Javascript enfim nan navigatè w la kounye a. Gen kèk fonksyonalite sou sit entènèt sa a ki p ap fonksyone lè Javascript enfim.
Enskri avèk detay espesifik ou yo ak medikaman espesifik ki enterese w la, epi n ap mete enfòmasyon ou bay yo an kontak ak atik ki nan baz done nou an epi n ap voye yon kopi PDF ba ou pa imèl touswit.
作者 Stella S, Vitale SR, Martorana F, Massimino M, Pavone G, Lanzafame K, Bianca S, Barone C, Gorgone C, Fichera M, Manzella L
Stefania Stella, 1.2 Silvia Rita Vitale, 1.2 Federica Martorana, 1.2 Michele Massimino, 1.2 Giuliana Pavone, 3 Katia Lanzafame, 3 Sebastiano Bianca, 4 Chiara Barone, 5 Cristina Gorgone, 6 Marco Fichera, 6. 95123, Itali; 2 Sant pou nkoloji eksperimantal ak ematoloji, AOU Policlinico "G.Rodolico - San Marco", Catania , 95123, Itali; 3 Nkoloji Medikal, AOU Policlinico "G. Rodolico - San Marco", Catania, 95123, Itali; 4 Jenetik Medikal, ARNAS Garibaldi, Catania, 95123, Itali; 5 Medsin Jenetik, ASP, Syracuse, 96100, Itali; 6 Depatman Syans Byomedikal ak Byoteknoloji, Inivèsite Catania, Jenetik Medikal, Catania, Itali, 95123; 7Enstiti Rechèch Oasi-IRCCS, Troina, 94018, Itali Kominikasyon: Stefania Stella, tel +39 095 378 1946, imèl [email protected]; [email protected] Objektif: Mitasyon nan liy jèm nan BRCA1 ak BRCA2 ak kansè nan tete (BC) etabli, ova (OC) ak lòt ki asosye avèk yon risk kansè pandan tout lavi. Tès pou jèn BRCA a enpòtan pou evalye risk endividyèl, osi byen ke pou jwenn metòd prevansyon nan moun ki an sante epi adapte tretman nan pasyan kansè yo. Prevalans modifikasyon BRCA1 ak BRCA2 varye anpil atravè rejyon jewografik yo, epi byenke done egziste sou varyant patojèn BRCA nan fanmi sisilyen yo, etid ki vize espesyalman popilasyon nan lès Sicily yo manke. Objektif etid nou an sete envestige ensidans ak distribisyon modifikasyon liy jèm patojèn BRCA nan yon gwoup pasyan BC ki soti nan lès Sicily epi evalye asosyasyon yo ak karakteristik BC espesifik lè l sèvi avèk sekansaj pwochen jenerasyon. Prezans modifikasyon yo te korele avèk degre timè ak endèks pwoliferasyon. REZILTA: An jeneral, 35 pasyan (9%) te gen yon varyant patojèn BRCA, 17 (49%) nan BRCA1 ak 18 (51%) nan BRCA2. Modifikasyon BRCA1 yo répandu nan pasyan BC trip negatif, tandiske mitasyon BRCA2 yo pi komen nan pasyan BC luminal yo. Konpare Avèk moun ki pa t pote kansè nan san an, sijè ki te gen varyant BRCA1 yo te gen yon klas timè ak yon endis proliferatif ki te siyifikativman pi wo. Konklizyon: Rezilta nou yo bay yon apèsi sou estati mitasyon BRCA nan pasyan ki gen kansè nan san ki soti nan lès Sicily epi konfime wòl analiz NGS nan idantifye pasyan ki gen kansè nan san erityè. An jeneral, done sa yo konsistan avèk prèv anvan yo ki sipòte depistaj BRCA pou prevansyon ak tretman kansè ki apwopriye nan moun ki pote mitasyon.
Kansè nan tete (BC) se kansè ki pi komen nan lemonn epi li se kansè ki pi mòtèl lakay fanm.1 Yo te etidye anpil karakteristik byolojik ki detèmine pronostik ak konpòtman klinik BC yo epi yo te eksplike an pati sou tan. Anfèt, kounye a yo itilize plizyè makè sirogasyon pou klase BC nan diferan sou-tip molekilè. Yo se reseptè estwojèn (ER) ak/oswa pwojestewòn (PgR), anplifikasyon reseptè faktè kwasans epidèm imen 2 (HER2), endèks pwoliferasyon Ki-67 ak degre timè (G).2 Konbinezon varyab sa yo te idantifye kategori BC sa yo: 1) Timè luminal, ki montre ekspresyon ER ak/oswa PgR, te reprezante 75% nan BC yo. Yo te divize timè sa yo pi lwen an Luminal A, lè Ki-67 te anba 20% ak HER2 negatif, ak Luminal B, lè Ki-67 te egal a oswa pi wo pase 20% epi an prezans anplifikasyon HER2, kèlkeswa endèks pwoliferasyon an; 2) Timè HER2+ ki negatif pou ER ak PgR men ki montre anplifikasyon HER2. Gwoup sa a reprezante 10% nan tout timè nan tete yo; 3) Kansè nan tete trip negatif (TNBC), ki pa montre ekspresyon ER ak PgR epi anplifikasyon HER2, reprezante anviwon 15% nan kansè nan tete yo.2-4
Pami soutip kansè nan sèvo sa yo, degre timè a ak endèks pwoliferasyon an reprezante byomarkè kwa-seksyonèl ki asosye dirèkteman e endepandamman avèk agresivite ak pronostik timè a.5,6
Anplis karakteristik byolojik nou sot mansyone yo, wòl modifikasyon jenetik eritye ki mennen nan devlopman kansè nan tete (BC) vin pi enpòtan pandan kèk dènye ane yo.7 Anviwon 1 sou 10 timè nan tete eritye akòz modifikasyon nan liy jèm nan jèn espesifik.8 De gwo etid epidemyolojik ki enplike plis pase 180,000 fanm fèk idantifye yon gwoup uit jèn (sa vle di, ATM, BARD1, BRCA1, BRCA2, CHK2, PALB2, RAD51C, ak RAD51D) ki prensipalman responsab pou BC eritye. Pami jèn sa yo, BRCA1 ak BRCA2 (ki refere kòm BRCA1/2 apre sa) te montre korelasyon ki pi fò ak devlopman timè nan tete.9-12 Anfèt, mitasyon jèm BRCA1/2 yo ogmante anpil risk pou BC pandan tout lavi a ansanm ak lòt kansè, tankou kansè nan ovè, pwostat, pankreyas, kolorektal, ak melanom. Soti nan laj 13 rive nan 80 ane, ensidans kimilatif BC a se 72% nan fanm ki gen yon varyant patojèn BRCA1 (PV) ak 69% nan fanm ki gen yon varyant BRCA2. PV.14
Li enpòtan pou note ke yon piblikasyon resan sijere ke risk pou yon kansè nan vant (BC) depann de kalite PV a. Anfèt, konpare ak varyant tronkan patojèn yo, varyant ki pa klè nan jèn BRCA1 la, asosye avèk yon risk redwi pou BC, sitou nan fanm ki pi gran yo.15
Prezans BRCA1 oswa BRCA2 PV te asosye avèk diferan karakteristik byolojik ak klinikopatolojik.16,17 BC ki asosye ak BRCA1 yo gen tandans pou yo klinikman agresif, mal diferansye, epi trè proliferatif. Timè sa yo anjeneral trip negatif epi yo gen yon laj kòmansman bonè. Timè ki rive nan pasyan ki gen mitasyon BRCA2 yo tipikman montre grad modere a byen diferansye ak endis proliferatif varyab. Timè sa yo pi komen nan lumen B epi anjeneral rive nan granmoun aje yo.16-18 Li enpòtan pou note ke mitasyon nan BRCA1 ak BRCA2 ogmante sansiblite a tretman espesifik, tankou sèl platinum ak dwòg sible tankou inibitè poli(ADP-riboz) polimeraz (PARPi).19,20
Pandan kèk dènye ane yo, aplikasyon sekansaj nouvo jenerasyon (NGS) nan pratik klinik la pèmèt yon kantite k ap ogmante nan pasyan BC sibi tès molekilè pou sendwòm sansiblite kansè, tankou BRCA1/2.21 An menm tan, definisyon ki baze sou kritè presi konsènan istwa familyal, demografik, ak karakteristik klinikopatolojik pou pi byen idantifye moun ki merite tès BRCA1/2.22,23 Nan kontèks sa a, prèv yo ap akimile sou depistaj BRCA1/2 nan popilasyon espesifik, mete aksan sou diferans ki genyen ant rejyon jewografik yo.24–27 Malgre ke gen rapò sou gwoup BC nan lwès Sicily, mwens done disponib sou depistaj BRCA1/2 nan popilasyon lès Sicily la.28,29
Nou dekri isit la rezilta depistaj jèn BRCA1/2 nan pasyan ki gen kansè nan lès Sicily, epi nou korele prezans mitasyon BRCA1 oswa BRCA2 ak prensipal karakteristik klinikopatolojik timè sa yo.
Yo te fè yon etid retrospektiv nan "Sant pou Onkoloji Eksperimantal ak Ematoloji" nan Lopital Policlinico Rodolico - San Marco nan Catania. Soti janvye 2017 rive mas 2021, yo te refere yon total 455 pasyan ki gen kansè nan tete ak nan ovè, melanom, pankreyas oswa pwostat nan laboratwa dyagnostik molekilè nou an pou tès jenetik BRCA/2. Yo te fè etid sa a an akò avèk Deklarasyon Helsinki a, epi tout patisipan yo te bay konsantman enfòme alekri anvan analiz molekilè a.
Yo te evalye karakteristik istolojik ak byolojik (ER, PgR, estati HER2, Ki-67, ak klas) nan kansè nan san (BC) yo sou byopsi debaz oswa echantiyon chirijikal, yo te konsidere sèlman konpozan timè agresif yo. Baze sou karakteristik sa yo, yo te klase BC yo jan sa a: luminal A (ER+ ak/oswa PgR+, HER2-, Ki-67<20%), luminal B (ER+ ak/oswa PgR+, HER2-, Ki-67≥20%), luminal B-HER2+ (ER ak/oswa PgR+, HER2+), HER2+ (ER ak PgR-, HER2+) oswa trip negatif (ER ak PgR-, HER2-).
Anvan yo te evalye estati mitasyon BRCA1 ak BRCA2 a, yon ekip miltidisiplinè ki gen ladan yon onkològ, yon jenetisyen, ak yon sikològ te fè yon konsiltasyon jenetik timè pou chak pasyan pou detèmine prezans BRCA1 ak/oswa BRCA1. oubyen moun ki gen yon gwo risk pou PV nan jèn BRCA2 la. Seleksyon pasyan yo te fèt dapre direktiv Sosyete Italyen Onkoloji Medikal (AIOM) ak rekòmandasyon lokal Sisilyen yo.30,31 Kritè sa yo enkli: (i) istwa familyal varyant patojèn li te ye nan jèn sansiblite (pa egzanp, BRCA1, BRCA2, TP53, PTEN); (ii) gason ki gen kansè nan vant; (iii) moun ki gen kansè nan vant ak kansè okilè (CO); (iv) fanm ki gen kansè nan vant <36 ane, kansè nan vant transfobik (TNBC) <60 ane, oubyen kansè bilateral <50 ane; (v) istwa medikal pèsonèl kansè nan vant <50 ane ak omwen yon fanmi premye degre: (a) kansè nan vant <50 ane; (b) CO ki pa mukine e ki pa limitwòf nan nenpòt laj; (c) kansè bilateral; (d) kansè nan vant gason; (e) kansè nan pankreyas; (f) kansè pwostat; (vi) de oswa plis Istwa pèsonèl kansè nan kansè nan pwostat (BC) > 50 ane ak istwa familyal kansè nan BC, kansè nan kò (CO), oswa kansè nan pankreyas pou fanmi ki se fanmi premye degre youn ak lòt (ki gen ladan fanmi ak ki moun li se fanmi premye degre); (vii) Istwa pèsonèl kansè nan kò (CO) ak omwen yon fanmi premye degre: (a) BC <50 ane; (b) kansè nan kò (NOC); (c) BC bilateral; (d) BC gason; (vii) fi ki gen kansè nan kò serèz wo grad.
Yo te pran yon echantiyon san periferik 20 mL nan chak pasyan epi yo te kolekte l nan tib EDTA (BD Biosciences). Yo te izole ADN jenomik la nan 0.7 mL echantiyon san konplè lè l sèvi avèk kit Izolasyon QIAsymphony DSP DNA Midi a (QIAGEN, Hilden, Itali) dapre enstriksyon manifakti a epi yo te pase l nan yon Fluorometer Qubit® 3.0 (Thermo Fisher Scientific, Waltham, MA, Etazini). Yo te fè kantifikasyon an. Anrichisman sib ak preparasyon bibliyotèk yo fèt pa Oncomine™ BRCA Research Assay Chef la, pare pou chaje nan Ion AmpliSeq™ Chef Reagents DL8 Kit la pou preparasyon bibliyotèk otomatik dapre enstriksyon manifakti a. Kit la gen ladan l de pisin primer PCR miltiplex ki ka itilize pou etidye tout jèn BRCA1 (NM_007300.3) ak BRCA2 (NM_000059.3). An brèf, yo te ajoute 15 µL nan chak ADN echantiyon dilye (10 ng) nan plak ki gen kòd bar pou preparasyon bibliyotèk la epi yo te chaje tout reyaktif ak konsomab yo sou enstriman Ion Chef™ la. Apre sa, yo te fè preparasyon bibliyotèk otomatik ak rasanbleman bibliyotèk echantiyon ki gen kòd bar sou enstriman Ion Chef™ la. Apre sa, yo te evalye kantite bibliyotèk prepare yo pa yon Fluorometer Qubit® 3.0 (Thermo Fisher Scientific, Waltham, MA, USA) dapre enstriksyon manifakti a. Finalman, yo konbine bibliyotèk yo nan rapò ekimolè nan tib echantiyon bibliyotèk Ion Chef™ (tib ki gen kòd bar) epi yo chaje yo. sou enstriman Ion Chef™ lan. Sekans lan te fèt lè l sèvi avèk yon enstriman Ion Torrent S5 (Thermo Fisher Scientific) (Thermo Fisher Scientific) ki te itilize yon chip Ion 510 (Thermo Fisher Scientific). Analiz done yo te fèt ak Amplicon Suite (SmartSeq srl) ak lojisyèl Ion Reporter.
Tout nomenklatur varyant yo te swiv direktiv aktyèl Konsòsyòm Varyasyon Jenòm Imèn nan, ki disponib sou entènèt (HGVS, http://www.hgvs.org/mutnomen). Yo te defini siyifikasyon klinik varyant BRCA1/2 yo lè l sèvi avèk klasifikasyon Konsòsyòm Entènasyonal ENIGMA a (Rezo ki baze sou prèv pou entèprete alèl mutan jèm yo, https://enigmaconsortium.org/) epi konsilte diferan baz done tankou ARUP, BRCAEXCHANGE, ClinVar, IARC_LOVD, ak UMD. Klasifikasyon an gen ladan senk kategori risk distenk: benin (kategori I), pwobableman benin (kategori II), varyant ki gen siyifikasyon ensèten (VUS, kategori III), pwobableman patojèn (kategori IV), ak patojèn (kategori V). VarSome te analize tou efè mitasyon yo sou estrikti ak fonksyon pwoteyin, yon zouti enfòmatif ki gen aksè a 30 baz done.32
Pou bay chak VUS yon siyifikasyon klinik potansyèl, yo te itilize algoritm prediksyon pwoteyin konpitasyonèl sa yo: MUTATION TASTER, 33 PROVEAN-SIFT (http://provean.jcvi.org/index.php), POLYPHEN-2 (http:// /genetics.bwh.harvard.edu/pph2/) ak Align-GVGD (http://agvgd.hci.utah.edu/agvgd_input.php). Varyant ki klase kòm klas 1 ak 2 yo te konsidere kòm tip sovaj.
Sekansaj Sanger la te konfime prezans chak varyant patojèn. An brèf, yo te desine yon pè amorseur espesifik pou chak varyant detekte lè l sèvi avèk sekans referans jèn BRCA1 ak BRCA2 yo (NG_005905.2, NM_007294.3 ak NG_012772.3, NM_000059.3, respektivman). Se poutèt sa, yo te fè PCR siblé ki te swiv pa sekansaj Sanger.
Pasyan ki te teste negatif pou jèn BRCA1/2 a te sibi tès anplifikasyon sond depandan sou ligasyon miltiplèks (MLPA) dapre enstriksyon manifakti a pou evalye prezans gwo rearanjman jenomik (LGR). An brèf, echantiyon ADN yo denatire epi yo itilize jiska 60 sond espesifik pou jèn BRCA1 ak BRCA2, chak detekte yon sekans ADN espesifik apeprè 60 nikleyotid nan longè. Pwodwi anplifikasyon sond yo, ki konpoze de yon seri inik anplikon PCR, te analize pa elektwoforèz kapilè ak pa lojisyèl Cofalyser.Net ansanm ak tablo Cofalyser espesifik pou pakèt ki apwopriye yo (www.mrcholland.com).
Yo te asosye varyab klinikopatolojik yo chwazi (klas istolojik ak endis pwoliferasyon Ki-67%) ak prezans BRCA1/2 PV, kalkile lè l sèvi avèk lojisyèl Prism v. 8.4 la lè l sèvi avèk tès egzak Fisher a sipoze ke valè p <0.05 siyifikatif.
Ant janvye 2017 ak mas 2021, yo te fè tès depistaj sou 455 pasyan pou mitasyon BRCA1/2 nan liy jèn lan. Yo te fè tès mitasyon nan Sant Onkoloji Eksperimantal ak Ematoloji Lopital Policlinico a. Selon gid Sisilyen an (http://www.gurs.regione.sicilia.it/Indicep1.htm, N. 02-Vannen 10 Janvye 2020), nan Rodolico Catania – San Marco, an total, te gen 389 pasyan ki te gen kansè nan tete, 37 kansè nan ovè, 16 kansè nan pankreyas, 8 kansè nan pwostat ak 5 melanom. Distribisyon pasyan yo selon kalite kansè ak rezilta analiz yo montre nan Figi 1.
Figi 1 montre yon òganigram ki montre yon apèsi sou etid la. Pasyan ki gen timè nan tete, melanom, pankreyas, pwostat, oswa ovè yo te fè tès pou mitasyon nan jèn BRCA1 ak BRCA2 yo.
Abrevyasyon: PVs, varyant patojèn; VUS, varyant ki gen siyifikasyon ensèten; WT, sekans BRCA1/2 tip sovaj.
Nou te konsantre etid nou yo ak anpil atansyon sou gwoup moun ki gen kansè nan tete. Pasyan yo te gen yon laj medyàn 49 ane (ant 23-89) epi yo te majoritaireman fi (n=376, oubyen 97%).
Nan sijè sa yo, 64 (17%) te gen mitasyon BRCA1/2 epi yo tout te fi. Trannsenk (9%) te gen PV epi 29 (7.5%) te gen VUS. Disèt (48.6%) nan 35 varyant patojèn yo te rive nan BRCA1 ak 18 (51.4%) nan BRCA2, pandan ke 5 VUS te rive nan BRCA1 (17.2%) ak 24 (82.8%) nan BRCA2 (Figi 1 ak 2). LGR pa te prezan nan analiz MLPA a.
Figi 2. Analiz mitasyon BRCA1 ak BRCA2 nan 389 pasyan kansè nan tete. (A) Distribisyon varyant patojèn (PV) (wouj), varyant ki gen siyifikasyon ensèten (VUS) (zoranj), ak WT (ble) nan 389 pasyan kansè nan tete; (B) 389 pasyan kansè nan tete Trannsenk (9%) te gen varyant patojèn (PV) BRCA1/2. Pami yo, 17 (48.6%) te pòtè BRCA1 PV (wouj fonse) ak 18 (51.4%) te pòtè BRCA2 (wouj pal); (C) 29 (7.5%) nan 389 sijè yo te pote VUS, 5 (17.2%) jèn BRCA1 (zoranj fonse) ak 24 (82.8%) jèn BRCA2 (zoranj pal).
Abrevyasyon: PVs, varyant patojèn; VUS, varyant ki gen siyifikasyon ensèten; WT, sekans BRCA1/2 tip sovaj.
Apre sa, nou te envestige prevalans soutip molekilè BC yo nan pasyan ki gen BRCA1/2 PV. Distribisyon an te gen ladan 2 (5.7%) luminal A, 15 (42.9%) luminal B, 3 (8.6%) luminal B-HER2+, 2 (5.7%) HER2+ ak 13 (37.1%) pasyan TNBC. Pami pasyan BRCA1-pozitif yo, 5 (29.4%) te gen BC luminal B, 2 (11.8%) te gen maladi HER2+, epi 10 (58.8%) te gen TNBC. Timè san mitasyon BRCA1 yo te swa luminal A oswa luminal B-HER2+ (Figi 3). Nan sougwoup BRCA2-pozitif la, 10 (55.6%) timè te luminal B, 3 (16.7%) te luminal B-HER2+, 3 (16.7%) TNBC ak 2 (11.1%) te luminal A (Figi 3). Pa t gen okenn timè HER2+ nan gwoup sa a. Kidonk, mitasyon BRCA1 yo répandu nan pasyan ki gen TNBC, alòske modifikasyon BRCA2 yo predominan nan moun ki gen lumen B.
Figi 3 Prevalans soutip kansè nan tete nan pasyan ki gen varyant patojèn nan BRCA1 ak BRCA2. Istogram ki montre distribisyon PV BRCA1- (wouj fonse) ak BRCA2- (wouj pal) pami soutip molekilè pasyan ki gen kansè nan tete. Chif ki rapòte nan chak kare reprezante pousantaj pasyan ki gen PV BRCA1 ak BRCA2 pou chak soutip kansè nan tete.
Abrevyasyon: PV, varyant patojèn; HER2+, reseptè faktè kwasans epidèm imen 2 pozitif; TNBC, kansè nan tete trip negatif.
Apre sa, nou te evalye kalite ak lokalizasyon jèn PV BRCA1 ak BRCA2 yo. Nan PV BRCA1 yo, nou te obsève 7 varyant mononikleotid (SNV), 6 sipresyon, 3 diplikasyon ak 1 ensèsyon. Se yon sèl mitasyon (c.5522delG) ki reprezante yon nouvo dekouvèt. PV BRCA1 ki pi komen yo te detekte nan tou de sijè yo se te c.5035_5039delCTAAT. Modifikasyon sa a enplike yon sipresyon senk nikleotid (CTAAT) nan ègzon 15 BRCA1, sa ki lakòz sibstitisyon asid amine lesin lan pa tirozin nan kodon 1679, e akòz yon chanjman kad tradiksyon ak yon kodon stop altènatif prevwa mennen nan yon tronkasyon pwoteyin twò bonè. Tout lòt chanjman yo detekte nan yon sèl ka. Li enpòtan pou note ke youn nan PV yo rapòte yo te lokalize nan rejyon konsansis sit épissage a (c.4357+1G>T) (Tablo 1).
Konsènan BRCA2 PV, nou obsève 6 sipresyon, 6 SNV ak 2 diplikasyon. Okenn nan chanjman yo jwenn yo pa nouvo. Twa mitasyon te repwodui nan popilasyon nou an, c.428dup ak c.8487+1G>A obsève nan 3 sijè, ki te swiv pa c.5851_5854delAGTT rekipere nan de ka. Modifikasyon c.428dup la enplike yon repetisyon C nan ègzon 5 nan BRCA2, ki prevwa pou kode yon pwoteyin tronke, ki pa fonksyonèl. Mitasyon c.8487+1G>A a rive nan rejyon entwonik nan ègzon 19 BRCA2 (± 1,2) epi li afekte sekans konsansis épissage a, sa ki lakòz yon épissage modifye ki lakòz yon pwoteyin anòmal oswa absan. Varyan patojèn c.5851_5854delAGTT a se akòz yon sipresyon 4-nikleotid nan pozisyon nikleotid 5851 a 5854 nan ègzon kodaj 10 nan jèn BRCA2 la epi li lakòz yon chanjman kad tradiksyonèl ak yon kodon stop altènatif prevwa (p.S1951WfsTer). Li enpòtan pou note, jan yo te rapòte deja, tou de chanjman c.631G>A ak c.7008-2A>T yo te detekte nan menm pasyan an.34 Premye mitasyon an enplike ranplasman adenozin (A) nan ègzon 7 BRCA2 ak yon nikleotid ki gen guanin (G) sa ki lakòz yon chanjman valin an izolesin nan kodon 211, asid amine izolesin se yon asid amine ki gen pwopriyete ki sanble anpil. Chanjman sa a afekte épissage ARNm nòmal la. Dezyèm varyant lan sitiye nan yon rejyon entwonik epi li lakòz yon sibstitisyon doub A an timin (T) anvan ègzon 13 nan jèn ki kode BRCA2 a. Chanjman c.7008-2A>T a ka jenere plizyè transkripsyon ki gen diferan longè. Anplis de sa, nan gwoup PV BRCA2 yo, 4 sou 18 chanjman (22.2%) te entwonik.
Apre sa, nou te trase mitasyon danjere BRCA1/2 yo nan domèn fonksyonèl ak rejyon ki mare pwoteyin (Fig. 4). Nan jèn BRCA1 la, 50% nan PV yo te sitiye nan rejyon gwoup kansè nan tete (BCCR), alòske 22% nan mitasyon yo te sitiye nan rejyon gwoup kansè nan ovè (OCCR) (Fig. 4A). Nan PV BRCA2, 35.7% nan varyant yo te sitiye nan rejyon BCCR a epi 42.8% nan mitasyon yo te sitiye nan OCCR a (Fig. 4B). Apre sa, nou te evalye kote PV a ye nan domèn pwoteyin BRCA1 ak BRCA2 yo. Pou pwoteyin BRCA1 la, nou te jwenn twa PV nan domèn bouk ak bobin espiral yo, ak de mitasyon nan domèn BRCT a (Fig. 4A). Pou pwoteyin BRCA2 la, 4 PV te trase nan domèn repetisyon BRC a, alòske 3 chanjman entwonik ak 3 chanjman ekzonik yo te detekte nan domèn ki mare oligo/oligosakarid (OB) ak domèn ki mare tou (T) yo (Figi 4B).
Figi 4 Reprezantasyon eskematik pwoteyin BRCA1 ak BRCA2 yo ak lokalizasyon varyant patojèn yo. Figi sa a montre distribisyon varyant patojèn BRCA1 (A) ak BRCA2 (B) nan pasyan ki gen kansè nan tete. Mitasyon ekzonik yo montre an ble, alòske varyant entwonik yo montre an zoranj. Wotè ba a reprezante kantite ka yo. Pwoteyin BRCA1 ak BRCA2 yo ak domèn fonksyonèl yo rapòte. (A) Pwoteyin BRCA1 la gen yon domèn bouk (RING) ak yon sekans lokalizasyon nikleyè (NLS), yon domèn bobin-bobin, yon domèn gwoupman SQ/TQ (SCD), ak yon domèn C-tèminal BRCA1 (BRCT). (B) Pwoteyin BRCA2 la gen uit repetisyon BRC, yon domèn ki mare ADN ak yon domèn elikoid (Helical), twa pli ki mare oligonikleotid/oligosakarid (OB), yon domèn tou (T), ak yon NLS sou bò C a. Zòn yo rele Rejyon Gwoupman Kansè nan Tete (BCCR) ak Rejyon Gwoupman Kansè nan Ovè (OCCR) yo montre anba a. *Reprezante mitasyon ki detèmine kodon stop yo.
Apre sa, nou te envestige karakteristik klinikopatolojik kansè nan vant ki ta ka gen korelasyon ak prezans PV BRCA1/2. Dosye klinik konplè te disponib pou 181 pasyan BRCA1/2-negatif (ki pa pòtè) ak tout pòtè yo (n = 35). Te gen yon korelasyon ant to pwopagasyon timè a ak klas la.
Nou kalkile distribisyon Ki-67 la baze sou medyàn gwoup nou an (25%, entèval <10-90%). Moun ki gen Ki-67 < 25% te defini kòm "Ki-67 ki ba", alòske moun ki gen valè ≥ 25% te konsidere kòm "Ki-67 ki wo". Nou te jwenn diferans siyifikatif nan Ki-67 (p<0.01) ant moun ki pa pote BRCA1 PV ak moun ki pote BRCA1 PV (Fig. 5A).
Figi 5 Korelasyon Ki-67 ak distribisyon grad nan fanm ki gen kansè nan tete ki gen ak ki pa gen PV BRCA1 ak BRCA2.(A) Boxplot ki montre valè medyàn Ki-67 nan 181 pasyan kansè nan tete ki pa pòtè kont pasyan PV BRCA1 (18) oswa BRCA2 (17). Valè P ki anba 0.5 yo te konsidere kòm estatistikman siyifikatif.(B) Istogram ki reprezante plasman pasyan kansè nan tete nan gwoup grad istolojik (G2 ak G3) selon estati mitasyon BRCA1 ak BRCA2 (sijè WT, pòtè PV BRCA1 ak BRCA2).
Menm jan an tou, nou te egzamine si klas timè a te gen korelasyon ak prezans BRCA1/2 PV. Piske G1 BC te absan nan popilasyon nou an, nou te divize pasyan yo an de gwoup (G2 oswa G3). An akò ak rezilta Ki-67 yo, analiz la te revele yon korelasyon estatistikman siyifikatif ant klas timè a ak mitasyon BRCA1, ak yon pi gwo pwopòsyon timè G3 nan moun ki pote BRCA1 konpare ak moun ki pa pote (p<0.005) (Figi 5B).
Pwogrè nan teknoloji sekansaj ADN pèmèt pwogrè san parèy nan tès jenetik BRCA1/2, ak enplikasyon enpòtan pou pasyan ki gen yon istwa kansè nan fanmi yo. Jiska prezan, yo idantifye epi klase apeprè 20.000 varyant BRCA1/2 dapre Sosyete Ameriken pou Jenetik Medikal 35 ak sistèm ENIGMA a.35,36 Li byen koni ke spectre mitasyon BRCA1/2 a varye anpil selon rejyon jewografik yo.37 Nan peyi Itali, to PV BRCA1/2 yo te varye ant 8% ak 37%, sa ki montre yon gwo varyabilite andedan peyi a.38,39 Avèk yon popilasyon prèske 5 milyon moun, Sicily se senkyèm pi gwo rejyon nan peyi Itali an tèm de kantite moun ki rete. Malgre ke done egziste sou distribisyon BRCA1/2 nan lwès Sicily, pa gen okenn prèv konplè nan pati lès zile a.
Etid nou an se youn nan premye rapò sou ensidans BRCA1/2 PV nan pasyan ki gen kansè nan lès Sicily.28 Nou te konsantre analiz nou an sou kansè nan, paske sa a se maladi ki pi komen nan gwoup nou an.
Lè yo t ap teste 389 pasyan ki te gen kansè nan tete (BC), 9% te gen PV BRCA1/2, distribye egalman ant BRCA1 ak BRCA2. Rezilta sa yo konsistan avèk sa yo te rapòte deja nan popilasyon Italyen an.28 Sa ki enteresan, 3% (13/389) nan gwoup nou an te gason. Pousantaj sa a pi wo pase sa yo te espere pou kansè nan tete gason (1% nan tout BC yo),40 sa ki reflete seleksyon popilasyon nou yo ki baze sou risk mitasyon BRCA1/2. Sepandan, okenn nan mesye sa yo pa t devlope yon PV BRCA1/2, kidonk yo te kandida pou plis analiz molekilè pou elimine prezans mitasyon mwens komen tankou PALB2, RAD51C ak D, pami lòt moun. Varyan ki gen siyifikasyon ensèten yo te jwenn nan 7% nan sijè yo kote BRCA2 VUS te evidan. Menm rezilta sa a konsistan avèk prèv ki te egziste deja.28,41,42
Lè nou te analize distribisyon soutip molekilè BC nan fanm ki gen mutasyon BRCA1/2 yo, nou te konfime asosyasyon li te ye ant TNBC ak BRCA1 PV (58.8%) ak ant BC luminal B ak BRCA2 PV (55.6%).16,43 Timè luminal A ak HER2+ nan moun ki pote BRCA1 ak BRCA2 PV yo konsistan avèk done literati ki deja egziste yo.16,43
Apre sa, nou konsantre sou kalite ak kote PV BRCA1/2 la. Nan gwoup nou an, PV BRCA1 ki pi komen an se te c.5035_5039delCTAAT. Malgre ke Incorvaia et al. pa t dekri varyant sa a nan gwoup Sisilyen yo a, gen lòt otè ki rapòte li kòm yon PV BRCA1 nan liy jèn lan.34 Yo te jwenn plizyè PV BRCA1 nan gwoup nou an – pa egzanp c.181T>G, c.514del, c.3253dupA ak c.5266dupC – ki te obsève nan Sicily.28 Nan sa yo, de mitasyon fondatè BRCA1 (c.181T>G ak c.5266dupC) yo souvan jwenn nan jwif Ashkenazi nan Ewòp de Lès ak Santral (Polòy, Tchèk), Slovenyen, Otrichyen, Ongwa, Belarisyen ak Alman), 44,45 epi, Ozetazini ak Ajantin, yo te defini li dènyèman kòm yon "varyant nan liy jèn rekiran" nan pasyan italyen ki gen BC ak OC. Yo te idantifye varyant 34c.514del la deja nan 8 pasyan kansè nan tete ki soti nan nò Sicily nan Palermo ak Messina. Sa ki enteresan, menm Incorvaia et al. yo te jwenn varyant c.3253dupA a nan kèk fanmi nan Catania.28 PV BRCA2 ki pi reprezantatif yo se c.428dup, c.5851_5854delAGTT ak varyant entwonik c.8487+1G>A a, ki te rapòte an plis detay 28 nan yon pasyan nan Palermo ak c.428dup, c.5851_5854delAGTT PV te obsève nan kay nan nòdwès Sicily, sitou nan rejyon Trapani ak Palermo, tandiske c.5851_5854delAGTT PV te obsève nan kay nan nòdwès Sicily. Varyant 8487+1G>A a te pi komen nan sijè ki soti Messina, Palermo, ak Caltanissetta.28 Rebbeck et al. deja dekri modifikasyon c.5851_5854delAGTT nan Kolonbi.37 Yon lòt BRCA2 PV, c.631+1G>A, yo te jwenn nan pasyan BC ak OC ki soti nan Sicily (Agrigento, Siracusa ak Ragusa).28 Li enpòtan pou note ke nou te obsève koegzistans de varyant BRCA2 (BRCA2 c.631G>A ak c.7008-2A>T) nan menm pasyan an, ke nou te sipoze separe nan mòd cis, jan yo te rapòte deja konsa.34,46 Mitasyon BRCA2 sa yo souvan obsève nan rejyon Italyen an epi yo te jwenn ke yo entwodui kodon stop twò bonè, ki afekte épissage ARN mesaje a epi ki lakòz pwoteyin BRCA2 la echwe.47,48
Nou te trase tou PV BRCA1 ak BRCA2 nan rejyon OCCR ak BCCR swadizan nan domèn pwoteyin ak jèn yo. Rebbeck et al. te dekri rejyon sa yo kòm zòn risk pou devlope kansè nan ovè ak nan tete, respektivman.49 Sepandan, prèv konsènan asosyasyon ki genyen ant kote varyant liy jèn yo ak risk kansè nan tete oswa nan ovè rete kontwovèse.28,50-52 Nan ​​popilasyon nou an, PV BRCA1 yo te sitou sitiye nan rejyon BCCR a, tandiske PV BRCA2 yo te sitou sitiye nan rejyon OCCR a. Sepandan, nou pa t kapab jwenn okenn asosyasyon ant rejyon OCCR ak BCCR swadizan yo ak karakteristik BC yo. Sa ka akòz kantite limite pasyan ki gen mitasyon BRCA1/2 yo. Nan yon pèspektiv domèn pwoteyin, PV BRCA1 yo distribye sou tout pwoteyin nan, epi modifikasyon BRCA2 yo jwenn preferansyèlman nan domèn repetisyon BRC a.
Finalman, nou te korele karakteristik klinikopatolojik BC ak BRCA1/2 PV. Akòz kantite limite pasyan ki te enkli yo, nou sèlman jwenn yon korelasyon siyifikatif ant Ki-67 ak klas timè a. Malgre ke evalyasyon ak entèpretasyon Ki-67 la rete yon ti jan kontwovèsyal, li sèten ke gwo pousantaj pwoliferatif yo asosye avèk yon risk ogmante pou maladi a reprann epi yon diminisyon nan siviv. Jiska prezan, papòt pou distenge ant Ki-67 "wo" ak "ba" se 20%. Sepandan, papòt sa a pa aplike pou popilasyon pasyan ki gen mitasyon BRCA1/2 nou an, ki gen yon valè medyàn Ki-67 de 25%. Tandans sa a nan gwo pousantaj Ki-67 yo ka eksplike pa prevalans nan gwoup limyè B ak TNBC nou yo, kote te gen kèk timè limyè A. Sepandan, gen kèk prèv ki sanble sijere ke yon papòt Ki-67 ki pi wo (25-30%) ka pi byen stratifye pasyan yo selon pronostik yo.53,54 Apati rezilta analiz nou an, yon korelasyon siyifikatif pa etonan. Li rive ant gwo pousantaj Ki-67 ak klas yo ak prezans BRCA1 PV. Anfèt, timè ki gen rapò ak BRCA1 yo tipik nan TNBC epi yo montre karakteristik ki pi agresif.16,17
An konklizyon, etid sa a bay yon rapò sou estati mitasyon BRCA1/2 nan yon gwoup kansè nan sèvo ki soti nan lès Sicily. An jeneral, rezilta nou yo konsistan avèk prèv ki egziste deja, ni an tèm de prevalans mitasyon ni an tèm de karakteristik klinikopatolojik nan kansè nan sèvo. Plis etid nan pi gwo popilasyon pasyan ki gen kansè nan sèvo ki gen mutasyon BRCA1/2, tankou itilizasyon analiz mitasyon elaji miltijenòm, yo jistifye pou evalye prezans PV ki diferan e mwens souvan pase BRCA1/2. Sa ap pèmèt idantifikasyon ak jesyon apwopriye kantite k ap ogmante nan sijè ki gen plis risk pou yo gen kansè akòz mitasyon jenetik.
Nou te konfime ke pasyan yo te siyen konsantman enfòme pou yo te ka lage echantiyon timè yo anonimman pou rezon rechèch. Tout pasyan yo te siyen konsantman enfòme alekri dapre Deklarasyon Helsinki a. Dapre règleman AOU Policlinico "G. Rodolico - S. Marco", etid sa a te egzante de revizyon etik paske analiz BRCA1/2 a te fèt dapre pratik klinik la epi tout pasyan yo te bay konsantman enfòme alekri. Pasyan yo bay konsantman tou pou yo itilize done yo pou rezon rechèch.
Nou remèsye Pwofesè Paolo Vigneri pou èd li nan swen pasyan kansè nan tete jan Komite Etik la te mande a.
Federica Martorana rapòte onorè nan men Istituto Gentili, Eli Lilly, Novartis, Pfizer. Lòt otè yo deklare pa gen okenn konfli enterè nan travay sa a.
1. Sung H, Ferlay J, Siegel RL, et al. Estatistik Kansè Mondyal 2020: GLOBOCAN estime ensidans ak mòtalite 36 kansè nan 185 peyi atravè lemond. CA Cancer J Clin. 2021;71(3):209-249. doi: 10.3322/caac.21660