ito sa kanilang Sicilian cohort, iniulat ito ng ibang mga may-akda bilang germline BRCA1 PV.34 Maraming BRCA1 PV ang natagpuan sa aming cohort – hal c.181T>G, c.514del, c.3253dupA at c.5266dupC – na na-obserbahan sa dalawang mutasyon na ito ng BRCA1. (c.181T>G at c.5266dupC) ay karaniwang matatagpuan sa Ashkenazi Jews ng Eastern at Central Europe (Poland, Czech), Slovenian, Austrian, Hungarian, Belarusian at German ), 44,45 at, sa United States at Argentina, kamakailan ay tinukoy bilang isang "paulit-ulit na variant ng germline" sa mga pasyenteng Italyano na may 4del at OC 5 na dating cancer. mga pasyente mula sa hilagang Sicily sa Palermo at Messina. Kapansin-pansin, maging ang Incorvaia et al. natagpuan ang c.3253dupA na variant sa ilang pamilya sa Catania.28 Ang pinakakinakatawan na BRCA2 PV ay c.428dup, c.5851_5854delAGTT at ang intronic na variant na c.8487+1G>A, na naiulat nang mas detalyado 28 sa isang pasyente sa Palermo na may c.5858dup na c.4258dup. naobserbahan sa mga sambahayan sa hilagang-kanluran ng Sicily, pangunahin sa mga rehiyon ng Trapani at Palermo, samantalang ang c.5851_5854delAGTT PV ay naobserbahan sa mga sambahayan sa hilagang-kanluran ng Sicily. Ang 8487+1G>A variant ay mas karaniwan sa mga paksa mula sa Messina, Palermo, at Caltanissetta.28 Rebbeck et al. naunang inilarawan ang c.5851_5854delAGTT na pagbabago sa Colombia.37 Ang isa pang BRCA2 PV, c.631+1G>A, ay natagpuan sa mga pasyente ng BC at OC mula sa Sicily (Agrigento, Siracusa at Ragusa).28 Kapansin-pansin, napagmasdan namin ang magkakasamang pag-iral ng dalawang variant ng BRCA2 at 63170>c.A. sa parehong pasyente, na ipinapalagay namin na ibinukod sa cis mode, tulad ng naiulat na dati nang ganoon.34,46 Ang mga BRCA2 uble mutations na ito ay talagang madalas na sinusunod sa rehiyon ng Italy at napag-alaman na nagpapakilala ng mga premature stop codons, na nakakaapekto sa messenger RNA splicing at nagiging sanhi ng pagbagsak ng BRCA2 protein.47,48
Na-map din namin ang mga BRCA1 at BRCA2 PV sa putative OCCR at BCCR na mga rehiyon ng mga domain ng protina at mga gene. Ang mga rehiyong ito ay inilarawan ni Rebbeck et al. bilang mga lugar na may panganib para sa pagbuo ng ovarian at breast cancer, ayon sa pagkakabanggit.49 Gayunpaman, ang katibayan tungkol sa kaugnayan sa pagitan ng lokasyon ng mga variant ng germline at ang panganib ng kanser sa suso o ovarian ay nananatiling kontrobersyal.28,50-52 Sa aming populasyon, ang mga BRCA1 PV ay higit na matatagpuan sa rehiyon ng BCCR, samantalang ang mga BRCA2 PV ay nakararami na matatagpuan sa pagitan ng OCCR, alinmang rehiyon ay matatagpuan sa OCCR. at mga rehiyon ng BCCR at mga feature ng BC. Ito ay maaaring dahil sa limitadong bilang ng mga pasyente na may BRCA1/2 mutations. Mula sa pananaw ng domain ng protina, ang mga BRCA1 PV ay ipinamamahagi kasama ang buong protina, at ang mga pagbabago sa BRCA2 ay mas gustong makita sa BRC repeat domain.
Sa wakas, iniugnay namin ang BC clinicopathological feature sa BRCA1/2 PV. Dahil sa limitadong bilang ng mga pasyenteng kasama, nakakita lang kami ng makabuluhang ugnayan sa pagitan ng Ki-67 at tumor grade. Bagama't nananatiling kontrobersyal ang pagtatasa at interpretasyon ng Ki-67, tiyak na ang mataas na proliferative rate ay nauugnay sa mas mataas na panganib ng pag-ulit ng sakit at pagbaba ng petsa ng "pagbabago ng sakit", at ang pagbaba ng "pagbaba ng buhay". Ang Ki-67 ay 20%.Gayunpaman, ang threshold na ito ay hindi nalalapat sa aming BRCA1/2 mutation na populasyon ng pasyente, na may median na Ki-67 na halaga na 25%. Ang trend na ito sa mataas na Ki-67 rate ay maaaring ipaliwanag sa pamamagitan ng paglaganap sa aming luminal B at TNBC cohorts, kung saan kakaunti ang luminal A na tumor ang naroroon. Gayunpaman, ang ilang mas mataas na Ki2-5%) ay maaaring magmungkahi na ang ilang mas mataas na Ki2-5% na ebidensiya pagsasapin-sapin ang mga pasyente ayon sa kanilang pagbabala.53,54 Mula sa mga resulta ng aming pagsusuri, ang isang makabuluhang ugnayan ay hindi nakakagulat.Nangyayari sa pagitan ng mataas na Ki-67 at mga grado at ang pagkakaroon ng BRCA1 PV. Sa katunayan, ang mga tumor na nauugnay sa BRCA1 ay tipikal ng TNBC at nagpapakita ng mga mas agresibong katangian.16,17
Sa konklusyon, ang pag-aaral na ito ay nagbibigay ng ulat sa mutational status ng BRCA1/2 sa isang BC cohort mula sa silangang Sicily. Sa pangkalahatan, ang aming mga natuklasan ay pare-pareho sa preexisting na ebidensya, parehong sa mga tuntunin ng mutation prevalence at clinicopathological features sa BC. Higit pang mga pag-aaral sa mas malalaking populasyon ng BRCA1/2-mutant BC na mga pasyente, tulad ng paggamit ng mga mutational na pagsusuri ng PV na mga pasyente, tulad ng pinalawak na pag-aaral ay ang paggamit ng mga mutational na pagsusuri ng mga pasyente ng PV, ang pinalawak na pagtatasa ng mga mutational na PV. naiiba at hindi gaanong madalas kaysa sa BRCA1/2. Ito ay magbibigay-daan sa pagtukoy at wastong pamamahala sa dumaraming mga paksa sa mas mataas na panganib ng kanser dahil sa genetic mutations.
Kinumpirma namin na ang mga pasyente ay pumirma ng may-kaalamang pahintulot na ilabas ang kanilang mga sample ng tumor nang hindi nagpapakilala para sa mga layunin ng pananaliksik. Ang lahat ng mga pasyente ay pumirma ng nakasulat na may kaalamang pahintulot ayon sa Deklarasyon ng Helsinki. pahintulot sa paggamit ng kanilang data para sa mga layunin ng pananaliksik.
Nagpapasalamat kami kay Prof. Paolo Vigneri sa kanyang tulong sa pangangalaga ng mga pasyente ng kanser sa suso gaya ng hiniling ng Ethics Committee.
Si Federica Martorana ay nag-uulat ng honoraria mula sa Istituto Gentili, Eli Lilly, Novartis, Pfizer. Ang ibang mga may-akda ay nagpahayag na walang mga salungatan ng interes sa gawaing ito.
1. Sung H, Ferlay J, Siegel RL, et al.Global Cancer Statistics 2020: Tinatantya ng GLOBOCAN ang saklaw at dami ng namamatay ng 36 na cancer sa 185 na bansa sa buong mundo.CA Cancer J Clin.2021;71(3):209-249.doi: 10.3222/6caac.3


Oras ng post: Abr-15-2022