א דאנק פארן באזוכן Nature.com. די בראַוזער ווערסיע וואָס איר ניצט האט באַגרענעצטע CSS שטיצע. פֿאַר די בעסטע דערפאַרונג, מיר רעקאָמענדירן אַז איר ניצט אַן דערהייַנטיקטן בראַוזער (אָדער דיאַקטיווירט קאָמפּאַטיביליטי מאָדע אין אינטערנעט עקספּלאָרער). אין דער דערווייל, צו ענשור ווייטערדיקע שטיצע, וועלן מיר רענדערן דעם וועבזייטל אָן סטילן און דזשאַוואַסקריפּט.
אַנגוסטיפאָליוס לופּין (NLL, Lupinus angustifolius L.) איז אַ לעגומינע פלאַנץ געניצט פֿאַר עסן פּראָדוקציע און באָדן פֿאַרבעסערונג. די גלאָבאַלע יקספּאַנשאַן פון NLL ווי אַ גערעטעניש האט צוגעצויגן פילע פּאַטאַדזשעניק פונגי, אַרייַנגערעכנט לופּין אַנטראַקאָזע, וואָס פאַרשאַפן די שרעקלעך אַנטראַקאָזע קראַנקייט. צוויי אַלעלס, Lanr1 און AnMan, וואָס געבן געוואקסן קעגנשטעל, זענען געניצט אין NLL ברידינג, אָבער די אַנדערלייינג מאָלעקולאַר מעקאַניזאַמז בלייבן אומבאַקאַנט. אין דעם לערנען, די Lanr1 און AnMan מאַרקערס זענען געניצט צו סקרינען אייראָפּעיִשע NLL סאַמפּאַלז. טעסטינג פון די וואַקסינע אין אַ קאַנטראָולד סוויווע באשטעטיקט די עפעקטיווקייַט פון ביידע קעגנשטעליק דאָנאָרס. דיפערענטשאַל דזשין עקספּרעססיאָן פּראָופיילינג איז דורכגעפירט אויף רעפּרעזענטאַטיוו קעגנשטעליק און סאַסעפּטאַבאַל שורות. אַנטראַקאָזע קעגנשטעל איז געווען פֿאַרבונדן מיט אָוווערעקספּרעססיאָן פון די דזשין אָנטאָלאָגי טערמינען "GO:0006952 Defense Response", "GO:0055114 Redox Process", און "GO:0015979 Photosynthesis". דערצו, די Lanr1(83A:476) ליניע האט געוויזן באדייטנדיקע טראַנסקריפּטאָם רעפּראָגראַמירן שנעל נאָך ינאָקולאַציע, בשעת די אנדערע ליניעס האבן געוויזן אַ פאַרהאַלטונג אין דעם ענטפער מיט אַרום 42 שעה. פארטיידיקונג רעאַקציעס זענען פארבונדן מיט די TIR-NBS, CC-NBS-LRR און NBS-LRR גענעס, 10 פּראָטעאינען ינוואַלווד אין פּאַטאָגענעסיס, ליפּיד אַריבערפירן פּראָטעאינען, ענדאָגלוקאַן-1,3-β-גלוקאָסידאַסע, גליצין-רייַך צעל וואַנט פּראָטעאינען, און גענעס פון רעאַקטיוו וועג פון זויערשטאָף. פרי רעאַקציעס צו 83A:476, אַרייַנגערעכנט אָפּגעהיט סאַפּרעשאַן פון גענעס פארבונדן מיט פאָטאָסינטעז, קאָואַנסיידאַד מיט געראָטן שוץ בעשאַס די וועגעטאַטיווע וווּקס פאַסע פון ​​פונגאַל ביאָלאָגי, סאַגדזשעסטיד אַז אַן עפעקטאָר טריגערז ימיונאַטי. די מאַנדעלופּ רעאַקציע איז פאַרלאַנגזאַמט, ווי אויך די קוילעלדיק האָריזאָנטאַל שלעפּן.
די שמאָל-בלעטעריגע לופּין (NLL, Lupinus angustifolius L.) איז אַ הויך-פּראָטעין תבואה וואָס שטאַמט פֿון דער מערב מיטלענדישער געגנט1,2. זי ווערט היינט געוואַקסן ווי אַ עסן-גערעטעניש פֿאַר חיות און מענטשן. זי ווערט אויך באַטראַכט ווי גרינע מיסט אין גערעטעניש-ראָוטאַציע סיסטעמען צוליב נייטראָגען-פֿיקסאַציע דורך סימביאָטישע נייטראָגען-פֿיקסירנדיקע באַקטעריעס און דער אַלגעמיינער פֿאַרבעסערונג פֿון דער באָדן-סטרוקטור. NLL האָט דורכגעמאַכט אַ שנעלן פּראָצעס פֿון דאָמעסטיקאַציע אין די לעצטע יאָרהונדערט און איז נאָך אַלץ אונטער אַ הויכן ברידינג-דרוק3,4,5,6,7,8,9,10,11,12. מיט דער ברייטער קולטיוואַציע פֿון NLL, האָט די סוקסעסיע פֿון פּאַטאָגענע שוואָמען אַנטוויקלט נייע לאַנדווירטשאַפטלעכע נישעס און געפֿירט צו נייע גערעטעניש-פֿאַרניכטנדיקע קראַנקייטן. דאָס מערקווירדיקסטע פֿאַר לופּין פאַרמערס און ברידערס איז געווען די אויפֿטרעטונג פֿון אַנטראַקאָזע, פֿאַראורזאַכט דורך דעם פּאַטאָגענעם שוואָם, Colletotrichum lupini (באָנדאַר) נירענבערג, פיילער און האַגעדאָרן13. דאָס מערקווירדיקסטע פֿאַר לופּין פאַרמערס און ברידערס איז געווען די אויפֿטרעטונג פֿון אַנטראַקאָזע, פֿאַראורזאַכט דורך דעם פּאַטאָגענעם שוואָם, Colletotrichum lupini (באָנדאַר) נירענבערג, פיילער און האַגעדאָרן13. Наиболее примечательным для фермеров и селекционеров люпина было появление антракноза, вызванного патогионго патогиного (באנדאר ) נירענבערג , פעילער & האגעדאָרן 13 . מערסט באַמערקעוודיק פֿאַר לופּין פאַרמערס און ברידערס איז געווען די אויפֿקומען פֿון אַנטראַקאָזע געפֿירט דורך דעם פּאַטאַגעניק פונגוס קאָללעטאָטריטשום לופּיני (באָנדאַר) נירענבערג, פיילער און האַגעדאָרן13.对于羽扇豆农民和饲养者来说，最引人注目的是炭疽病的出现，它是由県它是由県(באָנדאַר) Nirenberg, Feiler & Hagedorn13 引起的.对于羽扇豆农民和饲养者来说，最引人注目的是炭疽病的出现，它是由県它是由県(באָנדאַר) 嵵 כערד。1 Наиболее поразительным для фермеров и селекционеров люпина является появление антракноза, вызываемого патогом לופּיני (באָנדאַר) נירענבערג, פעילער & האגעדאָרן13. מערסט אויפפאלנד פאר לופּין פארמערס און ברידערס איז די אויפקום פון אנטראקאנאזע געפֿארזאַכט דורך די פּאַטאַגעניק פונגוס קאָללעטאָטריטשום לופּיני (באָנדאַר) נירענבערג, פיילער און האַגעדאָרן13.די ערשטע באריכטן וועגן דער קראַנקייט זענען געקומען פֿון Brazil און די פֿאַראייניקטע שטאַטן, מיט טיפּישע סימפּטאָמען וואָס זענען דערשינען אין 1912 און 1929 בהתאמה. אָבער, נאָך אַרום 30 יאָר, איז דער פּאַטאָגענע באַצייכנט געוואָרן ווי Colletotrichum gloeosporioides (Penz.) Penz. און סאַק., טעלעאָמאָרף גלאָמערעללאַ סינגולאַטאַ (סטאָונמאַן) ספּאָלד. און סאַק., טעלעאָמאָרף גלאָמערעללאַ סינגולאַטאַ (סטאָונמאַן) ספּאָלד. & Sacc., телеоморф Glomerella cingulata (Stoneman) Spauld. און סאַק., טעלעאָמאָרף פון גלאָמערעללאַ סינגולאַטאַ (סטאָונמאַן) ספּאָלד. & סאַק.，有目的形态的Glomerella cingulata (סטאָנעמאַן) ספּאַולד. & סאַק.，有目的形态的Glomerella cingulata (סטאָנעמאַן) ספּאַולד. & Sacc., Glomerella cingulata (Stoneman) Spauld в Целенаправленной морфологии. & סאַק., גלאָמערעללאַ סינגולאַטאַ (סטאָונמאַן) ספּאָלד אין געצילטע מאָרפאָלאָגיע. און ה. שרעק,. און ה. שרעק, .און ה. שרעק. & H.施伦克，. & H.施伦克，.און ה. שלענק,.פאָרלייפיקע קראַנקייט פענאָטיפּינג געטאָן אין מיטן 20סטן יאָרהונדערט האָט געוויזן עטלעכע קעגנשטעל אין NLL און געלע לופּין (L. luteus L.) אַקסעסיעס, אָבער אַלע ווייסע לופּין (L. albus L.) אַקסעסיעס וואָס זענען געטעסט געוואָרן זענען געווען העכסט סאַסעפּטאַבאַל15,16. שטודיעס האָבן געוויזן אַז די אַנטוויקלונג פון אַנטראַקאָזע איז פֿאַרבונדן מיט געוואקסענע רעגן (לופט הומידיטי) און טעמפּעראַטור (אין די קייט פון 12-28°C), וואָס פירט צו אַ ווייאַליישאַן פון קעגנשטעל ביי העכערע טעמפּעראַטורן17, 18. אין פאַקט, די צייט וואָס איז געווען נויטיק פֿאַר קאָנידיאַ צו דזשערמאַנייט און די קראַנקייט צו אָנהייבן, איז געווען פיר מאָל קירצער ביי 24°C (4 שעה) ווי ביי 12°C (16 שעה) אונטער הויך הומידיטי באדינגונגען19. אַזוי, די אָנגייענדיקע גלאבאלע דערהיצונג האָט געפֿירט צו דער פאַרשפּרייטונג פון אַנטראַקאָזע. אָבער, די קראַנקייט איז באמערקט געוואָרן אין פֿראַנקרייַך (1982) און אוקראַיִנע (1983) ווי אַ כאַבינדזשער פון אַן אָנקומענדיקער סאַקאָנע, אָבער איז געווען לכאורה איגנאָרירט דורך די לופּין אינדוסטריע אין דער צייט20,21. א פאר יאר שפעטער, האט זיך די דאזיקע פארניכטנדיקע קראנקהייט פארשפרייט איבער דער וועלט און אויך באטראפן גרויסע לופּין-פראדוצירנדיקע לענדער ווי אויסטראליע, פוילן און דייטשלאנד22,23,24. נאך אן אויסברוך פון אנטראקאנאז אין מיטן 1990ער יארן, האט ברייטע דורכקוק רעזולטירט אין דער אידענטיפיקאציע פון ​​עטלעכע קעגנשטעליקע דאנארן אין NLL19 מוסטערן. NLL קעגנשטעל צו אנטראקאנאז ווערט קאנטראלירט דורך צוויי באזונדערע דאמינאנטע אלעלן געפונען אין פארשידענע גערמפלאזמע קוועלער: לאנר1 אין קולטיוואר טאנדזשיל און וואנגא און אנמען אין קולטיוואר מאנדאליי25,26. די אלעלן קאמפלעמענטירן די מאלעקולארע מארקערס וואס שטיצן די סעלעקציע פון ​​קעגנשטעליקן גערמפלאזמע אין ברידינג פראגראמען25,26,27,28,29,30. די קעגנשטעליקע ברידינג ליניע 83A:476 וואָס טראָגט דעם Lanr1 אַלעל איז געקראָסט געוואָרן מיט דער סאַסעפּטיבל ווילדער ליניע P27255 צו באַקומען אַ RIL פּאָפּולאַציע וואָס סעגרעגירט פֿאַר אַנטראַקנייז קעגנשטעל, וואָס האָט געמאַכט מעגלעך צו צוטיילן דעם Lanr1 לאָקוס צו כראָמאָסאָם NLL-1131, 32, 33. אַליינמענט פון לינקאַדזש מאַפּע מאַרקערס פון פלאַנקינג קעגנשטעל לאָסי ​​צו אַנטראַקנייז מיט אַ גענאָמישן פריימווערק, NLL האָט אַנטפּלעקט די אָרט פון אַלע דריי אַלעלס אויף דעם זעלבן כראָמאָסאָם (NLL-11), אָבער אין פאַרשידענע פּאָזיציעס29,34,35. אָבער, רעכט צו דער קליינער צאָל RILs און דער גרויסער גענעטישער דיסטאַנץ צווישן מאַרקערס און קאָרעספּאָנדירנדיקע אַלעלס, קענען קיין פאַרלאָזלעכע מסקנות נישט געצויגן ווערן וועגן זייערע אונטערלייגנדיקע גענעס. אויף דער אַנדערער האַנט, איז די נוצן פון פאַרקערטע גענעטיק אין לופּינס שווער רעכט צו זייער זייער נידעריק רעגענעראַציע פּאָטענציעל, וואָס מאַכט גענעטיש מאַניפּולאַציע שווער37.
די אַנטוויקלונג פון דאָמעסטיקירט דזשערמפּלאַזם וואָס טראָגט דעם געוואונטשענעם אַלעל אין דעם האָמאָזיגאָוס צושטאַנד, אַזאַ ווי 83A:476 (Lanr1) און מאַנדעלופּ (AnMan), האָט געעפֿנט די טיר צו שטודירן אַנטראַקנייז קעגנשטעל אין פּנים פון דער בייַזייַן פון קעגנגעזעצטע קאָמבינאַציעס פון אַלעלס אין ווילדע פּאָפּולאַציעס. מעגלעכקייטן פון מאָלעקולאַרע מעכאַניזמען. פאַרגלייַכן פאַרטיידיקונג רעאַקציעס דזשענערייטאַד דורך ספּעציפֿישע גענאָטיפּס. די שטודיע האָט עוואַלואַטעד די פרי טראַנסקריפּטאָם רעאַקציע פון ​​NLL צו C. lupini וואַקסינאַציע. ערשטנס, אַ אייראָפּעיִשע NLL דזשערמפּלאַזם פּאַנעל מיט 215 שורות איז געווען סקריינד ניצן מאָלעקולאַרע מאַרקערס וואָס צייכן די Lanr1 און AnMan אַלעלס. אַנטראַקנייז פענאָטיפּינג איז דעמאָלט דורכגעפירט געוואָרן אויף 50 NLL שורות, פריער אויסגעקליבן פֿאַר מאָלעקולאַרע מאַרקערס, אונטער קאָנטראָלירטע באדינגונגען. באַזירט אויף די עקספּערימענטן, פיר שורות וואָס אַנדערשן זיך אין אַנטראַקנייז קעגנשטעל און Lanr1/AnMan אַלעליק קאָמפּאָזיציע זענען אויסגעקליבן געוואָרן פֿאַר דיפערענטשאַל פאַרטיידיקונג דזשין אויסדרוק פּראָופיילינג ניצן צוויי קאַמפּלעמענטאַרע אַפּראָוטשיז: הויך-דורכפֿלוס RNA סיקוואַנסינג און רעאַל-צייט PCR קוואַנטיפיקאַציע.
סקרינינג פון א סעט פון NLL דזשערמפּלאַזם (N = 215) מיט מאַרקערס Lanr1 (Anseq3 און Anseq4) און AnMan (Anseq4) און AnMan (AnManM1) האט געוויזן אַז בלויז איין ליניע (95726, לעבן סאַלאַמאַנקאַ-ב) אַמפּליפיצירט דעם "קעגנשטעל" אַלעל פֿאַר אַלע מאַרקערס, בשעת "פּרעזענץ פון 'סאַסעפּטאַבאַל' אַלעלס" האט געפֿונען דעם פּראָפּאָרציע פון ​​אַלע מאַרקערס אין 158 (~73.5%) ליניעס. דרייצן ליניעס האָבן פּראָדוצירט צוויי "קעגנשטעליקע" אַלעלס פון דעם Lanr1 מאַרקער, און 8 ליניעס האָבן פּראָדוצירט "קעגנשטעליקע" אַלעלס פון Lanr1. מאַרקער. דער "קעגנשטעל" אַלעל פון דעם AnMan מאַרקער (צוגאב טאַבעלע S1). צוויי ליניעס זענען געווען העטעראָזיגאָוס פֿאַר דעם Anseq3 מאַרקער און איין העטעראָזיגאָוס פֿאַר דעם AnManM1 מאַרקער. 42 ליניעס (19.5%) האָבן געטראָגן פאַרקערטע פאַזעס פון די Anseq3 און Anseq4 אַלעלס, וואָס ווײַזט אויף אַ הויכע אָפטקייט פון רעקאָמבינאַציע צווישן די צוויי לאָסי. אנטראקאנאזע פענאטיפן אונטער קאנטראלירטע באדינגונגען (צוגאב טאבעלע S2) האבן געוויזן וועריאביליטעט אין די קעגנשטעל פון די געטעסטע גענאטיפן, וואס איז געווען אפגעשפיגלט אין די שטרענגקייט פון אנטראקאנאזע. אונטערשיידן אין דורכשניטלעכע סקאָרס זענען געווען פון 1.8 (מיטלמעסיק קעגנשטעליק) ביז 6.9 (סאַסעפּטאַבאַל) און פלאַנצן וואָג אונטערשיידן זענען געווען פון 0.62 (סאַסעפּטאַבאַל) ביז 4.45 ג (סאַסעפּטאַבאַל). עס איז געווען א באדייטנדע קארעלאציע צווישן ווערטן באמערקט אין צוויי רעפּליקאַציעס פון דעם עקספּערימענט (0.51 פֿאַר קראַנקייט שטרענגקייט סקאָרז, P = 0.00017 און 0.61 פֿאַר פלאַנצן וואָג, P < 0.0001) ווי אויך צווישן די צוויי פּאַראַמעטערס (− 0.59 און − 0.77, P < 0.0001). עס איז געווען א באַדייטנדיקע קאָרעלאַציע צווישן די ווערטן באמערקט אין צוויי רעפּליקאַציעס פון דעם עקספּערימענט (0.51 פֿאַר קראַנקייט שטרענגקייט סקאָרז, P = 0.00017 און 0.61 פֿאַר פלאַנצן וואָג, P < 0.0001) ווי אויך צווישן די צוויי פּאַראַמעטערס (− 0.59 און − 0.77, P < 0.0001). וויסנשאפטלעכע פאַרמעסט מיט 0,51 פאַרמעגן (0,51 פֿאַר болезни, P = 0,00017 און 0,61 פֿאַר מאַקסימאַל, פּ < 0,0001), אַזוי איר קענען באַקומען די רעכט צייט (-0,59,0,0,0,0,0,0,0,0,0, 0,0001). א באַדייטנדיקע קאָרעלאַציע איז געפֿונען געוואָרן צווישן די ווערטן באַאָבאַכטעט אין צוויי איבערחזרונגען פֿון דעם עקספּערימענט (0.51 פֿאַר קראַנקהייט שטרענגקייט סקאָרז, P = 0.00017 און 0.61 פֿאַר פּלאַנץ וואָג, P < 0.0001), ווי אויך צווישן די צוויי פּאַראַמעטערס (- 0.59 און -0.77, P < 0.0001) 0.0001).在两次重复实验中观察到的值之间存在显着相关性（疾病严重程度评分1︺. 0.00017，植物重量为0.61，P <0.0001）以及这两个参数之间（- 0.59 和- 0.77。01)在 两 次 重复 实验 中 观察 的 值 之间 存在 相关性 （疾病 严重 为庈度 诟分为 0.51 ， p = 0.00017 , 植物 为 为 为 0.61 ， p <0.0001) פון 0.59 צו 0.59 ERN 0.59 和-0.77, פּ < 0.0001). 1 = 0,00017 און מאַססאַטשוסעטץ 0,61, פּ <0,0001), און מיר האָבן אַ נומער (-0,59 און -0,0001) 0,77, פּ <0,0001. עס איז געווען אַ באַדייטנדיקע קאָרעלאַציע צווישן די ווערטן באמערקט אין דופּליקאַט (קראַנקייט שטרענגקייט כעזשבן 0.51, P = 0.00017 און פלאַנצן וואָג 0.61, P < 0.0001) און צווישן די צוויי פּאַראַמעטערס (-0.59 און -0 .0001) 0.77, P<0.0001. ).טיפישע סימפּטאָמען וואָס מען זעט אין סאַסעפּטאַבאַל פלאַנצן אַרייַננעמען קנייטשן און דרייען דעם שטאַם וואָס זעט אויס ווי אַ "שעפערדס בויגן" סטרוקטור, נאכגעגאנגען דורך אָוואַל לעזשאַנז מיט אָראַנדזש/ראָזעווע ספּאָראָזאָיטן (צוגאב בילד 1). אויסטראַלישע אַקסעסיעס וואָס טראָגן די Lanr1 (83A:476 און Tanjil) און AnMan (Mandelup) גענעס זענען מיטלמעסיק קעגנשטעליק, 0.0331 און 0.0036). עטלעכע ליניעס וואָס אויך טראָגן "קעגנשטעליק" Lanr1 און/אָדער AnMan אַלעלס ווייַזן סימפּטאָמען פון דער קראַנקייט.
אינטערעסאנט, א פאר NLL ליניעס וואס האבן נישט קיין "רעזיסטענט" מארקער אלעל האבן געוויזן א הויכן לעוועל פון אנטראקאנאזע רעזיסטענץ (פארגלייכבאר אדער העכער ווי פאר Lanr1 אדער AnMan גענאטיפן), ווי למשל בארעגינע (P ווערט < 0.0001 פאר ביידע פאראמעטערס), באדזשאר (P ווערט < 0.0001 פאר סקאר און 0.001 פאר פלאנץ וואָג) און פאפולאציע B-549/79b (P ווערט < 0.0001 פאר סקאר און נישט-באַדייטנד פאר וואָג). אינטערעסאנט, א פאר NLL ליניעס וואס האבן נישט קיין "רעזיסטענט" מארקער אלעל האבן געוויזן א הויכן לעוועל פון אנטראקאנאזע רעזיסטענץ (פארגלייכבאר אדער העכער ווי פאר Lanr1 אדער AnMan גענאטיפן), ווי למשל בארעגינע (P ווערט < 0.0001 פאר ביידע פאראמעטערס), באדזשאר (P ווערט < 0.0001 פאר סקאר און 0.001 פאר פלאנץ וואָג) און פאפולאציע B-549/79b (P ווערט < 0.0001 פאר סקאר און נישט-באַדייטנד פאר וואָג). Интересно, что несколько линий NLL, лишенных какого-либо «резистентного» маркерного аллеля, покасаливы устойчивости к антракнозу (сопоставимый или более высокий, чем для генотипов Lanr1 и AnMan), таких или более высокий, чем для генотипов Lanr1 и Anman), таких или болеевысокий параметров), באָדזשאַר (זייַן פּ <0,0001 פֿאַר אַקאַונץ און 0,001 פֿאַר מאַססы растения) און ב-549/79ב (פֿאַרבונדן פּ) <0,0001 פֿאַר אָס און ניט פֿאַר מאַססы). אינטערעסאנט, עטלעכע NLL ליניעס אָן קיין 'רעזיסטענט' מאַרקער אַלעל האָבן געוויזן אַ הויך מדרגה פון קעגנשטעל צו אַנטראַקאָזע (פאַרגלייַכלעך צו אָדער העכער ווי פֿאַר Lanr1 אָדער AnMan גענאָטיפּעס), אַזאַ ווי באָרעגינע (P ווערט < 0.0001 פֿאַר ביידע פּאַראַמעטערס), באָדזשאַר (P ווערט < 0.0001 פֿאַר עוואַלואַציע און 0.001 פֿאַר פלאַנצן וואָג) און פּאָפּולאַציע B-549/79b (P ווערט < 0.0001 פֿאַר עוואַלואַציע און נישט באַטייַטיק פֿאַר וואָג).有趣的是，一些缺乏任何“抗性”标记等位基因的NLL 系显示出高水平的炧水平的炭疽或AnMan 基因型相当或更高），例如Boregine（两个参数的P 值< 0.0001）、Bojar（P 值<得分为0.0001，植物重量为0.001）和种群B-549/79b（得分P 值<0.0001，重量 עס איז אינטערעסאנט אז עטלעכע NLL סיסטעמען וואָס האָבן נישט קיין "אַנטיגענע" מאַרקערס ווייַזן הויך האָריזאָנטאַל קעגנשטעל (עקוויוואַלענט צו Lanr1 אָדער AnMan גענעס אָדער העכער), אַזאַ ווי באָרעגינע (ביידע פּאַראַמעטערס P < 0.0001), באָדזשאַר (P ווערט < 0.0001, פלאַנצן וואָג 0.001) און שטאַם B-549/79b (P ווערט < 0.0001, וואָג נישט באַטייַטיק). אינטערנאציאנאלע, נעטוואָרקינג נעטהערלאַנדס נללס, ליסטעד מאַרקאַץ אַלע «רעזיסטענטנעס», וויסנשאפטלעכע וועבסיטעס устойчивости к антракнозу (сравнимые или выше, чем у генотипов Lanr1 или AnMan), такие как Boregine (значение P для обобоих,000ров), (פֿאַרקויף פּ <0,0001, מאַקסימום 0,001) און B-549/79b (פּ-פֿאַרבעסערונג <0,0001, масса незначительна). אינטערעסאנט, עטלעכע NLL ליניעס אָן קיין 'קעגנשטעל' מאַרקער אַלעלן האָבן געוויזן הויכע לעוועלס פון אַנטראַקאָזע קעגנשטעל (פאַרגלייַכלעך צו אָדער העכער ווי Lanr1 אָדער AnMan גענאָטיפּעס), אַזאַ ווי באָרעגינע (P ווערט פֿאַר ביידע פּאַראַמעטערס <0.0001), באָדזשאַר (P-ווערט < 0.0001, פלאַנצן וואָג 0.001) און פּאָפּולאַציע B-549/79b (P-ווערט < 0.0001, וואָג נישט באַטייַטיק).די דערשיינונג ווייזט אויף די מעגלעכקייט פון א נייעם גענעטישן מקור פון קעגנשטעל, און דערקלערט דעם באאבאכטעטן מאנגל אין קארעלאציע צווישן מארקער גענאטיפן און קראנקהייט פענאטיפן (P ווערטן פון ~0.42 ביז ~0.98). אזוי, דער קאלמאגאראוו-סמירנאוו טעסט האט געוויזן אז די דאטן וועגן אנטראקאנאז קעגנשטעל זענען געווען בערך נארמאל פארטיילט פאר סקאָרן (P-ווערטן 0.25 און 0.11) און פלאנץ מאסע (P-ווערטן 0.47 און 0.55), וואס ווייזט אז איך שטעל אויף א היפאטעז אז מער אלעלן ווי Lanr1 און AnMan זענען פארמישט.
באַזירט אויף די רעזולטאַטן פון אַנטראַקנייז קעגנשטעל סקרינינג, 4 ליניעס זענען אויסגעקליבן געוואָרן פֿאַר טראַנסקריפּטאָם אַנאַליז: 83A:476, באָרעגין, מאַנדעלופּ, און פּאָפּולאַציע 22660. די ליניעס זענען ווידער געטעסט געוואָרן פֿאַר אַנטראַקס קעגנשטעל אין ינאָקולאַציע עקספּערימענטן דורך RNA סיקווענסינג, מיט דער באַדינגונג אַז זיי זענען געווען די זעלבע ווי אין די פריערדיקע טעסט. די כעזשבן ווערטן זענען געווען ווי פאלגט: באָרעגין (1.71 ± 1.39), 83A: 476 (2.09 ± 1.38), מאַנדעלופּ (3.82 ± 1.42) און פּאָפּולאַציע 22660 (6.11 ± 1.29).
דער Illumina NovaSeq 6000 פּראָטאָקאָל האָט דערגרייכט אַ דורכשניט פון 40.5 Mread פּאָרן פּער מוסטער (29.7 ביז 54.4 Mreads) (צוגאב טאַבעלע S3). אַליינמענט סקאָרז אין דער רעפערענץ סיקוואַנס זענען געווען פון 75.5% ביז 88.6%. די דורכשניטלעכע קאָרעלאַציע פון ​​לייען צייל דאַטן צווישן עקספּערימענטאַלע וואַריאַנטן צווישן ביאָלאָגישע רעפּליקאַטן איז געווען פון 0.812 ביז 0.997 (דורכשניט 0.959). פֿון די 35,170 גענעס וואָס זענען אַנאַליזירט געוואָרן, האָבן 2917 נישט געוויזן קיין אויסדרוק, און די איבעריקע 4785 גענעס זענען אויסגעדריקט געוואָרן אויף אַ מינימאַלן לעוועל (באַזע דורכשניט < 5). פֿון די 35,170 גענעס וואָס זענען אַנאַליזירט געוואָרן, האָבן 2917 נישט געוויזן קיין אויסדרוק, און די איבעריקע 4785 גענעס זענען אויסגעדריקט געוואָרן אויף אַ מינימאַלן לעוועל (באַזע דורכשניט < 5). ביז 35 170 גענעראל 2917 קיין הוצאות, און 4785 גרעסטן געלט. уровне (базовое среднее <5). פֿון די 35,170 גענעס וואָס זענען אַנאַליזירט געוואָרן, האָבן 2917 נישט געוויזן קיין אויסדרוק, און די איבעריקע 4785 גענעס זענען אויסגעדריקט געוואָרן אויף אַ מינימאַלן לעוועל (באַזע דורכשניט <5).在分析的35,170 个基因中，2917 个没有表达，其他4785个基因的表达可以忽略不计（基本平均值< 5）.35,170 ביז 35 170 גענעראלן 2917 ניט וויסנשאפטלעכע, און 4785 רעגיסטרירט וניווערסאַל קאַנסאַנטריישאַנז. среднее значение <5). פֿון די 35,170 גענען וואָס זענען אַנאַליזירט געוואָרן, זענען 2917 נישט אויסגעדריקט געוואָרן און די איבעריקע 4785 גענען האָבן געהאַט אַ מינימאַלע אויסדרוק (באַזע דורכשניט <5).אזוי, די צאָל גענעס וואָס מען האָט באַטראַכט אויסגעדריקט (באַזע דורכשניט ≥ 5) בעת דעם עקספּערימענט איז געווען 27,468 (78.1%) (צוגאב טאַבעלע S4).
פֿון דער ערשטער צייט־פונקט, האָבן אַלע NLL ליניעס רעאַגירט אויף דער אינאָקולאַציע פֿון C. lupini (שטאַם Col-08) דורך איבערפּראָגראַמירן דעם טראַנסקריפּטאָם (טאַבעלע 1), אָבער, באַדייטנדיקע אונטערשיידן זענען באמערקט געוואָרן צווישן די ליניעס. אַזוי, די קעגנשטאַנד־ליניע 83A:476 (טראָגנדיק דעם Lanr1 גען) האָט געוויזן באַדייטנדיקע טראַנסקריפּטאָם איבערפּראָגראַמירן ביים ערשטן צייט־פונקט (6 hpi) מיט אַ 31-69־פֿאַכיגער פאַרגרעסערונג אין דער צאָל פֿון אפגעזונדערטע אַרויף־ און אַראָפּ־גענעס פֿאַרגליכן מיט אַנדערע צייט־פּונקטן אין דעם צייט־פונקט. דערצו, איז דער שפּיץ געווען קורץ־לעבעדיק, ווייל די אויסדרוק פֿון בלויז אַ פּאָר גענעס איז געבליבן באַדייטנדיק געביטן ביים צווייטן צייט־פונקט (12 hpi). אינטערעסאַנט, באָרעגינע, וואָס האָט אויך געוויזן אַ הויכן לעוועל פֿון קעגנשטאַנד אין דעם גראַפֿט־טעסט, האָט נישט דורכגעמאַכט אַזאַ מאַסיווע טראַנסקריפּציאָנעלע איבערפּראָגראַמירן בעת ​​דעם עקספּערימענט. אָבער, די צאָל פֿון דיפֿערענציעל אויסגעדריקטע גענעס (DEG) איז געווען די זעלבע פֿאַר באָרעגינע און 83A:476 ביי 12 HPI. ביידע מאַנדעלופּ און פּאָפּולאַציע 22660 האָבן געוויזן DEG שפּיצן ביים לעצטן צייטפונקט (48 ל/ס), וואָס ווײַזט אויף אַ רעלאַטיווע פאַרהאַלטונג אין דיפענס רעאַקציעס.
ווייל 83A:476 האט דורכגעמאכט מאסיווע טראַנסקריפּטאָם רעפּראָגראַמירן אין ענטפער צו C. lupini ביי 6 HPI קאַמפּערד צו אַלע אנדערע ליניעס, ~91% פון די DEGs באמערקט אין דעם צייט פונקט זענען ליניעשיפּ-ספּעציפיש (פיגור 1). אָבער, עס איז געווען עטלעכע אָוווערלאַפּ אין פריע רעספּאָנסעס צווישן שטודיע ליניעס, ווי 68.5%, 50.9%, און 52.6% DEG אין באָרעגינע, מאַנדעלופּ, און פּאָפּולאַציע 22660, ריספּעקטיוולי, אָוווערלאַפּט מיט די געפֿונען אין 83A:476 אין זיכער פונקטן אין צייט. אָבער, די DEGs פאַראַנטוואָרטלעך פֿאַר בלויז אַ קליין בראָכצאָל (0.97-1.70%) פון אַלע DEGs דערווייַל דיטעקטעד ניצן 83A:476. דערצו, 11 DEGs פון אלע ליניעס זענען געווען קאכערענט אין דעם צייט (צוגאב טאבעלעס S4-S6), אריינגערעכנט געמיינזאמע קאמפאנענטן פון פלאנץ פארטיידיגונג רעאקציעס: ליפיד טראנספער פראטעין (TanjilG_32225), ענדאגלוקאן-1,3-β-גלוקאסיד ענזיים (TanjilG_23384), צוויי סטרעס-אינדוצירבארע פראטעאינען ווי SAM22 (TanjilG_31528 און TanjilG_31531), באזישער לאטעקס פראטעין (TanjilG_32352), און צוויי גליצין-רייכע סטרוקטורעלע צעל וואנט פראטעאינען (TanjilG_19701 און TanjilG_19702). עס איז אויך געווען א רעלאטיוו הויכע איבערלאפונג אין טראנסקריפטאם רעאקציעס צווישן 83A:476 און בארעגינע ביי 24 HPI (טאטאל 16-38% DEG) און צווישן מאנדעלופ און פאפולאציע 22660 ביי 48 HPI (טאטאל 14-20% DEG).
ווען דיאַגראַם וואָס ווייזט די צאָל פון דיפערענציעל אויסגעדריקטע גענעס (DEG) אין שמאָל-בלעטעריקע לופּין (NLL) ליניעס וואָס זענען אינאקולירט געוואָרן מיט Colletotrichum lupini (שטאַם Col-08 באַקומען פון לופּין פעלדער אין וויזשעניצע, פּוילן, 1999). די NLL ליניעס וואָס זענען אַנאַליזירט געוואָרן זענען געווען: 83A:476 (רעזיסטענט, טראָגנדיק דעם Lanr1 אַלעל), באָרעגינע (רעזיסטענט, גענעטישער הינטערגרונט אומבאַקאַנט), מאַנדעלופּ (מיטעלמעסיק רעזיסטענט, טראָגנדיק דעם AnMan אַלעל) און פּאָפּולאַציע 22660 (זייער סאַסעפּטאַבאַל). די אַבריווייישאַן hpi שטייט פֿאַר שעה נאָך וואַקסינאַציע. נול ווערטן זענען אַוועקגענומען געוואָרן צו פאַרפּשוטערן דעם גראַף.
דער סכום פון איבער-אויסגעדריקטע גענעס ביי 6 הפּי איז אנאליזירט געווארן פארן אנוועזנהייט פון קאנאנישע R גענע דאמעינען (צוגאב טאבעלע S7). די שטודיע האט געוויזן טראנסקריפטאם אינדוקציע פון ​​קלאסישע קראנקהייט קעגנשטעל גענעס מיט NBS-LRR דאמעינען נאר ביי 83A:476. דער סכום האט באשטאנען פון איין TIR-NBS-LRR גענע (tanjilg_05042), פינף CC-NBS-LRR גענעס (tanjilg_06165, tanjilg_06162, tanjilg_22773, tanjilg_22640, און tanjilg_16162), און פיר NBS-LR, Tanjilg_16162), און פיר NBS-LRRE (tanjilg_16162) ווי אויך פיר NBS-Lrr (tanjilg_16162) און פיר NBS-LRR (TANJILG_16162). אלע פון ​​די גענעס האבן קאנאנישע דאמעינען אראנדזשירט אין קאנסערווירטע סיקווענצן. אין צוגאב צו די NBS-LRR דאמעין גענעס, זענען עטלעכע RLL קינאזעס אקטיוויזירט געווארן ביי 6 הפּי, נעמליך איינס אין באָרעגינע (TanjilG_19877), צוויי אין מאַנדעלופּ (TanjilG_07141 און TanjilG_19877) און אין פּאָפּולאַציע 22660 (TanjilG_09014 און TanjilG_10361) און צוויי אין 83A 27:476.
גענעס מיט באַדייטנד געביטן אויסדרוק אין ענטפער צו ינאַקאַליישאַן מיט C. lupini (שטאַם Col-08) זענען אונטערגעוואָרפן געוואָרן צו גענע אָנטאָלאָגיע (GO) ענריטשמענט אַנאַליז (צוגאב טאַבעלע S8). דער אָפטסט איבעררעפּרעזענטירטער ביאָלאָגישער פּראָצעס טערמין איז געווען "GO:0006952 דיפענס רעספּאָנס" וואָס איז דערשינען אין 6 פון 16 (צייט × ליניע) קאָמבינאַציעס מיט הויכער באַדייַטיקייט (P ווערט < 0.001) (פיגור 2). דער אָפטסט איבעררעפּרעזענטירטער ביאָלאָגישער פּראָצעס טערמין איז געווען "GO:0006952 דיפענס רעספּאָנס" וואָס איז דערשינען אין 6 פון 16 (צייט × ליניע) קאָמבינאַציעס מיט הויכער באַדייַטיקייט (P ווערט < 0.001) (פיגור 2). Наиболее часто чрезмерно представленным термином биологического процесса был «GO: 0006952 защитный», 6 פון 16 (רעמיאַ × ליניע) קאַמבאַניישאַנז מיט די וויסנשאפטלעכע פאַרנעמונג (זיין פּ <0,001) (ריז. 2). דער אָפטסט איבעררעפּרעזענטירטער ביאָלאָגישער פּראָצעס טערמין איז געווען 'GO:0006952 דיפענס רעספּאָנס', וואָס איז דערשינען אין 6 פון 16 (צייט × ליניאַדזש) קאָמבינאַציעס מיט הויך באַדייַטיקייט (P ווערט < 0.001) (פיגור 2).最常被过度代表的生物过程术语是“GO:0006952 防御反应”，它出现在16个（时间×线）组合中的6 个中，具有高显着性（P 值<0.001）（图2）. דער מערסט רעפּרעזענטאַטיווער ביאָלאָגישער פּראָצעס טערמין איז "GO:0006952 דיפענס רעספּאָנס", וואָס דערשיינט אין 6 פון די 16 (时间×线) קאָמבינאַציעס, מיט הויכער באַדייַטיקייט (P ווערט < 0.001) (图2). Наиболее часто чрезмерно представленным термином биологического процесса был «GO: 0006952 Defense Response», косторвыв 16 קאַמבאַניישאַנז (ווייַל × ליניע) מיט высокой значимостью (זינאַטשען פּ <0,001) (ריס. 2). דער אָפטסט איבעררעפּרעזענטירטער ביאָלאָגישער פּראָצעס טערמין איז געווען 'GO:0006952 Defense Response', וואָס איז דערשינען אין 6 פון 16 קאָמבינאַציעס (צייט × ליניע) מיט הויכער באַדייַטיקייט (P ווערט < 0.001) (פיגור 2).דער טערמין איז געווען איבעררעפּרעזענטירט אין צוויי צייט פונקטן אין 83A: 476 און באָרעגינע (6 און 24 הפּ) און אין איין צייט פונקט אין מאַנדעלופּ און פּאָפּולאַציע 22660 (12 און 6 הפּ, ריספּעקטיוולי). דאָס איז אַן ערוואַרטעט רעזולטאַט, וואָס אונטערשטרייכט די אַנטיפונגאַל רעאַקציע פון ​​די קעגנשטעליק ליניעס. אין דערצו, 83A:476 האט רעאַגירט צו C. lupini דורך שנעל אינדוצירן גענעס שייך צו די אָקסידאַטיוו בערסט רעפּרעזענטירט דורך דעם טערמין "GO:0055114 רעדאָקס פּראָצעס", וואָס ווייַזט אויף אַ ספּעציפיש פאַרטיידיקונג רעאַקציע, בשעת באָרעגינע האט געוויזן ספּעציפיש פאַרטיידיקונג רעאַקציעס, שייך צו דעם טערמין 'GO'. :0006950 סטרעס רעאקציע”. פּאָפּולאַציע 22660 האָט אַקטיוויזירט די האָריזאָנטאַלע קעגנשטעל רעאקציע וואָס אַרייַננעמט צווייטיקע מעטאַבאָליטן, וואָס האָט אַרויסגעוויזן די איבערגעטריבענע צאָל טערמינען “GO:0016104 פּראָצעס פון טריטערפּען ביאָסינטעז” און “GO:0006722 פּראָצעס פון טריטערפּען מעטאַבאָליזם” (ביידע טערמינען געהערן צו דער זעלבער סעט פון גענען), נעמענדיג אין באַטראַכט די רעזולטאַטן פון די GO טערמין ענריטשמענט אַנאַליז, איז די מאַנדעלופּ רעאקציע סטאַביליטעט געווען צווישן באָרעגינע און פּאָפּולאַציע 22660. אין דערצו, די פריע רעאקציע 83A:476 (6 הפּי) און די פאַרשפּעטיקטע רעאקציע מאַנדעלופּ און פּאָפּולאַציע 22660 אַרייַננעמען דעם טערמין GO:0015979 'פאָטאָסינטעז' און אַנדערע פֿאַרבונדענע ביאָלאָגישע פּראָצעסן.
די ביאָפּראָצעס גענע אָנטאָלאָגיע טערמינען אויסגעקליבן אין דער אַנאָטאַציע פון ​​דיפערענציעל אויסגעדריקטע גענעס בעת טראַנסקריפּטאָם רעספּאָנסעס פון שמאָל-בלעטעריק לופּין (NLL) ינאַקיאַלייטיד מיט אַנטראַקס לופּין (Col-08 שטאַם באקומען פון לופּין פעלדער אין וויזשעניס, פּוילן, אין 1999) זענען שטארק איבערגעטריבן. די NLL ליניעס אַנאַלייזד זענען געווען: 83A:476 (רעזיסטענט, טראָגן די כאָומאָזיגאָוס Lanr1 אַלעל), באָרעגינע (רעזיסטענט, אומבאַקאַנט גענעטישע הינטערגרונט), מאַנדעלופּ (מיטלמעסיק רעזיסטענט, טראָגן די כאָומאָזיגאָוס AnMan אַלעל) און פּאָפּולאַציע 22660 (סאַסעפּטאַבאַל).
ווייל די שטודיע האט געצילט צו אידענטיפיצירן גענעס וואס ביישטייערן צו אנטראקאנאזע קעגנשטעל, זענען די גענעס וואס זענען צוגעטיילט צו די טערמינען GO "GO: 0006952 דעפענסיווע רעאקציעס" און "GO: 0055114 רעדאקס פראצעסן" אנאליזירט געווארן מיט אפשניטן, ווייל באזעלינע מיטלען ≥ 30 מיט לפחות איין ליניע × צייט-פונקט וואס קאמבינירט סטאטיסטיש באדייטנדע ווערטן פון log2 (פאך ענדערונג). די צאל גענעס וואס האבן דערפילט די קריטעריע איז געווען 65 פאר GO:0006952 און 524 פאר GO:0055114.
83A:476 האט געוויזן צוויי DEG שפּיצן מיט דעם טערמין GO:0006952, דער ערשטער ביי 6 גענעס פּער אינטש (64 גענעס, אַרויף און אַראָפּ רעגולאַציע) און דער צווייטער ביי 24 גענעס פּער אינטש (15 גענעס, אַרויף רעגולאַציע בלויז). באָרעגינע האט אויך געוויזן אַז GO:0006952 האט דערגרייכט דעם שפּיץ אין דער זעלבער צייט פונקט, אָבער מיט ווייניקער DEG (11 און 8) און פּרעפערענציעל אַקטיוואַציע. מאַנדעלופּ האט געוויזן צוויי שפּיצן פון GO:0006952 ביי 12 און 48 HPI, ביידע טראָגנדיק 12 גענעס (דער ערשטער מיט אַקטיווירנדיקע גענעס, און דער צווייטער מיט בלויז סאַפּרעסיוו גענעס), בשעת די 22660 באַפעלקערונג ביי 6 HPI (13 גענעס) האט געהאט אַ גרעסערע פּרעדאָמינאַנס פון דער פאַרגרעסערונג שפּיץ רעגולאַציע. עס זאָל זיין באמערקט אַז 96.4% פון GO:0006952 DEG אין די שפּיצן האבן געהאט דעם זעלבן טיפּ פון ענטפער (אַרויף אָדער אַראָפּ), וואָס ווייזט אַ באַטייטיק אָוווערלאַפּ אין דיפענס ענטפערס טראָץ דיפעראַנסיז אין דער נומער פון גענעס ינוואַלווד. די גרעסטע גרופע פון ​​סיקווענצן פארבונדן מיטן טערמין GO:0006952 קאדירט דעם Starvation Stress-Associated Message Protein 22 (SAM22-like), וואס געהערט צו דער קלאס 10 פאטאגענעסיס-פארבונדענער פראטעין (PR-10) פראטעין קלאד און דעם קערן פראטעין לאטעקס. ענלעכער (MLP-like) פראטעין) פראטעין (פיגור 3). די צוויי גרופעס האבן זיך אונטערשיידן אין דער נאטור פון אויסדרוק און דער ריכטונג פון דער רעאקציע. די גענעס וואס קאדירן SAM22-like פראטעאינען האבן געוויזן קאנסיסטענטע און באדייטנדע אינדוקציע ביי פריע צייט פונקטן (6 אדער 12 הפי) און זענען בכלל נישט געווען רעאגירנדיק ביים סוף פונעם עקספערימענט (48 הפי), בשעת MLP-like פראטעאינען האבן געוויזן קאארדינאציע ביי 6 הפי. הפי. 83A:476 און מאנדעלופ ביי 48 הפי/אין, כמעט אלע אנדערע דאטן פונקטן זענען נישט געווען רעאגירנדיק. דערצו, אונטערשיידן אין אויסדרוק פראפיילן פון SAM22-like פראטעין גענעס האבן נאכגעפאלגט באאבאכטעטע וועריאַביליטי אין אנטראקאנאזע קעגנשטעל, ווייל מער קעגנשטעליקע ליניעס האבן געהאט מער צייט פונקטן וואס האבן באדייטנד אינדוצירט די גענעס ווי מער סאַסעפּטאַבאַל גענעס. אן אנדער LlR18A/B-ענלעך PR-10 גען האט געוויזן א זייער ענלעכן אויסדרוק מוסטער צו דעם SAM22-ענלעכן פּראָטעין גען.
די הויפּט קאָמפּאָנענטן פון דעם ביאָלאָגישן פּראָצעס טערמין "GO:0006952 Defense Response" און די אויסדרוק מוסטערן פון קאַנדידאַט גענעס פון די Lanr1 און AnMan אַלעלס זענען געווען אידענטיפיצירט. די Log2 וואָג רעפּרעזענטירט log2 ווערטן (פאַרלייגן ענדערונג) צווישן ינאָקולירטע (Colletotrichum lupini, שטאַם Col-08, באקומען פון לופּין פעלדער, Wizhenica, פוילן, 1999) און קאָנטראָל (שאַם-ינאָקולירטע) געוויקסן אין דער זעלביקער צייט פונט. די פאלגענדע שמאָלבלאַט לופּין ליניעס זענען אַנאַליזירט: 83A:476 (רעזיסטענט, טראָגן די כאָומאָזיגאָוס Lanr1 אַלעל), באָרעגינע (רעזיסטענט, גענעטישער הינטערגרונט אומבאַקאַנט), מאַנדעלופּ (מיטלמעסיק רעזיסטענט, טראָגן די כאָומאָזיגאָוס AnMan אַלעל), און פּאָפּולאַציע 22660 (סאַסעפּטאַבאַל).
דערצו, די אויסדרוק פּראָפֿילן פון RNA-seq קאַנדידאַט גענעס Lanr1 (TanjilG_05042) און AnMan (TanjilG_12861) זענען עוואַלויִרט געוואָרן (פיגור 3). די TanjilG_05042 גענע האט געוויזן אַ באַדייטנדיקע רעאַקציע (אַקטיוואַציע) ביי 83A:476 נאָר ביים ערשטן צייט פּונקט (6 hpi), בשעת TanjilG_12861 איז געווען באַדייטנדיק אין מאַנדעלופּ נאָר ביי צוויי צייט פּונקטן: 6 hpi (דאַון רעגולאַציע) און 24 hpi (6 hpi). מיט.). אַדזשאַסטאַבאַל) ).
די מערסט איבער-אויסגעדריקטע גענעס אין דעם טערמין GO:0055114 "רעדאקס פראצעס" זענען געווען גענעס וואס קאדירן ציטאכראום P450 פראטעאינען און פעראקסידאז (פיגור 4). פאר סעמפלען אפגעזונדערט פון 83A:476 ביי 6 HPI, זענען מאקסימום אדער מינימום log2 (פאך ענדערונג) ווערטן (פאר 86.6% פון גענעס) בכלל באמערקט געווארן צווישן אינאקולירטע און קאנטראל פלאנצן, וואס אונטערשטרייכט די הויכע רעאקציע פון ​​דעם גענאטיפ צו אינאקולירטע געשלעכט. 83A:476 האט געוויזן די מערסט באדייטנדע GO: 0055114 DEG ביי 6 hpi (503 גענעס), בשעת די איבעריגע ליניעס ביי 48 hpi (באָרעגינע, 31 גענעס; מאַנדעלופּ, 85 גענעס; און פּאָפּולאַציע 22660, 78 גענעס)). אין רוב גענעס פון דער GO:0055114 פאמיליע, זענען צוויי טיפן רעאקציעס צו וואקסינאציע (אקטיוואציע און אינהיביציע) באמערקט געווארן. אינטערעסאנט, ביז 97.6% פון די DEGs אידענטיפיצירט פארן טערמין GO: 0055114 אין מאַנדעלופּע ביי 48 הפּ. די אבזערוואציעס ווייזן אז, טראץ דעם באדייטנד קלענערן פארנעם (ד.ה., די צאל פון מוטירטע רעדאקס גענעס, 85 קעגן 503), איז דער מוסטער פון פארשפעטיקטע טראַנסקריפּטאָם רעאקציעס פון מאַנדעלופּע צו אַנטראַקנאָזע ענלעך צו דער פריער רעאקציע פון ​​83A:476. אין באָרעגינע און פּאָפּולאַציע 22660, איז די קאָנווערגענץ נידעריקער ביי 51.6% און 75.6%, ריספּעקטיוולי.
די אויסדרוק-מוסטערן פון די הויפט קאמפאנענטן פון דעם טערמין פון דעם ביאלאגישן פראצעס "GO:0055114 Redox פראצעס" זענען אנטפלעקט געווארן. די Log2 סקאלע רעפרעזענטירט log2 ווערטן (פאך ענדערונג) צווישן אינאקולירטע (Colletotrichum lupini, שטאם Col-08, באקומען פון לופּין פעלדער, Wizhenica, פוילן, 1999) און קאנטראל (שאם-אינאקולירטע) פלאנצן אין דער זעלבער צייט-פונקט. די פאלגענדע שמאָלבלאטיקע לופּין ליניעס זענען אנאליזירט געווארן: 83A:476 (רעזיסטענט, טראגט דעם האמאזיגאטישן Lanr1 אלעל), באָרעגינע (רעזיסטענט, גענעטישער הינטערגרונט אומבאַקאַנט), מאַנדעלופּ (מיטלמעסיק רעזיסטענט, טראגט דעם האמאזיגאטישן AnMan אלעל), און פּאָפּולאַציע 22660 (סאַסעפּטאַבאַל).
83A:476 טראַנסקריפּטאָמישע רעאַקציעס צו ינאָקולאַציע מיט C. lupini (שטאַם Col-08) האָבן אויך אַרייַנגענומען קאָאָרדינירטע שטילמאַכן פון גענעס וואָס ווערן צוגעשריבן צום טערמין GO:0015979 "פאָטאָסינטעז" און אַנדערע פֿאַרבונדענע ביאָלאָגישע פּראָצעסן (פיגור 5). די GO:0015979 DEG סעט האָט ענטהאַלטן 105 גענעס וואָס זענען באַדייטנד אונטערדריקט געוואָרן ביי 6 הפּי ביי 83A:476. אין דעם סאַבסעט, 37 גענעס זענען אויך דאַונרעגולירט געוואָרן אין מאַנדעלופּ ביי 48 הפּי און 35 אין דער זעלבער צייט אין דער 22660 באַפעלקערונג, אַרייַנגענומען 19 DEGs וואָס זענען געווען געוויינטלעך פֿאַר ביידע גענאָטיפּס. קיין DEGs פֿאַרבונדן מיטן טערמין GO: 0015979 זענען נישט באַדייטנד אַקטיוויזירט געוואָרן אין קיין קאָמבינאַציע (ליניע x צייט).
די אויסדרוק-מוסטערן פון די הויפט קאמפאנענטן פון דעם טערמין פון דעם ביאלאגישן פראצעס "GO:0015979 פאטאסינטעז" זענען אנטפלעקט געווארן. די לאג2 וואג רעפרעזענטירט לאג2 ווערטן (פאך ענדערונג) צווישן אינאקולירטע (Colletotrichum lupini, שטאם Col-08, באקומען פון לופּין פעלדער, וויזשעניצא, פוילן, 1999) און קאנטראל (שאם-אינאקולירטע) פלאנצן אין דער זעלבער צייט-פונקט. די פאלגנדע שמאל-בלעטעריגע לופּין ליניעס זענען אנאליזירט געווארן: 83A:476 (רעזיסטענט, טראגט דעם האמאזיגאטישן Lanr1 אלעל), בארעגינע (רעזיסטענט, גענעטישן הינטערגרונט אומבאקאנט), מאנדעלופ (מיטעלע רעזיסטענט, טראגט דעם האמאזיגאטישן AnMan אלעל), און פאפולאציע 22660 (סאספעקטיוו).
באַזירט אויף די רעזולטאַטן פון דיפערענציעלע אויסדרוק אַנאַליז און מסתּמא ינוואַלווד אין פאַרטיידיקונג רעספּאָנסעס קעגן פּאַטאַדזשעניק פאַנדזשיי, איז דעם סכום פון זיבן גענעס אויסגעקליבן געוואָרן פֿאַר קוואַנטיפיקאַציע פון ​​אויסדרוק פּראָופיילז דורך רעאַל-צייט PCR (צוגאב טאַבעלע S9).
דער מעגלעכער פּראָטעין גען TanjilG_10657 איז געווען באַדייטנד אינדוצירט אין אַלע שטודירטע ליניעס און צייט פונקטן קאַמפּערד צו קאָנטראָל (מימיק) געוויקסן (צוגאב טאַבעלעס S10, S11). אין דערצו, דער אויסדרוק פּראָפיל פון TanjilG_10657 האט געוויזן אַ וואַקסנדיק טענדענץ איבער דעם קורס פון דעם עקספּערימענט פֿאַר אַלע ליניעס. פּאָפּולאַציע 22660 האט געוויזן די העכסטע סענסיטיוויטי פון TanjilG_10657 צו ינאָקולאַציע מיט 114-פאַך אַקטיוואַציע און די העכסטע רעלאַטיווע אויסדרוק מדרגה (4.4 ± 0.4) ביי 24 HPI (פיגור 6a). דער PR10 LlR18A פּראָטעין גען TanjilG_27015 האט אויך געוויזן אַקטיוואַציע אַריבער אַלע ליניעס און צייט פונקטן, מיט סטאַטיסטיש באַדייטונג ביי רובֿ דאַטן פונקטן (פיגור 6b). ענלעך צו TanjilG_10657, דער העכסטער רעלאַטיווער אויסדרוק מדרגה פון TanjilG_27015 איז באמערקט געוואָרן אין דער 22660 ינאָקולירטער פּאָפּולאַציע ביי 24 HPI (19.5 ± 2.4). דער זויער ענדאָטשיטינאַסע גען TanjilG_04706 איז געווען באַדייטנד אַרויפֿרעגולירט אין אַלע ליניעס און אין אַלע צייטפּונקטן אַחוץ פֿאַר באָרעגינע 6 hpi (פֿיגור 6c). עס איז געווען שטאַרק אינדוצירט ביים ערשטן צייטפּונקט (6 HPI) ביי 83A:476 (מיט 10.5 מאָל) און מיטלמעסיק געוואַקסן אין אַנדערע ליניעס (מיט 6.6-7.5 מאָל). בעת דעם עקספּערימענט, איז די אויסדרוק פֿון TanjilG_04706 געבליבן אויף ענלעכע לעוועלס אין 83A:476 און באָרעגינע, בשעת אין מאַנדעלופּ און פּאָפּולאַציע 22660 איז עס באַדייטנד געוואַקסן, דערגרייכנדיק רעלאַטיוו הויכע ווערטן (5.9 ± 1.5 און 6.2 ± 1.5, ריספּעקטיוולי). דער ענדאָגלוקאַן-1,3-β-גלוקאָסידאַזע-ווי גען TanjilG_23384 האָט געוויזן הויכע אַקטיוואַציע אין די ערשטע צוויי צייטפּונקטן (6 און 12 hpi) אין אַלע ליניעס אַחוץ פּאָפּולאַציע 22660 (פֿיגור 6d). די העכסטע רעלאַטיווע אויסדרוק לעוועלס פון TanjilG_23384 זענען באמערקט געוואָרן ביים צווייטן צייט פונקט (12 הפּאי) אין מאַנדעלופּ (2.7 ± 0.3) און 83A:476 (1.5 ± 0.1). ביי 24 הפּאי, איז TanjilG_23384 אויסדרוק געווען רעלאַטיוו נידעריק אין אַלע שטודירטע ליניעס (פון 0.04 ± 0.009 ביז 0.44 ± 0.12).
אויסדרוק פּראָפֿילן פֿון אויסגעקליבענע גענעס (ag) אַנטפּלעקט דורך קוואַנטיטאַטיווער PCR. די נומערן 6, 12 און 24 רעפּרעזענטירן שעה נאָך וואַקסינאַציע. די LanDExH7 און LanTUB6 גענעס זענען געניצט געוואָרן פֿאַר נאָרמאַליזאַציע און LanTUB6 איז געניצט געוואָרן פֿאַר אינטער-סעריע קאַליבראַציע. טעות באַרס רעפּרעזענטירן די סטאַנדאַרט דיווייישאַן באַזירט אויף דריי ביאָלאָגישע רעפּליקאַטעס, יעדער פֿון וועלכע איז דער דורכשניט פֿון דריי טעכנישע רעפּליקאַטעס. די סטאַטיסטישע באַדייַטיקייט פון די אונטערשיידן אין די אויסדרוק לעוועלס צווישן די אינאקולירטע (Colletotrichum lupini, שטאַם Col-08, באַקומען אין 1999 פון די לופּין פעלד אין וויערזעניקאַ, פּוילן) און קאָנטראָל (מאָק-אינאקולירטע) פלאַנצן זענען אָנגעצייכנט אויבן דאַטן פונקטן (*P ווערט < 0.05, **P ווערט ≤ 0.01, ***P ווערט ≤ 0.001). די סטאַטיסטישע באַדייַטיקייט פון די אונטערשיידן אין די אויסדרוק לעוועלס צווישן די אינאקולירטע (Colletotrichum lupini, שטאַם Col-08, באַקומען אין 1999 פון די לופּין פעלד אין וויערזעניקאַ, פּוילן) און קאָנטראָל (מאָק-אינאקולירטע) פלאַנצן זענען אָנגעצייכנט אויבן דאַטן פונקטן (*P ווערט < 0.05, **P ווערט ≤ 0.01, ***P ווערט ≤ 0.001). סטאַטיסטיש רעספּעקטעד קאַנסאַנטריישאַנז (Colletotrichum lupini, 9 דעצעמבער 9, 9 אויגוסט. поля люпина в Верженице, Польша) и контрольными (לאָדזשנאָ инокулированными) поля люпина в Верженице, Польша) 0,05, **זנאַטשעניע פּ ≤ 0,01, ***זנאַטשען פּ ≤ 0,001). סטאַטיסטיש באַדייטנדיקע אונטערשיידן אין אויסדרוק לעוועלס צווישן אינאקולירטע (Colletotrichum lupini, שטאַם Col-08, באקומען אין 1999 פון אַ לופּין פעלד אין וויזשעניצע, פוילן) און קאָנטראָל (שאַם-אינאקולירטע) פלאַנצן זענען באמערקט העכער די דאַטן פונקטן (*P ווערט < 0.05, **P-ווערט ≤ 0.01, ***P-ווערט ≤ 0.001).接种（Colletotrichum lupini, Col-08株, 1999年从波兰Wierzenica的羽扇豆田获得）和对照（模拟接种）植物之间表达水平差异的统计学显着性标记圮於於在繂0.05, **P 值≤ 0.01, ***P 值≤ 0.001).接种 （colletotrichum lupini ， color-08 株 ， 1999 年 波兰 波兰 wierzenica 的 羽扇 获得） 撌 鯹煤照缉水平 差异 的 统计学 显着性 标记 数据点 上方*p 值 <0.05, **P ≤ 0.01, ***P ≤ 0.01). סטאַטיסטיש רעספּאָנסעס אין די לעצטע יאָרן (Colletotrichum lupini, штамм Col-08, полйсч) люпина в Верженице, Польша, אין 1999 הער. האַכלאָטע פּ < 0,05, ** פּ-געפֿאַלן ≤ 0,01, *** פּ - 0,001). סטאַטיסטיש באַדייטנדיקע אונטערשיידן אין אויסדרוק לעוועלס צווישן אינאקולירטע (Colletotrichum lupini, שטאַם Col-08, באקומען פון לופּין פעלדער אין ווערזשעניצע, פוילן, אין 1999) און קאָנטראָל (שאַם-אינאקולירטע) פלאַנצן זענען באמערקט העכער די דאַטן פונקטן (*P ווערט < 0.05, **P-ווערט ≤ 0.01, ***P-ווערט ≤ 0.001).די NLL ליניעס וואָס זענען אַנאַליזירט געוואָרן זענען געווען: 83A:476 (רעזיסטענט, טראָגנדיק דעם האָמאָזיגאָסן Lanr1 אַלעל), מאַנדעלופּ (מיטלמעסיק רעזיסטענט, טראָגנדיק דעם האָמאָזיגאָסן AnMan אַלעל), באָרעגינע (רעזיסטענט, אומבאַקאַנט גענעטישן הינטערגרונט) און פּאָפּולאַציע 22660 (סאַסעפּטאַבאַל).
דער קאנדידאט גען TanjilG_05042 ביים Lanr1 לאקוס האט געוויזן א באמערקבאר אנדערש אויסדרוק מוסטער פון די פראפיילן באקומען פון RNA-seq שטודיעס (פיגור 6e). באדייטנדע אקטיוואציע פון ​​דעם גען איז באמערקט געווארן אין מאנדעלופ און די 22660 באפעלקערונג (ביז 39.7 און 11.7 מאל, בהתאמה), רעזולטירנדיג אין רעלאטיוו הויכע אויסדרוק לעוועלס (ביז 1.4 ± 0.14 און 7.2 ± 1.3, בהתאמה). 83A:476 האט אויך געוויזן עטוואס פארגרעסערונג פון דעם TanjilG_05042 גען (ביז 3.8-פאך), אבער, די רעלאטיווע אויסדרוק לעוועלס דערגרייכט (0.044 ± 0.002) זענען געווען מער ווי 30-פאך נידעריגער ווי די באמערקט אין מאנדעלופ און די 22660 באפעלקערונג. אנאליזירט דורך qPCR האט געוויזן באדייטנדע אונטערשיידן אין אויסדרוק לעוועלס צווישן גענאטיפן אין מאק-וואקסינירטע (קאנטראל) וואריאנטן, דערגרייכנדיג א 58-פאכיגן אונטערשייד צווישן פאפולאציעס 22660 און 83A:476, ווי אויך צווישן פאפולאציעס 22660 און 22660. א צווייפאכיגער אונטערשייד איז דערגרייכט געווארן צווישן בארעגינע און מאנדאלופ.
דער קאנדידאט גען ביים AnMan לאקוס, TanjilG_12861, איז אקטיוויזירט געווארן אלס רעאקציע צו וואקסינאציע אין 83A:476 און מאנדעלופ, איז געווען נייטראל אין דער 22660 פאפולאציע, און איז געווען דאון-רעגולירט אין בארעגינע (פיגור 6f). די רעלאטיווע אויסדרוק פון דעם TanjilG_12861 גען איז געווען די העכסטע אין אינאקולירטן 83A: 476 (0.14±0.01). דער 17.4 kDa קלאס I היץ שאק פראטעין גען TanjilG_05080 HSP17.4 האט געוויזן נידעריגערע רעלאטיווע אויסדרוק לעוועלס אין אלע שטודירטע שטאמען און צייט פונקטן (פיגור 6g). דער העכסטער ווערט איז באמערקט געווארן ביי 24 HPI אין דער 22660 פאפולאציע (0.14 ± 0.02, אן אכט-פאכיגע פארגרעסערונג אין רעאקציע צו וואקסינאציע).
א פארגלייך פון גענע אויסדרוק פראפיילן (פיגור 7) האט געוויזן א הויכע קארעלאציע צווישן TanjilG_10657 און פיר אנדערע גענען: TanjilG_27015 (r = 0.89), TanjilG_05080 (r = 0.85), TanjilG_05042 (r = 0.80), און TanjilG_04706 (r = 0.79). אזעלכע רעזולטאטן קענען ווייזן אויף קא-רעגולאציע פון ​​די גענען בעת ​​פארטיידיקונג רעאקציעס. די TanjilG_12861 און TanjilG_23384 גענען האבן געוויזן אנדערע אויסדרוק פראפיילן מיט נידעריגערע פּירסאָן קארעלאציע קאעפיציענט ווערטן (פון 0.08 ביז 0.43 און -0.19 ביז 0.28, בהתאמה) אין פארגלייך מיט אנדערע גענען.
קארעלאציעס צווישן גען אויסדרוק פראפיילן זענען דעטעקטירט געווארן ניצנדיק קוואנטיטאטיווע PCR. די פאלגענדע שמאלע בלעטערדיגע לופּין ליניעס זענען אנאליזירט געווארן: 83A:476 (רעזיסטענט, טראגט דעם האמאזיגאטישן Lanr1 אלעל), מאנדעלופ (מיטעלע רעזיסטענט, טראגט דעם האמאזיגאטישן AnMan אלעל), בארעגינע (רעזיסטענט, גענעטישער הינטערגרונט אומבאקאנט), און פאפולאציע 22660 (סאספעקטיוו). דריי צייט פונקטן זענען אויסגערעכנט געווארן (6, 12 און 24 שעה נאך אינאקולאציע), אריינגערעכנט אינאקולירטע (Colletotrichum lupini, שטאם Col-08, באקומען פון לופּין פעלדער אין וויזשעניס, פוילן, אין 1999) און קאנטראל (שאם-אינאקולירטע) פלאנצן. די וואג ווייזט דעם ווערט פון דעם פּירסאָן קארעלאציע קאעפיציענט.
באַזירט אויף דאַטן באַקומען ביי 6 פערד-קראַפט פּער אינטש, איז WGCNA דורכגעפירט געוואָרן אויף 9981 DEG אידענטיפיצירט דורך פאַרגלייַכן ינאָקולירטע און קאָנטראָל פלאַנצן צו פאָקוסירן אויף פריע פאַרטיידיקונג רעאַקציעס (צוגאב טאַבעלע S12). צוויי און צוואַנציק דזשין מאָדולן (קלאַסטערס) זענען געפֿונען געוואָרן מיט קאָרעלירטע (פּאָזיטיוו אָדער נעגאַטיוו) אויסדרוק פּראָופיילן צווישן גענאָטיפּעס און עקספּערימענטאַלע וואַריאַנטן. דורכשניטלעך, זענען די גען אויסדרוק לעוועלס געווען אראפגייענדיג אין סדר 83A:476 > מאַנדעלופּ > באָרעגינע > פּאָפּולאַציע 22660 (אין ביידע וואַריאַנטן, אָבער, איז די טענדענץ געווען שטאַרקער אין קאָנטראָל פלאַנצן). דורכשניטלעך, זענען די גען אויסדרוק לעוועלס געווען אראפגייענדיג אין סדר 83A:476 > מאַנדעלופּ > באָרעגינע > פּאָפּולאַציע 22660 (אין ביידע וואַריאַנטן, אָבער, איז די טענדענץ געווען שטאַרקער אין קאָנטראָל פלאַנצן). В среднем уровни экспрессии генов снижались в порядке 83A:476 > Mandelup > Boregine > Population 22660 (в обоих вариантах, тенденция была сильнее у контрольных растений). דורכשניטלעך, זענען די גענע אויסדרוק לעוועלס געפאלן אין דער סדר 83A:476 > מאַנדעלופּ > באָרעגינע > פּאָפּולאַציע 22660 (אין ביידע וואַריאַנטן, אָבער, איז די טענדענץ געווען שטאַרקער אין קאָנטראָל פלאַנצן).平均而言，基因表达水平按83A:476 > Mandelup > באָרעגינע > באַפעלקערונג 22660的顺序下降（然而，在两种变体中，这种趋势在对照植物中更强）。平均 而 言 , 基因 水平 按 按 83a: 476> מאַנדעלופּ> באָרעגינע> באַפעלקערונג 22660 的 顺序 下降 （， 缌 圌在 在 植物 中 更）。。。…… В среднем уровни экспрессии генов снижались в ряду 83A:476 > מאַנדעלופּ > באָרעגינע > באַפעלקערונג 22660 была сильнее у контрольных растений). דורכשניטלעך, זענען די גענע אויסדרוק לעוועלס געפאלן אין די סעריע 83A:476 > מאַנדעלופּ > באָרעגינע > פּאָפּולאַציע 22660 (אָבער, אין ביידע וואַריאַנטן, איז די טענדענץ געווען שטאַרקער אין קאָנטראָל פלאַנצן).וואַקסינאַציע האָט רעזולטירט אין אַן אַרויפֿרעגולאַציע פֿון גענע אויסדרוק, ספּעציעל אין מאָדולן 18, 19, 14, 6 און 1 (אין אַראָפּגייענדיקן סדר פֿון ווירקונג), נעגאַטיווע רעגולאַציע (למשל מאָדולן 9 און 20) אָדער מיט נייטראַלע ווירקונגען (למשל מאָדולן 11, 22, 8 און 13). GO טערמין ענריטשמענט אַנאַליז (צוגאב טאַבעלע S13) האָט אַנטפּלעקט "GO: 0006952 פּראַטעקטיוו רעספּאָנסעס" פֿאַר דעם אינאָקולירטן מאָדול (18) מיט מאַקסימום אַקטיוואַציע, אַרייַנגערעכנט גענעס אַנאַליזירט דורך qPCR (TanjilG_04706, TanjilG_23384, TanjilG_10657 און TanjilG_27015), ווי אויך פֿילע אינאָקולירט מערסט אונטערדריקטע פֿאָטאָסינטעז מאָדולן (9). מאָדול 18 קאָנצענטראַטאָר (פיגור 8) איז אידענטיפיצירט געוואָרן ווי דער TanjilG_26536 גען וואָס קאָדירט דעם PR-10-ווי LlR18B פּראָטעין, און מאָדול 9 קאָנצענטראַטאָר איז אידענטיפיצירט געוואָרן ווי דער TanjilG_28955 גען וואָס קאָדירט דעם פאָטאָסיסטעם II PsbQ פּראָטעין. א קאַנדידאַט אַנטראַקנאָסע קעגנשטעל גען Lanr1, TanjilG_05042, איז געפֿונען געוואָרן אין מאָדול 22 (פיגור 9) און איז פֿאַרבונדן מיט די טערמינען "GO:0044260 צעלולאַר מאַקראָמאָלעקולאַר מעטאַבאַליק פּראָצעסן" און "GO:0006355 טראַנסקריפּשאַנאַל רעגולאַציע, DNA טעמפּלייטינג" וואָס טראָגט דעם TanjilG_01212 כאַב. דער גען קאָדירט היץ סטרעס טראַנסקריפּציע פאַקטאָר A-4a (HSFA4a).
געוויכטע נעץ אנאליז פון גענע קא-עקספרעסיע פון ​​מאדולן מיט איבער-רעפּרעזענטירטע ביאלאגישע פראצעס טערמינען "GO: 0006952 פארטיידיקונג רעאקציעס". ליגאציע איז געווארן פארפּשוטעט צו ארויסהייבן די פיר גענעס אנאליזירט דורך qPCR (TanjilG_04706, TanjilG_23384, TanjilG_10657 און TanjilG_27015).
געוויכטעטע נעץ אנאליז פון גען קא-עקספרעסיע פון ​​א מאדול מיט אן איבעררעפּרעזענטירטן ביאלאגישן פראצעס טערמין "GO: 0006355: טראַנסקריפּציאָנעלע רעגולאציע, דנאַ טעמפּלייטינג" און טראָגנדיק א קאַנדידאַט אַנטראַקנאָסע קעגנשטעל גען Lanr1 TanjilG_05042. ליגאַציע איז געווען סימפּליפייד צו אפגעזונדערן דעם TanjilG_05042 גען און דעם צענטראַלן TanjilG_01212 גען.
אנטראקאנאזע קעגנשטעל סקרינינג געזאמלט אין אויסטראליע האט געוויזן אז רוב פון די פרי-פרייטע קולטיווארס זענען געווען סאַסעפּטאַבאַל; קאַליאַ, קאָראָמופּ און מאַנדעלופּ זענען באַשריבן געוואָרן ווי מיטלמעסיק קעגנשטעליק, בשעת וואָנגאַ, טאַנדזשיל און 83A:476 זענען באַשריבן געוואָרן ווי העכסט קעגנשטעליק26,27,31. האבן געהאט דעם זעלבן קעגנשטעל אַלעל, באַצייכנט Lanr1, און קאָראָמופּ און מאַנדעלופּ האבן געהאט אן אנדער אַלעל, באַצייכנט AnMan10,26,39, בשעת קאַליאַ האט איבערגעגעבן אן אנדער אַלעל, Lanr2. סקרינינג פאר אנטראקאנאזע קעגנשטעל אין דייטשלאנד האט רעזולטירט אין דער אידענטיפיקאציע פון ​​א קעגנשטעליקע ליניע Bo7212 מיט א קאנדידאט אַלעל אַנדערש ווי Lanr1, באַצייכנט LanrBo36.
אונדזער שטודיע האט אַנטפּלעקט אַ זייער נידעריקע אָפטקייט (ארום 6%) פון די Lanr1 אַלעל אין די געטעסטע דזשערמפּלאַזם. די אָבסערוואַציע איז קאָנסיסטענט מיט די רעזולטאַטן פון סקרינינג מזרח אייראָפּעיִשע דזשערמפּלאַזם ניצן די Anseq3 און Anseq4 מאַרקערס, וואָס האָבן געוויזן אַז די Lanr1 אַלעל איז פאָרשטעלן אין בלויז צוויי בעלאָרוסישע ליניעס. דאָס סאַגדזשעסט אַז די Lanr1 אַלעל איז נאָך נישט וויידלי געניצט דורך לאָקאַלע ברידינג פּראָגראַמען, ניט ווי אין אויסטראַליע, וווּ עס איז איינער פון די שליסל אַלעלס פֿאַר מאַרקער-אַסיסטעד ברידינג. דאָס קען זיין רעכט צו דעם נידעריקער מדרגה פון קעגנשטעל צוגעשטעלט דורך די Lanr1 אַלעל אין אייראָפּעיִשע פעלד באדינגונגען קאַמפּערד צו די אויסטראַלישע באַריכט. אין דערצו, שטודיעס פון אַנטראַקאָסע אין הויך רעגן געביטן אין אויסטראַליע האָבן געוויזן אַז קעגנשטעל רעספּאָנסעס מעדיאַטעד דורך די Lanr1 אַלעל קען נישט זיין עפעקטיוו אין וועטער באדינגונגען וואָס גינפאַסט וווּקס און שנעל אַנטוויקלונג פון די פּאַטאַדזשעניק19,42. אין פאַקט, אין דער איצטיקער שטודיע, עטלעכע סימפּטאָמס פון אַנטראַקאָסע זענען אויך באמערקט אין גענאָטיפּעס וואָס טראָגן די Lanr1 אַלעל, סאַגדזשעסט אַז קעגנשטעל קען פאַרשווינדן אונטער אָפּטימאַל באדינגונגען פֿאַר די אַנטוויקלונג פון C. lupini. דערצו, פאַלשע פּאָזיטיווע אינטערפּרעטאַציעס פון דער אנוועזנהייט פון Anseq3 און Anseq4 מאַרקערס, וועלכע זענען אַרום 1 cM פון די Lanr1 לאָקוס, זענען מעגלעך 28,30,43.
אונדזער שטודיע האט געוויזן אז 83A:476, טראגנדיק דעם Lanr1 אלעל, האט רעאגירט צו C. lupini אינאקולאציע מיט גרויס-מאסשטאב טראנסקריפטאם רעפראגראמירן ביים ערשטן אנאליזירטן צייטפונקט (6 הפּ), בשעת אין מאַנדעלופּ, טראגנדיק דעם AnMan אלעל, זענען טראנסקריפטאמישע רעאקציעס באמערקט געווארן פיל שפעטער (פון 24 ביז 48 הפּ). די צייטווייליגע וועריאציעס אין פארטיידיקונג רעאקציעס זענען פארבונדן מיט אונטערשיידן אין קראנקהייט סימפטאמען, וואס אונטערשטרייכט די וויכטיקייט פון פריער פאטאגן דערקענונג פאר א געלונגענע רעאקציע צו קעגנשטעל. צו אנשטעקן פלאנץ געוועב, מוזן אנטראקס ספארן דורכגיין עטלעכע אנטוויקלונג שטאפלען אויף דער גאסטגעבער אייבערפלאך, אריינגערעכנט דזשערמאַניישאַן, צעל טיילונג, און פארמאציע פון ​​אן אפּרעסאָריום. אן אפּענדידזש איז אן אינפעקטיווע סטרוקטור וואס באפעסטיקט זיך צו דער אייבערפלאך פון גאסטגעבער און ערמעגליכט דורכדרינגונג אין די גאסטגעבער געוועבן. אזוי, ספארן פון C. gloeosporioides אין ערבס עקסטראַקט האבן געוויזן די ערשטע טיילונג פון דעם קערן נאך 75-90 מינוט פון אינקובאציע, די פארמאציע פון ​​א דזשערם רער נאך 90-120 מינוט, און סאַפּרעשאַן נאך 4 שעה. מאַנגאָ C. gloeosporioides האט געוויזן מער ווי 40% קאָנידיאַל דזשערמאַניישאַן נאָך 3 שעה פון אינקובאַציע און וועגן 20% פאָרמאַציע פון ​​אַפּרעסערז נאָך 4 שעה. די ווירולענס-פֿאַרבונדענע CAP20 דזשין פון C. gloeosporioides האט געוויזן טראַנסקריפּשאַנאַל טעטיקייט אין עפּיפיט-פאָרמינג קאָנידיאַ נאָך 3.5 שעה אינקובאַציע אין אַוואָקאַדאָ ייבערפלאַך וואַקס מיט הויך קאַנסאַנטריישאַנז פון CAP20 פּראָטעין נאָך 4 שעה 46 מינוט. סימילאַרלי, די טעטיקייט פון מעלאַנין ביאָסינטעז גענעס אין C. trifolii איז געווען ינדוסט בעשאַס אַ 2-שעה אינקובאַציע נאכגעגאנגען דורך די פאָרמאַציע פון ​​אַן אַפּרעסאָריום נאָך 1 שעה. שטודיעס פון בלאַט געוועבן האָבן געוויזן אַז סטראָבעריז ינאַקיאַלייטיד מיט C. acutatum האָבן ערשטער סאַפּרעשאַן ביי 8 hpi, בשעת טאָמאַטאָוז ינאַקיאַלייטיד מיט C. coccodes האָבן ערשטער סאַפּרעשאַן ביי 4 hpi48,49. לאַרגעלי קאָנסיסטענט מיט די צייט וואָג פון Colletotrichum spp. ינפעקטיאָוס פּראָצעס. שנעלע פארטיידיקונג רעאקציעס צו 83A:476 פֿאָרשלאָגן די באַטייליקונג פֿון פלאַנצן-קעגנשטאַנד און עפֿעקטאָר-געטריגערטע ימיונאַטי (ETI) גענעס אין דעם ליניע, בשעת מאַנדעלופּס פֿאַרשפּעטיקטע רעאקציעס שטיצן די מיקראָ-פֿאַרבונדענע מאָלעקולאַרע מוסטער-געטריגערטע ימיונאַטי (MTI) היפּאָטעזע 50. פֿרי רעאקציעס צו 83A: 476 און מאַנדעלופּ. די טיילווייזע איבערלאַפּונג צווישן אַרויף- אָדער אַראָפּ-רעגולירטע גענעס אין פֿאַרשפּעטיקטער רעאַקציע שטיצט אויך דעם באַגריף, ווייל ETI ווערט אָפֿט באַטראַכט ווי אַ אַקסעלערירטע און פֿאַרשטאַרקטע MTI רעאַקציע וואָס קולמינירט אין פּראָגראַמירטן צעל טויט ביים אָרט פֿון אינפֿעקציע, באַקאַנט ווי אַנאַפֿילאַקטישער שאָק 51,52.
רובֿ פון די גענעס וואָס ווערן צוגעשריבן צום איבעררעפּרעזענטירטן טערמין Gene Ontology GO:0006952 "Defense Response" זענען די 11 האָמאָלאָגן פון דעם סטרעס-ינדוסט פאַסטינג מעסעדזש 22 פּראָטעין (ענלעך צו SAM22) און די זיבן הויפּט לאַטעקס פּראָטעין-ווי (MLPs). -ווי פּראָטעאינען 31, 34, 43 און 423 האָבן געוויזן סיקוואַנס ענלעכקייט. SAM22-ווי גענעס האָבן געוויזן באַדייטנדיק אַקטיוואַציע וואָס האָט געדויערט לענגער, ווייַזנדיק געוואקסענע לעוועלס פון אַנטראַקנייז קעגנשטעל (83A:476 און באָרעגינע). אָבער, MLP-ווי גענעס זענען דאַונרעגיאַלייטיד בלויז אין ליניעס וואָס טראָגן דעם קאַנדידאַט קעגנשטעל אַלעל (83A:476/Lanr1 ביי 6 hpi און Mandelup/AnMan ביי 24 hpi). עס זאָל זיין באמערקט אַז אַלע אידענטיפיצירטע SAM22-ווי האָמאָלאָגן שטאַמען פון אַ גענע קלאַסטער וואָס שפּאַנט אַפּראָקסימאַטלי 105 kb, בשעת MLP-ווי גענעס שטאַמען פון באַזונדערע מקומות פון דעם גענאָם. קאָאָרדינירטע אַקטיוואַציע פון ​​אַזעלכע SAM22-ענלעכע גענעס איז אויך געפֿונען געוואָרן אין אונדזער פֿריִערדיקער שטודיע פון ​​NLL קעגנשטעל צו Diaporthetoxica ינאָקולאַציע, וואָס סאַגדזשעסט אַז זיי זענען ינוואַלווד אין די האָריזאָנטאַלע קאָמפּאָנענטן פון דער פֿאַרטיידיקונג רעאַקציע. די מסקנא איז אויך געשטיצט דורך באַריכטן פון אַ positive רעאַקציע פון ​​SAM22-ענלעכע גענעס צו שאָדן אָדער באַהאַנדלונג מיט סאַליסיליק זויער, פונגאַל ינדוסערז, אָדער הידראָגען פּעראַקסייד.
MLP-ענלעכע גענעס האבן געוויזן צו רעאגירן צו פארשידענע אביאָטישע און ביאָטישע סטרעסן, אַרייַנגערעכנט באַקטיריאַלע, וויראַלע און פּאַטאַדזשעניקע פונגאַל ינפעקציעס אין פילע פלאַנצן מינים55. די ריכטונגען פון רעאַקציע צו זיכער ינטעראַקשאַנז צווישן פלאַנצן און פּאַטאַדזשענס זענען געווען פון שטאַרק ינקריסינג (ד"ה, בעשאַס ינפעסטיישאַן פון וואַטע מיט ווערטיקיליום דאַהליאַע) צו באַדייטנדיק דיקריסינג (ד"ה, נאָך ינפעקציע פון ​​עפּל בוים מיט Alternaria spp.)56,57. באַדייטנדיק דאַונרעגולאַטיאָן פון די MLP-ענלעך 423 דזשין איז באמערקט בעשאַס אַוואָקאַדאָ דיפענסיז צו F. ניגער ינפעקציע און בעשאַס ינפעקציע פון ​​די עפּל בוים Botryosphaeria berengeriana f. cn. piricola און Alternaria alternata זענען עפּל פּאַטהאָטיפּס58,59. אין אַדישאַן, עפּל קאַלי וואָס אָוווערעקספּרעסס די MLP-ענלעך 423 דזשין האָבן געהאַט נידעריקער עקספּרעסיע פון ​​קעגנשטעל-פֿאַרבונדענע גענעס און זענען מער סאַסעפּטאַבאַל צו פונגאַל ינפעקציע59. נאָך Fusarium oxysporum f, די MLP-ענלעך 423 דזשין איז אויך סאַפּרעסט אין קעגנשטעליק פּראָסט בין דזשערמפּלאַזם. cn. בין ינפעקציע 60.
אַנדערע מיטגלידער פון דער PR-10 משפּחה וואָס זענען אידענטיפיצירט געוואָרן אין אונדזער RNA-seq שטודיע זענען געווען די LlR18A און LlR18B גענעס אין ענטפער צו אַרויפֿרעגולאַציע, ווי אויך די אַרויפֿרעגולירטע (1 גענע) אָדער דאַונרעגולירטע (3 גענעס) גענע פֿאַר דעם ליפּיד טראַנספֿער פּראָטעין DIR1. . אין דערצו, WGCNA אונטערשטרייכט דעם LlR18B גענע ווי אַ צענטער אין דעם מאָדול, וואָס איז העכסט סאַסעפּטאַבאַל צו וואַקסינאַציע און טראָגט עטלעכע פּראַטעקטיוו ענטפער גענעס. די LlR18A און LlR18B גענעס זענען אינדוצירט געוואָרן אין געלע לופּין בלעטער אין ענטפער צו פּאַטאָגעניק באַקטעריע, ווי אויך אין NLL סטעמס נאָך D. toxica ינאָקולאַציע, בשעת דער רייז האָמאָלאָג פון די גענעס, RSOsPR10, איז געווען ראַפּאַדלי אינדוצירט דורך אַ פונגאַל ינפעקציע וואָס איז מסתּמא ינוואַלווד אין די יאַסמאָניק זויער סיגנאַלינג פּאַטוויי 53,61, 62. דער DIR1 גענע קאָדירט ניט-ספּעציפֿיש ליפּיד טראַנספּאָרט פּראָטעינס וואָס זענען פארלאנגט פֿאַר די אָנהייב פון סיסטעמישע קונה קעגנשטעל (SAR). מיט דער אַנטוויקלונג פון פּראַטעקטיוו ריאַקשאַנז, ווערט דער DIR1 פּראָטעין טראַנספּאָרטירט פון דעם פאָקוס פון ינפעקציע דורך דעם פלאָעם צו אינדוצירן SAR אין ווייטע אָרגאַנען. אינטערעסאנט, די TanjilG_02313 DIR1 גען איז געווען באדייטנד אינדוצירט ביים ערשטן צייטפונקט אין ליניעס 84A:476 און פאפולאציע 22660, אבער אנטראקאנאזע קעגנשטעל האט זיך אנטוויקלט ערפאלגרייך נאר אין ליניע 84A:476. דאס קען ווייזן אויף עטוואס סובפונקציאנאליזאציע פון ​​די DIR1 גען אין NLL, ווייל די איבעריגע דריי האמאלאגן האבן רעאגירט צו אינאקולאציע נאר אין די 83A:476 ליניע ביי 6 הפּי, און די רעאקציע איז געווען געריכטעט אראפ.
אין אונדזער שטודיע, די מערסטע געוויינטלעכע קאָמפּאָנענטן וואָס קאָרעספּאָנדירן צו דעם ביאָלאָגישן פּראָצעס גערופן "GO:0055114 רעדאָקס פּראָצעס" זענען געווען ציטאָכראָם P450 פּראָטעין, פּעראָקסידאַז, לינאָלעיק זויער 9S-/13S-ליפּאָקסיגענאַז, און 1-אַמינאָציקלאָפּראָפּאַן-1-קאַרבאָקסיל זויער אָקסידאַז. אין דערצו, אונדזער WGCNA דעפינירט דעם HSFA4a האָמאָלאָג ווי אַ כאַב וואָס טראָגט מאָדולן ווי דער Lanr1 קעגנשטעל דזשין קאַנדידאַט TanjilG_05042. HSFA4a איז אַ קאָמפּאָנענט פון דער רעדאָקס-אָפּהענגיקער רעגולאַציע פון ​​נוקלעאַרער טראַנסקריפּציע אין פלאַנצן.
ציטאָכראָם P450 פּראָטעאינען זענען אָקסידאָרעדוקטאַזעס וואָס קאַטאַליזירן NADPH און/אָדער O2-אָפּהענגיקע הידראָקסילאַציע רעאַקציעס אין ערשטיקן און צווייטיקן מעטאַבאָליזם, אַרייַנגערעכנט דעם מעטאַבאָליזם פון קסענאָביאָטיקס, ווי אויך האָרמאָנען, פעטי זויערן, סטעראָלס, צעל וואַנט קאָמפּאָנענטן, ביאָפּאָלימערס, און די ביאָסינטעז פון פּראַטעקטיוו קאַמפּאַונדז 69. אין אונדזער שטודיע, איז די וועריאַביליטי אין פלאַנצן ציטאָכראָם P450 פונקציע רעדוצירט געוואָרן פון -10.6 לאָג2 (פאַרלייגן ענדערונג) צו 5.7 רעכט צו אַ גרויסער צאָל פון געביטן האָמאָלאָגן (37) און דיפערענצן אין ענטפער פּאַטערנז צווישן ספּעציפישע גענעס, וואָס רעפלעקטירט אַן אויפשטייגנדיקע רעוויזיע. ניצן בלויז RNA-seq דאַטן צו דערקלערן די פּוטאַטיווע ביאָלאָגישע פונקציע פון ​​די NLL גענעס אין אַזאַ אַ גרויסער פּראָטעין סופּערפאַמיליע וואָלט זיין העכסט ספּעקולאַטיוו. אָבער, עס איז ווערט צו באַמערקן אַז עטלעכע ציטאָכראָם P450 גענעס זענען פארבונדן מיט געוואקסן קעגנשטעל צו פּאַטאַדזשעניק פונגי אָדער באַקטיריאַ, אַרייַנגערעכנט אַ בייַשטייַער צו אַלערדזשיק רעאַקציעס 69,70,71.
קלאַס III פּעראָקסידאַזעס זענען מולטיפונקציאָנעלע פלאַנצן ענזימען וואָס זענען ינוואַלווד אין אַ ברייט קייט פון מעטאַבאַליק פּראַסעסאַז בעשאַס פלאַנצן וווּקס און אַנטוויקלונג, ווי אויך אין ענטפער צו ינווייראַנמענאַל סטרעסאַז אַזאַ ווי זאַלץ, טריקעניש, הויך ליכט ינטענסיטי, און פּאַטאַדזשען אַטאַק 72. פּעראָקסידאַזעס זענען ינוואַלווד אין די ינטעראַקשאַן פון עטלעכע פלאַנצן מינים מיט Anthracis, אַרייַנגערעכנט Stylosanthes humilis און C. gloeosporioides, Lens culinaris און C. truncatum, Phaseolus vulgaris און C. lindemuthianum, Cucumis sativus און C. lagenarium 73,74,75,76. די ענטפער איז זייער שנעל, מאל אפילו ביי 4 HPI, איידער די פונגוס פּענאַטרייץ די פלאַנצן געוועב 73. די פּעראָקסידאַזע ​​דזשין אויך רעאַגירט צו D. toxica NLL ינאַקיאַליישאַן. אין אַדישאַן צו זייער טיפּיש פאַנגקשאַנז צו רעגולירן אָקסידאַטיוו בערסט אָדער עלימינירן אָקסידאַטיוו דרוק, פּעראָקסידאַזעס קענען ינטערפיר מיט פּאַטאַדזשען וווּקס דורך קריייטינג גשמיות באַריערז באזירט אויף צעל וואַנט ריינפאָרסמאַנט בעשאַס ליגניפיקאַטיאָן, סובוניט אָדער קראָס-לינקינג פון ספּעציפיש קאַמפּאַונדז. די פונקציע קען מען צושרייבן אין סיליקאָ צום TanjilG_03329 גען וואָס קאָדירט אַ מעגלעכע ליגנין-פאָרמענדיקע אניאָן פּעראָקסידאַזע, וואָס איז געווען באַדייטנד אַרויפֿרעגולירט אין אונדזער שטודיע אין דער 83A:476 קעגנשטעליקער ליניע ביי 6 HPI, אָבער נישט אין אַנדערע שטאַמען און צייטפּונקטן וואָס האָבן נישט רעאַגירט.
9S-/13S-ליפּאָקסיגענאַז פון לינאָלעיק זויער איז דער ערשטער שריט אין דעם אָקסידאַטיוון וועג פון ליפּיד ביאָסינטעז78. די פּראָדוקטן פון דעם וועג האָבן קייפל פונקציעס אין פלאַנצן פאַרטיידיקונג, אַרייַנגערעכנט צעל וואַנט פֿאַרשטאַרקונג דורך די פאָרמירונג פון קאַלאָוז און פּעקטין דיפּאַזאַץ, און רעגולירן פון אָקסידאַטיוו דרוק דורך די פּראָדוקציע פון ​​רעאַקטיוו זויערשטאָף מינים79,80,81,82,83. אין דער איצטיקער שטודיע, איז די אויסדרוק פון לינאָלעיק זויער 9S-/13S-ליפּאָקסיגענאַז געווען געביטן אין אַלע שטאַמען, אָבער אין דער סאַסעפּטאַבאַל באַפעלקערונג 22660, האָט ופּרעגולאַציע געהערשט אין פאַרשידענע צייט פונקטן, בשעת אין שטאַמען וואָס טראָגן קעגנשטעליק Lanr1 און די AnMan אַלעל, אונטערשטרייכט עס די דיווערסיפיקאַציע פון ​​​​די אָקסיליפּין שיכט אין פּראַטעקטיוו אַנטראַקס רעאַקציעס צווישן די גענאָטיפּעס.
דער 1-אַמינאָסיקלאָפּראָפּאַן-1-קאַרבאָקסילאַט אָקסידאַז (ACO) האָמאָלאָג איז געווען באַדייטנד אַרויפֿרעגולירט (9 גענעס) אָדער אַראָפּרעגולירט (2 גענעס) ווען ינאָקולירט מיט לופּין. מיט צוויי אויסנעמען, אַלע די רעאַקציעס זענען פארגעקומען ביי 6 הפּ. ביי 83A:476. די ענזימאַטישע רעאַקציע מעדיאַטעד דורך ACO פּראָטעינס איז דער ראַטע-לימיטינג שריט אין עטאַלין פּראָדוקציע און איז דעריבער העכסט רעגולירט84. עטאַלין איז אַ פלאַנצן האָרמאָן וואָס שפּילט אַ פאַרשיידנקייט פון ראָלעס אין רעגולירן פלאַנצן אַנטוויקלונג און רעאַקציע צו אַביאָטישע און ביאָטישע דרוק באדינגונגען. די אינדוקציע פון ​​ACO טראַנסקריפּציע און אַקטיוואַציע פון ​​די עטאַלין סיגנאַלינג פּאַטוויי זענען ינוואַלווד אין ינקריסינג די קעגנשטעל פון רייַז צו די העמיביאָטראָפיק פונגוס אָריזאַע אָריזאַע דורך רעגולירן די פּראָדוקציע פון ​​רעאַקטיוו זויערשטאָף מינים און פיטאָאַלעקסינס. א זייער ענלעכער בלאט-אינפעקציע פראצעס געפונען צווישן M. oryzae און C. lupini88,89, קעגן דעם הינטערגרונט פון א באדייטנדיקער פארגרעסערונג פון ACO האמאלאגן אין דער 83A:476 ליניע באריכטעט אין דעם שטודיע, פארשיבט די מעגלעכקייט פון געבן קעגנשטעל צו NLL אנטראקאנאזע עטילן, א סיגנאלינג צענטראלן שריט אין מאלעקולארע וועגן.
אין דער איצטיקער שטודיע, איז גרויס-מאסשטאביגע אונטערדריקונג פון פילע גענעס פארבונדן מיט פאָטאָסינטעז באמערקט געווארן ביי 6 הפּאי אין 83A:476 און ביי 48 הפּאי אין מאַנדלופּ און די 22660 באַפעלקערונג. די מאָס און פּראָגרעס פון די ענדערונגען איז פּראָפּאָרציאָנעל צו דעם לעוועל. אַנטראַקאָזע קעגנשטעל איז באמערקט געווארן אין דעם עקספּערימענט. לעצטנס, איז שטאַרקע און פריע אונטערדריקונג פון פאָטאָסינטעז-פארבונדענע טראַנסקריפּטן געמאלדן געווארן אין עטלעכע מאָדעלן פון פלאַנצן-פּאַטאָגען ינטעראַקשאַנז, אַרייַנגערעכנט פּאַטאָגענע באַקטעריעס און פונגי. האַסטע (פון 2 הפּאי אין עטלעכע ינטעראַקשאַנז) און גלאָבאַלע אונטערדריקונג פון גענעס פארבונדן מיט פאָטאָסינטעז אין ענטפער צו ינפעקציע קענען אויסלעזן פלאַנצן ימיונאַטי באזירט אויף די דיפּלוימאַנט פון רעאַקטיווע זויערשטאָף מינים און זייער ינטעראַקשאַן מיט די סאַליסיליק זויער פּאַטוויי צו מעדיאַטירן אַלערגישע רעאַקציעס 90,94.
אין מסקנא, פארטיידיקונג רעאקציע מעקאניזמען פארגעשלאגן פאר די מערסט קעגנשטעליקע ליניע (83A:476) שליסן איין שנעלע פאטאגען דערקענונג דורך די R גענע (מסתּמא TIR-NBS-LRR TanjilG_05042) און אלערגישע רעאקציע-געפירטע סאַליסיליק זויער און עטילען סיגנאַלינג, נאכגעפאלגט דורך אויפשטעלן לאנג-רייכווייטיגע SAR. די אקציע ווערט געשטיצט דורך די DIR-1 פּראָטעין. עס זאָל באַמערקט ווערן אַז די ביאָטראָפֿישע פּעריאָדע פֿאַר C. lupini אינפעקציע איז זייער קורץ (בעער 2 טעג), נאכגעפאלגט דורך נעקראָטישן וואוקס95. דער איבערגאַנג צווישן די סטאַגעס קען זיין פארבונדן מיט נעקראָזיס און אויסדרוק פון עטילען-ינדוסירבארע פּראָטעאינען וואָס אַקטן ווי טריגערס פֿאַר היפּערסענסיטיוויטי רעאַקציעס אין באַלעבאָס פלאַנצן. דעריבער, די צייט פֿענצטער פֿאַר מצליח כאַפּן פון C. lupini אין די ביאָטראָפֿישע בינע איז זייער שמאָל. די רעפּראָגראַממינג פון גענעס פארבונדן מיט רעדאָקס און פאָטאָסינטעז באמערקט אין 83A:476 ביי 6 הפּי איז קאָנסיסטענט מיט די פּראָגרעס פון פונגאַל היפֿע און כאָרדז די אַנטוויקלונג פון אַ מצליח פּראַטעקטיוו רעאקציע אין די ביאָטראָפֿישע בינע. די טראַנסקריפּטאָמישע רעאַקציעס פון מאַנדעלופּ און די 22660 פּאָפּולאַציע זענען אפשר צו שפּעט צו כאַפּן דעם פונגוס איידער עס גייט איבער צו נעקראָטישן וואוקס, אָבער, מאַנדעלופּ קען זיין מער עפעקטיוו ווי די 22660 פּאָפּולאַציע ווייל די רעלאַטיוו שנעלע רעגולאַציע פון ​​די PR-10 פּראָטעין פּראָמאָטירט האָריזאָנטאַלע קעגנשטעל.
ETI, געטריבן דורך דעם קאנאנישן R גען, שיינט צו זיין א געוויינטלעכער מעכאניזם פאר בינען קעגנשטעל צו אנטראקאזע. אזוי, אין דעם מאדעל לעגומע Medicago truncatula, ווערט קעגנשטעל צו אנטראקאזע געגעבן דורך דעם RCT1 גען, א מיטגליד פון דער TIR-NBS-LRR97 פלאנץ R גען קלאס. דאס גען גיט אויך ברייט-ספעקטרום אנטראקאזע קעגנשטעל אין אלפאלפא ווען עס ווערט טראנספערירט צו סוספעקטיווע פלאנצן. אין דער געוויינלעכער בין (P. vulgaris), זענען מער ווי צוויי טוץ אנטראקאזע קעגנשטעל גענען ביז היינט אידענטיפיצירט געווארן. עטלעכע פון ​​די גענען געפינען זיך אין ראיאנען וואו עס פעלט קיין קאנאנישע R גענען, אבער פילע אנדערע געפינען זיך ביי די ברעגן פון כראמאזאמען וואס טראגן דעם NBS-LRR גען קלאסטער, אריינגערעכנט TIR-NBS-LRRs99. די גענאם-ברייטע SSR שטודיע האט אויך באשטעטיקט די פארבינדונג פון דעם NBS-LRR גען מיט אנטראקאזע קעגנשטעל אין דער געוויינלעכער בין. דער קאנאנישער R גען איז אויך געפונען געווארן אין דער גענאמישער ראיאן וואס טראגט דעם הויפט אנטראקאזע קעגנשטעל לאקוס אין ווייסער לופין 101.
אונדזער ארבעט ווייזט אז אן אוממיטלבארע קעגנשטאנד רעאקציע, אקטיוויזירט אין א פריער שטאפל פון פלאנץ אינפעקציע (בעסער נישט שפעטער ווי 12 שעה א טאג), באשיצט עפעקטיוו שמאל-בלעטעריגע לופינע פון ​​אנטראקאזע געפארשאפט דורך דעם פאטאגענישן פונגוס קאלעלאטריטשום לופיני. ניצנדיג הויך-דורכפיר סיקווענסינג, האבן מיר דעמאנסטרירט דיפערענציעלע אויסדרוק פראפיילן פון אנטראקאזע קעגנשטאנד גענעס אין NLL פלאנצן מעדיעירט דורך די לאנר1 און אנאמען קעגנשטאנד גענעס. ערפאלגרייכע פארטיידיגונג באשטייט פון קערפול דיזיינען די גענעס פאר פראטעאינען וואס זענען פארמישט אין רעדאקס, פאטאצעניס, און פאטאגענעזיס אינערהאלב שעה פון דער פלאנץ'ס ערשטן קאנטאקט מיט א פאטאגן. ענלעכע באשיצנדיקע רעאקציעס, אבער פארשפעטיקט אין צייט, זענען פיל ווייניגער עפעקטיוו אין באשיצן פלאנצן פון קראנקהייטן. אנטראקס קעגנשטאנד מעדיעירט דורך דעם לאנר1 גען גלייכט די טיפישע שנעלע רעאקציע פון ​​דעם R גען (עפעקטאר-טריגערד אימוניטעט), בשעת דער אנאמען גען גיט מסתמא א האריזאנטאלע רעאקציע (אימוניטעט טריגערד דורך א מיקראב-פארבונדענע מאלעקולארע מוסטער), צושטעלנדיג א מיטלמעסיגע מדרגה פון נאכהאלטיקייט.
די 215 NLL ליניעס גענוצט צו סקרינען פֿאַר אַנטראַקאָזע מאַרקערס האָבן באַשטאַנען פֿון 74 קולטיוואַרס, 60 ליניעס באַקומען דורך קראָסינג אָדער ברידינג, 5 מוטאַנץ, און 76 ווילדע אָדער אָריגינעלע דזשערמפּלאַזמען. די ליניעס זענען געקומען פֿון 17 לענדער, הויפּטזעכלעך פֿון פּוילן (58), שפּאַניע (47), דײַטשלאַנד (27), אויסטראַליע (26), רוסלאַנד (19), ווײַסרוסלאַנד (7), איטאַליע (5) און אַנדערע ליניעס פֿון 10 לענדער. דער סכום כולל אויך רעפֿערענץ-קעגנשטעליקע ליניעס: 83A:476, טאַנדזשיל, וואָנגאַ וואָס טראָגן דעם Lanr1 אַלעל, און מאַנדעלופּ וואָס טראָגן דעם AnMan אַלעל. די ליניעס זענען באַקומען פֿון דער אייראָפּעיִשער לופּין גענעטישער רעסורס דאַטאַבאַזע וואָס ווערט געהאַלטן דורך Poznań Plant Breeding Ltd., Wiatrowo, פּוילן (צוגאב טאַבעלע S1).
פלאנצן זענען געוואקסן אונטער קאנטראלירטע באדינגונגען (פאָטאָפּעריאָד 16 שעה, טעמפּעראַטור 25°C בעתן טאָג און 18°C ​​ביינאכט). צוויי ביאָלאָגישע רעפּליקאַטן זענען אַנאַליזירט געוואָרן. דנאַ איז אפגעזונדערט געוואָרן פון דריי וואָכן אַלטע בלעטער מיטן DNeasy Plant Mini Kit (Qiagen, Hilden, דייטשלאַנד) לויטן פּראָטאָקאָל. די קוואַליטעט און קאָנצענטראַציע פון ​​דער אפגעזונדערטער דנאַ איז אָפּגעשאַצט געוואָרן דורך ספּעקטראָפאָטאָמעטרישע מעטאָדן (NanoDrop 2000; Thermo Fisher Scientific, Waltham, MA, USA). דער AnManM1 מאַרקער וואָס מאַרקירט דעם אַנטראַקאָזע קעגנשטעל גען AnMan (דערייווד פון cv. Mandelup) און די מאַרקערס Anseq3 און Anseq4 וואָס פלאַנקירן דעם גען Lanr1 (דערייווד פון cv. Tanjil) זענען אַנאַליזירט געוואָרן 11,26,28. האָמאָזיגאָטן פֿאַר דעם קעגנשטעליקן אַלעל זענען געשאַצט געוואָרן ווי "1", סאַסעפּטאַבאַל - ווי "0", און העטעראָזיגאָטן - ווי 0.5.
באַזירט אויף די רעזולטאַטן פון סקרינינג פֿאַר מאַרקערס AnManM1, AnSeq3 און AnSeq4 און די פֿאַרפֿיגבאַרקייט פֿון זוימען פֿאַר לעצטע נאָכפֿאָלג עקספּערימענטן, זענען 50 NLL ליניעס אויסגעקליבן געוואָרן פֿאַר אַנטראַקאָזע קעגנשטעל פֿענאָטייפּינג. די אַנאַליז איז דורכגעפֿירט געוואָרן אין דופּליקאַט אין אַ קאָמפּיוטער קאָנטראָלירטן גרינכאַוס מיט אַ 14 שעה פֿאָטאָפּעריִאָד מיט אַ טעמפּעראַטור קייט פֿון 22°C בעתן טאָג און 19°C בייַ נאַכט. די זוימען ווערן געקראַצט (אָפּשניידן די זוימען מאַנטל אויף דער אַנדערער זייט פֿון דעם עמבריאָ מיט אַ שאַרפֿן בלייד) פֿאַר זייען צו פֿאַרמייַדן זוימען דאָרמאַנסי צוליב דעם זוימען מאַנטל וואָס איז צו שווער און צו זיכער מאַכן מונדיר קערנינג. פלאַנצן זענען געוואַקסן אין טאָפּן (11 × 11 × 21 סענטימעטער) מיט סטעריל ערד (TS-1 REC 085 Medium Basic, Klasmann-Deilmann Polska, Warszawa, Poland). אינאקולאציע איז דורכגעפירט געווארן מיטן Colletotrichum lupini Col-08 שטאַם, וואָס איז געוואַקסן אין 1999 פֿון די שטאַמען פֿון שמאָל-בלעטעריקע לופּין פלאַנצן וואָס זענען געוואַקסן אין אַ פֿעלד אין ווערזשעניצאַ, גרויס-פּויליש (52° 27′ 42″ N 17° 04′ 05″ E). נעמט אַ שטח. די איזאָלאַטן זענען קאָלטיווירט געוואָרן אין SNA מעדיום ביי 20°C אונטער שוואַרצער ליכט פֿאַר 21 טעג צו אינדוצירן ספּאָרולאַציע. פֿיר וואָכן נאָך זייען, ווען די פלאַנצן האָבן דערגרייכט דעם 4-6 בלעטער בינע, איז אינאקולאציע דורכגעפירט געוואָרן דורך שפּריצן מיט אַ סאַספּענשאַן פֿון קאָנידיאַ אין אַ קאָנצענטראַציע פֿון 0.5 x 106 קאָנידיאַ פּער מל. נאָך אינאקולאציע, זענען די פלאַנצן געהאַלטן געוואָרן אין דער פֿינצטערניש פֿאַר 24 שעה ביי אַ פֿײַכטקייט פֿון בערך 98% און אַ טעמפּעראַטור פֿון 25°C צו פֿאַרלייכטערן די קײַמונג פֿון קאָנידיאַ און דעם אינפעקציע פּראָצעס. די פלאַנצן זענען דעמאָלט געוואַקסן אונטער אַ 14-שעה פאָטאָפּעריאָד ביי 22°C טאָג/19°C נאַכט און 70% הומידיטי. דער קראַנקהייט סקאָר איז געמאַכט 22 טעג נאָך ינאָקולאַציע און איז געווען פון 0 (אימון) ביז 9 (זייער סאַסעפּטאַבאַל) דיפּענדינג אויף די בייַזייַן אָדער אַוועק פון נעקראָטישע לעזשאַנז אויף סטעמס און בלעטער. אין אַדישאַן, נאָך סקאָרינג, איז די וואָג פון די פלאַנצן געמאָסטן. באַציִונגען צווישן מאַרקער גענאָטיפּס און קראַנקהייט פענאָטייפּס זענען קאַלקיאַלייטיד ווי פונט צוויי-סיקוואַנס קאָרעליישאַנז (אַוועזנהייט פון העטעראָזיגאָוס מאַרקערס אין די סכום פון שורות פֿאַר אַנאַליז פון די אַנטראַקאָסע קעגנשטעל פענאָטיפּ).