Nature.com സന്ദർശിച്ചതിന് നന്ദി. നിങ്ങൾ ഉപയോഗിക്കുന്ന ബ്രൗസർ പതിപ്പിന് പരിമിതമായ CSS പിന്തുണ മാത്രമേ ഉള്ളൂ. മികച്ച അനുഭവത്തിനായി, നിങ്ങൾ ഒരു അപ്ഡേറ്റ് ചെയ്ത ബ്രൗസർ ഉപയോഗിക്കാൻ ഞങ്ങൾ ശുപാർശ ചെയ്യുന്നു (അല്ലെങ്കിൽ ഇന്റർനെറ്റ് എക്സ്പ്ലോററിൽ കോംപാറ്റിബിലിറ്റി മോഡ് പ്രവർത്തനരഹിതമാക്കുക). അതേസമയം, തുടർച്ചയായ പിന്തുണ ഉറപ്പാക്കാൻ, സ്റ്റൈലുകളും ജാവാസ്ക്രിപ്റ്റും ഇല്ലാതെ ഞങ്ങൾ സൈറ്റ് റെൻഡർ ചെയ്യും.
ഭക്ഷ്യോത്പാദനത്തിനും മണ്ണിന്റെ മെച്ചപ്പെടുത്തലിനും ഉപയോഗിക്കുന്ന ഒരു പയർവർഗ്ഗ സസ്യമാണ് ആംഗുസ്റ്റിഫോളിയസ് ലുപിൻ (NLL, Lupinus angustifolius L.). NLL ഒരു വിളയായി ആഗോളതലത്തിൽ വ്യാപിക്കുന്നത്, വിനാശകരമായ ആന്ത്രാക്നോസ് രോഗത്തിന് കാരണമാകുന്ന ലുപിൻ ആന്ത്രാക്നോസ് ഉൾപ്പെടെയുള്ള നിരവധി രോഗകാരികളായ ഫംഗസുകളെ ആകർഷിച്ചിട്ടുണ്ട്. വർദ്ധിച്ച പ്രതിരോധം നൽകുന്ന രണ്ട് അല്ലീലുകൾ, Lanr1, AnMan എന്നിവ NLL പ്രജനനത്തിൽ ഉപയോഗിച്ചിട്ടുണ്ട്, എന്നാൽ അടിസ്ഥാന തന്മാത്രാ സംവിധാനങ്ങൾ അജ്ഞാതമായി തുടരുന്നു. ഈ പഠനത്തിൽ, യൂറോപ്യൻ NLL സാമ്പിളുകൾ പരിശോധിക്കാൻ Lanr1, AnMan മാർക്കറുകൾ ഉപയോഗിച്ചു. നിയന്ത്രിത പരിതസ്ഥിതിയിൽ വാക്സിൻ പരിശോധിച്ചപ്പോൾ പ്രതിരോധശേഷിയുള്ള രണ്ട് ദാതാക്കളുടെയും ഫലപ്രാപ്തി സ്ഥിരീകരിച്ചു. പ്രതിനിധി പ്രതിരോധശേഷിയുള്ളതും സാധ്യതയുള്ളതുമായ ലൈനുകളിൽ ഡിഫറൻഷ്യൽ ജീൻ എക്സ്പ്രഷൻ പ്രൊഫൈലിംഗ് നടത്തി. "GO:0006952 ഡിഫൻസ് റെസ്പോൺസ്", "GO:0055114 റെഡോക്സ് പ്രോസസ്", "GO:0015979 ഫോട്ടോസിന്തസിസ്" എന്നീ ജീൻ ഓൺടോളജി പദങ്ങളുടെ അമിത പ്രകടനവുമായി ആന്ത്രാക്നോസ് പ്രതിരോധം ബന്ധപ്പെട്ടിരിക്കുന്നു. കൂടാതെ, Lanr1(83A:476) ലൈൻ ഇനോക്കുലേഷനുശേഷം വേഗത്തിൽ ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റോം റീപ്രോഗ്രാമിംഗ് കാണിച്ചു, അതേസമയം മറ്റ് ലൈനുകൾ ഈ പ്രതികരണത്തിൽ ഏകദേശം 42 മണിക്കൂർ കാലതാമസം കാണിച്ചു. പ്രതിരോധ പ്രതികരണങ്ങൾ TIR-NBS, CC-NBS-LRR, NBS-LRR ജീനുകൾ, രോഗകാരികളിൽ ഉൾപ്പെട്ടിരിക്കുന്ന 10 പ്രോട്ടീനുകൾ, ലിപിഡ് ട്രാൻസ്ഫർ പ്രോട്ടീനുകൾ, എൻഡോഗ്ലൂക്കൻ-1,3-β-ഗ്ലൂക്കോസിഡേസ്, ഗ്ലൈസിൻ സമ്പുഷ്ടമായ സെൽ വാൾ പ്രോട്ടീനുകൾ, ഓക്സിജന്റെ റിയാക്ടീവ് പാതയിൽ നിന്നുള്ള ജീനുകൾ എന്നിവയുമായി ബന്ധപ്പെട്ടിരിക്കുന്നു. ഫോട്ടോസിന്തസിസുമായി ബന്ധപ്പെട്ട ജീനുകളെ ശ്രദ്ധാപൂർവ്വം അടിച്ചമർത്തുന്നത് ഉൾപ്പെടെ 83A:476 നുള്ള ആദ്യകാല പ്രതികരണങ്ങൾ ഫംഗസ് ബയോളജിയുടെ സസ്യവളർച്ചാ ഘട്ടത്തിൽ വിജയകരമായ സംരക്ഷണവുമായി പൊരുത്തപ്പെട്ടു, ഇത് ഒരു ഇഫക്റ്റർ പ്രതിരോധശേഷി ഉത്തേജിപ്പിക്കുന്നുവെന്ന് സൂചിപ്പിക്കുന്നു. മൊത്തത്തിലുള്ള തിരശ്ചീന വലിച്ചിടൽ പോലെ തന്നെ മാൻഡലൂപ്പ് പ്രതികരണവും മന്ദഗതിയിലാകുന്നു.
ഇടുങ്ങിയ ഇലകളുള്ള ലുപിൻ (NLL, Lupinus angustifolius L.) പടിഞ്ഞാറൻ മെഡിറ്ററേനിയൻ മേഖലയിൽ ഉത്ഭവിക്കുന്ന ഉയർന്ന പ്രോട്ടീൻ ധാന്യമാണ്1,2. നിലവിൽ ഇത് മൃഗങ്ങൾക്കും മനുഷ്യർക്കും ഭക്ഷ്യവിളയായി വളർത്തുന്നു. സിംബയോട്ടിക് നൈട്രജൻ ഫിക്സിംഗ് ബാക്ടീരിയകൾ വഴി നൈട്രജൻ ഫിക്സേഷൻ ചെയ്യുന്നതും മണ്ണിന്റെ ഘടനയുടെ മൊത്തത്തിലുള്ള പുരോഗതിയും കാരണം വിള ഭ്രമണ സംവിധാനങ്ങളിൽ ഇത് പച്ചിലവളമായും കണക്കാക്കപ്പെടുന്നു. കഴിഞ്ഞ നൂറ്റാണ്ടിൽ NLL ഒരു ദ്രുതഗതിയിലുള്ള വളർത്തൽ പ്രക്രിയയ്ക്ക് വിധേയമായി, ഇപ്പോഴും ഉയർന്ന പ്രജനന സമ്മർദ്ദത്തിലാണ്3,4,5,6,7,8,9,10,11,12. NLL ന്റെ വ്യാപകമായ കൃഷിയോടെ, രോഗകാരികളായ ഫംഗസുകളുടെ പിന്തുടർച്ച പുതിയ കാർഷിക ഇടങ്ങൾ വികസിപ്പിക്കുകയും പുതിയ വിള നശിപ്പിക്കുന്ന രോഗങ്ങൾക്ക് കാരണമാവുകയും ചെയ്തു. ലുപിൻ കർഷകർക്കും ബ്രീഡർമാർക്കും ഏറ്റവും ശ്രദ്ധേയമായത് കൊളെറ്റോട്രിക്കം ലുപിനി (ബോണ്ടാർ) നിരെൻബർഗ്, ഫെയ്ലർ & ഹാഗെഡോൺ13 എന്നീ രോഗകാരികളായ ഫംഗസുകൾ മൂലമുണ്ടാകുന്ന ആന്ത്രാക്നോസിന്റെ പ്രത്യക്ഷതയായിരുന്നു. ലുപിൻ കർഷകർക്കും ബ്രീഡർമാർക്കും ഏറ്റവും ശ്രദ്ധേയമായത് കൊളെറ്റോട്രിക്കം ലുപിനി (ബോണ്ടാർ) നിരെൻബർഗ്, ഫെയ്ലർ & ഹാഗെഡോൺ13 എന്നീ രോഗകാരികളായ ഫംഗസുകൾ മൂലമുണ്ടാകുന്ന ആന്ത്രാക്നോസിന്റെ പ്രത്യക്ഷതയായിരുന്നു. നയിബോളി പ്രിമെചതെല്ന്ыമ് ദ്ല്യ ഫെര്മെരൊവ് ആൻഡ് സെലെക്ത്സ്യൊനെരൊവ് ലിപിന ബ്യ്ലൊ പൊയവ്ലെനിഎ അന്ട്രാക്നോസ, വ്യ്ഗൊവനിഎ ഗ്രിബ്‌കോം കൊളെറ്റോട്രിചം ലുപിനി (ബോണ്ടാർ) നിരെൻബെർഗ്, ഫീലർ & ഹാഗെഡോൺ13. ലുപിൻ കർഷകർക്കും ബ്രീഡർമാർക്കും ഏറ്റവും ശ്രദ്ധേയമായത് കൊളെറ്റോട്രിക്കം ലുപിനി (ബോണ്ടാർ) നിരെൻബർഗ്, ഫെയ്ലർ & ഹാഗെഡോൺ എന്നീ രോഗകാരികളായ ഫംഗസുകൾ മൂലമുണ്ടാകുന്ന ആന്ത്രാക്നോസിന്റെ ആവിർഭാവമായിരുന്നു13.对于羽扇豆农民和饲养者来说，最引人注目的是炭疽病的出现，它是由病原，它是由病原) നിരെൻബെർഗ്, ഫീലർ & ഹാഗെഡോർൺ13 引起的。对于羽扇豆农民和饲养者来说，最引人注目的是炭疽病的出现，它是由病原，它是由病原(ബോണ്ടാർ)嵵മുടിയൻ。1 നയിബോളി പൊരസിതെല്ന്ыമ് ദ്ല്യ ഫെര്മെരൊവ് ആൻഡ് സെലെക്ത്സ്യൊനെരൊവ് ലിപിന ജവ്ല്ജജുത്സ്ജ പൊയവ്ലെന്ы അന്ട്രാക്നോസ, വ്ыമ്ыത് ഗ്രിബ്‌കോം കൊളെറ്റോട്രിചം ലുപിനി (ബോണ്ടാർ) നിരെൻബെർഗ്, ഫീലർ & ഹാഗെഡോൺ13. ലുപിൻ കർഷകരെയും ബ്രീഡർമാരെയും ഏറ്റവും കൂടുതൽ ആകർഷിക്കുന്നത് കൊളെറ്റോട്രിക്കം ലുപിനി (ബോണ്ടാർ) നിരെൻബർഗ്, ഫെയ്ലർ & ഹാഗെഡോൺ എന്നീ രോഗകാരികളായ ഫംഗസുകൾ മൂലമുണ്ടാകുന്ന ആന്ത്രാക്നോസിന്റെ ആവിർഭാവമാണ്.ഈ രോഗത്തെക്കുറിച്ചുള്ള ആദ്യകാല റിപ്പോർട്ടുകൾ ബ്രസീലിൽ നിന്നും അമേരിക്കയിൽ നിന്നുമാണ് വന്നത്, 1912 ലും 1929 ലും സാധാരണ ലക്ഷണങ്ങൾ പ്രത്യക്ഷപ്പെട്ടു. എന്നിരുന്നാലും, ഏകദേശം 30 വർഷത്തിനുശേഷം, രോഗകാരിയെ കൊളെറ്റോട്രിക്കം ഗ്ലോയോസ്പോറിയോയിഡ്സ് (പെൻസ്.) പെൻസ് എന്ന് നാമകരണം ചെയ്തു. & സാക്., ടെലിമോർഫ് ഗ്ലോമെറെല്ല സിംഗുലാറ്റ (സ്റ്റോൺമാൻ) സ്പോൾഡ്. & സാക്., ടെലിമോർഫ് ഗ്ലോമെറെല്ല സിംഗുലാറ്റ (സ്റ്റോൺമാൻ) സ്പോൾഡ്. & സാക്ക്., ടെലിയോമോർഫ് ഗ്ലോമെറല്ല സിങ്കുലാറ്റ (സ്റ്റോൺമാൻ) സ്പോൾഡ്. & സാക്., ഗ്ലോമെറെല്ല സിങ്കുലേറ്റ (സ്റ്റോൺമാൻ) സ്പോൾഡിന്റെ ടെലിമോർഫ്. & സാക്ക് & സാക്ക് & സാക്ക്., ഗ്ലോമെറല്ല സിങ്കുലാറ്റ (സ്റ്റോൺമാൻ) സ്പോൾഡ് വിൽ ഡെലനാപ്രാവ്ലെനോയ് മോർഫോളോഗികൾ. & സാക്., ടാർഗെറ്റഡ് മോർഫോളജിയിൽ ഗ്ലോമെറെല്ല സിങ്കുലാറ്റ (സ്റ്റോൺമാൻ) സ്പോൾഡ്. & എച്ച്. ഷ്രെങ്ക്,. & എച്ച്. ഷ്രെങ്ക്, .എച്ച്. ഷ്രെങ്ക്. & H.施伦克,. & H.施伦克,.എച്ച്. ഷ്ലെങ്ക്, .20-ാം നൂറ്റാണ്ടിന്റെ മധ്യത്തിൽ നടത്തിയ പ്രാഥമിക രോഗ ഫിനോടൈപ്പിംഗ് NLL, മഞ്ഞ ലുപിൻ (L. luteus L.) അക്സസനുകളിൽ ചില പ്രതിരോധം കാണിച്ചു, എന്നാൽ പരിശോധിച്ച എല്ലാ വെളുത്ത ലുപിൻ (L. albus L.) അക്സസനുകളും വളരെ സാധ്യതയുള്ളവയായിരുന്നു15,16. ആന്ത്രാക്നോസിന്റെ വികസനം വർദ്ധിച്ച മഴ (വായു ഈർപ്പം) താപനില (12-28°C പരിധിയിൽ) എന്നിവയുമായി ബന്ധപ്പെട്ടിരിക്കുന്നുവെന്ന് പഠനങ്ങൾ തെളിയിച്ചിട്ടുണ്ട്, ഇത് ഉയർന്ന താപനിലയിൽ പ്രതിരോധത്തിന്റെ ലംഘനത്തിലേക്ക് നയിക്കുന്നു17, 18. വാസ്തവത്തിൽ, കോണിഡിയ മുളയ്ക്കുന്നതിനും രോഗം ആരംഭിക്കുന്നതിനും ആവശ്യമായ സമയം, ഉയർന്ന ആർദ്രത സാഹചര്യങ്ങളിൽ 12°C (16 മണിക്കൂർ) ഉള്ളതിനേക്കാൾ 24°C (4 മണിക്കൂർ) ൽ നാലിരട്ടി കുറവായിരുന്നു19. അങ്ങനെ, തുടർച്ചയായ ആഗോളതാപനം ആന്ത്രാക്നോസിന്റെ വ്യാപനത്തിലേക്ക് നയിച്ചു. എന്നിരുന്നാലും, ഫ്രാൻസിലും (1982) ഉക്രെയ്നിലും (1983) വരാനിരിക്കുന്ന ഒരു ഭീഷണിയുടെ മുന്നോടിയായി ഈ രോഗം നിരീക്ഷിക്കപ്പെട്ടു, പക്ഷേ ആ സമയത്ത് ലുപിൻ വ്യവസായം അത് അവഗണിച്ചു20,21. ഏതാനും വർഷങ്ങൾക്ക് ശേഷം, ഈ വിനാശകരമായ രോഗം ലോകമെമ്പാടും വ്യാപിക്കുകയും ഓസ്‌ട്രേലിയ, പോളണ്ട്, ജർമ്മനി തുടങ്ങിയ പ്രധാന ലുപിൻ ഉൽപ്പാദക രാജ്യങ്ങളെയും ബാധിക്കുകയും ചെയ്തു22,23,24. 1990 കളുടെ മധ്യത്തിൽ ആന്ത്രാക്നോസ് പൊട്ടിപ്പുറപ്പെട്ടതിനെത്തുടർന്ന്, വിപുലമായ പരിശോധന NLL19 സാമ്പിളുകളിൽ നിരവധി പ്രതിരോധശേഷിയുള്ള ദാതാക്കളെ തിരിച്ചറിയാൻ കാരണമായി. വ്യത്യസ്ത ജേംപ്ലാസ് സ്രോതസ്സുകളിൽ കാണപ്പെടുന്ന രണ്ട് വ്യത്യസ്ത ആധിപത്യ അല്ലീലുകളാണ് ആന്ത്രാക്നോസിനുള്ള NLL പ്രതിരോധം നിയന്ത്രിക്കുന്നത്: ടാഞ്ചിൽ, വോംഗ എന്നീ കൾട്ടിവറിൽ ലാൻർ1, കൾട്ടിവറിൽ ആൻമാൻ. മണ്ഡലേ 25, 26. ബ്രീഡിംഗ് പ്രോഗ്രാമുകളിൽ പ്രതിരോധശേഷിയുള്ള ജേംപ്ലാസത്തിന്റെ തിരഞ്ഞെടുപ്പിനെ പിന്തുണയ്ക്കുന്ന തന്മാത്രാ മാർക്കറുകളെ ഈ അല്ലീലുകൾ പൂരകമാക്കുന്നു25,26,27,28,29,30. ആന്ത്രാക്നോസ് പ്രതിരോധത്തിനായി ഒരു RIL പോപ്പുലേഷൻ വേർതിരിക്കുന്നതിനായി Lanr1 അല്ലീൽ വഹിക്കുന്ന റെസിസ്റ്റന്റ് ബ്രീഡിംഗ് ലൈൻ 83A:476, P27255 എന്ന സസെപ്റ്റിബിൾ വൈൽഡ് ലൈൻ ഉപയോഗിച്ച് ക്രോസ് ചെയ്തു, ഇത് Lanr1 ലോക്കസിനെ NLL-1131, 32, 33 എന്ന ക്രോമസോമിലേക്ക് നിയോഗിക്കാൻ സാധ്യമാക്കി. ഒരു ജീനോമിക് ഫ്രെയിംവർക്ക് ഉപയോഗിച്ച് ഫ്ലാങ്കിംഗ് റെസിസ്റ്റൻസ് ലോക്കിയിൽ നിന്ന് ആന്ത്രാക്നോസിലേക്കുള്ള ലിങ്കേജ് മാപ്പ് മാർക്കറുകളുടെ വിന്യാസം, NLL മൂന്ന് അല്ലീലുകളുടെയും സ്ഥാനം ഒരേ ക്രോമസോമിൽ (NLL-11) വെളിപ്പെടുത്തി, എന്നാൽ വ്യത്യസ്ത സ്ഥാനങ്ങളിൽ29,34,35. എന്നിരുന്നാലും, RIL-കളുടെ എണ്ണം കുറവായതിനാലും മാർക്കറുകളും അനുബന്ധ അല്ലീലുകളും തമ്മിലുള്ള വലിയ ജനിതക അകലം കാരണം, അവയുടെ അടിസ്ഥാന ജീനുകളെക്കുറിച്ച് വിശ്വസനീയമായ നിഗമനങ്ങളിൽ എത്തിച്ചേരാൻ കഴിയില്ല. മറുവശത്ത്, ലുപിനുകളിൽ റിവേഴ്സ് ജനിതകശാസ്ത്രത്തിന്റെ ഉപയോഗം അവയുടെ വളരെ കുറഞ്ഞ പുനരുജ്ജീവന ശേഷി കാരണം ബുദ്ധിമുട്ടാണ്, ഇത് ജനിതക കൃത്രിമത്വം ബുദ്ധിമുട്ടാക്കുന്നു37.
83A:476 (Lanr1), Mandelup (AnMan) പോലുള്ള ഹോമോസൈഗസ് അവസ്ഥയിൽ ആവശ്യമുള്ള അല്ലീൽ വഹിക്കുന്ന വളർത്തുമൃഗ ജനിതക പ്ലാസ്മയുടെ വികസനം, കാട്ടു ജനസംഖ്യയിൽ അല്ലീലുകളുടെ വിപരീത സംയോജനങ്ങളുടെ സാന്നിധ്യത്തിന്റെ പശ്ചാത്തലത്തിൽ ആന്ത്രാക്നോസ് പ്രതിരോധത്തെക്കുറിച്ച് പഠിക്കുന്നതിനുള്ള വാതിൽ തുറന്നു. തന്മാത്രാ സംവിധാനങ്ങളുടെ സാധ്യതകൾ. നിർദ്ദിഷ്ട ജനിതകരൂപങ്ങൾ സൃഷ്ടിക്കുന്ന പ്രതിരോധ പ്രതികരണങ്ങൾ താരതമ്യം ചെയ്യുക. സി. ലുപിനി വാക്സിനേഷനോടുള്ള NLL ന്റെ ആദ്യകാല ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റോം പ്രതികരണം ഈ പഠനം വിലയിരുത്തി. ആദ്യം, Lanr1, AnMan അല്ലീലുകൾ അടയാളപ്പെടുത്തുന്ന തന്മാത്രാ മാർക്കറുകൾ ഉപയോഗിച്ച് 215 വരകൾ അടങ്ങിയ ഒരു യൂറോപ്യൻ NLL ജേംപ്ലാസ് പാനൽ പരിശോധിച്ചു. നിയന്ത്രിത സാഹചര്യങ്ങളിൽ, മുമ്പ് തന്മാത്രാ മാർക്കറുകൾക്കായി തിരഞ്ഞെടുത്ത 50 NLL ലൈനുകളിൽ ആന്ത്രാക്നോസ് ഫിനോടൈപ്പിംഗ് നടത്തി. ഈ പരീക്ഷണങ്ങളെ അടിസ്ഥാനമാക്കി, ആന്ത്രാക്നോസ് പ്രതിരോധത്തിലും Lanr1/AnMan അല്ലീലിക് ഘടനയിലും വ്യത്യാസമുള്ള നാല് വരികൾ രണ്ട് പൂരക സമീപനങ്ങൾ ഉപയോഗിച്ച് ഡിഫറൻഷ്യൽ ഡിഫൻസ് ജീൻ എക്സ്പ്രഷൻ പ്രൊഫൈലിംഗിനായി തിരഞ്ഞെടുത്തു: ഉയർന്ന ത്രൂപുട്ട് RNA സീക്വൻസിംഗും തത്സമയ PCR ക്വാണ്ടിഫിക്കേഷനും.
Lanr1 (Anseq3, Anseq4), AnMan (Anseq4), AnMan (AnManM1) എന്നീ മാർക്കറുകളുള്ള NLL ജെംപ്ലാസത്തിന്റെ (N = 215) ഒരു സെറ്റ് സ്‌ക്രീനിംഗ് കാണിക്കുന്നത്, എല്ലാ മാർക്കറുകൾക്കും ഒരു വരി (95726, സലാമാൻക-ബിക്ക് സമീപം) മാത്രമേ “പ്രതിരോധം” അല്ലീലിനെ വർദ്ധിപ്പിക്കുന്നുള്ളൂ എന്നാണ്, അതേസമയം “'സസെപ്റ്റബിൾ' അല്ലീലുകളുടെ സാന്നിധ്യം” 158 (~73.5%) വരികളിലെ എല്ലാ മാർക്കറുകളുടെയും അനുപാതം കണ്ടെത്തി. പതിമൂന്ന് വരികൾ Lanr1 മാർക്കറിന്റെ രണ്ട് “പ്രതിരോധശേഷിയുള്ള” അല്ലീലുകളും, 8 വരികൾ Lanr1 ന്റെ “പ്രതിരോധശേഷിയുള്ള” അല്ലീലുകളും ഉൽ‌പാദിപ്പിച്ചു. AnMan മാർക്കറിന്റെ “പ്രതിരോധം” അല്ലീൽ (സപ്ലിമെന്ററി ടേബിൾ S1). രണ്ട് വരികൾ Anseq3 മാർക്കറിന് ഹെറ്ററോസൈഗസും AnManM1 മാർക്കറിന് ഒരു ഹെറ്ററോസൈഗസും ആയിരുന്നു. 42 വരികളിൽ (19.5%) Anseq3, Anseq4 അല്ലീലുകളുടെ വിപരീത ഘട്ടങ്ങൾ ഉണ്ടായിരുന്നു, ഇത് ഈ രണ്ട് ലോക്കികൾക്കിടയിലുള്ള പുനഃസംയോജനത്തിന്റെ ഉയർന്ന ആവൃത്തിയെ സൂചിപ്പിക്കുന്നു. നിയന്ത്രിത സാഹചര്യങ്ങളിൽ (സപ്ലിമെന്ററി പട്ടിക S2) ആന്ത്രാക്നോസ് ഫിനോടൈപ്പുകൾ പരീക്ഷിച്ച ജനിതകരൂപങ്ങളുടെ പ്രതിരോധത്തിലെ വ്യതിയാനം വെളിപ്പെടുത്തി, ഇത് ആന്ത്രാക്നോസിന്റെ തീവ്രതയിൽ പ്രതിഫലിച്ചു. ശരാശരി സ്കോറുകളിലെ വ്യത്യാസങ്ങൾ 1.8 (മിതമായ പ്രതിരോധശേഷിയുള്ളത്) മുതൽ 6.9 (സംവേദനക്ഷമതയുള്ളത്) വരെയും സസ്യഭാര വ്യത്യാസങ്ങൾ 0.62 (സംവേദനക്ഷമതയുള്ളത്) മുതൽ 4.45 ഗ്രാം (പ്രതിരോധശേഷിയുള്ളത്) വരെയും ആയിരുന്നു. പരീക്ഷണത്തിന്റെ രണ്ട് പകർപ്പുകളിൽ നിരീക്ഷിച്ച മൂല്യങ്ങൾ തമ്മിൽ (രോഗ തീവ്രത സ്കോറുകൾക്ക് 0.51, സസ്യഭാരത്തിന് P = 0.00017 ഉം 0.61 ഉം, P < 0.0001) അതുപോലെ ഈ രണ്ട് പാരാമീറ്ററുകൾക്കിടയിലും (− 0.59 ഉം − 0.77 ഉം, P < 0.0001) ഒരു പ്രധാന ബന്ധം ഉണ്ടായിരുന്നു. പരീക്ഷണത്തിന്റെ രണ്ട് പകർപ്പുകളിൽ നിരീക്ഷിച്ച മൂല്യങ്ങൾ തമ്മിൽ (രോഗ തീവ്രത സ്കോറുകൾക്ക് 0.51, സസ്യഭാരത്തിന് P = 0.00017, 0.61, P < 0.0001) അതുപോലെ ഈ രണ്ട് പാരാമീറ്ററുകൾക്കിടയിലും (− 0.59, − 0.77, P < 0.0001) ഒരു പ്രധാന ബന്ധമുണ്ടായിരുന്നു. വ്യവ്ലെന ദൊസ്തൊവെര്നയ കൊര്രെല്യത്സ്യ്യ മെദ്ദു സജ്ജനിയാമി, നബ്ല്യുദയെമി വ് ദ്വുഹ് പൊവ്തൊര്നൊസ്ത്യ്ഹ് എസ്പെരിമെംത്, 510 തേജസ്‌റ്റി ബോലെസ്‌നി, പി = 0,00017 അല്ലെങ്കിൽ 0,61 മാസങ്ങൾ രാസ്‌റ്റേനിയ, പി <0,0001), അ ടക്‌ഷെ മെഷുഡ് എതിമി (-0,5,7 Р < 0,0001) 0,0001). പരീക്ഷണത്തിന്റെ രണ്ട് ആവർത്തനങ്ങളിൽ നിരീക്ഷിച്ച മൂല്യങ്ങൾക്കിടയിൽ (രോഗ തീവ്രത സ്കോറുകൾക്ക് 0.51, സസ്യഭാരത്തിന് P = 0.00017, 0.61, P < 0.0001), അതുപോലെ ഈ രണ്ട് പാരാമീറ്ററുകൾക്കിടയിലും (- 0.59 ഉം -0.77 ഉം, P < 0.0001) 0.0001) ഒരു പ്രധാന ബന്ധം കണ്ടെത്തി.കൂടാതെ 0.00017，植物重量为0.61,P <0.0001）以及这两个参数之间（- 0.59 和- 0.77,P <0.0001)കൂടാതെ分为 0.51 , p = 0.00017 , 植物 为 为 0.61 , p <0.0001） 以及 两 个 参数 之间 （09-5-5.和- 0.59 和– 0.59 和- 0.77，P <0.0001)。 നാബ്ല്യൂഡലസ് പ്രസിദ്ധമായ കൊറേലിയ മെജഡു ജ്ഞാനചേനിയമി, നബ്ലിയുഡേമിയും ദ്വുഹ് പോവ്തോർണോസ്തയാഹും (ഓഷെങ്കാസ് 0,51, P = 0,00017 и massa rasteniya 0,61, P <0,0001), и между этими двумя параметрами (-0,59 и -0,00070, P.10,0001) ഡ്യൂപ്ലിക്കേറ്റിൽ നിരീക്ഷിച്ച മൂല്യങ്ങൾ (രോഗ തീവ്രത സ്കോർ 0.51, P = 0.00017, സസ്യഭാരം 0.61, P < 0.0001) എന്നിവയ്ക്കും ഈ രണ്ട് പാരാമീറ്ററുകൾ (-0.59, -0 .0001) 0.77, P<0.0001 നും ഇടയിൽ ഒരു പ്രധാന ബന്ധം ഉണ്ടായിരുന്നു. ).രോഗബാധിതമായ സസ്യങ്ങളിൽ കാണപ്പെടുന്ന സാധാരണ ലക്ഷണങ്ങളിൽ "ഇടയന്റെ വില്ലു" ഘടനയോട് സാമ്യമുള്ള തണ്ട് വളച്ചൊടിക്കൽ, തുടർന്ന് ഓറഞ്ച്/പിങ്ക് സ്പോറോസോയിറ്റുകൾ ഉള്ള ഓവൽ മുറിവുകൾ എന്നിവ ഉൾപ്പെടുന്നു (അനുബന്ധ ചിത്രം 1). Lanr1 (83A:476 ഉം Tanjil ഉം) AnMan (Mandelup) ജീനുകൾ വഹിക്കുന്ന ഓസ്‌ട്രേലിയൻ അസെൻഷനുകൾ മിതമായ പ്രതിരോധശേഷിയുള്ളവയാണ്, 0.0331 ഉം 0.0036 ഉം). "പ്രതിരോധശേഷിയുള്ള" Lanr1 ഉം/അല്ലെങ്കിൽ AnMan അല്ലീലുകളും വഹിക്കുന്ന ചില വരകൾ രോഗത്തിന്റെ ലക്ഷണങ്ങൾ കാണിക്കുന്നു.
രസകരമെന്നു പറയട്ടെ, "പ്രതിരോധശേഷിയുള്ള" മാർക്കർ അല്ലീൽ ഇല്ലാത്ത ചില NLL ലൈനുകൾ ഉയർന്ന അളവിലുള്ള ആന്ത്രാക്നോസ് പ്രതിരോധം (ലാൻ1 അല്ലെങ്കിൽ ആൻമാൻ ജനിതകരൂപങ്ങളെ അപേക്ഷിച്ച് താരതമ്യപ്പെടുത്താവുന്നതോ ഉയർന്നതോ ആയത്) വെളിപ്പെടുത്തി. ഉദാഹരണത്തിന് ബോറെജിൻ (രണ്ട് പാരാമീറ്ററുകൾക്കും പി മൂല്യം < 0.0001), ബോജാർ (സ്കോറിന് പി മൂല്യം < 0.0001 ഉം സസ്യഭാരത്തിന് 0.001 ഉം), പോപ്പുലേഷൻ ബി-549/79b (സ്കോറിന് പി മൂല്യം < 0.0001 ഉം ഭാരത്തിന് അപ്രധാനവുമാണ്). രസകരമെന്നു പറയട്ടെ, "പ്രതിരോധശേഷിയുള്ള" മാർക്കർ അല്ലീൽ ഇല്ലാത്ത ചില NLL ലൈനുകൾ ഉയർന്ന അളവിലുള്ള ആന്ത്രാക്നോസ് പ്രതിരോധം (ലാൻ1 അല്ലെങ്കിൽ ആൻമാൻ ജനിതകരൂപങ്ങളെ അപേക്ഷിച്ച് താരതമ്യപ്പെടുത്താവുന്നതോ ഉയർന്നതോ ആയത്) വെളിപ്പെടുത്തി. ഉദാഹരണത്തിന് ബോറെജിൻ (രണ്ട് പാരാമീറ്ററുകൾക്കും പി മൂല്യം < 0.0001), ബോജാർ (സ്കോറിന് പി മൂല്യം < 0.0001 ഉം സസ്യഭാരത്തിന് 0.001 ഉം), പോപ്പുലേഷൻ ബി-549/79b (സ്കോറിന് പി മൂല്യം < 0.0001 ഉം ഭാരത്തിന് അപ്രധാനവുമാണ്). ആന്തെരെസ്നോ, ച്ടോ നെസ്‌കോൽക്കോ ലിനി എൻഎൽഎൽ, ലിഷെന്ыഹ് കക്കോഗോ-ലിബോ «റെസിസ്റ്റൻറ്നോഗോ» മാർക്കർണോഗോ അലേലിയ, പോക്കസ് ഉസ്‌റ്റോയ്‌ചിവസ്‌റ്റി കോ ആന്ട്രാക്‌നോസു (സോപോസ്‌റ്റവിമി അല്ലെങ്കിൽ ബോലെ വൈസോക്കി, ചെം ദില ജെനോട്ടിപോവ് ലാൻർ1 അല്ലെങ്കിൽ അൻമാൻ), <0 ബോറെഗ്‌നക്, 100 для ഒബോയ്ഹ് പാരമെട്രോവ്), ബോജാർ (സാധാരണ പി <0,0001 മുതൽ 0,001 വരെ മാസങ്ങൾ) и രസകരമെന്നു പറയട്ടെ, 'റെസിസ്റ്റന്റ്' മാർക്കർ അല്ലീൽ ഇല്ലാത്ത നിരവധി NLL ലൈനുകൾ ആന്ത്രാക്നോസിനെതിരെ ഉയർന്ന തലത്തിലുള്ള പ്രതിരോധം കാണിച്ചു (ലാൻ1 അല്ലെങ്കിൽ ആൻമാൻ ജനിതകരൂപങ്ങളുമായി താരതമ്യപ്പെടുത്താവുന്നതോ അതിലും ഉയർന്നതോ ആയത്), ഉദാഹരണത്തിന് ബോറെജിൻ (രണ്ട് പാരാമീറ്ററുകൾക്കും പി മൂല്യം < 0.0001), ബോജാർ (മൂല്യനിർണ്ണയത്തിന് പി മൂല്യം < 0.0001 ഉം സസ്യഭാരത്തിന് 0.001 ഉം), ജനസംഖ്യ B-549/79b (മൂല്യനിർണ്ണയത്തിന് പി മൂല്യം < 0.0001 ഉം ഭാരത്തിന് പ്രാധാന്യമില്ലാത്തതും).有趣的是，一些缺乏任何“抗性”标记等位基因的NLL 系显示出高水平的炭疽痸或AnMan 基因型相当或更高），例如Boregine（两个参数的P 值< 0.0001）、Bojar（P 值<得分为0.0001,植物重量为0.001）和种群B-549/79b（得分P 值< 0.0001,重量不昍 "ആന്റിജനിക്" മാർക്കറുകൾ ഇല്ലാത്ത ചില NLL സിസ്റ്റങ്ങൾ ഉയർന്ന തിരശ്ചീന പ്രതിരോധം (Lanr1 അല്ലെങ്കിൽ AnMan ജീനുകൾക്ക് തുല്യമോ അതിലും ഉയർന്നതോ ആയവ) കാണിക്കുന്നത് രസകരമാണ്, ഉദാഹരണത്തിന് Boregine (രണ്ട് പാരാമീറ്ററുകളും P < 0.0001), Bojar (P മൂല്യം < 0.0001, സസ്യ ഭാരം 0.001), strain B-549/79b (P മൂല്യം < 0.0001, ഭാരം പ്രധാനമല്ല). ഇൻ്ററസ്‌നോ, ടെക്‌റ്റോ നെക്കോട്ടോറി ലിനികൾ എൻഎൽഎൽ, ലിഷെൻ്റി കക്കിഷ്-ലിബോ മാർക്കർണിഹ് അല്ലെലെയ് «റീസിസ്റ്റൻറ്നോസ്റ്റി», പോക്കസ് ഉസ്‌റ്റോയ്‌ചിവോസ്‌റ്റി കോ ആന്ട്രാക്‌നോസു (സ്‌രാവ്‌നിം അല്ലെങ്കിൽ വീഷ്, ചെം യു ഗേനോട്ടിപോവ് ലാൻർ 1 അല്ലെങ്കിൽ അൻമാൻ), ടാക്കി കാക് ബോറെജിൻ (സാംസ്‌കാരികം параметров <0,0001), ബോജാർ (സാധാരണ പി <0,0001, മാസ റസ്‌റ്റേണി 0,001) കൂടാതെ പോപ്പുലഷ്യൻ ബി-549/79 ബി (ഒത്സൻക പി-ജ്നാച്ചെനി <0,0001, മാസങ്ങൾ). രസകരമെന്നു പറയട്ടെ, 'പ്രതിരോധ' മാർക്കർ അല്ലീലുകൾ ഇല്ലാത്ത ചില NLL ലൈനുകൾ ഉയർന്ന അളവിലുള്ള ആന്ത്രാക്നോസ് പ്രതിരോധം കാണിച്ചു (ലാൻ1 അല്ലെങ്കിൽ ആൻമാൻ ജനിതകരൂപങ്ങളുമായി താരതമ്യപ്പെടുത്താവുന്നതോ അതിലും ഉയർന്നതോ), ഉദാഹരണത്തിന് ബോറെജിൻ (രണ്ട് പാരാമീറ്ററുകൾക്കും P മൂല്യം <0.0001), ബോജാർ (P-മൂല്യം < 0.0001, സസ്യ ഭാരം 0.001), ജനസംഖ്യ B-549/79b (P-മൂല്യം < 0.0001, ഭാരം പ്രധാനമല്ല).മാർക്കർ ജനിതകരൂപങ്ങളും രോഗ ഫിനോടൈപ്പുകളും തമ്മിലുള്ള പരസ്പര ബന്ധത്തിന്റെ അഭാവം വിശദീകരിക്കുന്ന ഒരു പുതിയ ജനിതക സ്രോതസ്സിന്റെ സാധ്യതയെ ഈ പ്രതിഭാസം സൂചിപ്പിക്കുന്നു (P മൂല്യങ്ങൾ ~0.42 മുതൽ ~0.98 വരെ). അങ്ങനെ, കോൾമോഗോറോവ്-സ്മിർനോവ് പരിശോധനയിൽ ആന്ത്രാക്നോസ് പ്രതിരോധത്തെക്കുറിച്ചുള്ള ഡാറ്റ ഏകദേശം സാധാരണയായി സ്കോറുകൾക്കും (P- മൂല്യങ്ങൾ 0.25 ഉം 0.11 ഉം) സസ്യ പിണ്ഡത്തിനും (P- മൂല്യങ്ങൾ 0.47 ഉം 0.55 ഉം) വിതരണം ചെയ്യപ്പെട്ടിട്ടുണ്ടെന്ന് കാണിച്ചു, ഇത് Lanr1, AnMan എന്നിവയേക്കാൾ കൂടുതൽ അല്ലീലുകൾ ഉൾപ്പെട്ടിട്ടുണ്ടെന്ന് ഞാൻ അനുമാനിക്കുന്നു.
ആന്ത്രാക്നോസ് റെസിസ്റ്റൻസ് സ്ക്രീനിംഗിന്റെ ഫലങ്ങളെ അടിസ്ഥാനമാക്കി, ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റോം വിശകലനത്തിനായി 4 ലൈനുകൾ തിരഞ്ഞെടുത്തു: 83A:476, ബോറെജിൻ, മണ്ടലപ്പ്, പോപ്പുലേഷൻ 22660. ഈ ലൈനുകൾ ആർ‌എൻ‌എ സീക്വൻസിംഗ് വഴി ഇനോക്കുലേഷൻ പരീക്ഷണങ്ങളിൽ ആന്ത്രാക്സ് പ്രതിരോധത്തിനായി വീണ്ടും പരീക്ഷിച്ചു, മുൻ പരിശോധനയിലെ പോലെ തന്നെയാണെങ്കിൽ. സ്കോർ മൂല്യങ്ങൾ ഇപ്രകാരമായിരുന്നു: ബോറെജിൻ (1.71 ± 1.39), 83A: 476 (2.09 ± 1.38), മണ്ടലപ്പ് (3.82 ± 1.42), പോപ്പുലേഷൻ 22660 (6.11 ± 1.29).
ഇല്ലുമിന നോവസെക് 6000 പ്രോട്ടോക്കോൾ ഒരു സാമ്പിളിൽ ശരാശരി 40.5 Mread ജോഡികൾ (29.7 മുതൽ 54.4 Mreads വരെ) നേടി (സപ്ലിമെന്ററി ടേബിൾ S3). റഫറൻസ് ശ്രേണിയിലെ അലൈൻമെന്റ് സ്കോറുകൾ 75.5% മുതൽ 88.6% വരെയാണ്. ബയോളജിക്കൽ റെപ്ലിക്കേറ്റുകൾക്കിടയിലുള്ള പരീക്ഷണാത്മക വകഭേദങ്ങൾക്കിടയിലുള്ള റീഡ് കൗണ്ട് ഡാറ്റയുടെ ശരാശരി പരസ്പരബന്ധം 0.812 മുതൽ 0.997 വരെയാണ് (ശരാശരി 0.959). വിശകലനം ചെയ്ത 35,170 ജീനുകളിൽ 2917 എണ്ണം ഒരു എക്സ്പ്രഷനും വെളിപ്പെടുത്തിയില്ല, മറ്റ് 4785 ജീനുകൾ നിസ്സാരമായ തലത്തിലാണ് (അടിസ്ഥാന ശരാശരി < 5) പ്രകടിപ്പിച്ചത്. വിശകലനം ചെയ്ത 35,170 ജീനുകളിൽ 2917 എണ്ണം ഒരു എക്സ്പ്രഷനും വെളിപ്പെടുത്തിയില്ല, മറ്റ് 4785 ജീനുകൾ നിസ്സാരമായ തലത്തിലാണ് (അടിസ്ഥാന ശരാശരി < 5) പ്രകടിപ്പിച്ചത്. Из 35 170 പ്രോനാലിസിറോവനിഹ് ഗേനോവ് 2917 അല്ല പ്രൊയവ്ല്യലി എസ്പ്രെസി, എ ഓസ്‌റ്റാൽനി 4785 ജെനോവ് എക്‌സ്‌പ്രെസ്‌സി незначительном уровne (базовое среднее <5). വിശകലനം ചെയ്ത 35,170 ജീനുകളിൽ 2917 എണ്ണം ഒരു എക്സ്പ്രഷനും കാണിച്ചില്ല, ശേഷിക്കുന്ന 4785 ജീനുകൾ വളരെ നിസ്സാരമായ തലത്തിലാണ് (ബേസ് ശരാശരി <5) പ്രകടിപ്പിച്ചത്.在分析的35,170 个基因中，2917 个没有表达，其他4785个基因的表达可以忽略不计（基本平均值< 5）。35,170 Из 35 170 പ്രോനാലിസിറോവനിഹ് ജെനോവ് 2917 അല്ല എസ്പ്രെസിറോവലിസ്, ആ ഓസ്‌റ്റാൽനി 4785 ജെനോവ് ഇമെലി നെസ്‌നസ്‌നസ് (ബാസോവ സ്രഷ്ടാവ് <5). വിശകലനം ചെയ്ത 35,170 ജീനുകളിൽ 2917 എണ്ണം പ്രകടിപ്പിക്കപ്പെട്ടില്ല, ശേഷിക്കുന്ന 4785 ജീനുകൾക്ക് നിസ്സാരമായ എക്സ്പ്രഷൻ മാത്രമേ ഉണ്ടായിരുന്നുള്ളൂ (അടിസ്ഥാന ശരാശരി <5).അങ്ങനെ, പരീക്ഷണ സമയത്ത് പ്രകടിപ്പിച്ചതായി കണക്കാക്കിയ ജീനുകളുടെ എണ്ണം (അടിസ്ഥാന ശരാശരി ≥ 5) 27,468 (78.1%) ആയിരുന്നു (അനുബന്ധ പട്ടിക S4).
ആദ്യ സമയ പോയിന്റ് മുതൽ, എല്ലാ NLL ലൈനുകളും ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റോം റീപ്രോഗ്രാം ചെയ്തുകൊണ്ട് C. lupini (strain Col-08) യുടെ ഇനോക്കുലേഷനോട് പ്രതികരിച്ചു (പട്ടിക 1), എന്നിരുന്നാലും, ലൈനുകൾക്കിടയിൽ കാര്യമായ വ്യത്യാസങ്ങൾ നിരീക്ഷിക്കപ്പെട്ടു. അങ്ങനെ, റെസിസ്റ്റൻസ് ലൈൻ 83A:476 (ലാൻർ1 ജീൻ വഹിക്കുന്നത്) ആദ്യ സമയ പോയിന്റിൽ (6 hpi) ഗണ്യമായ ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റോം റീപ്രോഗ്രാമിംഗ് കാണിച്ചു, ഈ സമയ പോയിന്റിലെ മറ്റ് സമയ പോയിന്റുകളെ അപേക്ഷിച്ച് ഒറ്റപ്പെട്ട മുകളിലേക്കും താഴേക്കും ഉള്ള ജീനുകളുടെ എണ്ണത്തിൽ 31-69 മടങ്ങ് വർദ്ധനവ്. കൂടാതെ, രണ്ടാമത്തെ സമയ പോയിന്റിൽ (12 hpi) കുറച്ച് ജീനുകളുടെ മാത്രം പ്രകടനത്തിൽ കാര്യമായ മാറ്റം വന്നതിനാൽ, ഈ പീക്ക് ഹ്രസ്വകാലമായിരുന്നു. രസകരമെന്നു പറയട്ടെ, ഗ്രാഫ്റ്റ് ടെസ്റ്റിൽ ഉയർന്ന തലത്തിലുള്ള പ്രതിരോധം കാണിച്ച ബോറെജിൻ, പരീക്ഷണ സമയത്ത് ഇത്രയും വലിയ ട്രാൻസ്ക്രിപ്ഷണൽ റീപ്രോഗ്രാമിംഗിന് വിധേയമായില്ല. എന്നിരുന്നാലും, വ്യത്യസ്തമായി പ്രകടിപ്പിക്കുന്ന ജീനുകളുടെ എണ്ണം (DEG) ബോറെജിനും 12 HPI-ൽ 83A:476 നും തുല്യമായിരുന്നു. മണ്ടലപ്പും പോപ്പുലേഷൻ 22660 ഉം അവസാന സമയ പോയിന്റിൽ (48 l/s) DEG കൊടുമുടികൾ കാണിച്ചു, ഇത് പ്രതിരോധ പ്രതികരണങ്ങളിലെ ആപേക്ഷിക കാലതാമസത്തെ സൂചിപ്പിക്കുന്നു.
മറ്റെല്ലാ ലൈനുകളുമായും താരതമ്യപ്പെടുത്തുമ്പോൾ 6 HPI-ൽ C. lupini-യുടെ പ്രതികരണമായി 83A:476 വൻതോതിലുള്ള ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റോം റീപ്രോഗ്രാമിംഗിന് വിധേയമായതിനാൽ, ഈ സമയത്ത് നിരീക്ഷിച്ച DEG-കളിൽ ~91% വംശ-നിർദ്ദിഷ്ടമായിരുന്നു (ചിത്രം 1). എന്നിരുന്നാലും, പഠന ലൈനുകൾക്കിടയിലുള്ള ആദ്യകാല പ്രതികരണങ്ങളിൽ ചില ഓവർലാപ്പ് ഉണ്ടായിരുന്നു, കാരണം ബോറെജിൻ, മണ്ടലപ്പ്, ജനസംഖ്യ 22660 എന്നിവയിൽ യഥാക്രമം 68.5%, 50.9%, 52.6% DEG എന്നിവ 83A:476-ൽ ചില സമയങ്ങളിൽ കണ്ടെത്തിയവയുമായി ഓവർലാപ്പ് ചെയ്തു. എന്നിരുന്നാലും, 83A:476 ഉപയോഗിച്ച് നിലവിൽ കണ്ടെത്തിയ എല്ലാ DEG-കളിലും ഈ DEG-കൾ ഒരു ചെറിയ ഭാഗം (0.97–1.70%) മാത്രമേ ഉണ്ടായിരുന്നുള്ളൂ. കൂടാതെ, എല്ലാ ലൈനുകളിൽ നിന്നുമുള്ള 11 DEG-കൾ ഈ സമയത്ത് സ്ഥിരതയുള്ളതായിരുന്നു (സപ്ലിമെന്ററി ടേബിളുകൾ S4-S6), സസ്യ പ്രതിരോധ പ്രതികരണങ്ങളുടെ പൊതുവായ ഘടകങ്ങൾ ഉൾപ്പെടെ: ലിപിഡ് ട്രാൻസ്ഫർ പ്രോട്ടീൻ (TanjilG_32225), എൻഡോഗ്ലൂക്കൻ-1,3-β-ഗ്ലൂക്കോസൈഡ് എൻസൈം (TanjilG_23384), SAM22 (TanjilG_31528, TanjilG_31531) പോലുള്ള രണ്ട് സ്ട്രെസ്-ഇൻഡ്യൂസിബിൾ പ്രോട്ടീനുകൾ, അടിസ്ഥാന ലാറ്റക്സ് പ്രോട്ടീൻ (TanjilG_32352), രണ്ട് ഗ്ലൈസിൻ സമ്പുഷ്ടമായ ഘടനാപരമായ സെൽ വാൾ പ്രോട്ടീനുകൾ (TanjilG_19701, TanjilG_19702). 83A:476 നും 24 HPI (ആകെ 16-38% DEG) നും മാൻഡെലപ്പിനും പോപ്പുലേഷൻ 22660 നും ഇടയിൽ 48 HPI (ആകെ 14-20% DEG) നും ഇടയിൽ ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റോം പ്രതികരണങ്ങളിൽ താരതമ്യേന ഉയർന്ന ഓവർലാപ്പ് ഉണ്ടായിരുന്നു.
കൊളെറ്റോട്രിക്കം ലുപിനി (പോളണ്ടിലെ വീർഷെനിസിലെ ലുപിൻ ഫീൽഡുകളിൽ നിന്ന് ലഭിച്ച കോൾ-08 സ്ട്രെയിൻ) കുത്തിവച്ച ഇടുങ്ങിയ ഇലകളുള്ള ലുപിൻ (NLL) ലൈനുകളിലെ വ്യത്യസ്തമായി പ്രകടിപ്പിക്കപ്പെട്ട ജീനുകളുടെ എണ്ണം (DEG) കാണിക്കുന്ന വെൻ ഡയഗ്രം. വിശകലനം ചെയ്ത NLL ലൈനുകൾ ഇവയായിരുന്നു: 83A:476 (പ്രതിരോധശേഷിയുള്ളത്, ലാൻർ1 അല്ലീലിനെ വഹിക്കുന്നു), ബോറെജിൻ (പ്രതിരോധശേഷിയുള്ളത്, ജനിതക പശ്ചാത്തലം അജ്ഞാതം), മണ്ടലപ്പ് (മിതമായ പ്രതിരോധശേഷിയുള്ളത്, ആൻമാൻ അല്ലീലിനെ വഹിക്കുന്നു), ജനസംഖ്യ 22660 (വളരെ സാധ്യതയുള്ളത്). വാക്സിനേഷനു ശേഷമുള്ള മണിക്കൂറുകളെയാണ് hpi എന്ന ചുരുക്കെഴുത്ത് സൂചിപ്പിക്കുന്നത്. ഗ്രാഫ് ലളിതമാക്കാൻ പൂജ്യം മൂല്യങ്ങൾ നീക്കം ചെയ്തിട്ടുണ്ട്.
6 hpi-ൽ ഓവർഎക്‌സ്‌പ്രസ് ചെയ്‌ത ജീനുകളുടെ സെറ്റ്, കാനോനിക്കൽ R ജീൻ ഡൊമെയ്‌നുകളുടെ സാന്നിധ്യത്തിനായി വിശകലനം ചെയ്തു (സപ്ലിമെന്ററി ടേബിൾ S7). 83A:476-ൽ മാത്രം NBS-LRR ഡൊമെയ്‌നുകളുള്ള ക്ലാസിക് രോഗ പ്രതിരോധ ജീനുകളുടെ ട്രാൻസ്‌ക്രിപ്റ്റോം ഇൻഡക്ഷൻ ഈ പഠനം വെളിപ്പെടുത്തി. ഈ സെറ്റിൽ ഒരു TIR-NBS-LRR ജീൻ (tanjilg_05042), അഞ്ച് CC-NBS-LRR ജീനുകൾ (tanjilg_06165, tanjilg_06162, tanjilg_22773, tanjilg_22640, tanjilg_16162), നാല് NBS-LRRE (tanjilg_16162), നാല് NBS-LRR (tanjilg_16162), നാല് NBS-LRR (tanjilg_16162) എന്നിവയും നാല് NBS-Lrr (tanjilg_16162) ഉം നാല് NBS-LRR (TANJILG_16162) ഉം ഉൾപ്പെട്ടിരുന്നു. ഈ ജീനുകൾക്കെല്ലാം സംരക്ഷിത ശ്രേണികളിൽ ക്രമീകരിച്ച കാനോനിക്കൽ ഡൊമെയ്‌നുകൾ ഉണ്ട്. NBS-LRR ഡൊമെയ്ൻ ജീനുകൾക്ക് പുറമേ, നിരവധി RLL കൈനേസുകൾ 6 hpi-യിൽ സജീവമാക്കി, അതായത് ബോറെജിനിൽ ഒന്ന് (TanjilG_19877), മണ്ടേലപ്പിൽ രണ്ട് (TanjilG_07141, TanjilG_19877), ജനസംഖ്യ 22660 (TanjilG_09014, TanjilG_10361) എന്നിവയിൽ രണ്ട്, 83A 27:476-ൽ രണ്ട്.
സി. ലുപിനി (കോൾ-08 സ്‌ട്രെയിൻ) ഉപയോഗിച്ചുള്ള ഇനോക്കുലേഷന്റെ പ്രതികരണമായി ഗണ്യമായി മാറ്റം വരുത്തിയ ജീനുകളെ ജീൻ ഒന്റോളജി (GO) സമ്പുഷ്ടീകരണ വിശകലനത്തിന് വിധേയമാക്കി (സപ്ലിമെന്ററി ടേബിൾ S8). ഏറ്റവും കൂടുതൽ പ്രതിനിധാനം ചെയ്യപ്പെടുന്ന ജൈവ പ്രക്രിയ പദം "GO:0006952 പ്രതിരോധ പ്രതികരണം" ആയിരുന്നു, ഇത് ഉയർന്ന പ്രാധാന്യമുള്ള (P മൂല്യം < 0.001) 16 (സമയ × രേഖ) കോമ്പിനേഷനുകളിൽ 6 എണ്ണത്തിലും പ്രത്യക്ഷപ്പെട്ടു (ചിത്രം 2). ഏറ്റവും കൂടുതൽ പ്രതിനിധാനം ചെയ്യപ്പെടുന്ന ജൈവ പ്രക്രിയ പദം "GO:0006952 പ്രതിരോധ പ്രതികരണം" ആയിരുന്നു, ഇത് ഉയർന്ന പ്രാധാന്യമുള്ള (P മൂല്യം < 0.001) 16 (സമയ × രേഖ) കോമ്പിനേഷനുകളിൽ 6 എണ്ണത്തിലും പ്രത്യക്ഷപ്പെട്ടു (ചിത്രം 2). നയിബോളി ചാസ്റ്റോ ച്രെജ്മെര്നൊ പ്രെദ്സ്തവ്ലെംന്ыമ് തെര്മിനൊമ് ബയൊലൊഗിഛെസ്കൊഗൊ പ്രൊസെസ്സാ ബ്ыല് «ഗൊ: 0006952 കുറിപ്പ്, 6 മുതൽ 16 വരെ (വിവരണം × ലിനിയ) കോംബിനേഷ്യസ് വൈസോക്കോയ് സപ്ലിമെൻ്റ് (സാധാരണ പി <0,001) (റീസ്. 2). ഏറ്റവും കൂടുതൽ പ്രതിനിധാനം ചെയ്യപ്പെടുന്ന ജൈവ പ്രക്രിയ പദം 'GO:0006952 പ്രതിരോധ പ്രതികരണം' ആയിരുന്നു, ഇത് ഉയർന്ന പ്രാധാന്യമുള്ള (P മൂല്യം < 0.001) 16 (സമയ × വംശപരമ്പര) കോമ്പിനേഷനുകളിൽ 6 എണ്ണത്തിൽ പ്രത്യക്ഷപ്പെട്ടു (ചിത്രം 2).最常被过度代表的生物过程术语是“GO:0006952 防御反应”，它出现在16个（时间×线）组合中的6 个中，具有高显着性（P 值< 0.001）（图2）。 ഏറ്റവും പ്രതിനിധാനം ചെയ്യുന്ന ജൈവ പ്രക്രിയ പദം "GO:0006952 പ്രതിരോധ പ്രതികരണം" ആണ്, ഇത് 16 (时间×线) കോമ്പിനേഷനുകളിൽ 6 എണ്ണത്തിൽ കാണപ്പെടുന്നു, ഉയർന്ന പ്രാധാന്യത്തോടെ (P മൂല്യം < 0.001) (图2). നയിബോളി ചാസ്റ്റോ ച്രെജ്മെര്നൊ പ്രെദ്സ്തവ്ലെംന്ыമ് തെര്മിനൊമ് ബയോലൊഗിഛെസ്കൊഗൊ പ്രൊസെസ്സാ ബ്ыല് «GO: 0006952 പ്രതിരോധ പ്രതികരണം» в 6 из 16 കോമ്പിനേഷൻ (വ്രമ്യ × ലിനിയ) с высокой значимостью (значение P <0,001) (рис. 2). ഏറ്റവും കൂടുതൽ പ്രതിനിധാനം ചെയ്യപ്പെട്ട ജൈവ പ്രക്രിയ പദം 'GO:0006952 ഡിഫൻസ് റെസ്‌പോൺസ്' ആയിരുന്നു, ഇത് 16 കോമ്പിനേഷനുകളിൽ 6 എണ്ണത്തിലും (സമയ × രേഖ) ഉയർന്ന പ്രാധാന്യത്തോടെ (P മൂല്യം < 0.001) പ്രത്യക്ഷപ്പെട്ടു (ചിത്രം 2).83A-യിലെ രണ്ട് സമയ പോയിന്റുകളിലും: 476, ബോറെജിൻ (6, 24 hpi) എന്നീ സമയ പോയിന്റുകളിലും, മണ്ടലപ്പ്, പോപ്പുലേഷൻ 22660 (യഥാക്രമം 12, 6 hpi) എന്നിവയിലും ഈ പദം അമിതമായി പ്രതിനിധീകരിച്ചു. ഇത് പ്രതീക്ഷിക്കുന്ന ഫലമാണ്, ഇത് പ്രതിരോധ ലൈനുകളുടെ ആന്റിഫംഗൽ പ്രതികരണത്തെ എടുത്തുകാണിക്കുന്നു. കൂടാതെ, "GO:0055114 റെഡോക്സ് പ്രക്രിയ" എന്ന പദത്താൽ പ്രതിനിധീകരിക്കുന്ന ഓക്സിഡേറ്റീവ് ബർസ്റ്റുമായി ബന്ധപ്പെട്ട ജീനുകളെ വേഗത്തിൽ പ്രേരിപ്പിക്കുന്നതിലൂടെ 83A:476 സി. ലുപിനിയോട് പ്രതികരിച്ചു, ഇത് ഒരു പ്രത്യേക പ്രതിരോധ പ്രതികരണത്തെ സൂചിപ്പിക്കുന്നു, അതേസമയം 'GO' എന്ന പദവുമായി ബന്ധപ്പെട്ട പ്രത്യേക പ്രതിരോധ പ്രതികരണങ്ങൾ ബോറെജിൻ വെളിപ്പെടുത്തി. :0006950 സ്ട്രെസ് പ്രതികരണം”. പോപ്പുലേഷൻ 22660 ദ്വിതീയ മെറ്റബോളൈറ്റുകൾ ഉൾപ്പെടുന്ന തിരശ്ചീന പ്രതിരോധ പ്രതികരണത്തെ സജീവമാക്കി, “GO:0016104 ട്രൈറ്റെർപീൻ ബയോസിന്തസിസ് പ്രക്രിയ”, “GO:0006722 ട്രൈറ്റെർപീൻ മെറ്റബോളിസത്തിന്റെ പ്രക്രിയ” (രണ്ട് പദങ്ങളും ഒരേ ജീനുകളുടെ കൂട്ടത്തിൽ പെടുന്നു) എന്നീ പദങ്ങളുടെ അമിത എണ്ണം എടുത്തുകാണിച്ചു, GO ടേം സമ്പുഷ്ടീകരണ വിശകലനത്തിന്റെ ഫലങ്ങൾ കണക്കിലെടുക്കുമ്പോൾ, മണ്ടലപ്പ് പ്രതിപ്രവർത്തന സ്ഥിരത ബോറെജിനും പോപ്പുലേഷൻ 22660 നും ഇടയിലായിരുന്നു. കൂടാതെ, ആദ്യകാല പ്രതിപ്രവർത്തനം 83A:476 (6 hpi) ഉം വൈകിയ പ്രതിപ്രവർത്തനം മണ്ടലപ്പ്, പോപ്പുലേഷൻ 22660 ഉം GO:0015979 'ഫോട്ടോസിന്തസിസ്' എന്ന പദവും മറ്റ് അനുബന്ധ ജൈവ പ്രക്രിയകളും ഉൾക്കൊള്ളുന്നു.
ആന്ത്രാക്സ് ലുപിൻ (1999-ൽ പോളണ്ടിലെ വീർഷെനിസിലെ ലുപിൻ പാടങ്ങളിൽ നിന്ന് ലഭിച്ച Col-08 സ്ട്രെയിൻ) കുത്തിവച്ച നാരോ-ലീവഡ് ലുപിൻ (NLL) ന്റെ ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റോം പ്രതികരണങ്ങളിൽ വ്യത്യസ്തമായി പ്രകടിപ്പിക്കപ്പെട്ട ജീനുകളുടെ വ്യാഖ്യാനത്തിൽ തിരഞ്ഞെടുത്ത ബയോപ്രോസസ് ജീൻ ഓൺടോളജി പദങ്ങൾ വളരെയധികം അതിശയോക്തിപരമാണ്. വിശകലനം ചെയ്ത NLL ലൈനുകൾ ഇവയായിരുന്നു: 83A:476 (പ്രതിരോധശേഷിയുള്ളത്, ഹോമോസൈഗസ് ലാൻർ1 അല്ലീലിനെ വഹിക്കുന്നു), ബോറെജിൻ (പ്രതിരോധശേഷിയുള്ളത്, അജ്ഞാത ജനിതക പശ്ചാത്തലം), മാൻഡലപ്പ് (മിതമായ പ്രതിരോധശേഷിയുള്ളത്, ഹോമോസൈഗസ് ആൻമാൻ അല്ലീലിനെ വഹിക്കുന്നു), ജനസംഖ്യ 22660 (സംവേദനക്ഷമതയുള്ളത്).
ആന്ത്രാക്നോസ് പ്രതിരോധത്തിന് കാരണമാകുന്ന ജീനുകളെ തിരിച്ചറിയുക എന്നതാണ് ഈ പഠനത്തിന്റെ ലക്ഷ്യം എന്നതിനാൽ, GO "GO: 0006952 പ്രതിരോധ പ്രതികരണങ്ങൾ", "GO: 0055114 റെഡോക്സ് പ്രക്രിയകൾ" എന്നീ പദങ്ങൾക്ക് നൽകിയിട്ടുള്ള ജീനുകൾ കട്ട്-ഓഫുകൾ ഉപയോഗിച്ച് വിശകലനം ചെയ്തു, കാരണം അടിസ്ഥാന അർത്ഥം കുറഞ്ഞത് ഒരു വരയെങ്കിലും ഉള്ള ≥ 30 ആണ്. × പോയിന്റ് ഇൻ ടൈം, log2 ന്റെ സ്റ്റാറ്റിസ്റ്റിക്കൽ പ്രാധാന്യമുള്ള മൂല്യങ്ങൾ സംയോജിപ്പിക്കുന്നു (മടക്ക മാറ്റം). ഈ മാനദണ്ഡങ്ങൾ പാലിക്കുന്ന ജീനുകളുടെ എണ്ണം GO:0006952 ന് 65 ഉം GO:0055114 ന് 524 ഉം ആയിരുന്നു.
83A:476 GO:0006952 എന്ന പദം ഉപയോഗിച്ച് വ്യാഖ്യാനിച്ച രണ്ട് DEG കൊടുമുടികൾ വെളിപ്പെടുത്തി, ആദ്യത്തേത് ഒരു ഇഞ്ചിന് 6 ജീനുകൾ (64 ജീനുകൾ, മുകളിലേക്കും താഴേക്കും ഉള്ള നിയന്ത്രണം) എന്നതിലും രണ്ടാമത്തേത് ഒരു ഇഞ്ചിന് 24 ജീനുകൾ (15 ജീനുകൾ, മുകളിലേക്കും ഉള്ള നിയന്ത്രണം മാത്രം) എന്നതിലും. GO:0006952 ഒരേ സമയം ഉയർന്നതായി ബോറെജിൻ കാണിച്ചു, പക്ഷേ കുറഞ്ഞ DEG (11 ഉം 8 ഉം) ഉം പ്രിഫറൻഷ്യൽ ആക്റ്റിവേഷനുമായി. മാൻഡെലൂപ്പ് 12 ഉം 48 HPI യും ഉപയോഗിച്ച് GO:0006952 ന്റെ രണ്ട് കൊടുമുടികൾ കാണിച്ചു, രണ്ടും 12 ജീനുകൾ വഹിച്ചു (ആദ്യത്തേത് സജീവമാക്കുന്ന ജീനുകളുള്ളതും രണ്ടാമത്തേത് അടിച്ചമർത്തൽ ജീനുകൾ മാത്രമുള്ളതും), അതേസമയം 6 HPI (13 ജീനുകൾ) ഉള്ള 22660 ജനസംഖ്യയ്ക്ക് വർദ്ധനവ് പീക്ക് റെഗുലേഷന്റെ കൂടുതൽ ആധിപത്യം ഉണ്ടായിരുന്നു. ഈ കൊടുമുടികളിലെ GO:0006952 DEG യുടെ 96.4% നും ഒരേ തരത്തിലുള്ള പ്രതികരണം (മുകളിലേക്കോ താഴേക്കോ) ഉണ്ടായിരുന്നു എന്നത് ശ്രദ്ധിക്കേണ്ടതാണ്, ഇത് ഉൾപ്പെട്ടിരിക്കുന്ന ജീനുകളുടെ എണ്ണത്തിൽ വ്യത്യാസങ്ങൾ ഉണ്ടായിരുന്നിട്ടും പ്രതിരോധ പ്രതികരണങ്ങളിൽ ഗണ്യമായ ഓവർലാപ്പ് സൂചിപ്പിക്കുന്നു. GO:0006952 എന്ന പദവുമായി ബന്ധപ്പെട്ട ഏറ്റവും വലിയ ശ്രേണികൾ സ്റ്റാർവേഷൻ സ്ട്രെസ്-അസോസിയേറ്റഡ് മെസേജ് പ്രോട്ടീൻ 22 (SAM22-പോലുള്ളത്) എൻകോഡ് ചെയ്യുന്നു, ഇത് ക്ലാസ് 10 പാത്തോജെനിസിസ്-അസോസിയേറ്റഡ് പ്രോട്ടീൻ (PR-10) പ്രോട്ടീൻ ക്ലേഡിലും കോർ പ്രോട്ടീൻ ലാറ്റക്സിലും പെടുന്നു. സമാനമായ (MLP-പോലുള്ള) പ്രോട്ടീൻ) പ്രോട്ടീൻ (ചിത്രം 3). രണ്ട് ഗ്രൂപ്പുകളും പ്രകടനത്തിന്റെ സ്വഭാവത്തിലും പ്രതികരണത്തിന്റെ ദിശയിലും വ്യത്യാസപ്പെട്ടിരുന്നു. SAM22-പോലുള്ള പ്രോട്ടീനുകൾ എൻകോഡ് ചെയ്യുന്ന ജീനുകൾ ആദ്യകാല സമയ പോയിന്റുകളിൽ (6 അല്ലെങ്കിൽ 12 hpi) സ്ഥിരവും പ്രാധാന്യമുള്ളതുമായ ഇൻഡക്ഷൻ കാണിച്ചു, പരീക്ഷണത്തിന്റെ അവസാനം (48 hpi) പൊതുവെ പ്രതികരിക്കുന്നില്ലായിരുന്നു, അതേസമയം MLP-പോലുള്ള പ്രോട്ടീനുകൾ 6 hpi-യിൽ ഏകോപനം കാണിച്ചു. hpi. 83A:476 ഉം 48 hp/in ഉം ഉള്ള മണ്ടലപ്പ്, മറ്റ് മിക്കവാറും എല്ലാ ഡാറ്റാ പോയിന്റുകളും പ്രതികരിക്കുന്നില്ല. കൂടാതെ, SAM22 പോലുള്ള പ്രോട്ടീൻ ജീനുകളുടെ എക്സ്പ്രഷൻ പ്രൊഫൈലുകളിലെ വ്യത്യാസങ്ങൾ ആന്ത്രാക്നോസ് റെസിസ്റ്റൻസിൽ വ്യതിയാനം കണ്ടെത്തി, കാരണം കൂടുതൽ പ്രതിരോധശേഷിയുള്ള ലൈനുകൾക്ക് കൂടുതൽ സമയ പോയിന്റുകൾ ഈ ജീനുകളെ കൂടുതൽ സെൻസിറ്റീവ് ജീനുകളേക്കാൾ ഗണ്യമായി പ്രേരിപ്പിക്കുന്നുണ്ടായിരുന്നു. മറ്റൊരു LlR18A/B പോലുള്ള PR-10 ജീൻ SAM22 പോലുള്ള പ്രോട്ടീൻ ജീനിന് സമാനമായ എക്സ്പ്രഷൻ പാറ്റേൺ കാണിച്ചു.
"GO:0006952 ഡിഫൻസ് റെസ്‌പോൺസ്" എന്ന ജൈവ പ്രക്രിയാ പദത്തിന്റെ പ്രധാന ഘടകങ്ങളും ലാൻർ1, ആൻമാൻ അല്ലീലുകളുടെ കാൻഡിഡേറ്റ് ജീനുകളുടെ എക്സ്പ്രഷൻ പാറ്റേണുകളും തിരിച്ചറിഞ്ഞു. ലോഗ്2 സ്കെയിൽ, ഇൻകുലേറ്റഡ് (കൊളറ്റോട്രിക്കം ലുപിനി, സ്ട്രെയിൻ കോൾ-08, ലുപിൻ ഫീൽഡുകളിൽ നിന്ന് ലഭിച്ച, വിഷെനിക്ക, പോളണ്ട്, 1999) കൺട്രോൾ (ഷാം-ഇൻകുലേറ്റഡ്) സസ്യങ്ങൾ എന്നിവയ്ക്കിടയിലുള്ള ലോഗ്2 മൂല്യങ്ങളെ (മടക്ക മാറ്റം) പ്രതിനിധീകരിക്കുന്നു. ഇനിപ്പറയുന്ന ഇടുങ്ങിയ ഇലകളുള്ള ലുപിൻ ലൈനുകൾ വിശകലനം ചെയ്തു: 83A:476 (പ്രതിരോധശേഷിയുള്ളത്, ഹോമോസൈഗസ് ലാൻർ1 അല്ലീലിനെ വഹിക്കുന്നത്), ബോറെജിൻ (പ്രതിരോധശേഷിയുള്ളത്, ജനിതക പശ്ചാത്തലം അജ്ഞാതം), മണ്ടലപ്പ് (മിതമായ പ്രതിരോധശേഷിയുള്ളത്, ഹോമോസൈഗസ് ആൻമാൻ അല്ലീലിനെ വഹിക്കുന്നത്), പോപ്പുലേഷൻ 22660 (സംവേദനക്ഷമതയുള്ളത്).
കൂടാതെ, RNA-seq കാൻഡിഡേറ്റ് ജീനുകളുടെ Lanr1 (TanjilG_05042), AnMan (TanjilG_12861) എന്നിവയുടെ എക്സ്പ്രഷൻ പ്രൊഫൈലുകൾ വിലയിരുത്തി (ചിത്രം 3). TanjilG_05042 ജീൻ ആദ്യ സമയ പോയിന്റിൽ (6 hpi) മാത്രം 83A:476 ൽ ഒരു പ്രധാന പ്രതികരണം (സജീവമാക്കൽ) കാണിച്ചു, അതേസമയം TanjilG_12861 രണ്ട് സമയ പോയിന്റുകളിൽ മാത്രം Mandeloop ൽ പ്രാധാന്യമർഹിക്കുന്നു: 6 hpi (ഡൗൺ റെഗുലേഷൻ), 24 hpi (6 hpi). With.). adjustable).
GO:0055114 "റെഡോക്സ് പ്രക്രിയ" എന്ന പദത്തിൽ ഏറ്റവും കൂടുതൽ പ്രകടിപ്പിക്കപ്പെട്ട ജീനുകൾ സൈറ്റോക്രോം P450 പ്രോട്ടീനുകളും പെറോക്സിഡേസും എൻകോഡ് ചെയ്യുന്ന ജീനുകളായിരുന്നു (ചിത്രം 4). 6 HPI-യിൽ 83A:476-ൽ നിന്ന് വേർതിരിച്ചെടുത്ത സാമ്പിളുകൾക്ക്, കുത്തിവയ്പ്പുള്ളതും നിയന്ത്രണ പ്ലാന്റുകളും തമ്മിൽ പരമാവധി അല്ലെങ്കിൽ കുറഞ്ഞ ലോഗ്2 (മടങ്ങൽ മാറ്റം) മൂല്യങ്ങൾ (86.6% ജീനുകൾക്ക്) സാധാരണയായി നിരീക്ഷിക്കപ്പെട്ടു, ഇത് ലൈംഗികതയെ കുത്തിവയ്ക്കുന്നതിനുള്ള ഈ ജനിതകരൂപത്തിന്റെ ഉയർന്ന പ്രതികരണം എടുത്തുകാണിക്കുന്നു. 83A:476 ഏറ്റവും പ്രധാനപ്പെട്ട GO കാണിച്ചു: 0055114 DEG 6 hpi-യിൽ (503 ജീനുകൾ), ബാക്കിയുള്ള വരികൾ 48 hpi-യിൽ (ബോറെജിൻ, 31 ജീനുകൾ; മണ്ടലപ്പ്, 85 ജീനുകൾ; ജനസംഖ്യ 22660, 78 ജീനുകൾ)). GO:0055114 കുടുംബത്തിലെ മിക്ക ജീനുകളിലും, വാക്സിനേഷനോടുള്ള രണ്ട് തരം പ്രതികരണങ്ങൾ (സജീവമാക്കലും തടയലും) നിരീക്ഷിക്കപ്പെട്ടു. രസകരമെന്നു പറയട്ടെ, 48 hp-ൽ മണ്ടലൂപ്പിൽ GO: 0055114 എന്ന പദത്തിനായി തിരിച്ചറിഞ്ഞ DEG-കളുടെ 97.6% വരെ. ഈ നിരീക്ഷണങ്ങൾ സൂചിപ്പിക്കുന്നത്, ഗണ്യമായി ചെറിയ സ്കെയിൽ ഉണ്ടായിരുന്നിട്ടും (അതായത്, മ്യൂട്ടേറ്റഡ് റെഡോക്സ് ജീനുകളുടെ എണ്ണം, 85 vs 503), മണ്ടലൂപ്പിന്റെ ആന്ത്രാക്നോസിലേക്കുള്ള വൈകിയ ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റോം പ്രതികരണങ്ങളുടെ പാറ്റേൺ 83A:476 ന്റെ ആദ്യകാല പ്രതികരണത്തിന് സമാനമാണ്. ബോറെജിനിലും പോപ്പുലേഷൻ 22660 ലും, ഈ സംയോജനം യഥാക്രമം 51.6% ഉം 75.6% ഉം ആയി കുറവാണ്.
"GO:0055114 റെഡോക്സ് പ്രക്രിയ" എന്ന ജൈവ പ്രക്രിയയുടെ പ്രധാന ഘടകങ്ങളുടെ ആവിഷ്കാര രീതികൾ വെളിപ്പെടുത്തി. ലോഗ്2 സ്കെയിൽ, ഇൻകുലേറ്റഡ് (കൊളറ്റോട്രിക്കം ലുപിനി, സ്ട്രെയിൻ കോൾ-08, ലുപിൻ ഫീൽഡുകളിൽ നിന്ന് ലഭിച്ച, വിഷെനിക്ക, പോളണ്ട്, 1999) കൺട്രോൾ (ഷാം-ഇൻകുലേറ്റഡ്) സസ്യങ്ങൾ എന്നിവയ്ക്കിടയിലുള്ള ലോഗ്2 മൂല്യങ്ങളെ (മടക്ക മാറ്റം) പ്രതിനിധീകരിക്കുന്നു. ഇനിപ്പറയുന്ന ഇടുങ്ങിയ ഇലകളുള്ള ലുപിൻ ലൈനുകൾ വിശകലനം ചെയ്തു: 83A:476 (പ്രതിരോധശേഷിയുള്ളത്, ഹോമോസൈഗസ് ലാൻർ1 അല്ലീലിനെ വഹിക്കുന്നത്), ബോറെജിൻ (പ്രതിരോധശേഷിയുള്ളത്, ജനിതക പശ്ചാത്തലം അജ്ഞാതം), മണ്ടലപ്പ് (മിതമായ പ്രതിരോധശേഷിയുള്ളത്, ഹോമോസൈഗസ് ആൻമാൻ അല്ലീലിനെ വഹിക്കുന്നത്), പോപ്പുലേഷൻ 22660 (സംവേദനക്ഷമതയുള്ളത്).
83A:476 സി. ലുപിനി (സ്ട്രെയിൻ കോൾ-08) ഉപയോഗിച്ചുള്ള ഇനോക്കുലേഷനോടുള്ള ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റോമിക് പ്രതികരണങ്ങളിൽ GO:0015979 "ഫോട്ടോസിന്തസിസ്" എന്ന പദവുമായി ബന്ധപ്പെട്ട ജീനുകളുടെ ഏകോപിത നിശബ്ദതയും മറ്റ് അനുബന്ധ ജൈവ പ്രക്രിയകളും ഉൾപ്പെടുന്നു (ചിത്രം 5). ഈ GO:0015979 DEG സെറ്റിൽ 83A:476 ൽ 6 hpi ൽ ഗണ്യമായി അടിച്ചമർത്തപ്പെട്ട 105 ജീനുകൾ അടങ്ങിയിരിക്കുന്നു. ഈ ഉപസെറ്റിൽ, 22660 ജനസംഖ്യയിൽ ഒരേ സമയം 48 HPI യിലും 35 ലും 37 ജീനുകൾ മണ്ടലപ്പിൽ കുറഞ്ഞ നിയന്ത്രണത്തിലാക്കി, ഇതിൽ രണ്ട് ജനിതകരൂപങ്ങൾക്കും പൊതുവായുള്ള 19 DEG-കൾ ഉൾപ്പെടുന്നു. GO: 0015979 എന്ന പദവുമായി ബന്ധപ്പെട്ട ഒരു DEG-കളും ഏതെങ്കിലും സംയോജനത്തിൽ (ലൈൻ x സമയം) ഗണ്യമായി സജീവമാക്കിയിട്ടില്ല.
"GO:0015979 ഫോട്ടോസിന്തസിസ്" എന്ന ജൈവ പ്രക്രിയയുടെ പ്രധാന ഘടകങ്ങളുടെ ആവിഷ്കാര രീതികൾ വെളിപ്പെടുത്തി. ലോഗ്2 സ്കെയിൽ, ഇൻകുലേറ്റഡ് (കൊളറ്റോട്രിക്കം ലുപിനി, സ്ട്രെയിൻ കോൾ-08, ലുപിൻ ഫീൽഡുകളിൽ നിന്ന് ലഭിച്ച, വിഷെനിക്ക, പോളണ്ട്, 1999) കൺട്രോൾ (ഷാം-ഇൻകുലേറ്റഡ്) സസ്യങ്ങൾ എന്നിവയ്ക്കിടയിലുള്ള ലോഗ്2 മൂല്യങ്ങളെ (മടക്ക മാറ്റം) പ്രതിനിധീകരിക്കുന്നു. ഇനിപ്പറയുന്ന ഇടുങ്ങിയ ഇലകളുള്ള ലുപിൻ ലൈനുകൾ വിശകലനം ചെയ്തു: 83A:476 (പ്രതിരോധശേഷിയുള്ളത്, ഹോമോസൈഗസ് ലാൻർ1 അല്ലീലിനെ വഹിക്കുന്നത്), ബോറെജിൻ (പ്രതിരോധശേഷിയുള്ളത്, ജനിതക പശ്ചാത്തലം അജ്ഞാതം), മണ്ടലപ്പ് (മിതമായ പ്രതിരോധശേഷിയുള്ളത്, ഹോമോസൈഗസ് ആൻമാൻ അല്ലീലിനെ വഹിക്കുന്നത്), പോപ്പുലേഷൻ 22660 (സംവേദനക്ഷമതയുള്ളത്).
ഡിഫറൻഷ്യൽ എക്സ്പ്രഷൻ വിശകലനത്തിന്റെ ഫലങ്ങളുടെയും രോഗകാരിയായ ഫംഗസുകൾക്കെതിരായ പ്രതിരോധ പ്രതികരണങ്ങളിൽ ഉൾപ്പെട്ടിരിക്കുന്നതായും കരുതപ്പെടുന്നു, റിയൽ-ടൈം പിസിആർ (സപ്ലിമെന്ററി ടേബിൾ എസ് 9) ഉപയോഗിച്ച് എക്സ്പ്രഷൻ പ്രൊഫൈലുകളുടെ അളവ് നിർണ്ണയിക്കുന്നതിനായി ഈ ഏഴ് ജീനുകളുടെ സെറ്റ് തിരഞ്ഞെടുത്തു.
കൺട്രോൾ (മിമിക്) സസ്യങ്ങളുമായി താരതമ്യപ്പെടുത്തുമ്പോൾ, പഠിച്ച എല്ലാ ലൈനുകളിലും സമയ പോയിന്റുകളിലും TanjilG_10657 എന്ന പുട്ടേറ്റീവ് പ്രോട്ടീൻ ജീൻ ഗണ്യമായി പ്രചോദിപ്പിക്കപ്പെട്ടു (സപ്ലിമെന്ററി ടേബിളുകൾ S10, S11). കൂടാതെ, എല്ലാ ലൈനുകളിലും പരീക്ഷണ വേളയിൽ TanjilG_10657 ന്റെ എക്സ്പ്രഷൻ പ്രൊഫൈൽ വർദ്ധിച്ചുവരുന്ന പ്രവണത കാണിച്ചു. 24 HPI-ൽ 114-ഫോൾഡ് ആക്റ്റിവേഷനുള്ളതും ഏറ്റവും ഉയർന്ന ആപേക്ഷിക എക്സ്പ്രഷൻ ലെവലും (4.4 ± 0.4) ഉള്ളതുമായ കുത്തിവയ്പ്പിനോട് TanjilG_10657 ന്റെ ഏറ്റവും ഉയർന്ന സംവേദനക്ഷമത 22660 ജനസംഖ്യ കാണിച്ചു (ചിത്രം 6a). PR10 LlR18A പ്രോട്ടീൻ ജീൻ TanjilG_27015 എല്ലാ ലൈനുകളിലും സമയ പോയിന്റുകളിലും സജീവമാക്കൽ കാണിച്ചു, മിക്ക ഡാറ്റാ പോയിന്റുകളിലും സ്ഥിതിവിവരക്കണക്ക് പ്രാധാന്യത്തോടെ (ചിത്രം 6b). TanjilG_10657 ന് സമാനമായി, 22660 ഇനോക്കുലേറ്റഡ് പോപ്പുലേഷനിൽ 24 HPI (19.5 ± 2.4) ൽ TanjilG_27015 ന്റെ ഏറ്റവും ഉയർന്ന ആപേക്ഷിക എക്സ്പ്രഷൻ ലെവൽ നിരീക്ഷിക്കപ്പെട്ടു. ബോറെജിൻ 6 hpi (ചിത്രം 6c) ഒഴികെയുള്ള എല്ലാ ലൈനുകളിലും എല്ലാ സമയ പോയിന്റുകളിലും ആസിഡ് എൻഡോകൈറ്റിനേസ് ജീൻ TanjilG_04706 ഗണ്യമായി വർദ്ധിച്ചു. ആദ്യ സമയ പോയിന്റിൽ (6 HPI) 83A:476 (10.5 മടങ്ങ്) ഇത് ശക്തമായി പ്രചോദിപ്പിക്കപ്പെട്ടു, മറ്റ് ലൈനുകളിൽ (6.6-7.5 മടങ്ങ്) മിതമായ അളവിൽ വർദ്ധിച്ചു. പരീക്ഷണ സമയത്ത്, 83A:476 ലും ബോറെജിനിലും TanjilG_04706 ന്റെ എക്സ്പ്രഷൻ സമാന തലങ്ങളിൽ തുടർന്നു, അതേസമയം മണ്ടലപ്പിലും പോപ്പുലേഷൻ 22660 ലും ഇത് ഗണ്യമായി വർദ്ധിച്ചു, താരതമ്യേന ഉയർന്ന മൂല്യങ്ങളിൽ എത്തി (യഥാക്രമം 5.9 ± 1.5 ഉം 6.2 ± 1.5 ഉം). എൻഡോഗ്ലൂക്കൻ-1,3-β-ഗ്ലൂക്കോസിഡേസ് പോലുള്ള ജീൻ TanjilG_23384, പോപ്പുലേഷൻ 22660 ഒഴികെയുള്ള എല്ലാ ലൈനുകളിലും ആദ്യ രണ്ട് സമയ പോയിന്റുകളിൽ (6 ഉം 12 hpi ഉം) ഉയർന്ന സജീവമാക്കൽ കാണിച്ചു (ചിത്രം 6d). മണ്ടലപ്പിലെ (2.7 ± 0.3) രണ്ടാമത്തെ സമയ പോയിന്റിൽ (12 hpi) TanjilG_23384 ന്റെ ഏറ്റവും ഉയർന്ന ആപേക്ഷിക എക്സ്പ്രഷൻ ലെവലുകൾ നിരീക്ഷിക്കപ്പെട്ടു (2.7 ± 0.3), 83A:476 (1.5 ± 0.1). 24 HPI-ൽ, പഠിച്ച എല്ലാ ലൈനുകളിലും TanjilG_23384 എക്സ്പ്രഷൻ താരതമ്യേന കുറവായിരുന്നു (0.04 ± 0.009 മുതൽ 0.44 ± 0.12 വരെ).
ക്വാണ്ടിറ്റേറ്റീവ് പിസിആർ വെളിപ്പെടുത്തിയ തിരഞ്ഞെടുത്ത ജീനുകളുടെ (എജി) എക്സ്പ്രഷൻ പ്രൊഫൈലുകൾ. 6, 12, 24 എന്നീ സംഖ്യകൾ വാക്സിനേഷൻ കഴിഞ്ഞുള്ള മണിക്കൂറുകളെ പ്രതിനിധീകരിക്കുന്നു. LanDExH7, LanTUB6 ജീനുകൾ നോർമലൈസേഷനായി ഉപയോഗിച്ചു, LanTUB6 ഇന്റർ-സീരീസ് കാലിബ്രേഷനായി ഉപയോഗിച്ചു. പിശക് ബാറുകൾ മൂന്ന് ബയോളജിക്കൽ റെപ്ലിക്കേറ്റുകളെ അടിസ്ഥാനമാക്കിയുള്ള സ്റ്റാൻഡേർഡ് ഡീവിയേഷനെ പ്രതിനിധീകരിക്കുന്നു, അവയിൽ ഓരോന്നും മൂന്ന് സാങ്കേതിക റെപ്ലിക്കേറ്റുകളുടെ ശരാശരിയാണ്. 1999-ൽ പോളണ്ടിലെ വീർസെനിക്കയിലെ ലുപിൻ ഫീൽഡിൽ നിന്ന് ലഭിച്ച ഇനോക്കുലേറ്റഡ് (കൊളറ്റോട്രിക്കം ലുപിനി, സ്ട്രെയിൻ കോൾ-08) കൺട്രോൾ (മോക്ക്-ഇനോക്കുലേറ്റഡ്) സസ്യങ്ങൾ തമ്മിലുള്ള എക്സ്പ്രഷൻ ലെവലുകളിലെ വ്യത്യാസങ്ങളുടെ സ്ഥിതിവിവരക്കണക്ക് പ്രാധാന്യം ഡാറ്റാ പോയിന്റുകൾക്ക് മുകളിൽ അടയാളപ്പെടുത്തിയിരിക്കുന്നു (*P മൂല്യം < 0.05, **P മൂല്യം ≤ 0.01, ***P മൂല്യം ≤ 0.001). 1999-ൽ പോളണ്ടിലെ വീർസെനിക്കയിലെ ലുപിൻ ഫീൽഡിൽ നിന്ന് ലഭിച്ച ഇനോക്കുലേറ്റഡ് (കൊളറ്റോട്രിക്കം ലുപിനി, സ്ട്രെയിൻ കോൾ-08) കൺട്രോൾ (മോക്ക്-ഇനോക്കുലേറ്റഡ്) സസ്യങ്ങൾ തമ്മിലുള്ള എക്സ്പ്രഷൻ ലെവലുകളിലെ വ്യത്യാസങ്ങളുടെ സ്ഥിതിവിവരക്കണക്ക് പ്രാധാന്യം ഡാറ്റാ പോയിന്റുകൾക്ക് മുകളിൽ അടയാളപ്പെടുത്തിയിരിക്കുന്നു (*P മൂല്യം < 0.05, **P മൂല്യം ≤ 0.01, ***P മൂല്യം ≤ 0.001). സ്റ്റാറ്റിസ്‌റ്റിചെസ്‌കയ സനാച്ചിമോസ്‌റ്റ് റസ്‌ലിച്ചി വോ ഉറോവ്‌നിയഹ് എക്‌സ്‌പ്രെസി മെജഡു ഇനോകുലിറോവന്നിമി (കൊലെറ്റോട്രിചം ലുപിനി, സോൾ-081919 ഗ. സ് പോൾയ ലിപിന വി വർജനിഷേ, പോൾഷ) യും കോൺട്രോൾനിമിയും ദന്ыഹ് (*значение P <0,05, **значение പി ≤ 0,01, ***значение പി ≤ 0,001). 1999-ൽ പോളണ്ടിലെ വീർഷെനിസിലെ ഒരു ലുപിൻ പാടത്ത് നിന്ന് ലഭിച്ച ഇനോക്കുലേറ്റഡ് (കൊളറ്റോട്രിക്കം ലുപിനി, സ്‌ട്രെയിൻ കോൾ-08) കൺട്രോൾ (ഷാം-ഇനോക്കുലേറ്റഡ്) സസ്യങ്ങൾ തമ്മിലുള്ള എക്സ്പ്രഷൻ ലെവലുകളിലെ സ്ഥിതിവിവരക്കണക്കനുസരിച്ച് പ്രധാനപ്പെട്ട വ്യത്യാസങ്ങൾ ഡാറ്റാ പോയിന്റുകൾക്ക് മുകളിൽ രേഖപ്പെടുത്തിയിട്ടുണ്ട് (*P മൂല്യം < 0.05, **P-മൂല്യം ≤ 0.01, ***P-മൂല്യം ≤ 0.001).接种 (കൊലെറ്റോട്രിക്കം ലുപിനി, കേണൽ-08株, 1999, വിയർസെനിക്ക ）和对照（模拟接种）植物之间表达水平差异的统计学显着性标记在着性标记在湂︍ 0.05, **P 值≤ 0.01, ***P 值≤ 0.001).接种 （colletotricum lupini , color-08 株 , 1999 年 波兰 波兰 wierzenica 的 羽扇 获得） 和 对照水平 差异 的 统计学 显着性 标记 数据点 上方*p 值。 0.05, **P ≤ 0.01, ***P ≤ 01) 0. സ്റ്റാറ്റിസ്‌റ്റിഷെസ്‌കി സനാച്ചിം റസ്‌ലിച്ചിയാ വ്യൂ ഉറോവ്‌നഹ് എക്‌സ്‌പ്രെസ്സി മെഷദു ഇനോകുലിറോവന്നിമി (കൊലെറ്റോട്രിക്കം ലുപിനി, ഷൈറ്റം, കോൾ-08 പോലേ ലിപിന വർട്ട് വെർജെനിഷേ, പോൾഷ, 1999 കാലഘട്ടത്തിൽ.) കൂടാതെ കോൺട്രോൾനിമിയും ടച്ച്കാമി данных (* значение P <0,05, ** P-значение ≤ 0,01, ***P-значение ≤ 0,001). 1999-ൽ പോളണ്ടിലെ വെർഷെനിസിലെ ലുപിൻ പാടങ്ങളിൽ നിന്ന് ലഭിച്ച ഇനോക്കുലേറ്റഡ് (കൊളറ്റോട്രിക്കം ലുപിനി, സ്‌ട്രെയിൻ കോൾ-08) കൺട്രോൾ (ഷാം-ഇനോക്കുലേറ്റഡ്) സസ്യങ്ങൾ തമ്മിലുള്ള എക്സ്പ്രഷൻ ലെവലുകളിലെ സ്ഥിതിവിവരക്കണക്കനുസരിച്ച് പ്രധാനപ്പെട്ട വ്യത്യാസങ്ങൾ ഡാറ്റാ പോയിന്റുകൾക്ക് മുകളിൽ രേഖപ്പെടുത്തിയിട്ടുണ്ട് (*P മൂല്യം < 0.05 , **P-മൂല്യം ≤ 0.01, ***P-മൂല്യം ≤ 0.001).വിശകലനം ചെയ്ത NLL ലൈനുകൾ ഇവയായിരുന്നു: 83A:476 (പ്രതിരോധശേഷിയുള്ളത്, ഹോമോസൈഗസ് ലാൻ1 അല്ലീലിനെ വഹിക്കുന്നത്), മാൻഡലപ്പ് (മിതമായ പ്രതിരോധശേഷിയുള്ളത്, ഹോമോസൈഗസ് ആൻമാൻ അല്ലീലിനെ വഹിക്കുന്നത്), ബോറെജിൻ (പ്രതിരോധശേഷിയുള്ളത്, അജ്ഞാത ജനിതക പശ്ചാത്തലം), ജനസംഖ്യ 22660 (സംവേദനക്ഷമതയുള്ളത്).
ലാൻ1 ലോക്കസിലെ കാൻഡിഡേറ്റ് ജീൻ TanjilG_05042 RNA-seq പഠനങ്ങളിൽ നിന്ന് ലഭിച്ച പ്രൊഫൈലുകളിൽ നിന്ന് വളരെ വ്യത്യസ്തമായ ഒരു എക്സ്പ്രഷൻ പാറ്റേൺ കാണിച്ചു (ചിത്രം 6e). മണ്ടലപ്പിലും 22660 പോപ്പുലേഷനിലും (യഥാക്രമം 39.7 ഉം 11.7 ഉം തവണ വരെ) ഈ ജീനിന്റെ ഗണ്യമായ സജീവമാക്കൽ നിരീക്ഷിക്കപ്പെട്ടു, അതിന്റെ ഫലമായി താരതമ്യേന ഉയർന്ന എക്സ്പ്രഷൻ ലെവലുകൾ (യഥാക്രമം 1.4 ± 0.14 ഉം 7.2 ± 1.3 ഉം വരെ) ഉണ്ടായി. 83A:476 TanjilG_05042 ജീനിന്റെ ചില അപ്‌റെഗുലേഷനുകളും (3.8 മടങ്ങ് വരെ) വെളിപ്പെടുത്തി, എന്നിരുന്നാലും, നേടിയ ആപേക്ഷിക എക്സ്പ്രഷൻ ലെവലുകൾ (0.044 ± 0.002) മണ്ടലപ്പിലും 22660 പോപ്പുലേഷനിലും നിരീക്ഷിച്ചതിനേക്കാൾ 30 മടങ്ങ് കുറവാണ്. qPCR വിശകലനം ചെയ്തപ്പോൾ, മോക്ക്-വാക്സിനേറ്റഡ് (നിയന്ത്രണ) വേരിയന്റുകളിലെ ജനിതകരൂപങ്ങൾ തമ്മിലുള്ള എക്സ്പ്രഷൻ ലെവലിൽ കാര്യമായ വ്യത്യാസങ്ങൾ കാണിച്ചു, ഇത് 22660 നും 83A:476 നും ഇടയിൽ 58 മടങ്ങ് വ്യത്യാസത്തിൽ എത്തി, അതുപോലെ തന്നെ 22660 നും 22660 നും ഇടയിൽ പോപ്പുലേഷനുകളും തമ്മിൽ. ബോറെജിനും മണ്ടലപ്പും തമ്മിൽ ഇരട്ടി വ്യത്യാസം കൈവരിക്കാനായി.
83A:476 ലെ വാക്സിനേഷന് പ്രതികരണമായി ആൻമാൻ ലോക്കസിലെ കാൻഡിഡേറ്റ് ജീൻ, TanjilG_12861 സജീവമാക്കി, 22660 ജനസംഖ്യയിൽ മണ്ടലപ്പ് നിഷ്പക്ഷമായിരുന്നു, കൂടാതെ ബോറെജിനിൽ ഇത് നിയന്ത്രിക്കപ്പെട്ടു (ചിത്രം 6f). ഇൻകുലേറ്റഡ് 83A: 476 ൽ (0.14±0.01) TanjilG_12861 ജീനിന്റെ ആപേക്ഷിക എക്സ്പ്രഷൻ ഏറ്റവും ഉയർന്നതായിരുന്നു. 17.4 kDa ക്ലാസ് I ഹീറ്റ് ഷോക്ക് പ്രോട്ടീൻ ജീൻ TanjilG_05080 HSP17.4 പഠിച്ച എല്ലാ സ്ട്രെയിനുകളിലും സമയ പോയിന്റുകളിലും കുറഞ്ഞ ആപേക്ഷിക എക്സ്പ്രഷൻ ലെവലുകൾ കാണിച്ചു (ചിത്രം 6g). 22660 ജനസംഖ്യയിൽ 24 HPI ൽ ഏറ്റവും ഉയർന്ന മൂല്യം നിരീക്ഷിക്കപ്പെട്ടു (0.14 ± 0.02, വാക്സിനേഷനോടുള്ള പ്രതികരണത്തിൽ എട്ട് മടങ്ങ് വർദ്ധനവ്).
ജീൻ എക്സ്പ്രഷൻ പ്രൊഫൈലുകളുടെ താരതമ്യം (ചിത്രം 7) TanjilG_10657 ഉം മറ്റ് നാല് ജീനുകളും തമ്മിലുള്ള ഉയർന്ന പരസ്പരബന്ധം വെളിപ്പെടുത്തി: TanjilG_27015 (r = 0.89), TanjilG_05080 (r = 0.85), TanjilG_05042 (r = 0.80), TanjilG_04706 (r = 0.79). പ്രതിരോധ പ്രതികരണങ്ങൾക്കിടയിൽ ഈ ജീനുകളുടെ സഹ-നിയന്ത്രണത്തെ അത്തരം ഫലങ്ങൾ സൂചിപ്പിക്കാം. മറ്റ് ജീനുകളെ അപേക്ഷിച്ച് TanjilG_12861, TanjilG_23384 ജീനുകൾ താഴ്ന്ന പിയേഴ്സൺ കോറിലേഷൻ കോഫിഫിഷ്യന്റ് മൂല്യങ്ങളുള്ള വ്യത്യസ്ത എക്സ്പ്രഷൻ പ്രൊഫൈലുകൾ കാണിച്ചു (യഥാക്രമം 0.08 മുതൽ 0.43 വരെയും -0.19 മുതൽ 0.28 വരെയും).
ക്വാണ്ടിറ്റേറ്റീവ് പിസിആർ ഉപയോഗിച്ച് ജീൻ എക്സ്പ്രഷൻ പ്രൊഫൈലുകൾ തമ്മിലുള്ള പരസ്പരബന്ധം കണ്ടെത്തി. ഇനിപ്പറയുന്ന ഇടുങ്ങിയ ഇലകളുള്ള ലുപിൻ ലൈനുകൾ വിശകലനം ചെയ്തു: 83A:476 (പ്രതിരോധശേഷിയുള്ളത്, ഹോമോസൈഗസ് ലാൻ1 അല്ലീലിനെ വഹിക്കുന്നത്), മണ്ടലപ്പ് (മിതമായ പ്രതിരോധശേഷിയുള്ളത്, ഹോമോസൈഗസ് ആൻമാൻ അല്ലീലിനെ വഹിക്കുന്നത്), ബോറെജിൻ (പ്രതിരോധശേഷിയുള്ളത്, ജനിതക പശ്ചാത്തലം അജ്ഞാതം), ജനസംഖ്യ 22660 (സംവേദനക്ഷമതയുള്ളത്). കുത്തിവയ്പ്പിന് ശേഷം 6, 12, 24 മണിക്കൂർ കഴിഞ്ഞ് മൂന്ന് സമയ പോയിന്റുകൾ കണക്കാക്കി, അതിൽ കുത്തിവയ്പ്പിന് ശേഷം (1999-ൽ പോളണ്ടിലെ വീർഷെനിസിലെ ലുപിൻ ഫീൽഡുകളിൽ നിന്ന് ലഭിച്ച കൊളെറ്റോട്രിക്കം ലുപിനി, സ്‌ട്രെയിൻ കോൾ-08), നിയന്ത്രണ (ഷാം-ഇൻകുലേറ്റഡ്) സസ്യങ്ങൾ എന്നിവ ഉൾപ്പെടുന്നു. പിയേഴ്സൺ പരസ്പരബന്ധന ഗുണകത്തിന്റെ മൂല്യം സ്കെയിൽ കാണിക്കുന്നു.
ഇഞ്ചിന് 6 കുതിരശക്തി എന്ന നിരക്കിൽ ലഭിച്ച ഡാറ്റയെ അടിസ്ഥാനമാക്കി, ആദ്യകാല പ്രതിരോധ പ്രതികരണങ്ങളിൽ ശ്രദ്ധ കേന്ദ്രീകരിക്കുന്നതിനായി ഇനോകുലേറ്റഡ്, കൺട്രോൾ പ്ലാന്റുകൾ താരതമ്യം ചെയ്തുകൊണ്ട് തിരിച്ചറിഞ്ഞ 9981 DEG-യിൽ WGCNA നടത്തി (സപ്ലിമെന്ററി ടേബിൾ S12). ജനിതകരൂപങ്ങൾക്കും പരീക്ഷണാത്മക വകഭേദങ്ങൾക്കും ഇടയിൽ പരസ്പരബന്ധിതമായ (പോസിറ്റീവ് അല്ലെങ്കിൽ നെഗറ്റീവ്) എക്സ്പ്രഷൻ പ്രൊഫൈലുകളുള്ള ഇരുപത്തിരണ്ട് ജീൻ മൊഡ്യൂളുകൾ (ക്ലസ്റ്ററുകൾ) കണ്ടെത്തി. ശരാശരി, ജീൻ എക്സ്പ്രഷൻ ലെവലുകൾ 83A:476 > Mandelup > Boregine > Population 22660 എന്ന ക്രമത്തിൽ താഴേക്കിറങ്ങിക്കൊണ്ടിരുന്നു (എന്നിരുന്നാലും, രണ്ട് വകഭേദങ്ങളിലും, നിയന്ത്രണ പ്ലാന്റുകളിൽ ഈ പ്രവണത ശക്തമായിരുന്നു). ശരാശരി, ജീൻ എക്സ്പ്രഷൻ ലെവലുകൾ 83A:476 > Mandelup > Boregine > Population 22660 എന്ന ക്രമത്തിൽ താഴേക്കിറങ്ങിക്കൊണ്ടിരുന്നു (എന്നിരുന്നാലും, രണ്ട് വകഭേദങ്ങളിലും, നിയന്ത്രണ പ്ലാന്റുകളിൽ ഈ പ്രവണത ശക്തമായിരുന്നു). വി സ്‌രെഡ്‌നെം ഉറോവ്‌നി എക്‌സ്‌പ്രെസ്‌സി ജെനോവ് സ്‌നിഷാലിസ് പോർയാഡ്‌കെ 83A:476 > മാൻഡലപ്പ് > ബോറെജിൻ > ജനസംഖ്യ 22660 ടെൻഡെൻസിയ ബ്യ്ല സിൽനെ യു കോൺട്രോൾ റസ്തെനി). ശരാശരി, ജീൻ എക്സ്പ്രഷൻ ലെവലുകൾ 83A:476 > Mandelup > Boregine > Population 22660 എന്ന ക്രമത്തിൽ കുറഞ്ഞു (എന്നിരുന്നാലും, രണ്ട് വകഭേദങ്ങളിലും, നിയന്ത്രണ സസ്യങ്ങളിൽ ഈ പ്രവണത ശക്തമായിരുന്നു).平均而言，基因表达水平按83A:476 > Mandelup > Boregine > ജനസംഖ്യ 22660 的 顺序下降 (然而, 在两种变体中, 这种趋势在对照植物中更强).平均 而 言 , 基因 水平 按 按 83a: 476> mandelup> boregin> ജനസംഖ്യ 22660 的 顺序 下降在 植物 നിങ്ങൾ 更.... വി സ്‌രെഡ്‌നെം ഉറോവ്‌നി എസ്‌പ്രെസ്‌സി ജെനോവ് സ്‌നിഷാലിസ് വ റിയാഡു 83A:476 > മാൻഡലപ്പ് > ബോറെജിൻ > ജനസംഖ്യ 22660 ബ്ыല സിലിനീ യു കോൺട്രോൾ റസ്റ്റേണി). ശരാശരി, 83A:476 > Mandelup > Boregine > Population 22660 എന്ന പരമ്പരയിൽ ജീൻ എക്സ്പ്രഷൻ ലെവലുകൾ കുറഞ്ഞു (എന്നിരുന്നാലും, രണ്ട് വകഭേദങ്ങളിലും, നിയന്ത്രണ പ്ലാന്റുകളിൽ ഈ പ്രവണത ശക്തമായിരുന്നു).വാക്സിനേഷൻ ജീൻ എക്സ്പ്രഷന്റെ അപ്‌റെഗുലേഷനിൽ കലാശിച്ചു, പ്രത്യേകിച്ച് മൊഡ്യൂളുകൾ 18, 19, 14, 6, 1 (പ്രഭാവത്തിന്റെ അവരോഹണ ക്രമത്തിൽ), നെഗറ്റീവ് റെഗുലേഷൻ (ഉദാ. മൊഡ്യൂളുകൾ 9 ഉം 20 ഉം) അല്ലെങ്കിൽ നിഷ്പക്ഷ ഇഫക്റ്റുകൾ (ഉദാ. മൊഡ്യൂളുകൾ 11, 22, 8 ഉം 13 ഉം) എന്നിവയിൽ. GO ടേം സമ്പുഷ്ടീകരണ വിശകലനം (സപ്ലിമെന്ററി ടേബിൾ S13), പരമാവധി സജീവമാക്കലോടെ ഇനോക്യുലേറ്റഡ് മൊഡ്യൂളിനായി "GO: 0006952 സംരക്ഷണ പ്രതികരണങ്ങൾ" വെളിപ്പെടുത്തി, qPCR (TanjilG_04706, TanjilG_23384, TanjilG_10657, TanjilG_27015) വിശകലനം ചെയ്ത ജീനുകൾ ഉൾപ്പെടെ, അതുപോലെ തന്നെ നിരവധി ഇനോക്യുലേറ്റ് ഏറ്റവും കൂടുതൽ അടിച്ചമർത്തപ്പെട്ട ഫോട്ടോസിന്തസിസ് മൊഡ്യൂളുകളും (9). മൊഡ്യൂൾ 18 കോൺസെൻട്രേറ്റർ (ചിത്രം 8) PR-10 പോലുള്ള LlR18B പ്രോട്ടീനിനെ എൻകോഡ് ചെയ്യുന്ന TanjilG_26536 ജീൻ ആണെന്നും, മൊഡ്യൂൾ 9 കോൺസെൻട്രേറ്റർ ഫോട്ടോസിസ്റ്റം II PsbQ പ്രോട്ടീനിനെ എൻകോഡ് ചെയ്യുന്ന TanjilG_28955 ജീൻ ആണെന്നും തിരിച്ചറിഞ്ഞു. മൊഡ്യൂൾ 22 (ചിത്രം 9) ൽ ഒരു കാൻഡിഡേറ്റ് ആന്ത്രാക്നോസ് റെസിസ്റ്റൻസ് ജീൻ, Lanr1, TanjilG_05042 കണ്ടെത്തി, ഇത് TanjilG_01212 ഹബ് വഹിക്കുന്ന “GO:0044260 സെല്ലുലാർ മാക്രോമോളിക്യുലാർ മെറ്റബോളിക് പ്രക്രിയകൾ”, “GO:0006355 ട്രാൻസ്ക്രിപ്ഷണൽ റെഗുലേഷൻ, ഡിഎൻഎ ടെംപ്ലേറ്റിംഗ്” എന്നീ പദങ്ങളുമായി ബന്ധപ്പെട്ടിരിക്കുന്നു. ജീൻ താപ സമ്മർദ്ദ ട്രാൻസ്ക്രിപ്ഷൻ ഘടകം A-4a (HSFA4a) എൻകോഡ് ചെയ്യുന്നു.
"GO: 0006952 പ്രതിരോധ പ്രതികരണങ്ങൾ" എന്ന അമിതമായ ജൈവ പ്രക്രിയ പദങ്ങളുള്ള മൊഡ്യൂളുകളുടെ ജീൻ സഹ-എക്സ്പ്രഷന്റെ വെയ്റ്റഡ് നെറ്റ്‌വർക്ക് വിശകലനം. qPCR വിശകലനം ചെയ്ത നാല് ജീനുകളെ ഹൈലൈറ്റ് ചെയ്യുന്നതിനായി ലിഗേഷൻ ലളിതമാക്കി (TanjilG_04706, TanjilG_23384, TanjilG_10657, TanjilG_27015).
"GO: 0006355: ട്രാൻസ്ക്രിപ്ഷണൽ റെഗുലേഷൻ, ഡിഎൻഎ ടെംപ്ലേറ്റിംഗ്" എന്ന അമിതമായ ജൈവ പ്രക്രിയ പദമുള്ള ഒരു മൊഡ്യൂളിന്റെ ജീൻ കോ-എക്സ്പ്രഷന്റെ വെയ്റ്റഡ് നെറ്റ്‌വർക്ക് വിശകലനം, ഒരു കാൻഡിഡേറ്റ് ആന്ത്രാക്നോസ് റെസിസ്റ്റൻസ് ജീൻ Lanr1 TanjilG_05042 വഹിക്കുന്നു. TanjilG_05042 ജീനിനെയും സെൻട്രൽ TanjilG_01212 ജീനിനെയും വേർതിരിക്കുന്നതിന് ലിഗേഷൻ ലളിതമാക്കി.
ഓസ്‌ട്രേലിയയിൽ ശേഖരിച്ച ആന്ത്രാക്നോസ് പ്രതിരോധ പരിശോധനയിൽ, നേരത്തെ പുറത്തിറക്കിയ മിക്ക ഇനങ്ങളും രോഗബാധിതമാണെന്ന് കണ്ടെത്തി; കല്യ, കൊറോമപ്പ്, മണ്ടലപ്പ് എന്നിവ മിതമായ പ്രതിരോധശേഷിയുള്ളവയാണെന്ന് വിവരിച്ചിരിക്കുന്നു, അതേസമയം വോംഗ, തഞ്ചിൽ, 83A:476 എന്നിവ ഉയർന്ന പ്രതിരോധശേഷിയുള്ളവയാണെന്ന് വിവരിച്ചിരിക്കുന്നു26,27,31. ലാൻർ1 എന്ന് നാമകരണം ചെയ്ത അതേ പ്രതിരോധ അല്ലീൽ ഉണ്ടായിരുന്നു, കൊറോമപ്പിനും മണ്ടലപ്പിനും ആൻമാൻ10, 26, 39 എന്ന് നാമകരണം ചെയ്ത വ്യത്യസ്തമായ അല്ലീൽ ഉണ്ടായിരുന്നു, അതേസമയം കല്യ മറ്റൊരു അല്ലീൽ കടത്തിവിട്ടു. , ലാൻർ2. ജർമ്മനിയിൽ ആന്ത്രാക്നോസ് പ്രതിരോധത്തിനായുള്ള സ്ക്രീനിംഗിൽ ലാൻർ1 അല്ലാത്ത ഒരു കാൻഡിഡേറ്റ് അല്ലീലുള്ള ഒരു പ്രതിരോധ രേഖ Bo7212 തിരിച്ചറിയാൻ കഴിഞ്ഞു, ലാൻർബോ36 എന്ന് നാമകരണം ചെയ്തിരിക്കുന്നു.
ഞങ്ങളുടെ പഠനം പരിശോധിച്ച ജേംപ്ലാസത്തിൽ ലാൻർ1 അല്ലീലിന്റെ വളരെ കുറഞ്ഞ ആവൃത്തി (ഏകദേശം 6%) വെളിപ്പെടുത്തി. Anseq3, Anseq4 മാർക്കറുകൾ ഉപയോഗിച്ച് കിഴക്കൻ യൂറോപ്യൻ ജേംപ്ലാസം പരിശോധിക്കുന്നതിന്റെ ഫലങ്ങളുമായി ഈ നിരീക്ഷണം പൊരുത്തപ്പെടുന്നു, ഇത് രണ്ട് ബെലാറഷ്യൻ ലൈനുകളിൽ മാത്രമേ ലാൻർ1 അല്ലീൽ ഉള്ളൂ എന്ന് കാണിച്ചു. ഓസ്‌ട്രേലിയയിൽ നിന്ന് വ്യത്യസ്തമായി, പ്രാദേശിക ബ്രീഡിംഗ് പ്രോഗ്രാമുകൾ ലാൻർ1 അല്ലീലിനെ ഇതുവരെ വ്യാപകമായി ഉപയോഗിക്കുന്നില്ലെന്ന് ഇത് സൂചിപ്പിക്കുന്നു, അവിടെ ഇത് മാർക്കർ സഹായത്തോടെയുള്ള പ്രജനനത്തിനുള്ള പ്രധാന അല്ലീലുകളിൽ ഒന്നാണ്. ഓസ്‌ട്രേലിയൻ റിപ്പോർട്ടുമായി താരതമ്യപ്പെടുത്തുമ്പോൾ യൂറോപ്യൻ ഫീൽഡ് സാഹചര്യങ്ങളിൽ ലാൻർ1 അല്ലീൽ നൽകുന്ന കുറഞ്ഞ പ്രതിരോധം ഇതിന് കാരണമാകാം. കൂടാതെ, ഓസ്‌ട്രേലിയയിലെ ഉയർന്ന മഴയുള്ള പ്രദേശങ്ങളിലെ ആന്ത്രാക്നോസിനെക്കുറിച്ചുള്ള പഠനങ്ങൾ കാണിക്കുന്നത് ലാൻർ1 അല്ലീൽ മധ്യസ്ഥത വഹിക്കുന്ന പ്രതിരോധ പ്രതികരണങ്ങൾ രോഗകാരിയുടെ വളർച്ചയ്ക്കും ദ്രുതഗതിയിലുള്ള വികാസത്തിനും അനുകൂലമായ കാലാവസ്ഥാ സാഹചര്യങ്ങളിൽ ഫലപ്രദമാകണമെന്നില്ല എന്നാണ്19,42. വാസ്തവത്തിൽ, ഇപ്പോഴത്തെ പഠനത്തിൽ, ലാൻർ1 അല്ലീൽ വഹിക്കുന്ന ജനിതകരൂപങ്ങളിലും ആന്ത്രാക്നോസിന്റെ ചില ലക്ഷണങ്ങൾ നിരീക്ഷിക്കപ്പെട്ടു, ഇത് സി. ലുപിനിയുടെ വികസനത്തിന് അനുയോജ്യമായ സാഹചര്യങ്ങളിൽ പ്രതിരോധം അപ്രത്യക്ഷമായേക്കാമെന്ന് സൂചിപ്പിക്കുന്നു. കൂടാതെ, ലാൻ1 ലോക്കസിൽ നിന്ന് ഏകദേശം 1 cM അകലെയുള്ള Anseq3, Anseq4 മാർക്കറുകളുടെ സാന്നിധ്യത്തെക്കുറിച്ചുള്ള തെറ്റായ പോസിറ്റീവ് വ്യാഖ്യാനങ്ങൾ സാധ്യമാണ് 28,30,43.
ഞങ്ങളുടെ പഠനം കാണിക്കുന്നത്, ലാൻ1 അല്ലീൽ വഹിക്കുന്ന 83A:476, സി. ലുപിനി ഇനോക്കുലേഷനോട് വലിയ തോതിലുള്ള ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റോം റീപ്രോഗ്രാമിംഗ് ഉപയോഗിച്ച് ആദ്യ വിശകലനം ചെയ്ത സമയ പോയിന്റിൽ (6 എച്ച്പിഐ) പ്രതികരിച്ചു എന്നാണ്, അതേസമയം ആൻമാൻ അല്ലീൽ വഹിക്കുന്ന മണ്ടലപ്പിൽ, ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റോമിക് പ്രതികരണങ്ങൾ വളരെ പിന്നീട് നിരീക്ഷിക്കപ്പെട്ടു. (24 മുതൽ 48 എച്ച്പി വരെ). പ്രതിരോധ പ്രതികരണങ്ങളിലെ ഈ താൽക്കാലിക വ്യതിയാനങ്ങൾ രോഗ ലക്ഷണങ്ങളിലെ വ്യത്യാസങ്ങളുമായി ബന്ധപ്പെട്ടിരിക്കുന്നു, പ്രതിരോധത്തോടുള്ള വിജയകരമായ പ്രതികരണത്തിന് രോഗകാരിയുടെ ആദ്യകാല തിരിച്ചറിയലിന്റെ പ്രാധാന്യം എടുത്തുകാണിക്കുന്നു. സസ്യകലകളെ ബാധിക്കുന്നതിന്, ആന്ത്രാക്സ് ബീജങ്ങൾ ആതിഥേയ ഉപരിതലത്തിൽ മുളയ്ക്കൽ, കോശവിഭജനം, ഒരു അപ്രെസോറിയത്തിന്റെ രൂപീകരണം എന്നിവയുൾപ്പെടെ നിരവധി വികസന ഘട്ടങ്ങളിലൂടെ കടന്നുപോകണം. ഒരു അനുബന്ധം ഹോസ്റ്റിന്റെ ഉപരിതലത്തിൽ പറ്റിപ്പിടിച്ച് ഹോസ്റ്റ് ടിഷ്യൂകളിലേക്ക് നുഴഞ്ഞുകയറ്റം സുഗമമാക്കുന്ന ഒരു പകർച്ചവ്യാധി ഘടനയാണ്. അങ്ങനെ, പയർ സത്തിൽ സി. ഗ്ലോയോസ്പോറിയോയിഡുകളുടെ ബീജങ്ങൾ 75-90 മിനിറ്റ് ഇൻകുബേഷനുശേഷം ന്യൂക്ലിയസിന്റെ ആദ്യ വിഭജനം, 90-120 മിനിറ്റിനുശേഷം ഒരു ജേം ട്യൂബിന്റെ രൂപീകരണം, 4 മണിക്കൂറിനുശേഷം അടിച്ചമർത്തൽ എന്നിവ കാണിച്ചു. മാമ്പഴ സി. ഗ്ലോയോസ്പോറിയോയിഡുകൾ 3 മണിക്കൂർ ഇൻകുബേഷനുശേഷം 40%-ത്തിലധികം കോണിഡിയൽ മുളയ്ക്കലും 4 മണിക്കൂറിനുശേഷം ഏകദേശം 20% അപ്രസ്സറുകളുടെ രൂപീകരണവും കാണിച്ചു. 4 മണിക്കൂർ 46 മിനിറ്റിനുശേഷം ഉയർന്ന സാന്ദ്രതയിലുള്ള CAP20 പ്രോട്ടീനുള്ള അവോക്കാഡോ ഉപരിതല വാക്സിൽ 3.5 മണിക്കൂർ ഇൻകുബേഷനുശേഷം എപ്പിഫൈറ്റ് രൂപപ്പെടുന്ന കോണിഡിയയിൽ സി. ഗ്ലോയോസ്പോറിയോയിഡുകളുടെ വൈറസുമായി ബന്ധപ്പെട്ട CAP20 ജീൻ ട്രാൻസ്ക്രിപ്ഷണൽ പ്രവർത്തനം കാണിച്ചു. അതുപോലെ, സി. ട്രൈഫോളിയിലെ മെലാനിൻ ബയോസിന്തസിസ് ജീനുകളുടെ പ്രവർത്തനം 2 മണിക്കൂർ ഇൻകുബേഷനിലൂടെ പ്രേരിപ്പിച്ചു, തുടർന്ന് 1 മണിക്കൂറിനുശേഷം ഒരു അപ്പ്രെസോറിയം രൂപപ്പെട്ടു. സി. അക്യുട്ടാറ്റം കുത്തിവച്ച സ്ട്രോബെറികൾക്ക് 8 എച്ച്പിഐയിൽ ആദ്യ സപ്രഷൻ ഉണ്ടെന്നും, സി. കൊക്കോഡുകൾ കുത്തിവച്ച തക്കാളികൾക്ക് 4 എച്ച്പിഐയിൽ ആദ്യ സപ്രഷൻ ഉണ്ടെന്നും ഇല കലകളെക്കുറിച്ചുള്ള പഠനങ്ങൾ തെളിയിച്ചിട്ടുണ്ട്. കൊളെറ്റോട്രിക്കം സ്പീഷീസ് പകർച്ചവ്യാധി പ്രക്രിയയുടെ സമയ സ്കെയിലുമായി 48,49. വലിയതോതിൽ പൊരുത്തപ്പെടുന്നു. 83A:476 നുള്ള ദ്രുത പ്രതിരോധ പ്രതികരണങ്ങൾ സസ്യ പ്രതിരോധത്തിന്റെയും എഫക്റ്റർ-ട്രിഗർഡ് ഇമ്മ്യൂണിറ്റി (ETI) ജീനുകളുടെയും ഈ വരിയിലെ പങ്കാളിത്തത്തെ സൂചിപ്പിക്കുന്നു, അതേസമയം മണ്ടലപ്പിന്റെ വൈകിയ പ്രതികരണങ്ങൾ മൈക്രോ-അസോസിയേറ്റഡ് മോളിക്യുലാർ പാറ്റേൺ-ട്രിഗർഡ് ഇമ്മ്യൂണിറ്റി (MTI) സിദ്ധാന്തത്തെ പിന്തുണയ്ക്കുന്നു 50. 83A: 476, മണ്ടലപ്പിനുള്ള ആദ്യകാല പ്രതികരണങ്ങൾ. വൈകിയ പ്രതികരണത്തിൽ മുകളിലേക്കോ താഴേക്കോ നിയന്ത്രിത ജീനുകൾ തമ്മിലുള്ള ഭാഗിക ഓവർലാപ്പും ഈ ആശയത്തെ പിന്തുണയ്ക്കുന്നു, കാരണം ETI പലപ്പോഴും ത്വരിതപ്പെടുത്തിയതും മെച്ചപ്പെടുത്തിയതുമായ MTI പ്രതികരണമായി കണക്കാക്കപ്പെടുന്നു, ഇത് അണുബാധയുടെ സ്ഥലത്ത് പ്രോഗ്രാം ചെയ്ത കോശ മരണത്തിൽ കലാശിക്കുന്നു, ഇത് അനാഫൈലക്റ്റിക് ഷോക്ക് 51,52 എന്നറിയപ്പെടുന്നു.
ജീൻ ഒന്റോളജി GO:0006952 "ഡിഫൻസ് റെസ്‌പോൺസ്" എന്ന അമിത പ്രാതിനിധ്യ പദത്തിന് കാരണമായ ജീനുകളിൽ ഭൂരിഭാഗവും സ്ട്രെസ്-ഇൻഡ്യൂസ്ഡ് ഫാസ്റ്റിംഗ് മെസേജ് 22 പ്രോട്ടീനിന്റെ (SAM22 ന് സമാനമായത്) 11 ഹോമോലോഗുകളും ഏഴ് പ്രധാന ലാറ്റക്സ് പ്രോട്ടീൻ-ലൈക്കുകളും (MLP-കൾ) ആണ്. -ലൈക്ക് പ്രോട്ടീനുകൾ 31, 34, 43, 423 എന്നിവ ക്രമാനുഗതമായ സമാനത കാണിച്ചു. SAM22-പോലുള്ള ജീനുകൾ കൂടുതൽ കാലം നീണ്ടുനിന്ന ഗണ്യമായ സജീവമാക്കൽ കാണിച്ചു, ആന്ത്രാക്നോസ് പ്രതിരോധത്തിന്റെ വർദ്ധിച്ച അളവ് കാണിച്ചു (83A:476 ഉം ബോറെജിനും). എന്നിരുന്നാലും, കാൻഡിഡേറ്റ് റെസിസ്റ്റൻസ് അല്ലീൽ വഹിക്കുന്ന വരികളിൽ മാത്രമേ MLP-പോലുള്ള ജീനുകൾ നിയന്ത്രിച്ചിട്ടുള്ളൂ (6 hpi-ൽ 83A:476/Lanr1 ഉം 24 hpi-ൽ മാൻഡെലപ്പ്/AnMan ഉം). തിരിച്ചറിഞ്ഞ എല്ലാ SAM22-പോലുള്ള ഹോമോലോഗുകളും ഏകദേശം 105 kb വ്യാപിച്ചുകിടക്കുന്ന ഒരു ജീൻ ക്ലസ്റ്ററിൽ നിന്നാണ് ഉത്ഭവിക്കുന്നതെന്നും അതേസമയം MLP-പോലുള്ള ജീനുകൾ ജീനോമിന്റെ പ്രത്യേക പ്രദേശങ്ങളിൽ നിന്നാണ് ഉത്ഭവിക്കുന്നതെന്നും ശ്രദ്ധിക്കേണ്ടതാണ്. ഡയപോർതെറ്റോക്സിക്ക ഇനോക്കുലേഷനെതിരായ NLL പ്രതിരോധത്തെക്കുറിച്ചുള്ള ഞങ്ങളുടെ മുൻ പഠനത്തിൽ SAM22 പോലുള്ള ജീനുകളുടെ ഏകോപിത സജീവമാക്കൽ കണ്ടെത്തി, പ്രതിരോധ പ്രതികരണത്തിന്റെ തിരശ്ചീന ഘടകങ്ങളിൽ അവ ഉൾപ്പെട്ടിട്ടുണ്ടെന്ന് ഇത് സൂചിപ്പിക്കുന്നു. സാലിസിലിക് ആസിഡ്, ഫംഗസ് ഇൻഡ്യൂസറുകൾ അല്ലെങ്കിൽ ഹൈഡ്രജൻ പെറോക്സൈഡ് ഉപയോഗിച്ചുള്ള പരിക്കിനോ ചികിത്സയ്‌ക്കോ SAM22 പോലുള്ള ജീനുകളുടെ പോസിറ്റീവ് പ്രതികരണത്തെക്കുറിച്ചുള്ള റിപ്പോർട്ടുകളും ഈ നിഗമനത്തെ പിന്തുണയ്ക്കുന്നു.
പല സസ്യ ഇനങ്ങളിലും ബാക്ടീരിയ, വൈറൽ, രോഗകാരിയായ ഫംഗസ് അണുബാധകൾ ഉൾപ്പെടെ വിവിധ അജീവീയ, ബയോട്ടിക് സമ്മർദ്ദങ്ങളോട് MLP-പോലുള്ള ജീനുകൾ പ്രതികരിക്കുന്നതായി കണ്ടെത്തിയിട്ടുണ്ട്55. സസ്യങ്ങളും രോഗകാരികളും തമ്മിലുള്ള ചില ഇടപെടലുകളോടുള്ള പ്രതികരണത്തിന്റെ ദിശകൾ ശക്തമായി വർദ്ധിക്കുന്നത് (അതായത്, വെർട്ടിസിലിയം ഡാലിയ ഉപയോഗിച്ച് പരുത്തിയിൽ ആക്രമണം ഉണ്ടാകുമ്പോൾ) മുതൽ ഗണ്യമായി കുറയുന്നത് (അതായത്, ആൾട്ടർനേറിയ സ്പീഷിസുകൾ ഉപയോഗിച്ച് ആപ്പിൾ മരത്തിൽ അണുബാധയുണ്ടായതിന് ശേഷം) വരെയായിരുന്നു. 56,57. എഫ്. നൈഗർ അണുബാധയ്‌ക്കെതിരായ അവോക്കാഡോ പ്രതിരോധത്തിനിടയിലും ആപ്പിൾ മരത്തിൽ അണുബാധയുണ്ടായപ്പോഴും MLP-പോലുള്ള 423 ജീനിന്റെ ഗണ്യമായ കുറവ് നിരീക്ഷിക്കപ്പെട്ടിട്ടുണ്ട്. ബോട്ട്യോസ്ഫേരിയ ബെറെൻഗെറിയാന എഫ്. സിഎൻ. പിരിക്കോളയും ആൾട്ടർനേറിയ ആൾട്ടർനാറ്റയും ആപ്പിൾ രോഗകാരികളാണ്58,59. കൂടാതെ, MLP-പോലുള്ള 423 ജീനിനെ അമിതമായി പ്രകടിപ്പിക്കുന്ന ആപ്പിൾ കാലിക്ക് പ്രതിരോധവുമായി ബന്ധപ്പെട്ട ജീനുകളുടെ പ്രകടനശേഷി കുറവായിരുന്നു, കൂടാതെ ഫംഗസ് അണുബാധയ്ക്ക് കൂടുതൽ സാധ്യതയുണ്ടായിരുന്നു59. ഫ്യൂസേറിയം ഓക്സിസ്പോറം f-നെ പിന്തുടർന്ന്, പ്രതിരോധശേഷിയുള്ള സാധാരണ ബീൻ ജെർംപ്ലാസത്തിൽ MLP-പോലുള്ള 423 ജീനിനെയും അടിച്ചമർത്തി. cn. ബീൻ അണുബാധ 60.
ഞങ്ങളുടെ RNA-seq പഠനത്തിൽ തിരിച്ചറിഞ്ഞ PR-10 കുടുംബത്തിലെ മറ്റ് അംഗങ്ങൾ, അപ്‌റെഗുലേഷനോടുള്ള പ്രതികരണമായി LlR18A, LlR18B ജീനുകളും, ലിപിഡ് ട്രാൻസ്ഫർ പ്രോട്ടീൻ DIR1-നുള്ള അപ്‌റെഗുലേറ്റഡ് (1 ജീൻ) അല്ലെങ്കിൽ ഡൗൺറെഗുലേറ്റഡ് (3 ജീനുകൾ) ജീനുകളുമാണ്. . കൂടാതെ, WGCNA ഈ മൊഡ്യൂളിലെ ഒരു കേന്ദ്രമായി LlR18B ജീനിനെ എടുത്തുകാണിക്കുന്നു, ഇത് വാക്സിനേഷന് വളരെ സാധ്യതയുള്ളതും നിരവധി സംരക്ഷണ പ്രതികരണ ജീനുകൾ വഹിക്കുന്നതുമാണ്. രോഗകാരികളായ ബാക്ടീരിയകളോടുള്ള പ്രതികരണമായി മഞ്ഞ ലുപിൻ ഇലകളിലും, D. ടോക്സിക്ക ഇനോക്കുലേഷനുശേഷം NLL തണ്ടുകളിലും LlR18A, LlR18B ജീനുകൾ പ്രചോദിപ്പിക്കപ്പെട്ടു, അതേസമയം ഈ ജീനുകളുടെ അരി ഹോമോലോഗ്, RSOsPR10, ജാസ്മോണിക് ആസിഡ് സിഗ്നലിംഗ് പാതയിൽ ഉൾപ്പെട്ടിരിക്കുന്നതായി കരുതപ്പെടുന്ന ഒരു ഫംഗസ് അണുബാധയാൽ വേഗത്തിൽ പ്രചോദിപ്പിക്കപ്പെട്ടു53,61, 62. DIR1 ജീൻ സിസ്റ്റമിക് അക്വയർഡ് റെസിസ്റ്റൻസ് (SAR) ആരംഭിക്കുന്നതിന് ആവശ്യമായ നോൺസ്പെസിഫിക് ലിപിഡ് ട്രാൻസ്പോർട്ട് പ്രോട്ടീനുകളെ എൻകോഡ് ചെയ്യുന്നു. സംരക്ഷണ പ്രതിപ്രവർത്തനങ്ങൾ വികസിക്കുന്നതോടെ, DIR1 പ്രോട്ടീൻ അണുബാധയുടെ കേന്ദ്രത്തിൽ നിന്ന് ഫ്ലോയം വഴി ദൂരെയുള്ള അവയവങ്ങളിൽ SAR പ്രേരിപ്പിക്കുന്നതിനായി കടത്തിവിടുന്നു. രസകരമെന്നു പറയട്ടെ, 84A:476, പോപ്പുലേഷൻ 22660 എന്നീ വരികളിലെ ആദ്യ സമയ പോയിന്റിൽ TanjilG_02313 DIR1 ജീൻ ഗണ്യമായി പ്രചോദിപ്പിക്കപ്പെട്ടു, എന്നാൽ 84A:476 വരിയിൽ മാത്രമേ ആന്ത്രാക്നോസ് പ്രതിരോധം വിജയകരമായി വികസിച്ചുള്ളൂ. ശേഷിക്കുന്ന മൂന്ന് ഹോമോലോഗുകൾ 6 hpi-ൽ 83A:476 ലൈനിൽ മാത്രം ഇനോക്കുലേഷനോട് പ്രതികരിച്ചതിനാൽ, ഈ പ്രതികരണം താഴേക്ക് നയിക്കപ്പെട്ടു, NLL-ൽ DIR1 ജീനിന്റെ ചില ഉപപ്രവർത്തനക്ഷമതയെ ഇത് സൂചിപ്പിക്കാം.
ഞങ്ങളുടെ പഠനത്തിൽ, "GO:0055114 റെഡോക്സ് പ്രക്രിയ" എന്ന് വിളിക്കപ്പെടുന്ന ജൈവ പ്രക്രിയയുമായി ബന്ധപ്പെട്ട ഏറ്റവും സാധാരണമായ ഘടകങ്ങൾ സൈറ്റോക്രോം P450 പ്രോട്ടീൻ, പെറോക്സിഡേസ്, ലിനോലെയിക് ആസിഡ് 9S-/13S-ലിപോക്സിജനേസ്, 1-അമിനോസൈക്ലോപ്രൊപെയ്ൻ-1-കാർബോക്സിലിക് ആസിഡ് ഓക്സിഡേസ് എന്നിവയായിരുന്നു. കൂടാതെ, ഞങ്ങളുടെ WGCNA, Lanr1 റെസിസ്റ്റൻസ് ജീൻ കാൻഡിഡേറ്റ് TanjilG_05042 പോലുള്ള മൊഡ്യൂളുകൾ വഹിക്കുന്ന ഒരു ഹബ്ബായി HSFA4a ഹോമോലോഗിനെ നിർവചിക്കുന്നു. സസ്യങ്ങളിലെ ന്യൂക്ലിയർ ട്രാൻസ്ക്രിപ്ഷന്റെ റെഡോക്സ്-ആശ്രിത നിയന്ത്രണത്തിന്റെ ഒരു ഘടകമാണ് HSFA4a.
സൈറ്റോക്രോം P450 പ്രോട്ടീനുകൾ പ്രാഥമിക, ദ്വിതീയ മെറ്റബോളിസത്തിൽ NADPH,/അല്ലെങ്കിൽ O2-ആശ്രിത ഹൈഡ്രോക്സിലേഷൻ പ്രതിപ്രവർത്തനങ്ങളെ ഉത്തേജിപ്പിക്കുന്ന ഓക്സിഡോറെഡക്റ്റേസുകളാണ്, ഇതിൽ സെനോബയോട്ടിക്സിന്റെ മെറ്റബോളിസം, ഹോർമോണുകൾ, ഫാറ്റി ആസിഡുകൾ, സ്റ്റിറോളുകൾ, സെൽ വാൾ ഘടകങ്ങൾ, ബയോപോളിമറുകൾ, സംരക്ഷിത സംയുക്തങ്ങളുടെ ബയോസിന്തസിസ് എന്നിവ ഉൾപ്പെടുന്നു. ഒരു പഠനത്തിൽ, സസ്യ സൈറ്റോക്രോം P450 ഫംഗ്ഷനിലെ വ്യതിയാനം -10.6 log2 (മടങ്ങ് മാറ്റം) ൽ നിന്ന് 5.7 ആയി കുറഞ്ഞു, കാരണം ധാരാളം മാറ്റം വരുത്തിയ ഹോമോലോഗുകൾ (37), നിർദ്ദിഷ്ട ജീനുകൾ തമ്മിലുള്ള പ്രതികരണ പാറ്റേണുകളിലെ വ്യത്യാസങ്ങൾ എന്നിവ മുകളിലേക്കുള്ള പുനരവലോകനത്തെ പ്രതിഫലിപ്പിക്കുന്നു. . ഇത്രയും വലിയ പ്രോട്ടീൻ സൂപ്പർഫാമിലിയിൽ NLL ജീനുകളുടെ ജീവശാസ്ത്രപരമായ പ്രവർത്തനം വ്യക്തമാക്കുന്നതിന് RNA-seq ഡാറ്റ മാത്രം ഉപയോഗിക്കുന്നത് വളരെ ഊഹാപോഹമായിരിക്കും. എന്നിരുന്നാലും, ചില സൈറ്റോക്രോം P450 ജീനുകൾ രോഗകാരികളായ ഫംഗസുകൾക്കോ ​​ബാക്ടീരിയകൾക്കോ ​​ഉള്ള പ്രതിരോധം വർദ്ധിപ്പിക്കുന്നതുമായി ബന്ധപ്പെട്ടിരിക്കുന്നു എന്നത് ശ്രദ്ധിക്കേണ്ടതാണ്, അലർജി പ്രതിപ്രവർത്തനങ്ങൾക്ക് സംഭാവന നൽകുന്നു69,70,71.
ക്ലാസ് III പെറോക്‌സിഡേസുകൾ സസ്യവളർച്ചയിലും വികാസത്തിലും വൈവിധ്യമാർന്ന ഉപാപചയ പ്രക്രിയകളിൽ ഉൾപ്പെടുന്ന മൾട്ടിഫങ്ഷണൽ സസ്യ എൻസൈമുകളാണ്, അതുപോലെ തന്നെ ലവണാംശം, വരൾച്ച, ഉയർന്ന പ്രകാശ തീവ്രത, രോഗകാരി ആക്രമണം തുടങ്ങിയ പാരിസ്ഥിതിക സമ്മർദ്ദങ്ങളോടുള്ള പ്രതികരണമായും. സ്റ്റൈലോസാന്തസ് ഹ്യുമിലിസ്, സി. ഗ്ലോയോസ്പോറിയോയിഡുകൾ, ലെൻസ് കുലിനാരൈസ്, സി. ട്രങ്കാറ്റം, ഫാസിയോലസ് വൾഗാരിസ്, സി. ലിൻഡെമുത്തിയാനം, കുക്കുമിസ് സാറ്റിവസ്, സി. ലഗനേറിയം എന്നിവയുൾപ്പെടെ ആന്ത്രാസിസുമായുള്ള നിരവധി സസ്യ ഇനങ്ങളുടെ പ്രതിപ്രവർത്തനത്തിൽ പെറോക്‌സിഡേസുകൾ ഉൾപ്പെടുന്നു. ഫംഗസ് സസ്യകലകളിലേക്ക് തുളച്ചുകയറുന്നതിനുമുമ്പ് പ്രതികരണം വളരെ വേഗത്തിലാണ്, ചിലപ്പോൾ 4 HPI-ൽ പോലും73. പെറോക്‌സിഡേസ് ജീൻ D. ടോക്‌സിക്ക NLL ഇനോക്കുലേഷനോടും പ്രതികരിച്ചു. ഓക്‌സിഡേറ്റീവ് പൊട്ടിത്തെറി നിയന്ത്രിക്കുന്നതിനോ ഓക്‌സിഡേറ്റീവ് സമ്മർദ്ദം ഇല്ലാതാക്കുന്നതിനോ ഉള്ള അവയുടെ സാധാരണ പ്രവർത്തനങ്ങൾക്ക് പുറമേ, ലിഗ്നിഫിക്കേഷൻ, സബ്യൂണിറ്റ് അല്ലെങ്കിൽ പ്രത്യേക സംയുക്തങ്ങളുടെ ക്രോസ്-ലിങ്കിംഗ് സമയത്ത് കോശഭിത്തി ശക്തിപ്പെടുത്തലിനെ അടിസ്ഥാനമാക്കി ഭൗതിക തടസ്സങ്ങൾ സൃഷ്ടിച്ചുകൊണ്ട് പെറോക്‌സിഡേസുകൾക്ക് രോഗകാരി വളർച്ചയെ തടസ്സപ്പെടുത്താൻ കഴിയും. സിലിക്കോയിൽ ഈ പ്രവർത്തനം TanjilG_03329 ജീൻ എൻകോഡ് ചെയ്യുന്ന ഒരു പുട്ടേറ്റീവ് ലിഗ്നിൻ-ഫോർമിംഗ് ആനയോൺ പെറോക്സിഡേസുമായി ബന്ധപ്പെട്ടിരിക്കുന്നു, ഇത് ഞങ്ങളുടെ പഠനത്തിൽ 6 HPI-ൽ 83A:476 റെസിസ്റ്റന്റ് ലൈനിൽ ഗണ്യമായി വർദ്ധിച്ചു, എന്നാൽ പ്രതികരിക്കാത്ത മറ്റ് സ്ട്രെയിനുകളിലും സമയ പോയിന്റുകളിലും ഇത് അങ്ങനെയല്ല.
ലിപിഡ് ബയോസിന്തസിസിന്റെ ഓക്‌സിഡേറ്റീവ് പാതയിലെ ആദ്യപടിയാണ് ലിനോലെയിക് ആസിഡിന്റെ 9S-/13S-ലിപ്പോക്‌സിജനേസ്78. കാലോസ്, പെക്റ്റിൻ നിക്ഷേപങ്ങൾ എന്നിവയുടെ രൂപീകരണത്തിലൂടെ കോശഭിത്തി ശക്തിപ്പെടുത്തൽ, റിയാക്ടീവ് ഓക്‌സിജൻ സ്പീഷീസുകളുടെ ഉത്പാദനത്തിലൂടെ ഓക്‌സിഡേറ്റീവ് സ്ട്രെസ് നിയന്ത്രിക്കൽ എന്നിവയുൾപ്പെടെ സസ്യ പ്രതിരോധത്തിൽ ഈ പാതയുടെ ഉൽപ്പന്നങ്ങൾക്ക് ഒന്നിലധികം പ്രവർത്തനങ്ങൾ ഉണ്ട്.79,80,81,82,83. ഇപ്പോഴത്തെ പഠനത്തിൽ, ലിനോലെയിക് ആസിഡ് 9S-/13S-ലിപ്പോക്‌സിജനേസിന്റെ പ്രകടനത്തിൽ എല്ലാ സ്ട്രെയിനുകളിലും മാറ്റം വരുത്തി, എന്നാൽ 22660 എന്ന സംവേദനക്ഷമതയുള്ള ജനസംഖ്യയിൽ, വ്യത്യസ്ത സമയ പോയിന്റുകളിൽ അപ്‌റെഗുലേഷൻ നിലനിന്നിരുന്നു, അതേസമയം പ്രതിരോധശേഷിയുള്ള ലാൻ1 ഉം ആൻമാൻ അല്ലീലും വഹിക്കുന്ന സ്ട്രെയിനുകളിൽ, ഈ ജനിതകരൂപങ്ങൾക്കിടയിലുള്ള സംരക്ഷിത ആന്ത്രാക്സ് പ്രതിപ്രവർത്തനങ്ങളിൽ ഓക്‌സിലിപിൻ പാളിയുടെ വൈവിധ്യവൽക്കരണത്തിന് ഇത് ഊന്നൽ നൽകുന്നു.
ലുപിൻ കുത്തിവച്ചപ്പോൾ 1-അമിനോസൈക്ലോപ്രൊപെയ്ൻ-1-കാർബോക്‌സിലേറ്റ് ഓക്‌സിഡേസ് (ACO) ഹോമോലോഗ് ഗണ്യമായി വർദ്ധിച്ചു (9 ജീനുകൾ) അല്ലെങ്കിൽ കുറഞ്ഞു (2 ജീനുകൾ). രണ്ട് ഒഴിവാക്കലുകൾ ഒഴികെ, ഈ പ്രതികരണങ്ങളെല്ലാം 6 hp-ൽ 83A:476-ൽ സംഭവിച്ചു. ACO പ്രോട്ടീനുകൾ മധ്യസ്ഥത വഹിക്കുന്ന എൻസൈമാറ്റിക് പ്രതിപ്രവർത്തനം എഥിലീൻ ഉൽപാദനത്തിലെ നിരക്ക് പരിമിതപ്പെടുത്തുന്ന ഘട്ടമാണ്, അതിനാൽ ഇത് വളരെ നിയന്ത്രിക്കപ്പെടുന്നു84. സസ്യ വികസനം നിയന്ത്രിക്കുന്നതിലും അജിയോട്ടിക്, ബയോട്ടിക് സമ്മർദ്ദ സാഹചര്യങ്ങളോടുള്ള പ്രതികരണത്തിലും വൈവിധ്യമാർന്ന പങ്ക് വഹിക്കുന്ന ഒരു സസ്യ ഹോർമോണാണ് എഥിലീൻ. റിയാക്ടീവ് ഓക്സിജൻ സ്പീഷീസുകളുടെയും ഫൈറ്റോഅലെക്സിനുകളുടെയും ഉത്പാദനം നിയന്ത്രിക്കുന്നതിലൂടെ ഹെമിബയോട്രോഫിക് ഫംഗസ് ഒറിസെ ഒറിസെ ഒറിസെയോടുള്ള അരിയുടെ പ്രതിരോധം വർദ്ധിപ്പിക്കുന്നതിൽ ACO ട്രാൻസ്ക്രിപ്ഷന്റെ ഇൻഡക്ഷനും എഥിലീൻ സിഗ്നലിംഗ് പാതയുടെ സജീവമാക്കലും ഉൾപ്പെടുന്നു. ഈ പഠനത്തിൽ റിപ്പോർട്ട് ചെയ്തിരിക്കുന്ന 83A:476 ലൈനിൽ ACO ഹോമോലോഗുകളുടെ ഗണ്യമായ വർദ്ധനവിന്റെ പശ്ചാത്തലത്തിൽ, M. oryzae നും C. lupini നും ഇടയിൽ കാണപ്പെടുന്ന വളരെ സമാനമായ ഇല അണുബാധ പ്രക്രിയ, തന്മാത്രാ പാതകളിലെ ഒരു സിഗ്നലിംഗ് കേന്ദ്ര ഘട്ടമായ NLL ആന്ത്രാക്നോസ് എഥിലീനിന് പ്രതിരോധം നൽകാനുള്ള സാധ്യത മാറ്റുന്നു.
ഇപ്പോഴത്തെ പഠനത്തിൽ, പ്രകാശസംശ്ലേഷണവുമായി ബന്ധപ്പെട്ട നിരവധി ജീനുകളുടെ വലിയ തോതിലുള്ള അടിച്ചമർത്തൽ 83A:476-ൽ 6 hpi-ലും മാൻഡലൂപ്പിലും 22660 ജനസംഖ്യയിലും 48 hpi-ലും നിരീക്ഷിക്കപ്പെട്ടു. ഈ മാറ്റങ്ങളുടെ വ്യാപ്തിയും പുരോഗതിയും ലെവലിന് ആനുപാതികമാണ്. ഈ പരീക്ഷണത്തിൽ ആന്ത്രാക്നോസ് പ്രതിരോധം നിരീക്ഷിക്കപ്പെട്ടു. അടുത്തിടെ, രോഗകാരികളായ ബാക്ടീരിയകളും ഫംഗസുകളും ഉൾപ്പെടെ സസ്യ-രോഗകാരി ഇടപെടലുകളുടെ നിരവധി മാതൃകകളിൽ പ്രകാശസംശ്ലേഷണവുമായി ബന്ധപ്പെട്ട ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റുകളുടെ ശക്തവും നേരത്തെയുള്ളതുമായ അടിച്ചമർത്തൽ റിപ്പോർട്ട് ചെയ്യപ്പെട്ടിട്ടുണ്ട്. അണുബാധയ്ക്കുള്ള പ്രതികരണമായി പ്രകാശസംശ്ലേഷണവുമായി ബന്ധപ്പെട്ട ജീനുകളുടെ തിടുക്കവും (ചില ഇടപെടലുകളിൽ 2 HPI-ൽ നിന്ന്) ആഗോള അടിച്ചമർത്തലും റിയാക്ടീവ് ഓക്സിജൻ സ്പീഷീസുകളുടെ വിന്യാസത്തെയും അലർജി പ്രതിപ്രവർത്തനങ്ങൾക്ക് മധ്യസ്ഥത വഹിക്കുന്നതിനുള്ള സാലിസിലിക് ആസിഡ് പാതയുമായുള്ള അവയുടെ ഇടപെടലിനെയും അടിസ്ഥാനമാക്കി സസ്യ പ്രതിരോധശേഷിക്ക് കാരണമാകും [90,94].
ഉപസംഹാരമായി, ഏറ്റവും പ്രതിരോധശേഷിയുള്ള വംശത്തിന് (83A:476) നിർദ്ദേശിക്കപ്പെട്ട പ്രതിരോധ പ്രതികരണ സംവിധാനങ്ങളിൽ R ജീൻ (TIR-NBS-LRR TanjilG_05042) വഴിയുള്ള ദ്രുത രോഗകാരി തിരിച്ചറിയൽ, അലർജി പ്രതികരണത്തിലൂടെ മധ്യസ്ഥത വഹിക്കുന്ന സാലിസിലിക് ആസിഡ്, എഥിലീൻ സിഗ്നലിംഗ് എന്നിവ ഉൾപ്പെടുന്നു, തുടർന്ന് ദീർഘദൂര SAR പ്രവർത്തനം സ്ഥാപിക്കപ്പെടുന്നു. DIR-1 പ്രോട്ടീൻ ഇത് പിന്തുണയ്ക്കുന്നു. സി. ലുപിനി അണുബാധയ്ക്കുള്ള ബയോട്രോഫിക് കാലയളവ് വളരെ ചെറുതാണ് (ഏകദേശം 2 ദിവസം), തുടർന്ന് നെക്രോറ്റിക് വളർച്ച95. ഈ ഘട്ടങ്ങൾക്കിടയിലുള്ള പരിവർത്തനം നെക്രോസിസുമായും ഹോസ്റ്റ് സസ്യങ്ങളിലെ ഹൈപ്പർസെൻസിറ്റിവിറ്റി പ്രതിപ്രവർത്തനങ്ങൾക്ക് ട്രിഗറുകളായി പ്രവർത്തിക്കുന്ന എഥിലീൻ-ഇൻഡ്യൂസിബിൾ പ്രോട്ടീനുകളുടെ പ്രകടനവുമായും ബന്ധപ്പെട്ടിരിക്കാം. അതിനാൽ, ബയോട്രോഫിക് ഘട്ടത്തിൽ സി. ലുപിനി വിജയകരമായി പിടിച്ചെടുക്കുന്നതിനുള്ള സമയ വിൻഡോ വളരെ ഇടുങ്ങിയതാണ്. 6 hpi-ൽ 83A:476-ൽ നിരീക്ഷിക്കപ്പെടുന്ന റെഡോക്സ്, ഫോട്ടോസിന്തസിസ് എന്നിവയുമായി ബന്ധപ്പെട്ട ജീനുകളുടെ റീപ്രോഗ്രാമിംഗ് ഫംഗസ് ഹൈഫയുടെ പുരോഗതിയുമായി പൊരുത്തപ്പെടുന്നു, കൂടാതെ ബയോട്രോഫിക് ഘട്ടത്തിൽ വിജയകരമായ സംരക്ഷണ പ്രതികരണത്തിന്റെ വികാസത്തെ സൂചിപ്പിക്കുന്നു. മണ്ടലപ്പിന്റെയും 22660 പോപ്പുലേഷന്റെയും ട്രാൻസ്ക്രിപ്റ്റോമിക് പ്രതികരണങ്ങൾ നെക്രോറ്റിക് വളർച്ചയിലേക്ക് മാറുന്നതിന് മുമ്പ് ഫംഗസിനെ പിടികൂടാൻ വളരെ വൈകിയേക്കാം, എന്നിരുന്നാലും, PR-10 പ്രോട്ടീന്റെ താരതമ്യേന വേഗത്തിലുള്ള നിയന്ത്രണം തിരശ്ചീന പ്രതിരോധത്തെ പ്രോത്സാഹിപ്പിക്കുന്നതിനാൽ, മണ്ടലപ്പ് 22660 പോപ്പുലേഷനേക്കാൾ കൂടുതൽ ഫലപ്രദമാകാം.
കാനോനിക്കൽ ആർ ജീനാൽ നയിക്കപ്പെടുന്ന ETI, ആന്ത്രാക്നോസിനെതിരെയുള്ള ബീൻ പ്രതിരോധത്തിനുള്ള ഒരു പൊതു സംവിധാനമാണെന്ന് തോന്നുന്നു. അങ്ങനെ, മോഡൽ ലെഗ്യൂം മെഡിക്കാഗോ ട്രങ്കാറ്റുലയിൽ, TIR-NBS-LRR97 പ്ലാന്റ് R ജീൻ ക്ലാസിലെ അംഗമായ RCT1 ജീൻ ആണ് ആന്ത്രാക്നോസിനെതിരെയുള്ള പ്രതിരോധം നൽകുന്നത്. ഈ ജീൻ ആൽഫാൽഫയിൽ ബ്രോഡ്-സ്പെക്ട്രം ആന്ത്രാക്നോസ് പ്രതിരോധവും നൽകുന്നു. കോമൺ ബീനിൽ (P. vulgaris), ഇതുവരെ രണ്ട് ഡസനിലധികം ആന്ത്രാക്നോസ് പ്രതിരോധ ജീനുകൾ തിരിച്ചറിഞ്ഞിട്ടുണ്ട്. ഈ ജീനുകളിൽ ചിലത് കാനോനിക്കൽ R ജീനുകൾ ഇല്ലാത്ത പ്രദേശങ്ങളിലാണ് കാണപ്പെടുന്നത്, എന്നിരുന്നാലും TIR-NBS-LRRs99 ഉൾപ്പെടെ NBS-LRR ജീൻ ക്ലസ്റ്റർ വഹിക്കുന്ന ക്രോമസോമുകളുടെ അരികുകളിൽ മറ്റു പലതും സ്ഥിതിചെയ്യുന്നു. ജീനോം-വൈഡ് SSR പഠനം, NBS-LRR ജീനിനും കോമൺ ബീനിലെ ആന്ത്രാക്നോസ് പ്രതിരോധവുമായുള്ള ബന്ധവും സ്ഥിരീകരിച്ചു. വെളുത്ത ലുപിൻ 101 ലെ പ്രധാന ആന്ത്രാക്നോസ് പ്രതിരോധ ലോക്കസ് വഹിക്കുന്ന ജീനോമിക് മേഖലയിലും കാനോനിക്കൽ R ജീൻ കണ്ടെത്തി.
സസ്യ അണുബാധയുടെ പ്രാരംഭ ഘട്ടത്തിൽ (12 hpi-യിൽ കൂടാത്തത്) സജീവമാക്കുന്ന ഒരു അടിയന്തര പ്രതിരോധ പ്രതികരണം, കൊളെലോട്രിക്കം ലുപിനി എന്ന രോഗകാരിയായ ഫംഗസ് മൂലമുണ്ടാകുന്ന ആന്ത്രാക്നോസിൽ നിന്ന് ഇടുങ്ങിയ ഇലകളുള്ള ലുപിനെ ഫലപ്രദമായി സംരക്ഷിക്കുന്നുവെന്ന് ഞങ്ങളുടെ ഗവേഷണങ്ങൾ കാണിക്കുന്നു. ഉയർന്ന ത്രൂപുട്ട് സീക്വൻസിംഗ് ഉപയോഗിച്ച്, Lanr1, AnMan പ്രതിരോധ ജീനുകൾ മധ്യസ്ഥത വഹിക്കുന്ന NLL സസ്യങ്ങളിലെ ആന്ത്രാക്നോസ് പ്രതിരോധ ജീനുകളുടെ ഡിഫറൻഷ്യൽ എക്സ്പ്രഷൻ പ്രൊഫൈലുകൾ ഞങ്ങൾ പ്രദർശിപ്പിച്ചു. ഒരു രോഗകാരിയുമായി സസ്യത്തിന്റെ ആദ്യ സമ്പർക്കത്തിന് മണിക്കൂറുകൾക്കുള്ളിൽ റെഡോക്സ്, ഫോട്ടോസിന്തസിസ്, രോഗകാരി എന്നിവയിൽ ഉൾപ്പെട്ടിരിക്കുന്ന പ്രോട്ടീനുകൾക്കായി ജീനുകൾ ശ്രദ്ധാപൂർവ്വം രൂപകൽപ്പന ചെയ്യുന്നത് വിജയകരമായ പ്രതിരോധത്തിൽ ഉൾപ്പെടുന്നു. സമാനമായ സംരക്ഷണ പ്രതികരണങ്ങൾ, എന്നാൽ കാലതാമസം നേരിട്ടെങ്കിലും, സസ്യങ്ങളെ രോഗങ്ങളിൽ നിന്ന് സംരക്ഷിക്കുന്നതിൽ വളരെ കുറവാണ്. Lanr1 ജീൻ മധ്യസ്ഥത വഹിക്കുന്ന ആന്ത്രാക്സ് പ്രതിരോധം R ജീനിന്റെ (എഫക്റ്റർ-ട്രിഗർ ചെയ്ത പ്രതിരോധശേഷി) സാധാരണ ദ്രുത പ്രതികരണത്തോട് സാമ്യമുള്ളതാണ്, അതേസമയം AnMan ജീൻ ഒരു തിരശ്ചീന പ്രതികരണം (സൂക്ഷ്മജീവികളുമായി ബന്ധപ്പെട്ട തന്മാത്രാ പാറ്റേൺ മൂലമുണ്ടാകുന്ന പ്രതിരോധശേഷി) നൽകുന്നു, ഇത് മിതമായ സുസ്ഥിരത നൽകുന്നു.
ആന്ത്രാക്നോസ് മാർക്കറുകൾക്കായി സ്‌ക്രീൻ ചെയ്യാൻ ഉപയോഗിച്ച 215 NLL ലൈനുകളിൽ 74 കൾട്ടിവറുകൾ, ക്രോസിംഗ് അല്ലെങ്കിൽ ബ്രീഡിംഗ് വഴി ലഭിച്ച 60 ലൈനുകൾ, 5 മ്യൂട്ടന്റുകൾ, 76 വൈൽഡ് അല്ലെങ്കിൽ ഒറിജിനൽ ജെംപ്ലാസങ്ങൾ എന്നിവ ഉൾപ്പെടുന്നു. പ്രധാനമായും പോളണ്ട് (58), സ്‌പെയിൻ (47), ജർമ്മനി (27), ഓസ്‌ട്രേലിയ (26), റഷ്യ (19), ബെലാറസ് (7), ഇറ്റലി (5) തുടങ്ങിയ 10 രാജ്യങ്ങളിൽ നിന്നുള്ള 17 രാജ്യങ്ങളിൽ നിന്നാണ് ഈ ലൈനുകൾ വന്നത്. സെറ്റിൽ റഫറൻസ് റെസിസ്റ്റന്റ് ലൈനുകളും ഉൾപ്പെടുന്നു: 83A:476, ടാഞ്ചിൽ, ലാൻർ1 അല്ലീൽ വഹിക്കുന്ന വോംഗ, ആൻമാൻ അല്ലീൽ വഹിക്കുന്ന മണ്ടലപ്പ്. പോളണ്ടിലെ വിയാട്രോവോയിലുള്ള പോസ്‌നാൻ പ്ലാന്റ് ബ്രീഡിംഗ് ലിമിറ്റഡ് പരിപാലിക്കുന്ന യൂറോപ്യൻ ലുപിൻ ജനിതക വിഭവ ഡാറ്റാബേസിൽ നിന്നാണ് ഈ ലൈനുകൾ ലഭിച്ചത് (സപ്ലിമെന്ററി ടേബിൾ S1).
നിയന്ത്രിത സാഹചര്യങ്ങളിലാണ് സസ്യങ്ങൾ വളർത്തിയത് (ഫോട്ടോപീരിയഡ് 16 മണിക്കൂർ, പകൽ താപനില 25°C, രാത്രി 18°C). രണ്ട് ജൈവ പകർപ്പുകൾ വിശകലനം ചെയ്തു. പ്രോട്ടോക്കോൾ അനുസരിച്ച് DNeasy പ്ലാന്റ് മിനി കിറ്റ് (Qiagen, Hilden, Germany) ഉപയോഗിച്ച് മൂന്ന് ആഴ്ച പ്രായമുള്ള ഇലകളിൽ നിന്ന് DNA വേർതിരിച്ചെടുത്തു. സ്പെക്ട്രോഫോട്ടോമെട്രിക് രീതികൾ ഉപയോഗിച്ച് ഒറ്റപ്പെട്ട DNA യുടെ ഗുണനിലവാരവും സാന്ദ്രതയും വിലയിരുത്തി (നാനോഡ്രോപ്പ് 2000; തെർമോ ഫിഷർ സയന്റിഫിക്, വാൾത്താം, MA, USA). ആന്ത്രാക്നോസ് പ്രതിരോധ ജീനായ AnMan (cv. Mandelup-ൽ നിന്ന് ഉരുത്തിരിഞ്ഞത്) അടയാളപ്പെടുത്തുന്ന AnManM1 മാർക്കറും Lanr1 ജീനിന്റെ (cv. Tanjil-ൽ നിന്ന് ഉരുത്തിരിഞ്ഞത്) അരികിലുള്ള Anseq3, Anseq4 മാർക്കറുകളും 11,26,28 വിശകലനം ചെയ്തു. പ്രതിരോധശേഷിയുള്ള അല്ലീലിനുള്ള ഹോമോസൈഗോട്ടുകളെ "1" എന്നും, സംവേദനക്ഷമതയുള്ളത് - "0" എന്നും, ഹെറ്ററോസൈഗോട്ടുകൾ - 0.5 എന്നും സ്കോർ ചെയ്തു.
AnManM1, AnSeq3, AnSeq4 എന്നീ മാർക്കറുകൾക്കായുള്ള സ്ക്രീനിംഗിന്റെ ഫലങ്ങളുടെയും അന്തിമ തുടർ പരീക്ഷണങ്ങൾക്കായി വിത്തുകളുടെ ലഭ്യതയുടെയും അടിസ്ഥാനത്തിൽ, ആന്ത്രാക്നോസ് പ്രതിരോധ ഫിനോടൈപ്പിംഗിനായി 50 NLL ലൈനുകൾ തിരഞ്ഞെടുത്തു. പകൽ സമയത്ത് 22°C ഉം രാത്രിയിൽ 19°C ഉം താപനില പരിധിയുള്ള 14 മണിക്കൂർ ഫോട്ടോപീരിയഡുള്ള ഒരു കമ്പ്യൂട്ടർ നിയന്ത്രിത ഹരിതഗൃഹത്തിൽ വിശകലനം തനിപ്പകർപ്പായി നടത്തി. വിത്തിന്റെ പുറംതോട് വളരെ കടുപ്പമുള്ളതിനാൽ വിത്തിന്റെ സുഷുപ്തി തടയുന്നതിനും ഏകീകൃത മുളയ്ക്കൽ ഉറപ്പാക്കുന്നതിനും വിതയ്ക്കുന്നതിന് മുമ്പ് വിത്തുകൾ മാന്തികുഴിയുണ്ടാക്കുന്നു (മൂർച്ചയുള്ള ബ്ലേഡ് ഉപയോഗിച്ച് ഭ്രൂണത്തിന്റെ എതിർവശത്തുള്ള വിത്തിന്റെ പുറംതോട് മുറിക്കുന്നു). അണുവിമുക്തമായ മണ്ണ് (TS-1 REC 085 മീഡിയം ബേസിക്, ക്ലാസ്മാൻ-ഡീൽമാൻ പോൾസ്ക, വാർസോ, പോളണ്ട്) ഉപയോഗിച്ച് ചട്ടികളിലാണ് (11 × 11 × 21 സെ.മീ) സസ്യങ്ങൾ വളർത്തിയത്. ഗ്രേറ്റർ പോളണ്ടിലെ വെർഷെനിറ്റ്സയിലെ ഒരു വയലിൽ (52° 27′ 42″ N 17° 04′ 05″ E ) വളർത്തിയ ഇടുങ്ങിയ ഇലകളുള്ള ലുപിൻ ചെടികളുടെ തണ്ടിൽ നിന്ന് 1999-ൽ വളർത്തിയ കൊളെറ്റോട്രിക്കം ലുപിനി കോൾ-08 ഇനത്തിൽ നിന്നാണ് കുത്തിവയ്പ്പ് നടത്തിയത്. ഒരു വിസ്തീർണ്ണം എടുക്കുക. ബീജസങ്കലനം പ്രേരിപ്പിക്കുന്നതിനായി 21 ദിവസത്തേക്ക് കറുത്ത വെളിച്ചത്തിൽ 20° C താപനിലയിൽ SNA മീഡിയത്തിൽ ഐസൊലേറ്റുകൾ കൃഷി ചെയ്തു. വിതച്ചതിന് നാല് ആഴ്ചകൾക്ക് ശേഷം, സസ്യങ്ങൾ 4-6 ഇലകളുടെ ഘട്ടത്തിൽ എത്തിയപ്പോൾ, ഒരു മില്ലി ലിറ്ററിന് 0.5 x 106 കൊണിഡിയ എന്ന സാന്ദ്രതയിൽ കൊണിഡിയയുടെ ഒരു സസ്പെൻഷൻ ഉപയോഗിച്ച് തളിച്ചു കുത്തിവയ്പ്പ് നടത്തി. കുത്തിവയ്പ്പിനുശേഷം, കൊണിഡിയയുടെ മുളയ്ക്കലും അണുബാധ പ്രക്രിയയും സുഗമമാക്കുന്നതിന്, ഏകദേശം 98% ഈർപ്പം, 25°C താപനിലയിൽ 24 മണിക്കൂർ സസ്യങ്ങളെ ഇരുട്ടിൽ സൂക്ഷിച്ചു. തുടർന്ന് സസ്യങ്ങൾ 14 മണിക്കൂർ ഫോട്ടോപീരിയഡിൽ 22°C പകൽ/19°C രാത്രിയിലും 70% ഈർപ്പത്തിലും വളർത്തി. കുത്തിവയ്പ്പിന് 22 ദിവസങ്ങൾക്ക് ശേഷം രോഗ സ്കോർ ഉണ്ടാക്കി, തണ്ടുകളിലും ഇലകളിലും നെക്രോറ്റിക് നിഖേദങ്ങളുടെ സാന്നിധ്യമോ അഭാവമോ അനുസരിച്ച് 0 (പ്രതിരോധശേഷി) മുതൽ 9 (വളരെ സാധ്യതയുള്ളത്) വരെയായിരുന്നു രോഗ സ്കോർ. കൂടാതെ, സ്കോർ ചെയ്ത ശേഷം, സസ്യങ്ങളുടെ ഭാരം അളന്നു. മാർക്കർ ജനിതകരൂപങ്ങളും രോഗ ഫിനോടൈപ്പുകളും തമ്മിലുള്ള ബന്ധത്തെ പോയിന്റ് ടു-സീക്വൻസ് കോറിലേഷനുകളായി കണക്കാക്കി (ആന്ത്രാക്നോസ് റെസിസ്റ്റൻസ് ഫിനോടൈപ്പിന്റെ വിശകലനത്തിനായി വരികളുടെ കൂട്ടത്തിൽ ഹെറ്ററോസൈഗസ് മാർക്കറുകളുടെ അഭാവം).