లూపిన్ ఆంత్రాసిస్‌లో ఆంత్రాక్నోస్‌కు వ్యతిరేకంగా విజయవంతమైన రక్షణలో రెడాక్స్, కిరణజన్య సంయోగక్రియ మరియు వ్యాధికారకంలో పాల్గొన్న జన్యువుల వేగవంతమైన మరియు సమన్వయంతో కూడిన రీప్రొగ్రామింగ్ ఉంటుంది.

Nature.com ని సందర్శించినందుకు ధన్యవాదాలు. మీరు ఉపయోగిస్తున్న బ్రౌజర్ వెర్షన్ పరిమిత CSS మద్దతును కలిగి ఉంది. ఉత్తమ అనుభవం కోసం, మీరు నవీకరించబడిన బ్రౌజర్‌ను ఉపయోగించాలని మేము సిఫార్సు చేస్తున్నాము (లేదా ఇంటర్నెట్ ఎక్స్‌ప్లోరర్‌లో అనుకూలత మోడ్‌ను నిలిపివేయండి). ఈలోగా, నిరంతర మద్దతును నిర్ధారించడానికి, మేము సైట్‌ను శైలులు మరియు జావాస్క్రిప్ట్ లేకుండా రెండర్ చేస్తాము.
అంగుస్టిఫోలియస్ లూపిన్ (NLL, లూపినస్ అంగుస్టిఫోలియస్ L.) అనేది ఆహార ఉత్పత్తి మరియు నేల మెరుగుదల కోసం ఉపయోగించే ఒక పప్పుదినుసు మొక్క. NLL పంటగా ప్రపంచవ్యాప్తంగా విస్తరించడం వలన అనేక వ్యాధికారక శిలీంధ్రాలు ఆకర్షించబడ్డాయి, వీటిలో లూపిన్ ఆంత్రాక్నోస్ కూడా ఉంది, ఇది వినాశకరమైన ఆంత్రాక్నోస్ వ్యాధికి కారణమవుతుంది. పెరిగిన నిరోధకతను అందించే రెండు యుగ్మ వికల్పాలు, Lanr1 మరియు AnMan, NLL పెంపకంలో ఉపయోగించబడ్డాయి, కానీ అంతర్లీన పరమాణు విధానాలు తెలియవు. ఈ అధ్యయనంలో, యూరోపియన్ NLL నమూనాలను పరీక్షించడానికి Lanr1 మరియు AnMan గుర్తులను ఉపయోగించారు. నియంత్రిత వాతావరణంలో వ్యాక్సిన్ పరీక్ష నిరోధక దాతల రెండింటి సామర్థ్యాన్ని నిర్ధారించింది. ప్రాతినిధ్య నిరోధక మరియు అనుమానాస్పద రేఖలపై విభిన్న జన్యు వ్యక్తీకరణ ప్రొఫైలింగ్ నిర్వహించబడింది. ఆంత్రాక్నోస్ నిరోధకత "GO:0006952 డిఫెన్స్ రెస్పాన్స్", "GO:0055114 రెడాక్స్ ప్రాసెస్" మరియు "GO:0015979 కిరణజన్య సంయోగక్రియ" అనే జన్యు ఆన్టాలజీ పదాల అతిగా వ్యక్తీకరణతో సంబంధం కలిగి ఉంది. అదనంగా, Lanr1(83A:476) లైన్ ఇనాక్యులేషన్ తర్వాత వేగంగా గణనీయమైన ట్రాన్స్క్రిప్టోమ్ రీప్రోగ్రామింగ్‌ను చూపించింది, అయితే ఇతర లైన్లు ఈ ప్రతిస్పందనలో దాదాపు 42 గంటల ఆలస్యాన్ని చూపించాయి. రక్షణ ప్రతిస్పందనలు TIR-NBS, CC-NBS-LRR మరియు NBS-LRR జన్యువులతో సంబంధం కలిగి ఉంటాయి, పాథోజెనిసిస్‌లో పాల్గొన్న 10 ప్రోటీన్లు, లిపిడ్ బదిలీ ప్రోటీన్లు, ఎండోగ్లూకాన్-1,3-β-గ్లూకోసిడేస్, గ్లైసిన్-రిచ్ సెల్ వాల్ ప్రోటీన్లు మరియు ఆక్సిజన్ రియాక్టివ్ పాత్ నుండి జన్యువులు. కిరణజన్య సంయోగక్రియతో సంబంధం ఉన్న జన్యువులను జాగ్రత్తగా అణచివేయడంతో సహా 83A:476కి ప్రారంభ ప్రతిస్పందనలు శిలీంధ్ర జీవశాస్త్రం యొక్క వృక్షసంపద పెరుగుదల దశలో విజయవంతమైన రక్షణతో సమానంగా ఉన్నాయి, ఇది ఎఫెక్టర్ రోగనిరోధక శక్తిని ప్రేరేపిస్తుందని సూచిస్తుంది. మాండెలూప్ ప్రతిచర్య నెమ్మదిస్తుంది, అలాగే మొత్తం క్షితిజ సమాంతర డ్రాగ్ కూడా.
ఇరుకైన-ఆకులతో కూడిన లూపిన్ (NLL, లూపినస్ అంగుస్టిఫోలియస్ L.) పశ్చిమ మధ్యధరా ప్రాంతంలో ఉద్భవించిన అధిక ప్రోటీన్ కలిగిన తృణధాన్యం1,2. దీనిని ప్రస్తుతం జంతువులు మరియు మానవులకు ఆహార పంటగా పండిస్తున్నారు. సహజీవన నత్రజని ఫిక్సింగ్ బ్యాక్టీరియా ద్వారా నత్రజని స్థిరీకరణ మరియు నేల నిర్మాణం యొక్క మొత్తం మెరుగుదల కారణంగా పంట భ్రమణ వ్యవస్థలలో దీనిని పచ్చి ఎరువుగా కూడా పరిగణిస్తారు. NLL గత శతాబ్దంలో పెంపకం యొక్క వేగవంతమైన ప్రక్రియకు గురైంది మరియు ఇప్పటికీ అధిక సంతానోత్పత్తి ఒత్తిడిలో ఉంది3,4,5,6,7,8,9,10,11,12. NLL యొక్క విస్తృత సాగుతో, వ్యాధికారక శిలీంధ్రాల వారసత్వం కొత్త వ్యవసాయ సముదాయాలను అభివృద్ధి చేసింది మరియు కొత్త పంట-నాశనం చేసే వ్యాధులకు కారణమైంది. లూపిన్ రైతులు మరియు పెంపకందారులకు అత్యంత ముఖ్యమైన విషయం ఏమిటంటే, కోల్లెటోట్రిఖమ్ లుపిని (బోండార్) నిరెన్‌బర్గ్, ఫీలర్ & హాగెడోర్న్ అనే వ్యాధికారక శిలీంధ్రాల వల్ల కలిగే ఆంత్రాక్నోస్ కనిపించడం. లూపిన్ రైతులు మరియు పెంపకందారులకు అత్యంత ముఖ్యమైన విషయం ఏమిటంటే, కోల్లెటోట్రిఖమ్ లుపిని (బోండార్) నిరెన్‌బర్గ్, ఫీలర్ & హాగెడోర్న్ అనే వ్యాధికారక శిలీంధ్రాల వల్ల కలిగే ఆంత్రాక్నోస్ కనిపించడం. ఫెర్మెరోవ్ మరియు సెలెక్సియోనెరోవ్ లుపినా బైలో పోయావ్లెనియెన్ యాంట్రాక్నోజా, వాగ్నోవా గ్రిబ్కామ్ కొల్లెటోట్రిచమ్ లుపిని (బోండార్) నిరెన్‌బర్గ్, ఫీలర్ & హగెడోర్న్13. లూపిన్ రైతులు మరియు పెంపకందారులకు అత్యంత ముఖ్యమైన విషయం ఏమిటంటే, కొల్లెటోట్రిఖమ్ లుపిని (బొండార్) నిరెన్‌బర్గ్, ఫీలర్ & హాగెడోర్న్ అనే వ్యాధికారక శిలీంధ్రాల వల్ల కలిగే ఆంత్రాక్నోస్ ఆవిర్భావం.对于羽扇豆农民和饲养者来说,最引人注目的是炭疽病的出现,它是由病原,它是由病原) నిరెన్‌బర్గ్, ఫీలర్ & హగెడోర్న్13 引起的。对于羽扇豆农民和饲养者来说,最引人注目的是炭疽病的出现,它是由病原(బోండార్)嵵జుట్టు。1 ఫెర్మెరోవ్ మరియు సెలెక్సియోనెరోవ్ ల్యుపినా యావ్లాయెట్సియా పోయావ్లేని యాంట్రాక్నోజా, విమోచన గ్రిబ్కామ్ కొల్లెటోట్రిచమ్ లుపిని (బోండార్) నిరెన్‌బర్గ్, ఫీలర్ & హగెడోర్న్13. లూపిన్ రైతులు మరియు పెంపకందారులకు అత్యంత ఆకర్షణీయమైన విషయం ఏమిటంటే, కొల్లెటోట్రిఖమ్ లుపిని (బొండార్) నిరెన్‌బర్గ్, ఫీలర్ & హాగెడోర్న్ అనే వ్యాధికారక శిలీంధ్రాల వల్ల కలిగే ఆంత్రాక్నోస్ ఆవిర్భావం.ఈ వ్యాధి గురించి మొట్టమొదటి నివేదికలు బ్రెజిల్ మరియు యునైటెడ్ స్టేట్స్ నుండి వచ్చాయి, సాధారణ లక్షణాలు వరుసగా 1912 మరియు 1929 లలో కనిపించాయి. అయితే, దాదాపు 30 సంవత్సరాల తర్వాత, వ్యాధికారకాన్ని కొల్లెటోట్రిఖమ్ గ్లోయోస్పోరియోయిడ్స్ (పెన్జ్.) పెన్జ్‌గా గుర్తించారు. & సాక్., టెలిమోర్ఫ్ గ్లోమెరెల్లా సింగులాటా (స్టోన్‌మ్యాన్) స్పాల్డ్. & సాక్., టెలిమోర్ఫ్ గ్లోమెరెల్లా సింగులాటా (స్టోన్‌మ్యాన్) స్పాల్డ్. & సాక్., టెలియోమోర్ఫ్ గ్లోమెరెల్లా సింగ్యులాటా (స్టోన్‌మ్యాన్) స్పాల్డ్. & సాక్., గ్లోమెరెల్లా సింగులాటా (స్టోన్‌మ్యాన్) స్పాల్డ్ యొక్క టెలిమోర్ఫ్. & సాక్.,有目的形态的గ్లోమెరెల్లా సింగ్యులాటా (స్టోన్‌మ్యాన్) స్పాల్డ్。 & సాక్.,有目的形态的గ్లోమెరెల్లా సింగ్యులాటా (స్టోన్‌మ్యాన్) స్పాల్డ్。 & సాక్., గ్లోమెరెల్లా సింగ్యులాటా (స్టోన్‌మ్యాన్) స్పాల్డ్ మరియు డెలెనాప్రావ్లెన్నోయ్ మోర్‌ఫోలాగీలు. & సాక్., టార్గెటెడ్ మార్ఫాలజీలో గ్లోమెరెల్లా సింగులాటా (స్టోన్‌మ్యాన్) స్పాల్డ్. & హెచ్. ష్రెన్క్,. & హెచ్. ష్రెన్క్, .మరియు హెచ్. ష్రెన్క్. & H.施伦克,. & H.施伦克,.మరియు హెచ్. ష్లెంక్, .20వ శతాబ్దం మధ్యలో చేసిన ప్రాథమిక వ్యాధి ఫినోటైపింగ్ NLL మరియు పసుపు లూపిన్ (L. లూటియస్ L.) యాక్సెషన్లలో కొంత నిరోధకతను చూపించింది, కానీ పరీక్షించబడిన అన్ని తెల్ల లూపిన్ (L. ఆల్బస్ L.) యాక్సెషన్లు ఎక్కువగా ప్రభావితమయ్యాయి15,16. ఆంత్రాక్నోస్ అభివృద్ధి పెరిగిన అవపాతం (గాలి తేమ) మరియు ఉష్ణోగ్రత (12-28°C పరిధిలో)తో సంబంధం కలిగి ఉందని అధ్యయనాలు చూపించాయి, ఇది అధిక ఉష్ణోగ్రతల వద్ద నిరోధకత ఉల్లంఘనకు దారితీస్తుంది17, 18. వాస్తవానికి, కోనిడియా మొలకెత్తడానికి మరియు వ్యాధి ప్రారంభం కావడానికి అవసరమైన సమయం, అధిక తేమ పరిస్థితులలో 12°C (16 గంటలు) కంటే 24°C (4 గంటలు) వద్ద నాలుగు రెట్లు తక్కువగా ఉంది19. అందువల్ల, కొనసాగుతున్న గ్లోబల్ వార్మింగ్ ఆంత్రాక్నోస్ వ్యాప్తికి దారితీసింది. అయితే, ఈ వ్యాధి ఫ్రాన్స్ (1982) మరియు ఉక్రెయిన్ (1983)లలో రాబోయే ముప్పుకు సూచనగా గమనించబడింది, కానీ ఆ సమయంలో లూపిన్ పరిశ్రమ దీనిని విస్మరించింది20,21. కొన్ని సంవత్సరాల తరువాత, ఈ వినాశకరమైన వ్యాధి ప్రపంచవ్యాప్తంగా వ్యాపించింది మరియు ఆస్ట్రేలియా, పోలాండ్ మరియు జర్మనీ వంటి ప్రధాన లూపిన్ ఉత్పత్తి చేసే దేశాలను కూడా ప్రభావితం చేసింది22,23,24. 1990ల మధ్యలో ఆంత్రాక్నోస్ వ్యాప్తి తరువాత, విస్తృతమైన స్క్రీనింగ్ ఫలితంగా NLL19 నమూనాలలో అనేక నిరోధక దాతలను గుర్తించారు. ఆంత్రాక్నోస్‌కు NLL నిరోధకత వివిధ జెర్మ్‌ప్లాజమ్ మూలాలలో కనిపించే రెండు వేర్వేరు ఆధిపత్య యుగ్మ వికల్పాల ద్వారా నియంత్రించబడుతుంది: కల్టివర్ టాంజిల్ మరియు వోంగాలో లాన్ర్1 మరియు కల్టివర్‌లో అన్‌మాన్. మండలే 25, 26. ఈ యుగ్మ వికల్పాలు సంతానోత్పత్తి కార్యక్రమాలలో నిరోధక జెర్మ్‌ప్లాజమ్ ఎంపికకు మద్దతు ఇచ్చే పరమాణు గుర్తులను పూర్తి చేస్తాయి25,26,27,28,29,30. ఆంత్రాక్నోస్ నిరోధకత కోసం RIL జనాభా విభజనను పొందడానికి Lanr1 యుగ్మ వికల్పాన్ని మోసుకెళ్ళే నిరోధక సంతానోత్పత్తి రేఖ 83A:476 ను ససెప్టబుల్ వైల్డ్ లైన్ P27255 తో దాటారు, దీని వలన Lanr1 లోకస్‌ను NLL-1131, 32, 33 క్రోమోజోమ్‌కు కేటాయించడం సాధ్యమైంది. జెనోమిక్ ఫ్రేమ్‌వర్క్‌తో పార్శ్వ నిరోధక లోకి నుండి ఆంత్రాక్నోస్‌కు లింకేజ్ మ్యాప్ మార్కర్‌లను సమలేఖనం చేయడం ద్వారా, NLL ఒకే క్రోమోజోమ్‌పై (NLL-11) మూడు యుగ్మ వికల్పాల స్థానాన్ని వెల్లడించింది, కానీ వేర్వేరు స్థానాల్లో 29,34,35. అయితే, తక్కువ సంఖ్యలో RILలు మరియు మార్కర్‌లు మరియు సంబంధిత యుగ్మ వికల్పాల మధ్య పెద్ద జన్యు దూరం కారణంగా, వాటి అంతర్లీన జన్యువుల గురించి నమ్మదగిన తీర్మానాలు తీసుకోలేము. మరోవైపు, లూపిన్‌లలో రివర్స్ జెనెటిక్స్ వాడకం కష్టం ఎందుకంటే వాటి చాలా తక్కువ పునరుత్పత్తి సామర్థ్యం, ​​ఇది జన్యు మానిప్యులేషన్‌ను గజిబిజిగా చేస్తుంది37.
83A:476 (Lanr1) మరియు మాండెలప్ (AnMan) వంటి హోమోజైగస్ స్థితిలో కావలసిన యుగ్మ వికల్పాన్ని మోసే పెంపుడు జెర్మ్‌ప్లాజమ్ అభివృద్ధి, అడవి జనాభాలో యుగ్మ వికల్పాల వ్యతిరేక కలయికల ఉనికిని ఎదుర్కొంటున్నప్పుడు ఆంత్రాక్నోస్ నిరోధకతను అధ్యయనం చేయడానికి తలుపులు తెరిచింది. పరమాణు విధానాల అవకాశాలు. నిర్దిష్ట జన్యురూపాల ద్వారా ఉత్పన్నమయ్యే రక్షణ ప్రతిస్పందనలను పోల్చండి. ఈ అధ్యయనం C. లుపిని టీకాకు NLL యొక్క ప్రారంభ ట్రాన్స్క్రిప్టోమ్ ప్రతిస్పందనను అంచనా వేసింది. మొదట, Lanr1 మరియు AnMan యుగ్మ వికల్పాలను గుర్తించే మాలిక్యులర్ మార్కర్‌లను ఉపయోగించి 215 లైన్‌లను కలిగి ఉన్న యూరోపియన్ NLL జెర్మ్‌ప్లాజమ్ ప్యానెల్‌ను పరీక్షించారు. ఆంత్రాక్నోస్ ఫినోటైపింగ్‌ను నియంత్రిత పరిస్థితులలో గతంలో మాలిక్యులర్ మార్కర్‌ల కోసం ఎంచుకున్న 50 NLL లైన్‌లపై ప్రదర్శించారు. ఈ ప్రయోగాల ఆధారంగా, ఆంత్రాక్నోస్ నిరోధకత మరియు Lanr1/AnMan అల్లెలిక్ కూర్పులో విభిన్నమైన నాలుగు లైన్‌లను రెండు పరిపూరకరమైన విధానాలను ఉపయోగించి అవకలన రక్షణ జన్యు వ్యక్తీకరణ ప్రొఫైలింగ్ కోసం ఎంపిక చేశారు: అధిక-త్రూపుట్ RNA సీక్వెన్సింగ్ మరియు రియల్-టైమ్ PCR క్వాంటిఫికేషన్.
Lanr1 (Anseq3 మరియు Anseq4) మరియు AnMan (Anseq4) మరియు AnMan (AnManM1) మార్కర్లతో కూడిన NLL జెర్మ్‌ప్లాజమ్ (N = 215) సమితిని పరీక్షించినప్పుడు, అన్ని మార్కర్లకు ఒకే ఒక లైన్ (95726, సలామాంకా-బి దగ్గర) “నిరోధకత” యుగ్మ వికల్పాన్ని విస్తరిస్తుందని తేలింది, అయితే “'సుస్సెప్టబుల్' యుగ్మ వికల్పాల ఉనికి” 158 (~73.5%) లైన్లలో అన్ని మార్కర్ల నిష్పత్తిని కనుగొంది. పదమూడు లైన్లు Lanr1 మార్కర్ యొక్క రెండు “నిరోధక” యుగ్మ వికల్పాలను ఉత్పత్తి చేశాయి మరియు 8 లైన్లు Lanr1 యొక్క “నిరోధక” యుగ్మ వికల్పాలను ఉత్పత్తి చేశాయి. AnMan మార్కర్ యొక్క “నిరోధకత” యుగ్మ వికల్పం (సప్లిమెంటరీ టేబుల్ S1). రెండు లైన్లు Anseq3 మార్కర్‌కు హెటెరోజైగస్ మరియు AnManM1 మార్కర్‌కు ఒక హెటెరోజైగస్. 42 పంక్తులు (19.5%) Anseq3 మరియు Anseq4 యుగ్మ వికల్పాల యొక్క వ్యతిరేక దశలను కలిగి ఉన్నాయి, ఇది ఈ రెండు స్థానాల మధ్య అధిక ఫ్రీక్వెన్సీ పునఃసంయోగాన్ని సూచిస్తుంది. నియంత్రిత పరిస్థితులలో (సప్లిమెంటరీ టేబుల్ S2) ఆంత్రాక్నోస్ ఫినోటైప్‌లు పరీక్షించబడిన జన్యురూపాల నిరోధకతలో వైవిధ్యాన్ని వెల్లడించాయి, ఇది ఆంత్రాక్నోస్ యొక్క తీవ్రతలో ప్రతిబింబిస్తుంది. సగటు స్కోర్‌లలో తేడాలు 1.8 (మధ్యస్థంగా నిరోధకత) నుండి 6.9 (సున్నితత్వం) వరకు మరియు మొక్కల బరువు తేడాలు 0.62 (సున్నితత్వం) నుండి 4.45 గ్రా (రుతువు) వరకు ఉన్నాయి. ప్రయోగం యొక్క రెండు ప్రతిరూపాలలో గమనించిన విలువల మధ్య (వ్యాధి తీవ్రత స్కోర్‌లకు 0.51, మొక్క బరువుకు P = 0.00017 మరియు 0.61, P < 0.0001) అలాగే ఈ రెండు పారామితుల మధ్య (− 0.59 మరియు − 0.77, P < 0.0001) గణనీయమైన సహసంబంధం ఉంది. ప్రయోగం యొక్క రెండు ప్రతిరూపాలలో గమనించిన విలువల మధ్య (వ్యాధి తీవ్రత స్కోర్‌లకు 0.51, మొక్క బరువుకు P = 0.00017 మరియు 0.61, P < 0.0001) అలాగే ఈ రెండు పారామితుల మధ్య (− 0.59 మరియు − 0.77, P < 0.0001) గణనీయమైన సహసంబంధం ఉంది. వియవ్లేనా డోస్టోవర్నయా కోరల్యాసియా మెగ్డూ జానచెనియామి, నాబ్లిడామిమి వి ద్వూ పోవ్టోర్నోస్ట్యాహ్ ఎక్సపెరిమెంట్,510 టైజెస్టి బోలెజ్నీ, P = 0,00017 మరియు 0,61 для massy rasteniya, P <0,0001), а также между этими двуме, 7,5 R < 0,0001) 0,0001). ప్రయోగం యొక్క రెండు పునరావృతాలలో గమనించిన విలువల మధ్య (వ్యాధి తీవ్రత స్కోర్‌లకు 0.51, మొక్క బరువుకు P = 0.00017 మరియు 0.61, P < 0.0001), అలాగే ఈ రెండు పారామితుల మధ్య (- 0.59 మరియు -0.77, P < 0.0001) 0.0001) ఒక ముఖ్యమైన సహసంబంధం కనుగొనబడింది.మీరు 0.00017,植物重量为0.61,P <0.0001)以及这两个参数之间(- 0.59 和- 0.77,P <0.0001)在 两 次 重复 实验 中 观察 的 值 之间 存在 相关性 (疾病 严重 ఉదాహరణ分为 0.51 , p = 0.00017 , 植物 为 为 0.61 , p <0.0001) 以及 两 个 参数 之间 (5-09-5和- 0.59 和– 0.59 和- 0.77,P <0.0001)。 నాబ్లిడాలస్ ప్రఖ్యాతి గాంచిన కొర్రెలియా మెగ్డూ జాన్చెనియమి, నాబ్లిడామిమి వి ద్వూ పోవ్టోర్నోస్ట్యాస్ (సాంకేతికత 0,51, P = 0,00017 и massa rasteniya 0,61, P <0,0001), и между этими двумя параметрами (-0,59 и -0,00070, P.10,0001) నకిలీలో గమనించిన విలువల మధ్య (వ్యాధి తీవ్రత స్కోరు 0.51, P = 0.00017 మరియు మొక్కల బరువు 0.61, P < 0.0001) మరియు ఈ రెండు పారామితుల మధ్య (-0.59 మరియు -0 .0001) 0.77, P<0.0001 మధ్య గణనీయమైన సంబంధం ఉంది. ).అనుమానాస్పద మొక్కలలో కనిపించే సాధారణ లక్షణాలు "గొర్రెల కాపరి విల్లు" నిర్మాణాన్ని పోలి ఉండే కాండం వంగిపోవడం మరియు మెలితిప్పడం, తరువాత నారింజ/గులాబీ రంగు స్పోరోజోయిట్‌లతో ఓవల్ గాయాలు (అనుబంధ చిత్రం 1). Lanr1 (83A:476 మరియు Tanjil) మరియు AnMan (మాండెలప్) జన్యువులను కలిగి ఉన్న ఆస్ట్రేలియన్ అనుబంధాలు మధ్యస్తంగా నిరోధకతను కలిగి ఉంటాయి, 0.0331 మరియు 0.0036). "నిరోధక" Lanr1 మరియు/లేదా AnMan యుగ్మ వికల్పాలను కలిగి ఉన్న కొన్ని పంక్తులు వ్యాధి లక్షణాలను చూపుతాయి.
ఆసక్తికరంగా, "నిరోధక" మార్కర్ యుగ్మ వికల్పం లేని కొన్ని NLL లైన్లు అధిక స్థాయి ఆంత్రాక్నోస్ నిరోధకతను (Lanr1 లేదా AnMan జన్యురూపాల కంటే పోల్చదగినవి లేదా అంతకంటే ఎక్కువ) వెల్లడించాయి, ఉదాహరణకు బోరెజిన్ (రెండు పారామితులకు P విలువ < 0.0001), బోజార్ (స్కోర్‌కు P విలువ < 0.0001 మరియు మొక్కల బరువుకు 0.001) మరియు జనాభా B-549/79b (స్కోర్‌కు P విలువ < 0.0001 మరియు బరువుకు ముఖ్యమైనది కాదు). ఆసక్తికరంగా, "నిరోధక" మార్కర్ యుగ్మ వికల్పం లేని కొన్ని NLL లైన్లు అధిక స్థాయి ఆంత్రాక్నోస్ నిరోధకతను (Lanr1 లేదా AnMan జన్యురూపాల కంటే పోల్చదగినవి లేదా అంతకంటే ఎక్కువ) వెల్లడించాయి, ఉదాహరణకు బోరెజిన్ (రెండు పారామితులకు P విలువ < 0.0001), బోజార్ (స్కోర్‌కు P విలువ < 0.0001 మరియు మొక్కల బరువుకు 0.001) మరియు జనాభా B-549/79b (స్కోర్‌కు P విలువ < 0.0001 మరియు బరువుకు ముఖ్యమైనది కాదు). ఆంతెరెస్నో, చ్టో నెస్కోల్కో లినియ్ NLL, లిషెనిహ్ కాకోగో-లైబో «రెజిస్టెన్ట్నోగో» మార్కర్నోగో అలీలియా, పోకస్ అంట్రాక్నోజూ для обоих параметров), బోజార్ (ప్రత్యేక పి < 0,0001 మరియు 0,001 రోజులు) మరియు < популяци B-509/7091 ఒషెంకి మరియు నెజాన్చిమో డ్లియా మాస్సి). ఆసక్తికరంగా, 'నిరోధక' మార్కర్ యుగ్మ వికల్పం లేని అనేక NLL లైన్లు ఆంత్రాక్నోస్‌కు అధిక స్థాయి నిరోధకతను చూపించాయి (Lanr1 లేదా AnMan జన్యురూపాలతో పోల్చదగినవి లేదా అంతకంటే ఎక్కువ), ఉదాహరణకు బోరెజిన్ (రెండు పారామితులకు P విలువ < 0.0001), బోజార్ (మూల్యాంకనం కోసం P విలువ < 0.0001 మరియు మొక్కల బరువుకు 0.001) మరియు జనాభా B-549/79b (మూల్యాంకనం కోసం P విలువ < 0.0001 మరియు బరువుకు ముఖ్యమైనది కాదు).有趣的是,一些缺乏任何“抗性”标记等位基因的NLL 系显示出高水平的炭疽痸或AnMan 基因型相当或更高),例如Boregine(两个参数的P 值< 0.0001)、Bojar(P 值<得分为0.0001,植物重量为0.001)和种群B-549/79b(得分P 值< 0.0001,重量不昍 ఆసక్తికరమైన విషయం ఏమిటంటే, "యాంటిజెనిక్" మార్కర్లు లేని కొన్ని NLL వ్యవస్థలు అధిక క్షితిజ సమాంతర నిరోధకతను (Lanr1 లేదా AnMan జన్యువులకు సమానం లేదా అంతకంటే ఎక్కువ) చూపిస్తాయి, ఉదాహరణకు బోరెజిన్ (రెండు పారామితులు P < 0.0001), బోజార్ (P విలువ < 0.0001, మొక్క బరువు 0.001) మరియు స్ట్రెయిన్ B-549/79b (P విలువ < 0.0001, బరువు ముఖ్యమైనది కాదు). ఇంటరెస్నో, హెచ్‌టో నెకోటోరీ లినిస్ ఎన్‌ఎల్‌ఎల్, లిషెనియస్ కాకిహ్-లైబో మార్కర్న్ అల్లెలీ «రెజిస్టెన్స్‌నోస్టి», పోకవస్ అంట్రాక్నోజూ параметров <0,0001), బోజార్ (జ్ఞాపక పి <0,0001, మాస్ రాస్టేనియ 0,001) మరియు పోపులయాషైయా B-549/79b (ఓస్సెన్కా పి-ప్రజాన్చియే <0,0001, మాస్సా NO). ఆసక్తికరంగా, కొన్ని NLL లైన్లు 'నిరోధకత' మార్కర్ యుగ్మ వికల్పాలు లేకపోవడం వలన ఆంత్రాక్నోస్ నిరోధకత అధిక స్థాయిలో కనిపించింది (Lanr1 లేదా AnMan జన్యురూపాలతో పోల్చదగినది లేదా అంతకంటే ఎక్కువ), ఉదాహరణకు బోరెజిన్ (రెండు పారామితులకు P విలువ <0.0001), బోజార్ (P-విలువ < 0.0001, మొక్క బరువు 0.001) మరియు జనాభా B-549/79b (P-విలువ < 0.0001, బరువు ముఖ్యమైనది కాదు).ఈ దృగ్విషయం మార్కర్ జన్యురూపాలు మరియు వ్యాధి సమలక్షణాల మధ్య సహసంబంధం లేకపోవడాన్ని వివరిస్తూ, నిరోధకత యొక్క కొత్త జన్యు మూలం యొక్క అవకాశాన్ని సూచిస్తుంది (P విలువలు ~0.42 నుండి ~0.98 వరకు). అందువల్ల, కోల్మోగోరోవ్-స్మిర్నోవ్ పరీక్ష ఆంత్రాక్నోస్ నిరోధకతపై డేటా సుమారుగా సాధారణంగా స్కోర్‌లకు (P-విలువలు 0.25 మరియు 0.11) మరియు మొక్కల ద్రవ్యరాశికి (P-విలువలు 0.47 మరియు 0.55) పంపిణీ చేయబడిందని చూపించింది, ఇది Lanr1 మరియు AnMan కంటే ఎక్కువ యుగ్మ వికల్పాలు ఇందులో ఉన్నాయని నేను పరికల్పన చేస్తున్నాను.
ఆంత్రాక్నోస్ రెసిస్టెన్స్ స్క్రీనింగ్ ఫలితాల ఆధారంగా, ట్రాన్స్క్రిప్ట్ విశ్లేషణ కోసం 4 లైన్లు ఎంపిక చేయబడ్డాయి: 83A:476, బోరెజిన్, మాండెలప్ మరియు పాపులేషన్ 22660. ఈ లైన్లు RNA సీక్వెన్సింగ్ ద్వారా ఇనాక్యులేషన్ ప్రయోగాలలో ఆంత్రాక్స్ నిరోధకత కోసం తిరిగి పరీక్షించబడ్డాయి, అవి మునుపటి పరీక్షలో వలె ఉంటే. స్కోర్ విలువలు ఈ క్రింది విధంగా ఉన్నాయి: బోరెజిన్ (1.71 ± 1.39), 83A: 476 (2.09 ± 1.38), మాండెలప్ (3.82 ± 1.42) మరియు పాపులేషన్ 22660 (6.11 ± 1.29).
ఇల్యూమినా నోవాసెక్ 6000 ప్రోటోకాల్ ప్రతి నమూనాకు సగటున 40.5 Mread జతలను (29.7 నుండి 54.4 Mreads) సాధించింది (అనుబంధ పట్టిక S3). రిఫరెన్స్ సీక్వెన్స్‌లో అలైన్‌మెంట్ స్కోర్‌లు 75.5% నుండి 88.6% వరకు ఉన్నాయి. జీవ ప్రతిరూపాల మధ్య ప్రయోగాత్మక వైవిధ్యాల మధ్య రీడ్ కౌంట్ డేటా యొక్క సగటు సహసంబంధం 0.812 నుండి 0.997 వరకు ఉంది (సగటు 0.959). విశ్లేషించబడిన 35,170 జన్యువులలో, 2917 ఎటువంటి వ్యక్తీకరణను వెల్లడించలేదు మరియు మిగిలిన 4785 జన్యువులు అతితక్కువ స్థాయిలో వ్యక్తీకరించబడ్డాయి (బేస్ సగటు < 5). విశ్లేషించబడిన 35,170 జన్యువులలో, 2917 ఎటువంటి వ్యక్తీకరణను వెల్లడించలేదు మరియు మిగిలిన 4785 జన్యువులు అతితక్కువ స్థాయిలో వ్యక్తీకరించబడ్డాయి (బేస్ సగటు < 5). Из 35 170 ప్రోనాలైజేషన్ జెనోవ్ 2917 కాదు ప్రోవాలీ ఎక్స్‌ప్రెసిలు, ఎ ఓస్టాల్ 4785 జెనోవ్ ఎక్సప్రెసిస్ незначительном уровне (базовое среднее <5). విశ్లేషించబడిన 35,170 జన్యువులలో, 2917 ఎటువంటి వ్యక్తీకరణను చూపించలేదు మరియు మిగిలిన 4785 జన్యువులు అతితక్కువ స్థాయిలో వ్యక్తీకరించబడ్డాయి (బేస్ సగటు <5).在分析的35,170 个基因中,2917 个没有表达,其他4785个基因的表达可以忽略不计(基本平均值< 5)。35,170 Из 35 170 ప్రోనాలైజేషన్ జెనోవ్ 2917 కాదు ఎక్స్‌ప్రెస్సిరోవాలిస్, ఎ ఓస్టాలియో 4785 జెనోవ్ ఎమిలీస్ నెసంగ్నాస్ (ప్రకటనలు <5). విశ్లేషించబడిన 35,170 జన్యువులలో, 2917 వ్యక్తీకరించబడలేదు మరియు మిగిలిన 4785 జన్యువులు అతితక్కువ వ్యక్తీకరణను కలిగి ఉన్నాయి (బేస్ సగటు <5).అందువల్ల, ప్రయోగం సమయంలో వ్యక్తీకరించబడిన జన్యువుల సంఖ్య (బేస్ సగటు ≥ 5) 27,468 (78.1%) (అనుబంధ పట్టిక S4).
మొదటి సమయం పాయింట్ నుండి, అన్ని NLL లైన్లు ట్రాన్స్క్రిప్టోమ్ (టేబుల్ 1) ను రీప్రోగ్రామింగ్ చేయడం ద్వారా C. లుపిని (స్ట్రెయిన్ Col-08) యొక్క ఇనాక్యులేషన్‌కు ప్రతిస్పందించాయి, అయితే, లైన్ల మధ్య గణనీయమైన తేడాలు గమనించబడ్డాయి. అందువల్ల, రెసిస్టెన్స్ లైన్ 83A:476 (Lanr1 జన్యువును మోసుకెళ్ళేది) మొదటి సమయం పాయింట్ వద్ద (6 hpi) గణనీయమైన ట్రాన్స్క్రిప్టోమ్ రీప్రోగ్రామింగ్‌ను చూపించింది, ఈ సమయంలో ఇతర సమయ పాయింట్‌లతో పోలిస్తే వివిక్త అప్- మరియు డౌన్-జన్యువుల సంఖ్యలో 31-69 రెట్లు పెరుగుదల ఉంది. అదనంగా, ఈ శిఖరం స్వల్పకాలికం, ఎందుకంటే రెండవ సమయం పాయింట్ (12 hpi) వద్ద కొన్ని జన్యువుల వ్యక్తీకరణ గణనీయంగా మార్పు చెందింది. ఆసక్తికరంగా, గ్రాఫ్ట్ పరీక్షలో అధిక స్థాయి నిరోధకతను చూపించిన బోరెజిన్, ప్రయోగం సమయంలో అంత భారీ ట్రాన్స్క్రిప్షనల్ రీప్రోగ్రామింగ్‌కు గురికాలేదు. అయితే, బోరెజిన్‌కు మరియు 12 HPI వద్ద 83A:476 కు భేదాత్మకంగా వ్యక్తీకరించబడిన జన్యువుల సంఖ్య (DEG) ఒకే విధంగా ఉంది. మాండెలప్ మరియు జనాభా 22660 రెండూ చివరి సమయ బిందువు (48 l/s) వద్ద DEG శిఖరాలను చూపించాయి, ఇది రక్షణ ప్రతిస్పందనలలో సాపేక్ష ఆలస్యాన్ని సూచిస్తుంది.
83A:476 అన్ని ఇతర లైన్లతో పోలిస్తే 6 HPI వద్ద C. lupini కి ప్రతిస్పందనగా భారీ ట్రాన్స్క్రిప్టోమ్ రీప్రోగ్రామింగ్‌కు గురైంది కాబట్టి, ఈ సమయంలో గమనించిన DEGలలో ~91% వంశపారంపర్య-నిర్దిష్టమైనవి (Fig. 1). అయితే, అధ్యయన లైన్‌ల మధ్య ప్రారంభ ప్రతిస్పందనలలో కొంత అతివ్యాప్తి ఉంది, ఎందుకంటే బోరెజిన్, మాండెలప్ మరియు జనాభా 22660లో వరుసగా 68.5%, 50.9% మరియు 52.6% DEG, కొన్ని సమయాల్లో 83A:476లో కనుగొనబడిన వాటితో అతివ్యాప్తి చెందాయి. అయితే, ఈ DEGలు 83A:476 ఉపయోగించి ప్రస్తుతం కనుగొనబడిన అన్ని DEGలలో ఒక చిన్న భాగాన్ని (0.97–1.70%) మాత్రమే కలిగి ఉన్నాయి. అదనంగా, ఈ సమయంలో అన్ని లైన్ల నుండి 11 DEGలు పొందికగా ఉన్నాయి (అనుబంధ పట్టికలు S4-S6), వీటిలో మొక్కల రక్షణ ప్రతిస్పందనల యొక్క సాధారణ భాగాలు ఉన్నాయి: లిపిడ్ బదిలీ ప్రోటీన్ (TanjilG_32225), ఎండోగ్లూకాన్-1,3-β-గ్లూకోసైడ్ ఎంజైమ్ (TanjilG_23384), SAM22 (TanjilG_31528 మరియు TanjilG_31531) వంటి రెండు ఒత్తిడి-ప్రేరేపించగల ప్రోటీన్లు, ప్రాథమిక లేటెక్స్ ప్రోటీన్ (TanjilG_32352), మరియు రెండు గ్లైసిన్-రిచ్ స్ట్రక్చరల్ సెల్ వాల్ ప్రోటీన్లు (TanjilG_19701 మరియు TanjilG_19702). 83A:476 మరియు బోరెజిన్ మధ్య 24 HPI (మొత్తం 16-38% DEG) మరియు మాండెలప్ మరియు పాపులేషన్ 22660 మధ్య 48 HPI (మొత్తం 14-20% DEG) మధ్య ట్రాన్స్క్రిప్టోమ్ ప్రతిస్పందనలలో సాపేక్షంగా అధిక అతివ్యాప్తి కూడా ఉంది.
కొల్లెటోట్రిఖం లుపిని (పోలాండ్‌లోని వైర్‌జెనిస్‌లోని లుపిన్ క్షేత్రాల నుండి పొందిన స్ట్రెయిన్ కోల్-08) తో టీకాలు వేయబడిన ఇరుకైన-లీవ్డ్ లుపిన్ (NLL) లైన్లలో భేదాత్మకంగా వ్యక్తీకరించబడిన జన్యువుల సంఖ్య (DEG) ను చూపించే వెన్ రేఖాచిత్రం. విశ్లేషించబడిన NLL లైన్లు: 83A:476 (నిరోధకత, Lanr1 యుగ్మ వికల్పాన్ని కలిగి ఉంటుంది), బోరెజిన్ (నిరోధకత, జన్యు నేపథ్యం తెలియదు), మాండెలప్ (మధ్యస్తంగా నిరోధకత, AnMan యుగ్మ వికల్పాన్ని కలిగి ఉంటుంది) మరియు జనాభా 22660 (చాలా సున్నితంగా ఉంటుంది). hpi అనే సంక్షిప్తీకరణ టీకా తర్వాత గంటలను సూచిస్తుంది. గ్రాఫ్‌ను సరళీకృతం చేయడానికి సున్నా విలువలు తొలగించబడ్డాయి.
6 hpi వద్ద అతిగా వ్యక్తీకరించబడిన జన్యువుల సమితిని కానానికల్ R జన్యు డొమైన్‌ల ఉనికి కోసం విశ్లేషించారు (అనుబంధ పట్టిక S7). ఈ అధ్యయనం 83A:476 వద్ద మాత్రమే NBS-LRR డొమైన్‌లతో క్లాసిక్ వ్యాధి నిరోధక జన్యువుల ట్రాన్స్‌క్రిప్టోమ్ ప్రేరణను వెల్లడించింది. ఈ సెట్‌లో ఒక TIR-NBS-LRR జన్యువు (tanjilg_05042), ఐదు CC-NBS-LRR జన్యువులు (tanjilg_06165, tanjilg_06162, tanjilg_22773, tanjilg_22640, మరియు tanjilg_16162), మరియు నాలుగు NBS-LRRE (tanjilg_16162), అలాగే నాలుగు NBS-LRR (tanjilg_16162) మరియు నాలుగు NBS-LRR (TANJILG_16162) ఉన్నాయి. ఈ జన్యువులన్నీ సంరక్షించబడిన శ్రేణులలో అమర్చబడిన కానానికల్ డొమైన్‌లను కలిగి ఉన్నాయి. NBS-LRR డొమైన్ జన్యువులతో పాటు, అనేక RLL కైనేసులు 6 hpi వద్ద సక్రియం చేయబడ్డాయి, అవి బోరెజిన్‌లో ఒకటి (TanjilG_19877), మాండెలప్‌లో రెండు (TanjilG_07141 మరియు TanjilG_19877) మరియు జనాభా 22660 (TanjilG_09014 మరియు TanjilG_10361) మరియు 83A 27:476లో రెండు.
సి. లుపిని (స్ట్రెయిన్ కోల్-08) తో టీకాలు వేయడం వల్ల ప్రతిస్పందనగా గణనీయంగా మారిన వ్యక్తీకరణ కలిగిన జన్యువులను జీన్ ఆంటాలజీ (GO) సుసంపన్న విశ్లేషణకు (సప్లిమెంటరీ టేబుల్ S8) గురి చేశారు. అత్యంత తరచుగా అతిగా ప్రాతినిధ్యం వహించే జీవ ప్రక్రియ పదం “GO:0006952 రక్షణ ప్రతిస్పందన”, ఇది 16 (సమయం × రేఖ) కలయికలలో 6 లో అధిక ప్రాముఖ్యతతో (P విలువ < 0.001) కనిపించింది (చిత్రం 2). అత్యంత తరచుగా అతిగా ప్రాతినిధ్యం వహించే జీవ ప్రక్రియ పదం “GO:0006952 రక్షణ ప్రతిస్పందన”, ఇది 16 (సమయం × రేఖ) కలయికలలో 6 లో అధిక ప్రాముఖ్యతతో (P విలువ < 0.001) కనిపించింది (చిత్రం 2). నయిబోలీ చాస్టో ప్రెజెంటర్ ప్రెడ్స్టావ్లెనిమ్ టెర్మినోమ్ బయోలాగిచెస్కోగో ప్రోషెస్సా బైల్ «GO: 0006952 ప్రకటన, » 6 నుండి 16 వరకు (వర్ణం × లినియా) కాంబినేషన్ స్ వైసోకోయ్ జానపదం (ప్రజలు పి <0,001) (రిస్. 2). అత్యంత తరచుగా అతిగా ప్రాతినిధ్యం వహించే జీవ ప్రక్రియ పదం 'GO:0006952 రక్షణ ప్రతిస్పందన', ఇది అధిక ప్రాముఖ్యత కలిగిన 16 (సమయం × వంశం) కలయికలలో 6 లో కనిపించింది (P విలువ < 0.001) (Fig. 2).最常被过度代表的生物过程术语是“GO:0006952 防御反应”,它出现在16个(时间×线)组合中的6 个中,具有高显着性(P 值< 0.001)(图2)。 అత్యంత ప్రాతినిధ్య జీవ ప్రక్రియ పదం “GO:0006952 రక్షణ ప్రతిస్పందన”, ఇది 16 (时间×线) కలయికలలో 6 లో కనిపిస్తుంది, అధిక ప్రాముఖ్యత (P విలువ < 0.001) (图2) తో. నాయిబోలీ చాస్టో ప్రెజెర్నో ప్రెడ్స్టావ్లెనిమ్ టెర్మినోమ్ బయోలాగిచెస్కోగో ప్రోషెస్సా బైల్ «GO: 0006952 డిఫెన్స్ రెస్పాన్స్» в 6 из 16 కాంబినేషన్ (వర్ణం × లినియా) с высокой значимостью (ప్రజాస్వామ్య పి <0,001) (రిస. 2). అత్యంత తరచుగా అతిగా ప్రాతినిధ్యం వహించే జీవ ప్రక్రియ పదం 'GO:0006952 డిఫెన్స్ రెస్పాన్స్', ఇది 16 కలయికలలో 6 (సమయం × రేఖ)లో అధిక ప్రాముఖ్యతతో (P విలువ < 0.001) కనిపించింది (చిత్రం 2).ఈ పదం 83Aలో రెండు సమయ బిందువులలో: 476 మరియు బోరెజిన్ (6 మరియు 24 hpi) మరియు మాండెలప్ మరియు పాపులేషన్ 22660లో ఒక సమయంలో (వరుసగా 12 మరియు 6 hpi) అతిగా ప్రాతినిధ్యం వహించబడింది. ఇది ఆశించిన ఫలితం, ఇది నిరోధక రేఖల యాంటీ ఫంగల్ ప్రతిస్పందనను హైలైట్ చేస్తుంది. అదనంగా, 83A:476 "GO:0055114 రెడాక్స్ ప్రక్రియ" అనే పదం ద్వారా సూచించబడే ఆక్సీకరణ పేలుడుకు సంబంధించిన జన్యువులను వేగంగా ప్రేరేపించడం ద్వారా C. లుపినికి ప్రతిస్పందించింది, ఇది నిర్దిష్ట రక్షణ ప్రతిస్పందనను సూచిస్తుంది, అయితే బోరెజిన్ 'GO' అనే పదానికి సంబంధించిన నిర్దిష్ట రక్షణ ప్రతిస్పందనలను వెల్లడించింది. :0006950 ఒత్తిడి ప్రతిస్పందన”. జనాభా 22660 ద్వితీయ జీవక్రియలతో కూడిన క్షితిజ సమాంతర నిరోధక ప్రతిస్పందనను సక్రియం చేసింది, అధిక సంఖ్యలో పదాలను హైలైట్ చేసింది “GO:0016104 ట్రైటెర్పీన్ బయోసింథసిస్ ప్రక్రియ” మరియు “GO:0006722 ట్రైటెర్పీన్ జీవక్రియ ప్రక్రియ” (రెండు పదాలు ఒకే జన్యువుల సమూహానికి చెందినవి), GO పదం సుసంపన్న విశ్లేషణ ఫలితాలను పరిగణనలోకి తీసుకుంటే, మాండెలప్ ప్రతిచర్య స్థిరత్వం బోరెజిన్ మరియు పాపులేషన్ 22660 మధ్య ఉంది. అదనంగా, ప్రారంభ ప్రతిచర్య 83A:476 (6 hpi) మరియు ఆలస్యమైన ప్రతిచర్య మాండెలప్ మరియు పాపులేషన్ 22660 GO:0015979 'కిరణజన్య సంయోగక్రియ' మరియు ఇతర సంబంధిత జీవ ప్రక్రియలను కలిగి ఉన్నాయి.
ఆంత్రాక్స్ లూపిన్ (1999లో పోలాండ్‌లోని వైర్‌జెనిస్‌లోని లూపిన్ క్షేత్రాల నుండి పొందిన Col-08 జాతి) తో టీకాలు వేయబడిన ఇరుకైన-ఆకులతో కూడిన లూపిన్ (NLL) యొక్క ట్రాన్స్‌క్రిప్టోమ్ ప్రతిస్పందనల సమయంలో విభిన్నంగా వ్యక్తీకరించబడిన జన్యువుల వ్యాఖ్యానంలో ఎంచుకున్న బయోప్రాసెస్ జన్యు ఆంటాలజీ పదాలు చాలా అతిశయోక్తిగా ఉన్నాయి. విశ్లేషించబడిన NLL పంక్తులు: 83A:476 (నిరోధకత, హోమోజైగస్ లాన్ర్1 యుగ్మ వికల్పాన్ని కలిగి ఉంటుంది), బోరెజిన్ (నిరోధకత, తెలియని జన్యు నేపథ్యం), మాండెలప్ (మధ్యస్తంగా నిరోధకత, హోమోజైగస్ అన్‌మాన్ యుగ్మ వికల్పాన్ని కలిగి ఉంటుంది) మరియు జనాభా 22660 (సున్నితమైనది).
ఈ అధ్యయనం ఆంత్రాక్నోస్ నిరోధకతకు దోహదపడే జన్యువులను గుర్తించడం లక్ష్యంగా పెట్టుకున్నందున, GO “GO: 0006952 డిఫెన్సివ్ స్పందనలు” మరియు “GO: 0055114 రెడాక్స్ ప్రక్రియలు” అనే పదాలకు కేటాయించిన జన్యువులను కట్-ఆఫ్‌లతో విశ్లేషించారు ఎందుకంటే బేస్‌లైన్ అంటే కనీసం ఒక లైన్‌తో ≥ 30. × పాయింట్ ఇన్ టైమ్ లాగ్2 (రెట్లు మార్పు) యొక్క గణాంకపరంగా ముఖ్యమైన విలువలను కలుపుతుంది. ఈ ప్రమాణాలకు అనుగుణంగా ఉన్న జన్యువుల సంఖ్య GO:0006952కి 65 మరియు GO:0055114కి 524.
83A:476 GO:0006952 అనే పదంతో వ్యాఖ్యానించబడిన రెండు DEG శిఖరాలను వెల్లడించింది, మొదటిది అంగుళానికి 6 జన్యువులు (64 జన్యువులు, పైకి క్రిందికి నియంత్రణ) మరియు రెండవది అంగుళానికి 24 జన్యువులు (15 జన్యువులు, పైకి నియంత్రణ మాత్రమే). బోరెజిన్ కూడా GO:0006952 అదే సమయంలో గరిష్ట స్థాయికి చేరుకుందని చూపించింది, కానీ తక్కువ DEG (11 మరియు 8) మరియు ప్రిఫరెన్షియల్ యాక్టివేషన్‌తో. మాండెలూప్ 12 మరియు 48 HPI వద్ద GO:0006952 యొక్క రెండు శిఖరాలను చూపించింది, రెండూ 12 జన్యువులను కలిగి ఉన్నాయి (మొదటిది సక్రియం చేసే జన్యువులతో మరియు రెండవది అణచివేసే జన్యువులతో మాత్రమే), అయితే 6 HPI (13 జన్యువులు) వద్ద 22660 జనాభా పెరుగుదల శిఖరం యొక్క అధిక ప్రాబల్యాన్ని కలిగి ఉంది. నియంత్రణ. ఈ శిఖరాలలో 96.4% GO:0006952 DEG ఒకే రకమైన ప్రతిస్పందనను (పైకి లేదా క్రిందికి) కలిగి ఉన్నాయని గమనించాలి, ఇది జన్యువుల సంఖ్యలో తేడాలు ఉన్నప్పటికీ రక్షణ ప్రతిస్పందనలలో గణనీయమైన అతివ్యాప్తిని సూచిస్తుంది. GO:0006952 అనే పదానికి సంబంధించిన అతిపెద్ద సమూహ శ్రేణులు స్టార్వేషన్ స్ట్రెస్-అసోసియేటెడ్ మెసేజ్ ప్రోటీన్ 22 (SAM22-వంటివి) ను ఎన్కోడ్ చేస్తాయి, ఇది క్లాస్ 10 పాథోజెనిసిస్-అసోసియేటెడ్ ప్రోటీన్ (PR-10) ప్రోటీన్ క్లాడ్ మరియు కోర్ ప్రోటీన్ లేటెక్స్‌కు చెందినది. సారూప్య (MLP-వంటి) ప్రోటీన్) ప్రోటీన్ (Fig. 3). రెండు సమూహాలు వ్యక్తీకరణ స్వభావం మరియు ప్రతిస్పందన దిశలో విభిన్నంగా ఉన్నాయి. SAM22-వంటి ప్రోటీన్‌లను ఎన్‌కోడింగ్ చేసే జన్యువులు ప్రారంభ సమయ బిందువులలో (6 లేదా 12 hpi) స్థిరమైన మరియు ముఖ్యమైన ప్రేరణను చూపించాయి మరియు ప్రయోగం చివరిలో (48 hpi) సాధారణంగా స్పందించలేదు, అయితే MLP-వంటి ప్రోటీన్లు 6 hpi వద్ద సమన్వయాన్ని చూపించాయి. hpi. 83A:476 మరియు మాండెలప్ 48 hp/in వద్ద, దాదాపు అన్ని ఇతర డేటా పాయింట్లు స్పందించలేదు. అదనంగా, SAM22-వంటి ప్రోటీన్ జన్యువుల వ్యక్తీకరణ ప్రొఫైల్‌లలో తేడాలు ఆంత్రాక్నోస్ నిరోధకతలో గమనించిన వైవిధ్యాన్ని అనుసరించాయి, ఎందుకంటే ఎక్కువ నిరోధక రేఖలు ఈ జన్యువులను ఎక్కువ సెన్సిబిలిటీ జన్యువుల కంటే గణనీయంగా ప్రేరేపించే సమయ బిందువులను కలిగి ఉన్నాయి. మరొక LlR18A/B-వంటి PR-10 జన్యువు SAM22-వంటి ప్రోటీన్ జన్యువుకు చాలా సారూప్య వ్యక్తీకరణ నమూనాను చూపించింది.
"GO:0006952 డిఫెన్స్ రెస్పాన్స్" అనే జీవ ప్రక్రియ పదం యొక్క ప్రధాన భాగాలు మరియు Lanr1 మరియు AnMan యుగ్మ వికల్పాల అభ్యర్థి జన్యువుల వ్యక్తీకరణ నమూనాలను గుర్తించారు. Log2 స్కేల్ ఒకే సమయంలో టీకాలు వేసిన (Colletotrichum lupini, స్ట్రెయిన్ Col-08, లూపిన్ క్షేత్రాల నుండి పొందబడింది, Wizhenica, పోలాండ్, 1999) మరియు నియంత్రణ (షామ్-ఇనాక్యులేటెడ్) మొక్కల మధ్య log2 విలువలను (రెట్లు మార్పు) సూచిస్తుంది. కింది ఇరుకైన ఆకు లూపిన్ పంక్తులు విశ్లేషించబడ్డాయి: 83A:476 (నిరోధకత, హోమోజైగస్ Lanr1 యుగ్మ వికల్పాన్ని కలిగి ఉంటుంది), బోరెజిన్ (నిరోధకత, జన్యు నేపథ్యం తెలియదు), మాండెలప్ (మధ్యస్థంగా నిరోధకత, హోమోజైగస్ AnMan యుగ్మ వికల్పాన్ని కలిగి ఉంటుంది), మరియు జనాభా 22660 (సున్నితమైనది).
అదనంగా, RNA-seq అభ్యర్థి జన్యువుల Lanr1 (TanjilG_05042) మరియు AnMan (TanjilG_12861) యొక్క వ్యక్తీకరణ ప్రొఫైల్‌లు మూల్యాంకనం చేయబడ్డాయి (చిత్రం 3). TanjilG_05042 జన్యువు మొదటి సమయ పాయింట్ (6 hpi) వద్ద మాత్రమే 83A:476 వద్ద గణనీయమైన ప్రతిస్పందన (క్రియాశీలత) చూపించింది, అయితే TanjilG_12861 మాండెలూప్‌లో రెండు సమయ పాయింట్ల వద్ద మాత్రమే ముఖ్యమైనది: 6 hpi (డౌన్ రెగ్యులేషన్) మరియు 24 hpi (6 hpi). With.). సర్దుబాటు చేయగల) ).
GO:0055114 “రెడాక్స్ ప్రాసెస్” అనే పదంలో అత్యంత అతిగా వ్యక్తీకరించబడిన జన్యువులు సైటోక్రోమ్ P450 ప్రోటీన్లు మరియు పెరాక్సిడేస్‌ను ఎన్‌కోడింగ్ చేసే జన్యువులు (Fig. 4). 6 HPI వద్ద 83A:476 నుండి వేరుచేయబడిన నమూనాల కోసం, గరిష్ట లేదా కనిష్ట log2 (రెట్లు మార్పు) విలువలు (86.6% జన్యువులకు) సాధారణంగా టీకాలు వేసిన మరియు నియంత్రణ మొక్కల మధ్య గమనించబడ్డాయి, ఇది టీకాలు వేసే లైంగికతకు ఈ జన్యురూపం యొక్క అధిక ప్రతిస్పందనను హైలైట్ చేస్తుంది. 83A:476 అత్యంత ముఖ్యమైన GOని చూపించింది: 0055114 DEG 6 hpi వద్ద (503 జన్యువులు), మిగిలిన పంక్తులు 48 hpi వద్ద (బోరెజిన్, 31 జన్యువులు; మాండెలప్, 85 జన్యువులు; మరియు జనాభా 22660, 78 జన్యువులు)). GO:0055114 కుటుంబంలోని చాలా జన్యువులలో, టీకాకు (క్రియాశీలత మరియు నిరోధం) రెండు రకాల ప్రతిస్పందనలు గమనించబడ్డాయి. ఆసక్తికరంగా, 48 hp వద్ద మాండెలూప్‌లో GO: 0055114 అనే పదానికి గుర్తించబడిన DEGలలో 97.6% వరకు ఈ పరిశీలనలు గణనీయంగా చిన్న స్కేల్ ఉన్నప్పటికీ (అంటే, పరివర్తన చెందిన రెడాక్స్ జన్యువుల సంఖ్య, 85 వర్సెస్ 503), ఆంత్రాక్నోస్‌కు మాండెలోప్ యొక్క ఆలస్యమైన ట్రాన్స్‌క్రిప్టోమ్ ప్రతిస్పందనల నమూనా 83A:476 యొక్క ప్రారంభ ప్రతిస్పందనకు సమానంగా ఉంటుందని సూచిస్తున్నాయి. బోరెజిన్ మరియు జనాభా 22660లో, ఈ కన్వర్జెన్స్ వరుసగా 51.6% మరియు 75.6% వద్ద తక్కువగా ఉంది.
"GO:0055114 రెడాక్స్ ప్రక్రియ" అనే జీవ ప్రక్రియ యొక్క ప్రధాన భాగాల వ్యక్తీకరణ నమూనాలు వెల్లడయ్యాయి. లాగ్2 స్కేల్ ఇనాక్యులేటెడ్ (కొల్లెటోట్రిచమ్ లుపిని, స్ట్రెయిన్ కోల్-08, లూపిన్ ఫీల్డ్స్ నుండి పొందబడింది, విజెనికా, పోలాండ్, 1999) మరియు కంట్రోల్ (షామ్-ఇనాక్యులేటెడ్) మొక్కల మధ్య ఒకే సమయంలో లాగ్2 విలువలను (రెట్లు మార్పు) సూచిస్తుంది. కింది ఇరుకైన ఆకు లుపిన్ పంక్తులు విశ్లేషించబడ్డాయి: 83A:476 (నిరోధకత, హోమోజైగస్ లాన్ర్1 యుగ్మ వికల్పాన్ని కలిగి ఉంటుంది), బోరెజిన్ (నిరోధకత, జన్యు నేపథ్యం తెలియదు), మాండెలప్ (మధ్యస్తంగా నిరోధకత, హోమోజైగస్ అన్మాన్ యుగ్మ వికల్పాన్ని కలిగి ఉంటుంది) మరియు జనాభా 22660 (సున్నితమైనది).
83A:476 C. lupini (స్ట్రెయిన్ Col-08) తో ఇనాక్యులేషన్‌కు ట్రాన్స్‌క్రిప్టోమిక్ ప్రతిస్పందనలలో GO:0015979 "కిరణజన్య సంయోగక్రియ" అనే పదానికి ఆపాదించబడిన జన్యువుల సమన్వయ నిశ్శబ్దం మరియు ఇతర సంబంధిత జీవ ప్రక్రియలు కూడా ఉన్నాయి (FIG. 5). ఈ GO:0015979 DEG సెట్‌లో 83A:476 వద్ద 6 hpi వద్ద గణనీయంగా అణచివేయబడిన 105 జన్యువులు ఉన్నాయి. ఈ ఉపసమితిలో, 22660 జనాభాలో మాండెలప్‌లో 48 HPI వద్ద 37 జన్యువులు మరియు అదే సమయంలో 35 జన్యువులు కూడా నియంత్రించబడ్డాయి, వీటిలో రెండు జన్యురూపాలకు సాధారణమైన 19 DEGలు ఉన్నాయి. GO: 0015979 అనే పదానికి సంబంధించిన DEGలు ఏ కలయికలోనూ గణనీయంగా సక్రియం చేయబడలేదు (లైన్ x సమయం).
"GO:0015979 కిరణజన్య సంయోగక్రియ" అనే జీవ ప్రక్రియ యొక్క ప్రధాన భాగాల వ్యక్తీకరణ నమూనాలు వెల్లడయ్యాయి. లాగ్2 స్కేల్ ఇనాక్యులేటెడ్ (కొల్లెటోట్రిచమ్ లుపిని, స్ట్రెయిన్ కోల్-08, లూపిన్ ఫీల్డ్స్ నుండి పొందబడింది, విజెనికా, పోలాండ్, 1999) మరియు కంట్రోల్ (షామ్-ఇనాక్యులేటెడ్) మొక్కల మధ్య ఒకే సమయంలో లాగ్2 విలువలను (రెట్లు మార్పు) సూచిస్తుంది. కింది ఇరుకైన ఆకు లుపిన్ లైన్‌లను విశ్లేషించారు: 83A:476 (నిరోధకత, హోమోజైగస్ లాన్ర్1 యుగ్మ వికల్పాన్ని కలిగి ఉంటుంది), బోరెజిన్ (నిరోధకత, జన్యు నేపథ్యం తెలియదు), మాండెలప్ (మధ్యస్థంగా నిరోధకత, హోమోజైగస్ అన్‌మాన్ యుగ్మ వికల్పాన్ని కలిగి ఉంటుంది) మరియు జనాభా 22660 (సున్నితమైనది).
అవకలన వ్యక్తీకరణ విశ్లేషణ ఫలితాల ఆధారంగా మరియు వ్యాధికారక శిలీంధ్రాలకు వ్యతిరేకంగా రక్షణ ప్రతిస్పందనలలో పాల్గొన్నట్లు భావించి, ఈ ఏడు జన్యువుల సమితిని రియల్-టైమ్ PCR (సప్లిమెంటరీ టేబుల్ S9) ద్వారా వ్యక్తీకరణ ప్రొఫైల్‌ల పరిమాణీకరణ కోసం ఎంపిక చేశారు.
నియంత్రణ (మిమిక్) మొక్కలతో పోలిస్తే (సప్లిమెంటరీ టేబుల్స్ S10, S11) అధ్యయనం చేయబడిన అన్ని లైన్లు మరియు టైమ్ పాయింట్లలో పుటేటివ్ ప్రోటీన్ జన్యువు TanjilG_10657 గణనీయంగా ప్రేరేపించబడింది. అదనంగా, TanjilG_10657 యొక్క ఎక్స్‌ప్రెషన్ ప్రొఫైల్ అన్ని లైన్లకు ప్రయోగం సమయంలో పెరుగుతున్న ధోరణిని చూపించింది. జనాభా 22660 24 HPI వద్ద 114-రెట్లు యాక్టివేషన్ మరియు అత్యధిక సాపేక్ష ఎక్స్‌ప్రెషన్ స్థాయి (4.4 ± 0.4)తో టీకాలకు TanjilG_10657 యొక్క అత్యధిక సున్నితత్వాన్ని చూపించింది (Fig. 6a). PR10 LlR18A ప్రోటీన్ జన్యువు TanjilG_27015 కూడా అన్ని లైన్లు మరియు టైమ్ పాయింట్లలో యాక్టివేషన్‌ను చూపించింది, చాలా డేటా పాయింట్ల వద్ద గణాంక ప్రాముఖ్యతతో (Fig. 6b). TanjilG_10657 మాదిరిగానే, 22660 మంది టీకాలు వేసిన జనాభాలో 24 HPI (19.5 ± 2.4) వద్ద TanjilG_27015 యొక్క అత్యధిక సాపేక్ష వ్యక్తీకరణ స్థాయి గమనించబడింది. బోరెజిన్ 6 hpi (Fig. 6c) మినహా అన్ని లైన్లలో మరియు అన్ని టైమ్ పాయింట్లలో యాసిడ్ ఎండోకైటినేస్ జన్యువు TanjilG_04706 గణనీయంగా నియంత్రించబడింది. ఇది మొదటి టైమ్ పాయింట్ (6 HPI) వద్ద 83A:476 (10.5 రెట్లు) వద్ద బలంగా ప్రేరేపించబడింది మరియు ఇతర లైన్లలో (6.6-7.5 రెట్లు) మధ్యస్తంగా పెరిగింది. ప్రయోగం సమయంలో, TanjilG_04706 యొక్క వ్యక్తీకరణ 83A:476 మరియు బోరెజిన్లలో సారూప్య స్థాయిలలోనే ఉంది, అయితే మాండెలప్ మరియు పాపులేషన్ 22660లో ఇది గణనీయంగా పెరిగింది, సాపేక్షంగా అధిక విలువలకు చేరుకుంది (వరుసగా 5.9 ± 1.5 మరియు 6.2 ± 1.5). ఎండోగ్లూకాన్-1,3-β-గ్లూకోసిడేస్ లాంటి జన్యువు TanjilG_23384 జనాభా 22660 మినహా అన్ని లైన్లలో మొదటి రెండు టైమ్ పాయింట్‌ల (6 మరియు 12 hpi) వద్ద అధిక క్రియాశీలతను చూపించింది (చిత్రం 6d). TanjilG_23384 యొక్క అత్యధిక సాపేక్ష వ్యక్తీకరణ స్థాయిలు మాండెలప్ (2.7 ± 0.3) మరియు 83A:476 (1.5 ± 0.1)లో రెండవ టైమ్ పాయింట్ (12 hpi) వద్ద గమనించబడ్డాయి. 24 HPI వద్ద, TanjilG_23384 వ్యక్తీకరణ అన్ని అధ్యయనం చేయబడిన లైన్‌లలో (0.04 ± 0.009 నుండి 0.44 ± 0.12 వరకు) సాపేక్షంగా తక్కువగా ఉంది.
పరిమాణాత్మక PCR ద్వారా వెల్లడైన ఎంచుకున్న జన్యువుల (ag) వ్యక్తీకరణ ప్రొఫైల్‌లు. 6, 12 మరియు 24 సంఖ్యలు టీకా తర్వాత గంటలను సూచిస్తాయి. LanDExH7 మరియు LanTUB6 జన్యువులను సాధారణీకరణ కోసం ఉపయోగించారు మరియు LanTUB6 ఇంటర్-సిరీస్ క్రమాంకనం కోసం ఉపయోగించారు. ఎర్రర్ బార్‌లు మూడు జీవ ప్రతిరూపాల ఆధారంగా ప్రామాణిక విచలనాన్ని సూచిస్తాయి, వీటిలో ప్రతి ఒక్కటి మూడు సాంకేతిక ప్రతిరూపాల సగటు. 1999లో పోలాండ్‌లోని వియెర్జెనికాలోని లుపిన్ ఫీల్డ్ నుండి పొందిన ఇనాక్యులేటెడ్ (కొల్లెటోట్రిఖం లుపిని, స్ట్రెయిన్ కోల్-08) మరియు కంట్రోల్ (మాక్-ఇనాక్యులేటెడ్) ప్లాంట్ల మధ్య వ్యక్తీకరణ స్థాయిలలో తేడాల గణాంక ప్రాముఖ్యత డేటా పాయింట్ల పైన గుర్తించబడింది (*P విలువ < 0.05, **P విలువ ≤ 0.01, ***P విలువ ≤ 0.001). 1999లో పోలాండ్‌లోని వియెర్జెనికాలోని లుపిన్ ఫీల్డ్ నుండి పొందిన ఇనాక్యులేటెడ్ (కొల్లెటోట్రిఖం లుపిని, స్ట్రెయిన్ కోల్-08) మరియు కంట్రోల్ (మాక్-ఇనాక్యులేటెడ్) ప్లాంట్ల మధ్య వ్యక్తీకరణ స్థాయిలలో తేడాల గణాంక ప్రాముఖ్యత డేటా పాయింట్ల పైన గుర్తించబడింది (*P విలువ < 0.05, **P విలువ ≤ 0.01, ***P విలువ ≤ 0.001). స్థాటిస్టిచెస్కాయ ప్రఖ్యాతి గాంచింది. గ్ dannыh (*значение P <0,05, **значение P ≤ 0,01, ***значение P ≤ 0,001). 1999లో పోలాండ్‌లోని వైర్‌జెనిస్‌లోని లూపిన్ ఫీల్డ్ నుండి పొందిన ఇనాక్యులేటెడ్ (కొల్లెటోట్రిఖం లుపిని, స్ట్రెయిన్ కోల్-08) మరియు కంట్రోల్ (షామ్-ఇనాక్యులేటెడ్) ప్లాంట్ల మధ్య వ్యక్తీకరణ స్థాయిలలో గణాంకపరంగా ముఖ్యమైన తేడాలు డేటా పాయింట్ల పైన గుర్తించబడ్డాయి (*P విలువ < 0.05, **P-విలువ ≤ 0.01, ***P-విలువ ≤ 0.001).接种 (కొల్లెటోట్రిచమ్ లుపిని, కల్-08株, 1999 )和对照(模拟接种)植物之间表达水平差异的统计学显着性标记在着性标记在湕渍0.05, **P 值≤ 0.01, ***P 值≤ 0.001)。接扇水平 差异 的 统计学 显着性 标记 数据点 上方*p 值 。 。 ≤ 0.01, **P ≤ 0.01, ***P ≤) 0. స్టాటిస్టిచెస్కి జానచిమ్య రజ్లిచియా వ్ యూరోన్యహ్ ఎక్సప్రెస్సీ మేఘడు ఇనోకులిరోవానిమి (కోలెటోట్రిచమ్ లుపిని, షూటమ్, కల్నల్-08 పోలీ లిపినా వి వర్జెనిషే, పోల్షా, 1999లో టోచ్కామి данных (* значение P <0,05, ** P-значение ≤ 0,01, ***P-значение ≤ 0,001). 1999లో పోలాండ్‌లోని వెర్జెనిస్‌లోని లూపిన్ క్షేత్రాల నుండి పొందిన ఇనాక్యులేటెడ్ (కొల్లెటోట్రిఖం లుపిని, స్ట్రెయిన్ కోల్-08) మరియు నియంత్రణ (షామ్-ఇనాక్యులేటెడ్) మొక్కల మధ్య వ్యక్తీకరణ స్థాయిలలో గణాంకపరంగా ముఖ్యమైన తేడాలు డేటా పాయింట్ల పైన గుర్తించబడ్డాయి (*P విలువ < 0.05 , **P-విలువ ≤ 0.01, ***P-విలువ ≤ 0.001).విశ్లేషించబడిన NLL పంక్తులు: 83A:476 (నిరోధకత, హోమోజైగస్ Lanr1 యుగ్మ వికల్పాన్ని కలిగి ఉంటుంది), మాండెలప్ (మధ్యస్తంగా నిరోధకత, హోమోజైగస్ AnMan యుగ్మ వికల్పాన్ని కలిగి ఉంటుంది), బోరెజిన్ (నిరోధకత, తెలియని జన్యు నేపథ్యం) మరియు జనాభా 22660 (సున్నితత్వం).
Lanr1 లోకస్‌లోని అభ్యర్థి జన్యువు TanjilG_05042 RNA-seq అధ్యయనాల నుండి పొందిన ప్రొఫైల్‌ల నుండి చాలా భిన్నమైన వ్యక్తీకరణ నమూనాను చూపించింది (Fig. 6e). ఈ జన్యువు యొక్క గణనీయమైన క్రియాశీలత మాండెలప్ మరియు 22660 జనాభాలో (వరుసగా 39.7 మరియు 11.7 సార్లు వరకు) గమనించబడింది, దీని ఫలితంగా సాపేక్షంగా అధిక వ్యక్తీకరణ స్థాయిలు (వరుసగా 1.4 ± 0.14 మరియు 7.2 ± 1.3 వరకు) ఏర్పడ్డాయి. 83A:476 కూడా TanjilG_05042 జన్యువు యొక్క కొంత నియంత్రణను (3.8 రెట్లు వరకు) వెల్లడించింది, అయితే, సాధించిన సాపేక్ష వ్యక్తీకరణ స్థాయిలు (0.044 ± 0.002) మాండెలప్ మరియు 22660 జనాభాలో గమనించిన వాటి కంటే 30 రెట్లు తక్కువగా ఉన్నాయి. qPCR ద్వారా విశ్లేషించబడిన ఈ పరిశోధనలో మాక్-వ్యాక్సినేటెడ్ (నియంత్రణ) వేరియంట్లలో జన్యురూపాల మధ్య వ్యక్తీకరణ స్థాయిలలో గణనీయమైన తేడాలు కనిపించాయి, జనాభా 22660 మరియు 83A:476 మధ్య, అలాగే జనాభా 22660 మరియు 22660 మధ్య 58 రెట్లు వ్యత్యాసాన్ని చేరుకున్నాయి. బోరెజిన్ మరియు మండలప్ మధ్య రెండు రెట్లు వ్యత్యాసం సాధించబడింది.
83A:476 లో టీకాకు ప్రతిస్పందనగా AnMan లోకస్‌లోని అభ్యర్థి జన్యువు, TanjilG_12861, సక్రియం చేయబడింది మరియు మాండెలప్, 22660 జనాభాలో తటస్థంగా ఉంది మరియు బోరెజిన్‌లో నియంత్రించబడలేదు (Fig. 6f). TanjilG_12861 జన్యువు యొక్క సాపేక్ష వ్యక్తీకరణ టీకాలు వేసిన 83A: 476 (0.14±0.01) లో అత్యధికంగా ఉంది. 17.4 kDa క్లాస్ I హీట్ షాక్ ప్రోటీన్ జన్యువు TanjilG_05080 HSP17.4 అన్ని అధ్యయనం చేయబడిన జాతులు మరియు సమయ బిందువులలో తక్కువ సాపేక్ష వ్యక్తీకరణ స్థాయిలను చూపించింది (Fig. 6g). 22660 జనాభాలో 24 HPI వద్ద అత్యధిక విలువ గమనించబడింది (0.14 ± 0.02, టీకాకు ప్రతిస్పందనలో ఎనిమిది రెట్లు పెరుగుదల).
జన్యు వ్యక్తీకరణ ప్రొఫైల్‌ల పోలిక (చిత్రం 7) TanjilG_10657 మరియు నాలుగు ఇతర జన్యువుల మధ్య అధిక సహసంబంధాన్ని వెల్లడించింది: TanjilG_27015 (r = 0.89), TanjilG_05080 (r = 0.85), TanjilG_05042 (r = 0.80), మరియు TanjilG_04706 (r = 0.79). ఇటువంటి ఫలితాలు రక్షణ ప్రతిస్పందనల సమయంలో ఈ జన్యువుల సహ-నియంత్రణను సూచిస్తాయి. TanjilG_12861 మరియు TanjilG_23384 జన్యువులు ఇతర జన్యువులతో పోలిస్తే తక్కువ పియర్సన్ సహసంబంధ గుణకం విలువలతో (వరుసగా 0.08 నుండి 0.43 మరియు -0.19 నుండి 0.28 వరకు) విభిన్న వ్యక్తీకరణ ప్రొఫైల్‌లను చూపించాయి.
పరిమాణాత్మక PCR ఉపయోగించి జన్యు వ్యక్తీకరణ ప్రొఫైల్‌ల మధ్య సహసంబంధాలు కనుగొనబడ్డాయి. కింది ఇరుకైన ఆకు లూపిన్ లైన్‌లను విశ్లేషించారు: 83A:476 (నిరోధకత, హోమోజైగస్ Lanr1 యుగ్మ వికల్పాన్ని కలిగి ఉంటుంది), మాండెలప్ (మధ్యస్థంగా నిరోధకత, హోమోజైగస్ AnMan యుగ్మ వికల్పాన్ని కలిగి ఉంటుంది), బోరెజిన్ (నిరోధకత, జన్యు నేపథ్యం తెలియదు), మరియు జనాభా 22660 (సున్నితత్వం). మూడు సమయ పాయింట్లు లెక్కించబడ్డాయి (టీకాలు వేసిన 6, 12 మరియు 24 గంటల తర్వాత), వీటిలో టీకాలు వేసిన (కొల్లెటోట్రిఖం లుపిని, స్ట్రెయిన్ కోల్-08, పోలాండ్‌లోని వైర్‌జెనిస్‌లోని లూపిన్ క్షేత్రాల నుండి 1999లో పొందబడింది) మరియు నియంత్రణ (షామ్-ఇనాక్యులేటెడ్) మొక్కలు ఉన్నాయి. స్కేల్ పియర్సన్ సహసంబంధ గుణకం విలువను చూపుతుంది.
అంగుళానికి 6 హార్స్‌పవర్‌తో పొందిన డేటా ఆధారంగా, ప్రారంభ రక్షణ ప్రతిస్పందనలపై దృష్టి పెట్టడానికి ఇనాక్యులేటెడ్ మరియు కంట్రోల్ ప్లాంట్‌లను పోల్చడం ద్వారా గుర్తించబడిన 9981 DEGపై WGCNA ప్రదర్శించబడింది (అనుబంధ పట్టిక S12). జన్యురూపాలు మరియు ప్రయోగాత్మక వైవిధ్యాల మధ్య పరస్పర సంబంధం ఉన్న (సానుకూల లేదా ప్రతికూల) వ్యక్తీకరణ ప్రొఫైల్‌లతో ఇరవై రెండు జన్యు మాడ్యూల్స్ (క్లస్టర్‌లు) కనుగొనబడ్డాయి. సగటున, జన్యు వ్యక్తీకరణ స్థాయిలు 83A:476 > మాండెలప్ > బోరెజిన్ > జనాభా 22660 క్రమంలో తగ్గుతున్నాయి (అయితే, రెండు రకాల్లోనూ, నియంత్రణ ప్లాంట్లలో ఈ ధోరణి బలంగా ఉంది). సగటున, జన్యు వ్యక్తీకరణ స్థాయిలు 83A:476 > మాండెలప్ > బోరెజిన్ > జనాభా 22660 క్రమంలో తగ్గుతున్నాయి (అయితే, రెండు రకాల్లోనూ, నియంత్రణ ప్లాంట్లలో ఈ ధోరణి బలంగా ఉంది). పోర్యాడ్కే 83A:476 > మాండలప్ > బోరెజిన్ > జనాభా 22660 టెండెనియస్ బైలా సిల్నీ యు కాంట్రోల్న్ రాస్టేనియ్). సగటున, జన్యు వ్యక్తీకరణ స్థాయిలు 83A:476 > మాండెలప్ > బోరెజిన్ > జనాభా 22660 క్రమంలో తగ్గాయి (అయితే, రెండు రకాల్లోనూ, ఈ ధోరణి నియంత్రణ మొక్కలలో బలంగా ఉంది).平均而言,基因表达水平按83A:476 > మాండెలప్ > బోరెజిన్ > జనాభా 22660的顺序下陌平均 而 言 , 基因 水平 按 按 83a: 476> మాండలప్> బోరిజిన్> జనాభా 22660 的 顺序 下降在 植物 మీరు 更.... స్రెడ్నెమ్ యూరోవ్ని ఎక్సప్రెస్సీ గెనోవ్ స్నిజాలిస్ వ రియాడు 83A:476 > మాండెలప్ > బోరెజిన్ > జనాభా 22660 была сильнее у kontroльных rasteniй). సగటున, 83A:476 > మాండెలప్ > బోరెజిన్ > పాపులేషన్ 22660 సిరీస్‌లో జన్యు వ్యక్తీకరణ స్థాయిలు తగ్గాయి (అయితే, రెండు వేరియంట్‌లలో, ఈ ధోరణి నియంత్రణ ప్లాంట్లలో బలంగా ఉంది).టీకాలు వేయడం వలన జన్యు వ్యక్తీకరణలో పెరుగుదల ఏర్పడింది, ముఖ్యంగా మాడ్యూల్స్ 18, 19, 14, 6 మరియు 1 (ప్రభావం యొక్క అవరోహణ క్రమంలో), ప్రతికూల నియంత్రణ (ఉదా. మాడ్యూల్స్ 9 మరియు 20) లేదా తటస్థ ప్రభావాలతో (ఉదా. మాడ్యూల్స్ 11, 22, 8 మరియు 13). GO టర్మ్ ఎన్‌రిచ్‌మెంట్ విశ్లేషణ (సప్లిమెంటరీ టేబుల్ S13) గరిష్ట క్రియాశీలతతో ఇనాక్యులేటెడ్ మాడ్యూల్ (18) కోసం “GO: 0006952 ప్రొటెక్టివ్ స్పందనలు” వెల్లడైంది, ఇందులో qPCR (TanjilG_04706, TanjilG_23384, TanjilG_10657 మరియు TanjilG_27015) ద్వారా విశ్లేషించబడిన జన్యువులు, అలాగే అనేక ఇనాక్యులేట్ ఎక్కువగా అణచివేయబడిన కిరణజన్య సంయోగక్రియ మాడ్యూల్స్ (9) ఉన్నాయి. మాడ్యూల్ 18 కాన్సంట్రేటర్ (Fig. 8) PR-10-వంటి LlR18B ప్రోటీన్‌ను ఎన్‌కోడ్ చేసే TanjilG_26536 జన్యువుగా గుర్తించబడింది మరియు మాడ్యూల్ 9 కాన్సంట్రేటర్ ఫోటోసిస్టమ్ II PsbQ ప్రోటీన్‌ను ఎన్‌కోడ్ చేసే TanjilG_28955 జన్యువుగా గుర్తించబడింది. అభ్యర్థి ఆంత్రాక్నోస్ రెసిస్టెన్స్ జన్యువు Lanr1, TanjilG_05042, మాడ్యూల్ 22 (Fig. 9)లో కనుగొనబడింది మరియు TanjilG_01212 హబ్‌ను కలిగి ఉన్న “GO:0044260 సెల్యులార్ మాక్రోమోలిక్యులర్ మెటబాలిక్ ప్రక్రియలు” మరియు “GO:0006355 ట్రాన్స్‌క్రిప్షనల్ రెగ్యులేషన్, DNA టెంప్లేటింగ్” అనే పదాలతో సంబంధం కలిగి ఉంది. జన్యువు ఉష్ణ ఒత్తిడి ట్రాన్స్‌క్రిప్షన్ కారకం A-4a (HSFA4a)ని ఎన్కోడ్ చేస్తుంది.
"GO: 0006952 డిఫెన్స్ స్పందనలు" అనే అతిగా ప్రాతినిధ్యం వహించిన జీవ ప్రక్రియ పదాలతో మాడ్యూళ్ల జన్యు సహ-వ్యక్తీకరణ యొక్క వెయిటెడ్ నెట్‌వర్క్ విశ్లేషణ. qPCR (TanjilG_04706, TanjilG_23384, TanjilG_10657 మరియు TanjilG_27015) ద్వారా విశ్లేషించబడిన నాలుగు జన్యువులను హైలైట్ చేయడానికి లిగేషన్ సరళీకృతం చేయబడింది.
"GO: 0006355: ట్రాన్స్క్రిప్షనల్ రెగ్యులేషన్, DNA టెంప్లేటింగ్" అనే అతిగా ప్రాతినిధ్యం వహించిన జీవ ప్రక్రియ పదంతో కూడిన మాడ్యూల్ యొక్క జన్యు సహ-వ్యక్తీకరణ యొక్క వెయిటెడ్ నెట్‌వర్క్ విశ్లేషణ మరియు అభ్యర్థి ఆంత్రాక్నోస్ నిరోధక జన్యువు Lanr1 TanjilG_05042 ను కలిగి ఉంది. TanjilG_05042 జన్యువు మరియు కేంద్ర TanjilG_01212 జన్యువును వేరుచేయడానికి బంధనాన్ని సరళీకృతం చేశారు.
ఆస్ట్రేలియాలో సేకరించిన ఆంత్రాక్నోస్ రెసిస్టెన్స్ స్క్రీనింగ్‌లో ముందుగా విడుదలైన సాగులలో చాలా వరకు ఈ వ్యాధికి గురయ్యే అవకాశం ఉందని తేలింది; కాల్య, కోరోమప్ మరియు మాండెలప్ మధ్యస్తంగా నిరోధకతను కలిగి ఉన్నాయని వర్ణించబడ్డాయి, అయితే వోంగా, టాంజిల్ మరియు 83A:476 అధిక నిరోధకతను కలిగి ఉన్నాయని వర్ణించబడ్డాయి26,27,31. Lanr1 అనే అదే నిరోధక యుగ్మ వికల్పాన్ని కలిగి ఉన్నాయి మరియు Coromup మరియు మాండెలప్ AnMan10, 26, 39 అనే వేరే యుగ్మ వికల్పాన్ని కలిగి ఉన్నాయి, అయితే కాల్య వేరే యుగ్మ వికల్పాన్ని దాటింది. , Lanr2. జర్మనీలో ఆంత్రాక్నోస్ రెసిస్టెన్స్ కోసం స్క్రీనింగ్ ఫలితంగా Lanr1 కాకుండా వేరే అభ్యర్థి యుగ్మ వికల్పంతో Bo7212 నిరోధక రేఖను గుర్తించడం జరిగింది, LanrBo36 అని నియమించబడింది.
మా అధ్యయనం పరీక్షించబడిన జెర్మ్‌ప్లాజంలో Lanr1 యుగ్మ వికల్పం యొక్క చాలా తక్కువ పౌనఃపున్యం (సుమారు 6%) ను వెల్లడించింది. ఈ పరిశీలన Anseq3 మరియు Anseq4 మార్కర్‌లను ఉపయోగించి తూర్పు యూరోపియన్ జెర్మ్‌ప్లాజమ్‌ను పరీక్షించిన ఫలితాలకు అనుగుణంగా ఉంది, ఇది Lanr1 యుగ్మ వికల్పం రెండు బెలారసియన్ లైన్లలో మాత్రమే ఉందని చూపించింది. ఇది Lanr1 యుగ్మ వికల్పాన్ని ఇంకా స్థానిక సంతానోత్పత్తి కార్యక్రమాలు విస్తృతంగా ఉపయోగించలేదని సూచిస్తుంది, ఆస్ట్రేలియాలో కాకుండా, ఇది మార్కర్-సహాయక సంతానోత్పత్తికి కీలకమైన యుగ్మ వికల్పాలలో ఒకటి. ఆస్ట్రేలియన్ నివేదికతో పోలిస్తే యూరోపియన్ క్షేత్ర పరిస్థితులలో Lanr1 యుగ్మ వికల్పం అందించిన తక్కువ స్థాయి నిరోధకత దీనికి కారణం కావచ్చు. అదనంగా, ఆస్ట్రేలియాలోని అధిక వర్షపాతం ఉన్న ప్రాంతాలలో ఆంత్రాక్నోస్ అధ్యయనాలు Lanr1 యుగ్మ వికల్పం ద్వారా మధ్యవర్తిత్వం వహించిన నిరోధక ప్రతిస్పందనలు వ్యాధికారక పెరుగుదల మరియు వేగవంతమైన అభివృద్ధికి అనుకూలంగా ఉండే వాతావరణ పరిస్థితులలో ప్రభావవంతంగా ఉండకపోవచ్చని చూపించాయి. వాస్తవానికి, ప్రస్తుత అధ్యయనంలో, Lanr1 యుగ్మ వికల్పాన్ని కలిగి ఉన్న జన్యురూపాలలో కూడా ఆంత్రాక్నోస్ యొక్క కొన్ని లక్షణాలు గమనించబడ్డాయి, C. లుపిని అభివృద్ధికి సరైన పరిస్థితులలో నిరోధకత అదృశ్యమవుతుందని సూచిస్తుంది. అదనంగా, Lanr1 లోకస్ నుండి దాదాపు 1 cM దూరంలో ఉన్న Anseq3 మరియు Anseq4 మార్కర్ల ఉనికి యొక్క తప్పుడు సానుకూల వివరణలు సాధ్యమే 28,30,43.
మా అధ్యయనం ప్రకారం, Lanr1 యుగ్మ వికల్పాన్ని మోసుకెళ్లే 83A:476, మొదటి విశ్లేషించబడిన సమయ బిందువు (6 hpi) వద్ద పెద్ద-స్థాయి ట్రాన్స్‌క్రిప్టోమ్ రీప్రోగ్రామింగ్‌తో C. లుపిని ఇనాక్యులేషన్‌కు ప్రతిస్పందించింది, అయితే మాండెలప్‌లో, AnMan యుగ్మ వికల్పాన్ని మోసుకెళ్లే ట్రాన్‌స్క్రిప్టోమిక్ ప్రతిస్పందనలు చాలా తరువాత గమనించబడ్డాయి. (24 నుండి 48 hp వరకు). రక్షణ ప్రతిస్పందనలలో ఈ తాత్కాలిక వైవిధ్యాలు వ్యాధి లక్షణాలలో తేడాలతో సంబంధం కలిగి ఉంటాయి, ప్రతిఘటనకు విజయవంతమైన ప్రతిస్పందన కోసం ప్రారంభ వ్యాధికారక గుర్తింపు యొక్క ప్రాముఖ్యతను హైలైట్ చేస్తాయి. మొక్కల కణజాలానికి సోకడానికి, ఆంత్రాక్స్ బీజాంశాలు హోస్ట్ ఉపరితలంపై అంకురోత్పత్తి, కణ విభజన మరియు అప్రెస్సోరియం ఏర్పడటం వంటి అనేక అభివృద్ధి దశల ద్వారా వెళ్ళాలి. అనుబంధం అనేది హోస్ట్ యొక్క ఉపరితలంతో జతచేయబడిన మరియు హోస్ట్ కణజాలాలలోకి చొచ్చుకుపోవడాన్ని సులభతరం చేసే ఒక ఇన్ఫెక్టివ్ నిర్మాణం. అందువల్ల, బఠానీ సారంలోని C. గ్లోయోస్పోరియోయిడ్స్ యొక్క బీజాంశాలు 75-90 నిమిషాల పొదిగే తర్వాత కేంద్రకం యొక్క మొదటి విభజనను, 90-120 నిమిషాల తర్వాత జెర్మ్ ట్యూబ్ ఏర్పడటాన్ని మరియు 4 గంటల తర్వాత అణచివేతను చూపించాయి 45 . మామిడి సి. గ్లోయోస్పోరియోయిడ్స్ 3 గంటల పొదిగే తర్వాత 40% కంటే ఎక్కువ కోనిడియల్ అంకురోత్పత్తిని మరియు 4 గంటల తర్వాత దాదాపు 20% అప్రెసర్‌లను ఏర్పరచాయి. సి. గ్లోయోస్పోరియోయిడ్స్ యొక్క వైరలెన్స్-సంబంధిత CAP20 జన్యువు 4 గంటల 46 నిమిషాల తర్వాత CAP20 ప్రోటీన్ యొక్క అధిక సాంద్రతలతో అవోకాడో ఉపరితల మైనపులో 3.5 గంటల పొదిగే తర్వాత ఎపిఫైట్-ఫార్మింగ్ కోనిడియాలో ట్రాన్స్క్రిప్షనల్ కార్యకలాపాలను చూపించింది. అదేవిధంగా, సి. ట్రైఫోలిలో మెలనిన్ బయోసింథసిస్ జన్యువుల కార్యకలాపాలు 2 గంటల పొదిగే సమయంలో ప్రేరేపించబడ్డాయి, ఆ తర్వాత 1 గంట తర్వాత అప్ప్రెసోరియం ఏర్పడ్డాయి. ఆకు కణజాలాల అధ్యయనాలు సి. అక్యుటాటమ్‌తో టీకాలు వేసిన స్ట్రాబెర్రీలు 8 hpi వద్ద మొదటి అణచివేతను కలిగి ఉన్నాయని, అయితే సి. కోకోడ్‌లతో టీకాలు వేసిన టమోటాలు 4 hpi వద్ద మొదటి అణచివేతను కలిగి ఉన్నాయని చూపించాయి. కొల్లెటోట్రిఖం spp. అంటు ప్రక్రియ యొక్క సమయ ప్రమాణంతో ఎక్కువగా స్థిరంగా ఉంటాయి. 83A:476 కు వేగవంతమైన రక్షణ ప్రతిస్పందనలు ఈ లైన్‌లో మొక్కల నిరోధకత మరియు ఎఫెక్టర్-ట్రిగ్గర్డ్ ఇమ్యూనిటీ (ETI) జన్యువుల ప్రమేయాన్ని సూచిస్తాయి, అయితే మాండెలప్ యొక్క ఆలస్య ప్రతిస్పందనలు సూక్ష్మ-అనుబంధ పరమాణు నమూనా-ట్రిగ్గర్డ్ ఇమ్యూనిటీ (MTI) పరికల్పన 50 కు మద్దతు ఇస్తాయి. 83A: 476 మరియు మాండెలప్‌కు ప్రారంభ ప్రతిస్పందనలు. ఆలస్య ప్రతిస్పందనలో పైకి లేదా క్రిందికి నియంత్రించబడిన జన్యువుల మధ్య పాక్షిక అతివ్యాప్తి కూడా ఈ భావనకు మద్దతు ఇస్తుంది, ఎందుకంటే ETI తరచుగా వేగవంతమైన మరియు మెరుగైన MTI ప్రతిస్పందనగా పరిగణించబడుతుంది, ఇది సంక్రమణ ప్రదేశంలో ప్రోగ్రామ్ చేయబడిన కణ మరణంతో ముగుస్తుంది, దీనిని అనాఫిలాక్టిక్ షాక్ 51,52 అని పిలుస్తారు.
జీన్ ఒంటాలజీ GO:0006952 "డిఫెన్స్ రెస్పాన్స్" అనే అతిగా ప్రాతినిధ్యం వహించిన పదానికి ఆపాదించబడిన జన్యువులలో ఎక్కువ భాగం ఒత్తిడి-ప్రేరిత ఉపవాస సందేశం 22 ప్రోటీన్ (SAM22 లాంటిది) యొక్క 11 హోమోలాగ్‌లు మరియు ఏడు ప్రధాన లేటెక్స్ ప్రోటీన్-లైక్‌లు (MLPలు). -లైక్ ప్రోటీన్లు 31, 34, 43 మరియు 423 సీక్వెన్స్ సారూప్యతను చూపించాయి. SAM22-వంటి జన్యువులు ఎక్కువ కాలం కొనసాగిన గణనీయమైన క్రియాశీలతను చూపించాయి, ఆంత్రాక్నోస్ నిరోధకత పెరిగిన స్థాయిలను చూపించాయి (83A:476 మరియు బోరెజిన్). అయితే, MLP-వంటి జన్యువులు అభ్యర్థి నిరోధక యుగ్మ వికల్పాన్ని కలిగి ఉన్న పంక్తులలో మాత్రమే నియంత్రించబడ్డాయి (83A:476/Lanr1 at 6 hpi మరియు మాండెలప్/AnMan at 24 hpi). గుర్తించబడిన అన్ని SAM22-వంటి హోమోలాగ్‌లు సుమారు 105 kb విస్తరించి ఉన్న జన్యు సమూహం నుండి ఉద్భవించాయని, అయితే MLP-వంటి జన్యువులు జన్యువు యొక్క ప్రత్యేక ప్రాంతాల నుండి ఉద్భవించాయని గమనించాలి. డయాపోర్థెటాక్సికా ఇనాక్యులేషన్‌కు NLL నిరోధకతపై మా మునుపటి అధ్యయనంలో కూడా అటువంటి SAM22-వంటి జన్యువుల సమన్వయ క్రియాశీలత కనుగొనబడింది, ఇవి రక్షణ ప్రతిస్పందన యొక్క క్షితిజ సమాంతర భాగాలలో పాల్గొంటున్నాయని సూచిస్తున్నాయి. సాలిసిలిక్ ఆమ్లం, ఫంగల్ ప్రేరకాలు లేదా హైడ్రోజన్ పెరాక్సైడ్‌తో గాయం లేదా చికిత్సకు SAM22-వంటి జన్యువుల సానుకూల ప్రతిస్పందన నివేదికలు కూడా ఈ తీర్మానానికి మద్దతు ఇస్తున్నాయి.
MLP-వంటి జన్యువులు అనేక వృక్ష జాతులలో బాక్టీరియల్, వైరల్ మరియు వ్యాధికారక శిలీంధ్ర సంక్రమణలతో సహా వివిధ అబియోటిక్ మరియు బయోటిక్ ఒత్తిళ్లకు ప్రతిస్పందిస్తాయని తేలింది55. మొక్కలు మరియు వ్యాధికారకాల మధ్య కొన్ని పరస్పర చర్యలకు ప్రతిస్పందన దిశలు బలంగా పెరగడం (అంటే, వెర్టిసిలియం డాలియాతో పత్తి ముట్టడి సమయంలో) నుండి గణనీయంగా తగ్గడం (అంటే, ఆల్టర్నేరియా spp.తో ఆపిల్ చెట్టు సంక్రమణ తర్వాత) వరకు ఉన్నాయి56,57. F. నైగర్ సంక్రమణకు అవకాడో రక్షణ సమయంలో మరియు ఆపిల్ చెట్టు యొక్క సంక్రమణ సమయంలో MLP-వంటి 423 జన్యువు యొక్క గణనీయమైన తగ్గింపు గమనించబడిందిBotryospharia berengeriana f. cn. piricola మరియు Alternaria alternata అనేవి ఆపిల్ పాథోటైప్‌లు58,59. అదనంగా, MLP-వంటి 423 జన్యువును అతిగా వ్యక్తీకరించే ఆపిల్ కాలి నిరోధకత-సంబంధిత జన్యువుల యొక్క తక్కువ వ్యక్తీకరణను కలిగి ఉంది మరియు శిలీంధ్ర సంక్రమణకు ఎక్కువ అవకాశం ఉంది59. Fusarium oxysporum f తరువాత, MLP-వంటి 423 జన్యువు నిరోధక సాధారణ బీన్ జెర్మ్‌ప్లాజంలో కూడా అణచివేయబడింది. cn. బీన్ ఇన్ఫెక్షన్ 60.
మా RNA-seq అధ్యయనంలో గుర్తించబడిన PR-10 కుటుంబంలోని ఇతర సభ్యులు అప్‌రెగ్యులేషన్‌కు ప్రతిస్పందనగా LlR18A మరియు LlR18B జన్యువులు, అలాగే లిపిడ్ బదిలీ ప్రోటీన్ DIR1 కోసం అప్‌రెగ్యులేటెడ్ (1 జన్యువు) లేదా డౌన్‌రెగ్యులేటెడ్ (3 జన్యువులు) జన్యువు. . అదనంగా, WGCNA ఈ మాడ్యూల్‌లో LlR18B జన్యువును కేంద్రంగా హైలైట్ చేస్తుంది, ఇది టీకాకు ఎక్కువగా గురవుతుంది మరియు అనేక రక్షణ ప్రతిస్పందన జన్యువులను కలిగి ఉంటుంది. వ్యాధికారక బాక్టీరియాకు ప్రతిస్పందనగా LlR18A మరియు LlR18B జన్యువులు పసుపు లూపిన్ ఆకులలో, అలాగే D. టాక్సికా టీకాల తర్వాత NLL కాండంలో ప్రేరేపించబడ్డాయి, అయితే ఈ జన్యువుల బియ్యం హోమోలాగ్, RSOsPR10, జాస్మోనిక్ యాసిడ్ సిగ్నలింగ్ మార్గంలో పాల్గొన్న ఫంగల్ ఇన్ఫెక్షన్ ద్వారా వేగంగా ప్రేరేపించబడింది53,61, 62. DIR1 జన్యువు దైహిక ఆర్జిత నిరోధకత (SAR) ప్రారంభానికి అవసరమైన నిర్దిష్ట-కాని లిపిడ్ రవాణా ప్రోటీన్‌లను ఎన్కోడ్ చేస్తుంది. రక్షిత ప్రతిచర్యల అభివృద్ధితో, DIR1 ప్రోటీన్ ఇన్ఫెక్షన్ యొక్క దృష్టి నుండి ఫ్లోయమ్ ద్వారా సుదూర అవయవాలలో SAR ను ప్రేరేపించడానికి రవాణా చేయబడుతుంది. ఆసక్తికరంగా, 84A:476 మరియు పాపులేషన్ 22660 లైన్లలో మొదటి సమయ బిందువు వద్ద TanjilG_02313 DIR1 జన్యువు గణనీయంగా ప్రేరేపించబడింది, కానీ ఆంత్రాక్నోస్ నిరోధకత 84A:476 లైన్‌లో మాత్రమే విజయవంతంగా అభివృద్ధి చెందింది. ఇది NLLలో DIR1 జన్యువు యొక్క కొంత ఉప-ఫంక్షనలైజేషన్‌ను సూచిస్తుంది, ఎందుకంటే మిగిలిన మూడు హోమోలాగ్‌లు 6 hpi వద్ద 83A:476 లైన్‌లో మాత్రమే టీకాలకు ప్రతిస్పందించాయి మరియు ఈ ప్రతిస్పందన క్రిందికి దర్శకత్వం వహించబడింది.
మా అధ్యయనంలో, “GO:0055114 రెడాక్స్ ప్రక్రియ” అని పిలువబడే జీవ ప్రక్రియకు సంబంధించిన అత్యంత సాధారణ భాగాలు సైటోక్రోమ్ P450 ప్రోటీన్, పెరాక్సిడేస్, లినోలెయిక్ ఆమ్లం 9S-/13S-లిపోక్సిజనేస్ మరియు 1-అమైనోసైక్లోప్రొపేన్-1-కార్బాక్సిలిక్ ఆమ్లం ఆక్సిడేస్. అదనంగా, మా WGCNA HSFA4a హోమోలాగ్‌ను Lanr1 నిరోధక జన్యు అభ్యర్థి TanjilG_05042 వంటి మాడ్యూల్‌లను మోసే కేంద్రంగా నిర్వచిస్తుంది. HSFA4a అనేది మొక్కలలో అణు ట్రాన్స్క్రిప్షన్ యొక్క రెడాక్స్-ఆధారిత నియంత్రణలో ఒక భాగం.
సైటోక్రోమ్ P450 ప్రోటీన్లు ఆక్సిడోరిడక్టేస్‌లు, ఇవి ప్రాథమిక మరియు ద్వితీయ జీవక్రియలో NADPH మరియు/లేదా O2-ఆధారిత హైడ్రాక్సిలేషన్ ప్రతిచర్యలను ఉత్ప్రేరకపరుస్తాయి, వీటిలో జెనోబయోటిక్స్ యొక్క జీవక్రియ, అలాగే హార్మోన్లు, కొవ్వు ఆమ్లాలు, స్టెరాల్స్, సెల్ వాల్ భాగాలు, బయోపాలిమర్‌లు మరియు రక్షిత సమ్మేళనాల బయోసింథసిస్ 69 ఉన్నాయి. మా అధ్యయనంలో, పెద్ద సంఖ్యలో మార్చబడిన హోమోలాగ్‌లు (37) మరియు నిర్దిష్ట జన్యువుల మధ్య ప్రతిస్పందన నమూనాలలో తేడాల కారణంగా మొక్కల సైటోక్రోమ్ P450 ఫంక్షన్‌లో వైవిధ్యం -10.6 log2 (రెట్లు మార్పు) నుండి 5.7కి తగ్గించబడింది, ఇది పైకి సవరణను ప్రతిబింబిస్తుంది. . ఇంత పెద్ద ప్రోటీన్ సూపర్‌ఫ్యామిలీలో NLL జన్యువుల యొక్క పుటేటివ్ బయోలాజికల్ ఫంక్షన్‌ను విశదీకరించడానికి RNA-seq డేటాను మాత్రమే ఉపయోగించడం చాలా ఊహాజనితంగా ఉంటుంది. అయితే, కొన్ని సైటోక్రోమ్ P450 జన్యువులు వ్యాధికారక శిలీంధ్రాలు లేదా బ్యాక్టీరియాకు పెరిగిన నిరోధకతతో సంబంధం కలిగి ఉన్నాయని గమనించాలి, అలెర్జీ ప్రతిచర్యలకు దోహదం కూడా ఉంటుంది69,70,71.
క్లాస్ III పెరాక్సిడేస్‌లు మొక్కల పెరుగుదల మరియు అభివృద్ధి సమయంలో విస్తృత శ్రేణి జీవక్రియ ప్రక్రియలలో పాల్గొనే బహుళ ప్రయోజన మొక్కల ఎంజైమ్‌లు, అలాగే లవణీయత, కరువు, అధిక కాంతి తీవ్రత మరియు వ్యాధికారక దాడి వంటి పర్యావరణ ఒత్తిళ్లకు ప్రతిస్పందనగా ఉంటాయి72. పెరాక్సిడేస్‌లు ఆంత్రాసిస్‌తో అనేక వృక్ష జాతుల పరస్పర చర్యలో పాల్గొంటాయి, వీటిలో స్టైలోసాంథెస్ హ్యూమిలిస్ మరియు సి. గ్లోయోస్పోరియోయిడ్స్, లెన్స్ కులినారిస్ మరియు సి. ట్రంకాటమ్, ఫేసియోలస్ వల్గారిస్ మరియు సి. లిండెముథియానమ్, కుకుమిస్ సాటివస్ మరియు సి. లాగనేరియం73,74,75,76 ఉన్నాయి. శిలీంధ్రం మొక్క కణజాలంలోకి చొచ్చుకుపోయే ముందు ప్రతిస్పందన చాలా వేగంగా ఉంటుంది, కొన్నిసార్లు 4 HPI వద్ద కూడా73. పెరాక్సిడేస్ జన్యువు D. టాక్సికా NLL టీకాకు కూడా ప్రతిస్పందించింది. ఆక్సీకరణ పేలుడును నియంత్రించడానికి లేదా ఆక్సీకరణ ఒత్తిడిని తొలగించడానికి వాటి సాధారణ విధులతో పాటు, పెరాక్సిడేస్‌లు లిగ్నిఫికేషన్, సబ్యూనిట్ లేదా నిర్దిష్ట సమ్మేళనాల క్రాస్-లింకింగ్ సమయంలో సెల్ గోడ ఉపబల ఆధారంగా భౌతిక అడ్డంకులను సృష్టించడం ద్వారా వ్యాధికారక పెరుగుదలకు ఆటంకం కలిగిస్తాయి. ఈ ఫంక్షన్‌ను సిలికోలో టాంజిల్‌జి_03329 జన్యువు ఎన్‌కోడింగ్ చేయడం ద్వారా ఆపాదించవచ్చు, ఇది పుటేటివ్ లిగ్నిన్-ఫార్మింగ్ అనియాన్ పెరాక్సిడేస్‌ను 6 HPI వద్ద 83A:476 రెసిస్టెంట్ లైన్‌లో మా అధ్యయనంలో గణనీయంగా నియంత్రించబడింది, కానీ స్పందించని ఇతర జాతులు మరియు సమయ బిందువులలో కాదు.
లినోలెయిక్ ఆమ్లం యొక్క 9S-/13S-లిపోక్సిజనేస్ అనేది లిపిడ్ బయోసింథసిస్ యొక్క ఆక్సీకరణ మార్గంలో మొదటి దశ78. ఈ మార్గం యొక్క ఉత్పత్తులు మొక్కల రక్షణలో బహుళ విధులను కలిగి ఉంటాయి, వీటిలో కాలోస్ మరియు పెక్టిన్ నిక్షేపాలు ఏర్పడటం ద్వారా కణ గోడ బలోపేతం కావడం మరియు రియాక్టివ్ ఆక్సిజన్ జాతుల ఉత్పత్తి ద్వారా ఆక్సీకరణ ఒత్తిడిని నియంత్రించడం79,80,81,82,83 ఉన్నాయి. ప్రస్తుత అధ్యయనంలో, లినోలెయిక్ ఆమ్లం 9S-/13S-లిపోక్సిజనేస్ యొక్క వ్యక్తీకరణ అన్ని జాతులలో మార్చబడింది, కానీ 22660కి గురయ్యే అవకాశం ఉన్న జనాభాలో, వేర్వేరు సమయ బిందువులలో అప్‌రెగ్యులేషన్ ప్రబలంగా ఉంది, అయితే నిరోధక Lanr1 మరియు AnMan యుగ్మ వికల్పాన్ని కలిగి ఉన్న జాతులలో, ఈ జన్యురూపాల మధ్య రక్షిత ఆంత్రాక్స్ ప్రతిచర్యలలో ఆక్సిలిపిన్ పొర యొక్క వైవిధ్యతను ఇది నొక్కి చెబుతుంది.
1-అమైనోసైక్లోప్రొపేన్-1-కార్బాక్సిలేట్ ఆక్సిడేస్ (ACO) హోమోలాగ్ లూపిన్‌తో టీకాలు వేసినప్పుడు గణనీయంగా అధిక నియంత్రణ (9 జన్యువులు) లేదా తక్కువ నియంత్రణ (2 జన్యువులు) పొందింది. రెండు మినహాయింపులతో, ఈ ప్రతిస్పందనలన్నీ 6 hp వద్ద 83A:476 వద్ద సంభవించాయి. ACO ప్రోటీన్ల ద్వారా మధ్యవర్తిత్వం వహించే ఎంజైమాటిక్ ప్రతిచర్య ఇథిలీన్ ఉత్పత్తిలో రేటు-పరిమితం చేసే దశ మరియు అందువల్ల అధికంగా నియంత్రించబడుతుంది84. ఇథిలీన్ అనేది మొక్కల హార్మోన్, ఇది మొక్కల అభివృద్ధిని నియంత్రించడంలో మరియు అబియోటిక్ మరియు బయోటిక్ ఒత్తిడి పరిస్థితులకు ప్రతిస్పందనలో వివిధ పాత్రలను పోషిస్తుంది. ACO ట్రాన్స్క్రిప్షన్ యొక్క ప్రేరణ మరియు ఇథిలీన్ సిగ్నలింగ్ మార్గం యొక్క క్రియాశీలత రియాక్టివ్ ఆక్సిజన్ జాతులు మరియు ఫైటోఅలెక్సిన్‌ల ఉత్పత్తిని నియంత్రించడం ద్వారా హెమిబయోట్రోఫిక్ ఫంగస్ ఒరిజా ఒరిజాకు బియ్యం నిరోధకతను పెంచడంలో పాల్గొంటాయి. ఈ అధ్యయనంలో నివేదించబడిన 83A:476 లైన్‌లో ACO హోమోలాగ్‌ల గణనీయమైన నియంత్రణ నేపథ్యంలో, M. oryzae మరియు C. lupini88,89 మధ్య చాలా సారూప్యమైన ఆకు సంక్రమణ ప్రక్రియ కనుగొనబడింది, NLL ఆంత్రాక్నోస్ ఇథిలీన్‌కు నిరోధకతను అందించే అవకాశాన్ని మారుస్తుంది, ఇది పరమాణు మార్గాల్లో సిగ్నలింగ్ కేంద్ర దశ.
ప్రస్తుత అధ్యయనంలో, కిరణజన్య సంయోగక్రియతో సంబంధం ఉన్న అనేక జన్యువులను 83A:476 లో 6 hpi వద్ద మరియు మాండెలూప్ మరియు 22660 జనాభాలో 48 hpi వద్ద పెద్ద ఎత్తున అణచివేయడం గమనించబడింది. ఈ మార్పుల పరిధి మరియు పురోగతి స్థాయికి అనులోమానుపాతంలో ఉంటుంది. ఈ ప్రయోగంలో ఆంత్రాక్నోస్ నిరోధకత గమనించబడింది. ఇటీవల, వ్యాధికారక బాక్టీరియా మరియు శిలీంధ్రాలతో సహా మొక్క-వ్యాధికారక పరస్పర చర్యల యొక్క అనేక నమూనాలలో కిరణజన్య సంయోగక్రియ-సంబంధిత ట్రాన్స్క్రిప్ట్స్ యొక్క బలమైన మరియు ప్రారంభ అణచివేత నివేదించబడింది. సంక్రమణకు ప్రతిస్పందనగా కిరణజన్య సంయోగక్రియతో సంబంధం ఉన్న జన్యువుల యొక్క తొందరపాటు (కొన్ని పరస్పర చర్యలలో 2 HPI నుండి) మరియు ప్రపంచ అణచివేత రియాక్టివ్ ఆక్సిజన్ జాతుల విస్తరణ మరియు అలెర్జీ ప్రతిచర్యలకు మధ్యవర్తిత్వం వహించడానికి సాలిసిలిక్ యాసిడ్ మార్గంతో వాటి పరస్పర చర్య ఆధారంగా మొక్కల రోగనిరోధక శక్తిని ప్రేరేపిస్తుంది 90,94.
ముగింపులో, అత్యంత నిరోధక వంశం (83A:476) కోసం ప్రతిపాదించబడిన రక్షణ ప్రతిస్పందన విధానాలలో R జన్యువు (బహుశా TIR-NBS-LRR TanjilG_05042) ద్వారా వేగవంతమైన వ్యాధికారక గుర్తింపు మరియు అలెర్జీ ప్రతిస్పందన-మధ్యవర్తిత్వ సాలిసిలిక్ ఆమ్లం మరియు ఇథిలీన్ సిగ్నలింగ్ ఉన్నాయి, తరువాత దీర్ఘ-శ్రేణి SAR చర్యను ఏర్పాటు చేయడం DIR-1 ప్రోటీన్ ద్వారా మద్దతు ఇస్తుంది. C. lupini సంక్రమణకు బయోట్రోఫిక్ కాలం చాలా తక్కువగా ఉంటుంది (సుమారు 2 రోజులు), తరువాత నెక్రోటిక్ పెరుగుదల95 ఉంటుంది. ఈ దశల మధ్య పరివర్తన హోస్ట్ ప్లాంట్లలో హైపర్సెన్సిటివిటీ ప్రతిచర్యలకు ట్రిగ్గర్‌లుగా పనిచేసే ఇథిలీన్-ప్రేరేపిత ప్రోటీన్ల నెక్రోసిస్ మరియు వ్యక్తీకరణతో సంబంధం కలిగి ఉండవచ్చు. అందువల్ల, బయోట్రోఫిక్ దశలో C. lupini విజయవంతంగా సంగ్రహించడానికి సమయ విండో చాలా ఇరుకైనది. 6 hpi వద్ద 83A:476 లో గమనించిన రెడాక్స్ మరియు కిరణజన్య సంయోగక్రియతో సంబంధం ఉన్న జన్యువుల పునఃప్రోగ్రామింగ్ ఫంగల్ హైఫే యొక్క పురోగతికి అనుగుణంగా ఉంటుంది మరియు బయోట్రోఫిక్ దశలో విజయవంతమైన రక్షణ ప్రతిస్పందన అభివృద్ధిని తెలియజేస్తుంది. మాండెలప్ మరియు 22660 జనాభా యొక్క ట్రాన్స్క్రిప్టోమిక్ ప్రతిస్పందనలు నెక్రోటిక్ పెరుగుదలకు మారే ముందు ఫంగస్‌ను సంగ్రహించడానికి చాలా ఆలస్యం కావచ్చు, అయితే, PR-10 ప్రోటీన్ యొక్క సాపేక్షంగా వేగవంతమైన నియంత్రణ క్షితిజ సమాంతర నిరోధకతను ప్రోత్సహిస్తుంది కాబట్టి, మాండెలప్ 22660 జనాభా కంటే మరింత ప్రభావవంతంగా ఉండవచ్చు.
కానానికల్ R జన్యువు ద్వారా నడిచే ETI, ఆంత్రాక్నోస్‌కు బీన్ నిరోధకతకు ఒక సాధారణ యంత్రాంగంగా కనిపిస్తుంది. అందువల్ల, మోడల్ లెగ్యూమ్ మెడికాగో ట్రంకాటులాలో, ఆంత్రాక్నోస్‌కు నిరోధకత TIR-NBS-LRR97 ప్లాంట్ R జన్యు తరగతి సభ్యుడైన RCT1 జన్యువు ద్వారా ఇవ్వబడుతుంది. ఈ జన్యువు అల్ఫాల్ఫాలో విస్తృత-స్పెక్ట్రం ఆంత్రాక్నోస్ నిరోధకతను కూడా అందిస్తుంది, ఇది అనుమానాస్పద మొక్కలకు బదిలీ చేయబడుతుంది. సాధారణ బీన్ (P. వల్గారిస్)లో, ఇప్పటి వరకు రెండు డజన్ల కంటే ఎక్కువ ఆంత్రాక్నోస్ నిరోధక జన్యువులను గుర్తించారు. ఈ జన్యువులలో కొన్ని కానానికల్ R జన్యువులు లేని ప్రాంతాలలో కనిపిస్తాయి, అయితే అనేక ఇతర జన్యువులు TIR-NBS-LRRs99తో సహా NBS-LRR జన్యు సమూహాన్ని మోసే క్రోమోజోమ్‌ల అంచుల వద్ద ఉన్నాయి. జీనోమ్-వైడ్ SSR అధ్యయనం కూడా NBS-LRR జన్యువు మరియు సాధారణ బీన్‌లో ఆంత్రాక్నోస్ నిరోధకత మధ్య సంబంధాన్ని నిర్ధారించింది. తెల్లటి లూపిన్ 101లో ప్రధాన ఆంత్రాక్నోస్ నిరోధక లోకస్‌ను మోసే జన్యు ప్రాంతంలో కానానికల్ R జన్యువు కూడా కనుగొనబడింది.
మొక్కల సంక్రమణ ప్రారంభ దశలో (ప్రాధాన్యంగా 12 hpi కంటే తక్కువ సమయంలో) సక్రియం చేయబడిన తక్షణ నిరోధక ప్రతిచర్య, కోల్లెలోట్రిచమ్ లుపిని అనే వ్యాధికారక శిలీంధ్రం వల్ల కలిగే ఆంత్రాక్నోస్ నుండి ఇరుకైన-ఆకులతో కూడిన లూపిన్‌ను సమర్థవంతంగా రక్షిస్తుందని మా పరిశోధన చూపిస్తుంది. అధిక త్రూపుట్ సీక్వెన్సింగ్‌ని ఉపయోగించి, Lanr1 మరియు AnMan నిరోధక జన్యువుల మధ్యవర్తిత్వం కలిగిన NLL మొక్కలలో ఆంత్రాక్నోస్ నిరోధక జన్యువుల అవకలన వ్యక్తీకరణ ప్రొఫైల్‌లను మేము ప్రదర్శించాము. విజయవంతమైన రక్షణలో మొక్క మొదటిసారి వ్యాధికారకంతో సంబంధంలోకి వచ్చిన కొన్ని గంటల్లోనే రెడాక్స్, కిరణజన్య సంయోగక్రియ మరియు వ్యాధికారకంలో పాల్గొన్న ప్రోటీన్ల కోసం జన్యువులను జాగ్రత్తగా రూపొందించడం జరుగుతుంది. ఇలాంటి రక్షణ ప్రతిచర్యలు, కానీ సమయంలో ఆలస్యం అయినప్పటికీ, మొక్కలను వ్యాధుల నుండి రక్షించడంలో చాలా తక్కువ ప్రభావవంతంగా ఉంటాయి. Lanr1 జన్యువు ద్వారా మధ్యవర్తిత్వం చేయబడిన ఆంత్రాక్స్ నిరోధకత R జన్యువు యొక్క సాధారణ వేగవంతమైన ప్రతిస్పందనను పోలి ఉంటుంది (ఎఫెక్టర్-ట్రిగ్గర్డ్ రోగనిరోధక శక్తి), అయితే AnMan జన్యువు చాలావరకు క్షితిజ సమాంతర ప్రతిస్పందనను (సూక్ష్మజీవులతో అనుబంధించబడిన పరమాణు నమూనా ద్వారా ప్రేరేపించబడిన రోగనిరోధక శక్తి) అందిస్తుంది, ఇది మితమైన స్థాయి స్థిరత్వాన్ని అందిస్తుంది.
ఆంత్రాక్నోస్ మార్కర్ల కోసం పరీక్షించడానికి ఉపయోగించిన 215 NLL లైన్లలో 74 సాగు రకాలు, 60 క్రాస్-అప్ లేదా బ్రీడింగ్ ద్వారా పొందిన లైన్లు, 5 మ్యూటెంట్లు మరియు 76 అడవి లేదా అసలు జెర్మ్ప్లాజమ్‌లు ఉన్నాయి. ఈ లైన్లు 17 దేశాల నుండి వచ్చాయి, ప్రధానంగా పోలాండ్ (58), స్పెయిన్ (47), జర్మనీ (27), ఆస్ట్రేలియా (26), రష్యా (19), బెలారస్ (7), ఇటలీ (5) మరియు ఇతర లైన్లు. 10 దేశాల నుండి. ఈ సెట్‌లో రిఫరెన్స్ రెసిస్టెంట్ లైన్లు కూడా ఉన్నాయి: 83A:476, టాంజిల్, లాన్ర్1 యుగ్మ వికల్పాన్ని మోసే వోంగా మరియు అన్‌మాన్ యుగ్మ వికల్పాన్ని మోసే మాండెలప్. ఈ లైన్లు పోలాండ్‌లోని వియాట్రోవోలోని పోజ్నాన్ ప్లాంట్ బ్రీడింగ్ లిమిటెడ్ (సప్లిమెంటరీ టేబుల్ S1) నిర్వహించే యూరోపియన్ లుపిన్ జెనెటిక్ రిసోర్స్ డేటాబేస్ నుండి పొందబడ్డాయి.
మొక్కలను నియంత్రిత పరిస్థితులలో పెంచారు (ఫోటోపియోడ్ 16 గంటలు, పగటిపూట ఉష్ణోగ్రత 25°C మరియు రాత్రి 18°C). రెండు జీవ ప్రతిరూపాలను విశ్లేషించారు. ప్రోటోకాల్ ప్రకారం DNeasy ప్లాంట్ మినీ కిట్ (కియాగెన్, హిల్డెన్, జర్మనీ) ఉపయోగించి మూడు వారాల వయస్సు గల ఆకుల నుండి DNA వేరుచేయబడింది. వివిక్త DNA యొక్క నాణ్యత మరియు సాంద్రతను స్పెక్ట్రోఫోటోమెట్రిక్ పద్ధతుల ద్వారా అంచనా వేశారు (నానోడ్రాప్ 2000; థర్మో ఫిషర్ సైంటిఫిక్, వాల్తామ్, MA, USA). ఆంత్రాక్నోస్ నిరోధక జన్యువు AnMan (cv. మాండెలప్ నుండి తీసుకోబడింది) ను గుర్తించే AnManM1 మార్కర్ మరియు Lanr1 జన్యువు (cv. టాంజిల్ నుండి తీసుకోబడింది) పక్కన ఉన్న Anseq3 మరియు Anseq4 మార్కర్‌లను 11,26,28 విశ్లేషించారు. నిరోధక యుగ్మ వికల్పం కోసం హోమోజైగోట్‌లను "1"గా, సుస్సిబుల్ - "0"గా మరియు హెటెరోజైగోట్‌లు - 0.5గా స్కోర్ చేశారు.
AnManM1, AnSeq3 మరియు AnSeq4 మార్కర్ల స్క్రీనింగ్ ఫలితాలు మరియు తుది తదుపరి ప్రయోగాలకు విత్తనాల లభ్యత ఆధారంగా, ఆంత్రాక్నోస్ రెసిస్టెన్స్ ఫినోటైపింగ్ కోసం 50 NLL లైన్‌లను ఎంపిక చేశారు. పగటిపూట 22°C మరియు రాత్రి 19°C ఉష్ణోగ్రత పరిధితో 14 గంటల ఫోటోపీరియడ్‌తో కంప్యూటర్ నియంత్రిత గ్రీన్‌హౌస్‌లో ఈ విశ్లేషణ నకిలీలో నిర్వహించబడింది. విత్తన కోటు చాలా గట్టిగా ఉండటం వల్ల విత్తన నిద్రాణస్థితిని నివారించడానికి మరియు ఏకరీతి అంకురోత్పత్తిని నిర్ధారించడానికి విత్తడానికి ముందు విత్తనాలను గీస్తారు (పదునైన బ్లేడుతో పిండం ఎదురుగా ఉన్న విత్తన కోటును కత్తిరించడం). మొక్కలను శుభ్రమైన నేలతో (TS-1 REC 085 మీడియం బేసిక్, క్లాస్మాన్-డీల్మాన్ పోల్స్కా, వార్సా, పోలాండ్) కుండలలో (11 × 11 × 21 సెం.మీ) పెంచారు. గ్రేటర్ పోలాండ్‌లోని వెర్జెనిట్సాలోని ఒక పొలంలో (52° 27′ 42″ N 17° 04′ 05″ E ) పెరిగిన ఇరుకైన-ఆకులతో కూడిన లూపిన్ మొక్కల కాండం నుండి 1999లో పెరిగిన కొల్లెటోట్రిచమ్ లుపిని కోల్-08 జాతితో టీకాలు వేయడం జరిగింది. ఒక ప్రాంతాన్ని పొందండి. స్పోర్యులేషన్‌ను ప్రేరేపించడానికి 21 రోజుల పాటు నల్ల కాంతి కింద 20° C వద్ద SNA మాధ్యమంలో ఐసోలేట్‌లను కల్చర్ చేశారు. విత్తిన నాలుగు వారాల తర్వాత, మొక్కలు 4-6 ఆకుల దశకు చేరుకున్నప్పుడు, mlకి 0.5 x 106 కోనిడియా సాంద్రతతో కోనిడియా యొక్క సస్పెన్షన్‌తో పిచికారీ చేయడం ద్వారా టీకాలు వేయడం జరిగింది. టీకాలు వేసిన తర్వాత, కోనిడియా అంకురోత్పత్తి మరియు సంక్రమణ ప్రక్రియను సులభతరం చేయడానికి మొక్కలను 24 గంటలు చీకటిలో 98% తేమ మరియు 25°C ఉష్ణోగ్రత వద్ద ఉంచారు. ఆ తరువాత మొక్కలను 22°C పగలు/19°C రాత్రి మరియు 70% తేమ వద్ద 14 గంటల ఫోటోపీరియడ్ కింద పెంచారు. టీకాలు వేసిన 22 రోజుల తర్వాత వ్యాధి స్కోరును తయారు చేశారు మరియు కాండం మరియు ఆకులపై నెక్రోటిక్ గాయాలు ఉండటం లేదా లేకపోవడంపై ఆధారపడి 0 (రోగనిరోధక శక్తి) నుండి 9 (చాలా సున్నితంగా ఉంటుంది) వరకు ఉంటుంది. అదనంగా, స్కోర్ చేసిన తర్వాత, మొక్కల బరువును కొలుస్తారు. మార్కర్ జన్యురూపాలు మరియు వ్యాధి సమలక్షణాల మధ్య సంబంధాలను పాయింట్ టూ-సీక్వెన్స్ సహసంబంధాలుగా లెక్కించారు (ఆంత్రాక్నోస్ రెసిస్టెన్స్ ఫినోటైప్ విశ్లేషణ కోసం లైన్ల సెట్‌లో హెటెరోజైగస్ మార్కర్లు లేకపోవడం).


పోస్ట్ సమయం: ఆగస్టు-17-2022